Xylella fastidiosa M12: Xfasm12_0992
Help
Entry
Xfasm12_0992 CDS
T00677
Name
(GenBank) surface protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
xfm
Xylella fastidiosa M12
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xfm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
xfm02000
]
Xfasm12_0992
Transporters [BR:
xfm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Xfasm12_0992
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_anchor
YadA_head
Apo-CIII
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA11962
LinkDB
All DBs
Position
1068670..1072242
Genome browser
AA seq
1190 aa
AA seq
DB search
MQIHTALPMVRLGGIEGVDPLFLPKYKIGQSLQHAVMTSAASSKKGTQPRCSNNAMTAKR
SAKLHDRRQLHIVLLTVLAASTGYTGKVAAQVYVNSDSTENCVEILGDSSQTSFIHSASN
DKCKPDFTQTEYSLFYDYRNLVLGGSLYVNEGKLGLVDISGATYSMRLGSIATMNGSAGI
DSIAIGSGQGSKTDGNTSGATVAQGLRSIAIGTTARSQSQDTISIGTGASTTGNFAIAIG
NGALTSIANGIALGASSSVTTRGGVALGQGSLAATASGITGYDPVTKSTSTLSTSMWRST
LGAVSIGNITSSTSQTRQLTGLAAGRSDTDAVNVAQLKLLAESVGGGWNLTASGANSSNV
ALGESVDLKNSDGNLLITKTTDSNDVTFNLATALKVDSLTTGNTAMTTDGVAVGSNVKLG
STGLIITDGPSVTSSGISAGNQKITNVAVGTADTDAVNFSQLQAVSSTASKGWNLLASGA
NSSNVAPGESVDLKNSDGNLLITKTTDSNDVTFNLATALKVDSLTTGNTAMTTDGVTVGK
RVTLDSTGLVIAEGPSVISSGINAAGQKIMNVGTGTADTDAVNFSQLQAVSDTASKGWNL
LASGANSSNVAPGGSVDLKNSDGNLLITKTTDSNDVTFNLATALKVDSLTTGNTAMTTDG
VAVGSNVKLGSTGLVITDGPSVTSSGISAGNQKITNVAVGTADTDAVNFSQLQAVSSTAS
KGWNLLASGANSSNVAPGESVDLKNTDGNIVISKESGSNDVLFNLSSSLKLDKLTVGDTV
MTTNGVTVGSGVTLGSMGLVITDGPSVTSSGINAGSQKITNVAAGTADTDAVNLSQLNTA
MASSGAKSVHYYSTYDGGTQGGNYNGDGATGNGSIAVGVGTLASAEGATAMGSGAAASGK
GSTAIGRNAVASADGSVALGDGAKDGARGAESYTGKYSGVQNNTVGTVSVGDASKGETRT
VSNVADAKEATDAVNLRQLDQVAQDANRYVDNKIESLSEGQTFVKVNSVNNSATPIAAGV
DATAIGVGATASGADSIAMGNKASASADNAVAIGNHSVADRANTVSVGSAGSERQVTNVA
AGTADTDAVNVSQLNQGLITAKQYTDGVVGSLRRDTDGGVAAAIATANLPQAYIPGRGMT
SVGVSSYRGQSAIAVGVSSVSESGRWVFKFSGSANTRSQVGIGAGVGYQW
NT seq
3573 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaattcatactgcactgcccatggttcggttgggtggaatcgaaggtgttgatcca
ttatttttgccgaaatacaagatcggtcagtcgctgcaacacgcagtgatgacgtcagca
gcttcaagtaaaaaaggtacgcagccacgatgttccaacaatgcgatgacagctaagcgt
agcgcgaaactgcacgaccggaggcagttgcatattgtcttattgacagtgcttgcagcc
tcaacgggatatacggggaaagtagcagctcaagtctatgtaaattccgactcgactgaa
aattgcgtagaaatacttggcgacagtagtcagacatccttcattcatagtgcttctaac
gataaatgcaagccagatttcacgcaaacagagtattccctgttttatgactatagaaac
ctggttcttggtgggtccttatatgtcaatgagggtaaactcgggctagtcgatatttct
ggtgcaacttattctatgcgcctaggcagcattgctaccatgaatggctcggctggcata
gattcgattgccatcggttcagggcaaggttccaaaacggacgggaataccagcggcgcc
actgtagcacaggggctgcgttcgattgcgattggtactacggcccgttcgcaatctcaa
gatacgatttctatagggaccggtgcatccactacaggcaattttgcgatagcgataggt
aatggagcattgacatcaattgccaatgggatagcgcttggtgcatcaagcagtgtcacc
acaagaggaggcgtggcactgggacaaggctcgctggctgcgaccgcttctggcattact
ggctatgatccggtcaccaagagcacctcgactctttccacgtcaatgtggagaagcacg
ctgggggcagtcagtatcggtaatataacctctagcacctcccagacacgtcaacttaca
ggattggcggcaggtaggtcggatacggatgcggtgaatgttgcccagctgaagttgctt
gctgaatctgtgggtggtggttggaatttgactgcttctggagccaacagcagtaatgtg
gcgctgggtgagtcggtggatctgaagaatagtgatgggaacctcttaatcaccaaaaca
accgacagcaatgatgtgacttttaatttggccactgctttaaaagtggacagtttgacc
actggcaacacggcgatgacgactgatggtgtggcggtgggtagtaacgtgaagttgggc
tcgacgggattaattattacagatggtccgtctgtgaccagctcgggcattagcgccggt
aaccaaaagataacgaatgttgccgtaggtactgcggataccgatgccgtcaactttagc
cagttgcaagcggtgagcagtacggccagtaagggttggaatttgctggcttctggagcc
aacagcagtaatgtggcgccgggtgagtcggtagatttgaagaatagtgacgggaacctc
ttaatcaccaaaacaaccgacagcaatgatgtgacttttaatttggccactgctttaaaa
gtggacagtttgaccactggcaacacggcgatgacgaccgatggtgtgacggtgggcaag
agagtgaccttggattcgacaggattagtgattgcggaaggtccctcggtaatcagttcg
ggcattaatgcggccggccaaaagatcatgaatgttggaacgggtactgcggatacagac
gccgtcaacttcagtcagctgcaagcggtgagcgatacagcaagcaagggctggaatttg
ctagcttctggagccaacagcagtaatgtggcgccgggtgggtcggtggatctgaagaat
agtgatgggaacctcttaatcaccaaaacaaccgacagcaatgatgtgacttttaatttg
gccactgctttaaaagtggacagtttgaccactggcaacacggcgatgacgactgatggt
gtggcggtgggtagtaacgtgaagttgggctcgacgggattagttattacagatggtccg
tctgtgaccagctcgggcattagcgccggtaaccaaaagataacgaatgttgccgtaggt
actgcggataccgatgccgtcaactttagccagttgcaagcggtgagcagtacggccagt
aagggttggaatttgctggcttctggagccaacagcagtaatgtggcgccgggtgagtcg
gtagacctgaagaataccgatggaaacatcgtgatcagcaaagaaagcggcagcaatgat
gtgcttttcaatctgtccagcagtttgaaactggacaaattgaccgttggcgacacggtg
atgacgaccaatggtgtgacagtggggagtggcgtgacgttgggttcgatgggattagtt
attacggatggtccctcggtgaccagttctggtattaatgctggcagccaaaagattacg
aatgttgccgcaggtactgcggacacggatgctgttaatcttagccaacttaatactgca
atggcgagctctggcgctaaatcagtccattactacagtacgtatgatggtggtacccaa
ggaggtaactacaatggtgatggtgcgacaggcaatgggtctatagccgttggtgttgga
acgcttgcatccgctgaaggagcgacagcaatgggttcaggggcggctgccagtgggaaa
ggctccacggcgatcggtcgtaacgcagttgccagcgctgatggtagcgtggcgttgggc
gatggtgcaaaggatggcgcgcgtggggcagagagttacaccggtaaatattcaggcgta
cagaataatacggtgggaactgtttcggtaggtgatgcttccaagggtgaaacccgcaca
gtgagtaatgtggctgatgccaaagaagcgacggatgcggtgaatttgcgtcagcttgat
caagtggctcaagatgccaatcgttatgttgataacaagatagaaagccttagcgaaggg
cagactttcgttaaggtgaacagcgtgaacaatagtgccactcctattgcagctggagtc
gatgcaacagcgattggtgtcggtgccaccgcttcgggtgccgatagcattgcgatgggt
aataaagccagtgcgtctgctgacaatgcggttgccattggtaaccattcagtagccgac
cgtgcaaacactgtttctgtaggatcggctggttctgagaggcaggtgacgaatgtagcc
gctggcactgctgatactgatgcggtcaatgtaagccaactcaatcaaggcttgatcact
gccaaacagtacacggatggggtcgtagggagtcttcgtagggatactgacggtggtgtg
gcggcagcaattgcaacagcaaatctcccacaggcttatattccgggacgcgggatgacc
tccgtaggcgttagtagttaccgagggcaatctgccattgcggtgggtgtttcttcggtt
tctgaaagcggacgttgggtgttcaagttcagcggtagtgcaaatacccgtagtcaagtg
ggtattggtgcaggtgtgggttatcagtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
