Xylella fastidiosa M12: Xfasm12_0471
Help
Entry
Xfasm12_0471 CDS
T00677
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
xfm
Xylella fastidiosa M12
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YhdP
DUF3394
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA11481
LinkDB
All DBs
Position
523507..527367
Genome browser
AA seq
1286 aa
AA seq
DB search
MRPIFSSLLLFKVSSLLRFPRVFRYAAYACVAVFVAVALAMGVVSQLLPVVERHPQQVAD
WLSVRAGQPVRFDTLSTSWTQRGPLLRLQGVRIGPQGKVGIGQVEVLVAMYTGLLPGHSL
IELRLRGMALTVHRDSAGRWSVYGLPRDVGGDPLEVLRRFGELQVIGGRLSVDAPSSGVS
TTLSQINLRVRVAGDRLRAGVHGWLDSARAPVTGVVDFDRVSGDGDVYVETLPNQLASWS
SLLAGVMRGVHLRDGAGHVRAWAQLHRHHVEQVTVQGDLQGVRFEGVRLAGQTVVPRVFW
PQLQVLVRWQRQGDGWRVVAPRLRMGESGRLQKLDGVVVEGGSFYTVSAPNAVDAGVVMA
VLALGDWLAPDLRTWLLRARPQLRVAGLHVSRQADGRFWVAGRVEQLGFLPVADAPGLSG
VRGTLEGDAQGAVLTLDSDASVHLDWPSGFGRRHEIHLAGRIVGWRQGDGWKVATPALRV
QAADYAANLRGGLWFEGHGMLPRISLAVQLDDVAVPVAKRFWVRSKMSRELIDWLNAALV
NGSTSGGFALIEGELKDWPFNNHDGYFEAAGRIHGGVMRFQSEWPVLEKLDADIAFIGNG
FSIKGRAELAGVPQVQLEAGIEDFEKGDLYVRAHVQSDATRLLGLLRRSPLHQHDADTLD
SVSASGPTSVSFDMHLPLRHEQGADDGHFWGEVSLENVNYIDRRWNLAFENVRGPVRYSS
DGFSAEALHVLHQGLEGRLSVRVGDAVDDPAQIFQARLSAAVNVKSLLRHAPQMDWLRPY
VNGISQWRIGVDLAKSVPDAHGVLGHLTLDSDLVGTALNLPAPLDKGSGRVLPAHINVAL
PMEQGDIALALGKLVAARVRHRDGGGVGVRVVMGSDSVREAPLEHGLVVIGHSTSLDAID
WMRLVRGGSAVSSDLPLRLIDLQVDSLLLLGGMFPNTRFQLRPVHQGVAVVVDGPALSGQ
LSIPESTDGTVTGTLGVLHWQAAQAPSVKVSGSVQSAMADVDPASIPSLAFEVEDARLGQ
VKLGRVGLRTRRLSDGMQVDQLQTNSPSQRLSMFATWRGKGEASIIRLSARVDSRDLGEL
AQAIGYGEQLRGGEGQIQLSAGWNGPPVGFQLPSLSGDLKVNARNGQLLELKPGAGRVLG
LLSVTQLPRRLMLDFRDLFSKGLAFNRFYGEVHFGDGKAHTDRLKIEGPAVNIAIRGQSD
LSTQTFDQIVDVNPKSGNLLTVVGAVAGGPVGAAVGAAANMVLGKSLGAIGAKTYHVSGP
WNDPKVQVMNLDSRQRDKPSNSKSEN
NT seq
3861 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggccgattttttcaagcttgctattgtttaaggtgtcttctttgttgcgcttcccc
cgtgttttccgttacgcggcgtacgcttgcgttgctgtctttgttgcagtggcgctggcg
atgggggtagtgagccagctcttgccagtggtcgaacgtcatccacagcaagtggcggac
tggctcagtgtgcgtgcgggtcagccggtgcgcttcgatacgttgagtacatcttggacg
cagcgcggtccattgctgcgtttgcaaggggtacgtatcggtccgcagggtaaggtgggg
attgggcaagtagaggtgctggtggcgatgtataccgggcttcttccagggcattcgcta
atcgagttgcggttgcgtgggatggcgctcactgtacatcgtgacagtgcgggacgttgg
tcggtctatgggttgccccgtgatgttgggggcgatccgttggaggtattgcggcggttt
ggtgagttacaggtgatcggtggtcggctcagtgtggatgctccgtcgtcaggggtgagt
acgacgttgtcgcagatcaatctgcgggtgcgtgtggccggagatcggctacgcgctggt
gttcatggttggttggattcagcgcgtgccccggtgacaggggttgtcgattttgatcgt
gtgagtggtgatggtgatgtttatgttgagacgctgccgaatcagttggcgtcttggtca
tccttgcttgctggtgtgatgagaggagtccacctacgtgatggtgctggccatgtgcgg
gcttgggcgcaacttcatcgccaccatgtcgagcaggtgacggtgcaaggtgatctacaa
ggggtccgattcgagggggtgcgtcttgctggacagacagtggtgccaagggtgttttgg
ccgcagttacaggtgctggtgcgttggcaacgtcagggggatgggtggcgggttgtggcg
cctcggttgcggatgggggaatcggggaggctgcaaaagttggatggggtggtggtcgaa
ggaggttcgttctatacggtcagtgcaccaaatgctgtagatgccggagtggtgatggcg
gtgttggcgcttggcgattggcttgcgccggatctgcgtacttggttgctgcgtgcacgg
ccacagttgcgggttgctgggttgcatgtgagcaggcaggccgatggtcggttttgggtt
gctggccgtgttgagcagcttggttttctacctgtggctgatgctcctggtctgagtggg
gtccgcggtacgttggagggggatgcgcagggggcggtgctgactctggattctgatgcg
tcggtgcatctcgattggccttccgggtttggacgtaggcatgaaatccacttggcgggg
cgtattgtcggttggcgtcaaggtgatggttggaaagttgcaacgccagcattgcgggtg
caggcagccgattacgcggcaaatctgcgtggtgggctgtggttcgaagggcatggcatg
ttgccgcgtatttcactggctgtgcagttggatgatgtcgcggtgccagtggccaagcgc
ttttgggttcgttctaagatgagccgtgagttgattgattggctgaatgctgctttggtc
aatggttcgactagtggtggttttgctctcattgagggggagttgaaggattggccgttt
aataaccatgacggttattttgaggcggctggccgtatccatggtggggtgatgcgattt
cagtccgagtggcctgtattggaaaagctggatgctgatatcgcttttatcggtaatggt
ttttcgatcaagggacgggcggagcttgctggcgtgccacaagttcagttggaggcgggt
atagaggattttgagaagggcgatctctatgtgcgtgctcatgtccaaagtgatgcgact
cggttgttggggctgttgcggcgcagtccattgcatcaacacgatgcggatactttggac
agtgtcagtgccagtggtccgacgagtgtcagttttgatatgcatctgcctttgcgtcat
gagcagggcgccgacgatggtcatttttggggggaggtgtcgctggagaatgtgaattat
attgaccggcgttggaatctcgcttttgagaatgtgcgtggtcctgtgcgctatagcagc
gatggtttcagtgctgaggccttgcatgtgctgcatcaggggttggaggggcgtttaagt
gtgcgggtgggcgatgcggttgatgatccagcacagatattccaggcgcggttgtcggca
gcggtcaatgtcaagtctttgctgcgtcatgcgcctcagatggattggttgcggccttat
gtcaatggtatttcgcaatggcggatcggtgttgatctggctaagagtgtgcctgacgct
cacggggtcttgggtcatttaactttggattcggatctggtcggtacggcgttgaatttg
ccggcgccgttggacaaagggagcggtagggtgttgcctgctcatataaatgttgcttta
cccatggagcagggtgatatcgctttggcattgggtaagttggttgcggcgcgtgtgcgt
catcgagatgggggaggggtcggtgtgcgtgtcgtcatggggagtgacagtgtgcgcgag
gcaccgctggagcatggtttggttgttattggacacagtacgtcgctggatgcaatcgac
tggatgaggttagtgcgtggtgggtctgctgtttcctcagatttgccattgcggttgatt
gatctgcaggtggatagtttgttgctgttgggtgggatgttcccgaatactcgattccag
ttgcgtccggtgcatcaaggggttgcggtggtggtggatgggccggcattgtctggtcaa
ttgagcattcccgagtcaactgacggtacggttacgggtacgttgggagtgttgcactgg
caggcagcgcaggctccgtcggtgaaggtgtctgggtcggtgcagtctgcaatggcggat
gtcgatccggcttcgattccatctttggcgtttgaggtggaagatgcgaggttaggtcag
gtcaagcttggccgtgtggggttgcgtactcggcgcttgtctgatgggatgcaggtagat
cagttgcagacaaattcgcctagtcagcggttatcgatgttcgctacgtggcggggtaaa
ggggaagcctccatcattcgactgtcggcgcgggtcgatagccgtgatcttggggagttg
gcacaagcgatcggttatggggagcaattgcgtggcggtgaggggcagattcagttgagt
gctggttggaatggaccgccggtcggtttccagttgccttcgctgagtggtgatttaaag
gtgaatgcgcgtaatggccagttactggaactcaagcctggggctggtcgggtgcttggg
ttactcagtgtgacgcagctgccacggcgcttgatgctggatttccgcgatttattttct
aagggtttagcgtttaatcgcttctatggtgaagtgcactttggggatggtaaggcgcac
acggatagactcaagattgagggaccagcggtgaatattgcgatccgtggtcagtctgat
ttatctacgcagacgtttgatcagatcgtggatgtgaatcccaaaagcggcaatttgttg
acggtggttggtgcggtggctggaggtccggtgggtgcggcggtgggtgcggccgccaat
atggtgcttggtaagtcattgggtgcgatcggtgccaaaacctatcatgtgagtgggcct
tggaatgatccaaaggtccaggtgatgaatctggactcgcgtcagcgtgataagccttcc
aatagtaagtcggagaattag
DBGET
integrated database retrieval system