KEGG   Xanthomonas fragariae: BER92_03120
Entry
BER92_03120       CDS       T04667                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
xfr  Xanthomonas fragariae
SSDB
Motif
Pfam: HemolysinCabind HCBP_related
Other DBs
NCBI-ProteinID: AOD13895
LinkDB
Position
690119..695872
AA seq 1917 aa
MIAILEKFNGSSLISYRYDQASTGGSSYSWSELSKLDGTKLFSMSILLQPEQVEALRAAY
ASLKESVYAGLVMETRLKSYLDGVSIKLVDGEFRFDVLGLTAKLSDKWQESKSEALQDAI
DLYRYGGGFLADTGWNGVDALRAMIAQAKVSPEGLAALVSSDINLVFAVAQLGSRDDIIW
GSAGGDDLRGGLGDDLIVGEPGNDSLYGEAGSDKLFGGDGNDVLFGGEGNDLLDGGVGND
TLYGGAGTDLLDGGAGDDYLSGDAGSDVYLFGRGSGRDTVSNYHSAGEEDRILIADDLSA
VDIKVSRYSDDLIIEIAGTNDRLAVSNYFYNDGNGPYSVKEIRFADGTIWDVAKLREMVQ
VAGDGSDQLTGYQGNDSLFGGRGDDTINGQGGDDLLEGGEGGDSLSGEAGNDRLFGGTQN
DTLYGGEGDDQLDGGANNDTLYGGSGNDRLEGGAGNDYLSGDAGSDIYLFGRASGQDTIS
NYTYDGGSTDVLELAADVAVSDVTVWRYGDDLVLTINGTDARVTVSSYFYNDANGPYALN
QVRFADGTVWDAAQIKLLVQASTAGNDQLTGYQGNDSLSGGRGDDTIYGQAGDDLLQGGE
GGDSLSGDAGNDLLFGGAQNDMLSGGEGDDQLDGGTNNDTLYGGGGNDRLEGGTGNDYLS
GDAGSDIYVFGRTSGQDTISNYTYDSGSTDVLELAADVAVSDVTIWRYSDDLVLAIKGSD
ARVTVSSHFYNNANGPYALAQVRFADGTVWDAAQIKSLVQTSTAGNDQLTGYEGNDSLSG
GRGDDTISGQGGDDLLDGGEGADNLSGEAGNDQLFGGTQNDTLHGGEGDDRLDGGANNDT
LYGGGGNDRLDGDSGNDYLSGDVGSDTYVFGRTSGQDTIFNYIYDNMSTDVLELAAGVAV
SDVTVWRSSDDLVLAIKDTEARVTVSSHFYNDANGPYTLNQIRFADGTIWDTAQIKSLVQ
ASTAGNDQLTGYQGNDSLYGGRGDDSVNGRGGDDLLDGGEGADNLFGEAGDDRLFGGAQG
DTLYGGEGDDQLDGGANNDILYGGGGNDRLEGGSGNDYLSGDAGSDTYVFGRASGQDTIS
NYSYETTSTDVIELAADVAVEDVTIWRYSNDLVLAIKGTDAQIRVGSHFYNDGRELYAIN
QVRFADGTVWDATQIRALVQASTAGDDQLIGYQGSDSLSGGRGDDTLNGQGGDDLLDGGE
GSDSLYGEAGNDLLLGGAQNDRLYGGEGNDRLDGGAGNDYLSGDVGGDTYVFGRTSGQDT
ISNYSYDSGSTDVLELAADVAVADLMVWRYSNDLIIAIKGTNAQITVGSYFYESGSTSYT
VGKINFADGTSWAYADVLNLVMQQPATQSYIYGTAESDILQGTSSLDNVYGCGGDDVLDG
GAGNDTIDGGYGNDVYRFGRGSGNDIITNNDWTAGKRDAIVMGEGISTGDVSVARDGDSL
VLSIKGTSDSVRVSSYFYADATYGYQVEEVRFADGTIWDIAAIKALVQVATDGNDTLVGY
ASADSLSGGLGEDNLSGMGGNDGLLGGIGADTLYGNEGDDTLDGGDQNDRLYGGSGNDLL
LGGVGNDSLSGENGDDLVDGGAGNDTLDGGFGNDVYIFGRGSGSDLIVNYDWTAGKRDAI
VMGEGISAGDVAVARDGDTLVLNLKGTSDTVRVNSYFYADATYGYQVEEVRFADGTTWDI
AAIKALVQVATDGNDALTGYAGADTLNGGLGDDSLSGREGDDVLQGGIGADTLSADAGND
TLDGGDQNDRLNGGTGNDLLLGGVGNDSLFGEDGDDVLDGGAGNDTLDGGYGNDVYRFGR
ASGSDRISSYDYSSSNDKVVFGGGVAIDQIWLARSGNDLVLSIAGTNDQLSIANWFDDSG
YQVDQLQTADGKILDASELTNLVAAMSSYNALVGGQMTLERVMNFERGWLHFQASGS
NT seq 5754 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgccatcttggaaaaattcaatggctccagtctgatcagctatcgttatgatcaa
gcgtcgaccgggggcagttcctattcatggagcgagttgtccaagttggacggaactaag
cttttttctatgagtattttattgcagcccgagcaggtcgaagcgctcagagctgcctat
gccagcttaaaagagtcggtgtatgcaggcttggtgatggagacgcgtctgaaaagttat
ttggacggcgttagcattaagctcgtggatggtgaattcaggttcgatgtccttggattg
acagccaagctttcggataagtggcaagaaagtaagagcgaggctctgcaagacgctatc
gatttgtatcgctacggcggaggttttcttgcggacacaggctggaacggtgtcgatgct
cttcgggcaatgatcgctcaagccaaagtttcgccagaaggacttgctgcactggtaagc
tcggatattaacctcgtgtttgcggtcgcgcagctggggtcacgcgatgacattatctgg
ggaagtgctggcggcgatgatttgcgaggaggacttggggacgacctcattgtcggtgaa
cctggcaatgattcgctttacggcgaggccggaagcgataagttgttcggcggagatggc
aatgatgtgctattcggtggggaaggcaatgacttgctggatggtggggtcggaaacgac
acgctgtacggtggtgctggtacggaccttcttgacggtggtgcgggtgacgactaccta
agtggcgatgctggtagtgacgtttacctattcggccgaggttctggtagggataccgta
tccaactaccactcagcaggcgaggaggatcggattttgattgcagacgatttgtctgca
gttgatatcaaggtatcccgctacagtgacgatctcatcattgagatagctggaaccaac
gaccgcctggccgtatcgaactatttttacaatgatggaaacggtccttactcggtaaaa
gagattcgattcgccgacggtacaatttgggacgttgcaaagctcagggaaatggtgcag
gtcgcaggtgacggaagtgatcaattgaccggctaccaaggcaacgacagcctttttggt
gggcgcggtgacgacaccatcaacggacaaggtggagacgatctgcttgagggtggtgag
gggggcgatagcttgtctggcgaggctggcaatgatcgcctattcggtggtacgcagaac
gatacgctctatggtggtgagggtgacgaccagctcgatggcggagcgaacaatgacacg
ctctatggtggcagtggcaatgaccgcctggagggcggcgccggcaacgactacttgagc
ggggacgcaggaagcgacatctacctgtttggtcgcgcgtccggacaggacacgatcagc
aactacacctatgacggtggttccactgatgtgttggagttggctgcggatgttgccgtg
tcagatgtgacggtttggcgctatggcgatgacttggtgctgacgatcaatgggacggat
gctcgcgttactgtcagtagctacttctacaacgatgctaacggtccatatgcgctcaat
caggtgcgttttgctgatgggacggtttgggatgctgcacagatcaaattattggttcag
gcctcgacggccgggaatgatcagctgaccggctaccaaggcaacgatagcctgtcgggt
ggacgtggggatgacactatctatggccaagccggagacgacctgcttcagggtggcgag
ggtggtgatagcctgtcaggcgacgcgggtaatgacctgctgttcggtggcgcgcagaac
gacatgctctccggtggcgagggcgatgatcagctggatggcgggacaaacaacgacacg
ctctatggtggcggcggcaatgaccgcctggagggcggcaccggcaacgactacttgagc
ggggatgcaggaagcgacatctacgtctttggtcgcacttctgggcaggatacgatcagc
aactatacctatgacagtggttccactgacgtgttggagttggcagcggatgttgccgtc
tcagatgtgacgatttggcgctatagcgacgacttggtgctggcgatcaagggctcggat
gctcgcgtcacggtaagcagccacttctacaacaatgccaatgggccatacgcgctcgct
caagtgcgttttgccgacggaacggtttgggatgctgcacagatcaagtcattggtgcag
acctcgacggccgggaatgatcagctgaccggctatgaaggcaatgacagtctttccggt
ggacgtggcgatgacaccatcagtgggcaaggcggagacgatctgcttgatggcggcgaa
ggtgctgacaacctttccggggaagcgggcaacgatcaattgtttggtggtacacaaaac
gacacgcttcatggtggtgagggcgatgatcgacttgacggaggggcaaataacgacacg
ctatacggtggtggcggtaatgatcgtttggatggcgatagcggaaatgactatttaagc
ggagacgtcggaagcgatacctatgtttttggccgaacctccggtcaggacacgatcttc
aactacatctacgacaatatgtcgactgacgtactggagttggctgctggcgttgccgtc
tcagacgtgacggtctggcgttctagtgatgatcttgtgcttgcgatcaaggatacggag
gcgcgcgttacggttagcagtcacttctacaacgacgccaatggtccgtatacgctcaat
cagatacgttttgccgatggaacgatctgggatactgcacagatcaagtcactggtgcag
gcctctacggccgggaatgatcagctgaccggctatcaagggaatgacagtctttatggt
gggcgtggtgacgatagcgtcaacggacgaggcggagacgacctacttgacggtggtgag
ggtgccgacaatctattcggtgaggcgggtgacgatcgactgttcggtggcgcacagggc
gatacgctctacggcggcgagggcgatgatcagctggatggtggagcgaacaacgacatc
ctgtatggcggtggaggcaatgatcgtcttgagggtggttccggtaatgactatctgagc
ggggatgccggaagcgacacttatgtattcggtcgcgcctcaggccaagatacgatcagc
aactatagctatgaaactacgtctactgacgtcattgagctagctgcggatgttgctgtg
gaagatgtcaccatctggcgctacagcaatgatctcgtgctggctatcaaaggaactgat
gcgcagattcgggttggaagtcatttttacaatgatggtagagagttgtatgcgatcaac
caggtgcgttttgccgatggaacggtgtgggatgccacacagatcagagcgttggtacag
gcctctacagcaggggatgatcagctaatcggttaccagggcagtgatagcctttctggg
gggcgtggcgatgacaccctcaacggccaaggtggagacgatctactcgatggcggtgag
ggctcggatagcctttatggtgaagccggcaatgacttgctgctcggtggtgcccaaaac
gataggctgtacggtggagaaggcaatgaccgtctagatggcggcgccggcaatgactac
ctgagcggagacgtcggaggtgacacctatgtgtttggtcgcacctctgggcaggacacg
attagcaactacagctatgacagtggctccactgacgtgctggagctggctgcggatgtt
gctgtggctgaccttatggtttggcgttatagcaacgacctgataatagcaattaagggg
acaaatgcgcagatcacagtgggtagctatttctatgaatctggaagcacttcctacaca
gtcggaaagatcaattttgctgatggaacttcttgggcctatgcggacgtacttaattta
gtaatgcagcaaccagctacgcagagctacatttatggcacggccgaatcagatatcctc
cagggtacgtcgtcgcttgataatgtatatgggtgcggcggagacgatgtgctggatggc
ggggccggcaacgatacgatcgacggtggatacggcaacgacgtgtatcgctttggtcgt
ggctccggcaacgacatcatcacaaataacgattggaccgcaggcaagcgcgatgcgatc
gtcatgggcgaaggtatctctaccggagatgtttcagtagcacgggacggcgacagcctg
gtgttgagcatcaagggcacctcggacagtgtccgtgtcagcagctacttctatgcagat
gccacctacggctatcaggtggaagaggtccgctttgcggacggcacgatctgggatatc
gctgcaatcaaggcgctggtccaggtggcaacggatggcaacgacacattggtaggatat
gcgagtgccgattcacttagcggcgggctgggtgaggataatttgtccggcatgggtgga
aacgatggtctcctaggtggaatcggtgccgacacgctctatggcaatgagggcgatgac
acacttgatggcggtgatcagaacgatcgcctttacggcggcagcgggaacgatctgctg
cttggcggcgttggcaatgatagtttgtctggcgagaatggcgacgacctggtagatggt
ggcgcaggcaacgatacccttgacggtggcttcggcaacgatgtctacatattcggacgt
ggctctggtagcgacctcatcgtcaactacgattggactgcaggcaagcgcgatgcgatc
gtcatgggtgaagggatctctgccggtgatgtagcggtagcacgggatggcgatacgctg
gtgctgaatctcaagggcacgtctgacaccgtgcgcgtcaacagctacttctacgctgat
gccacgtacggctaccaggtggaagaggtccgctttgcggacggcacgacctgggatatc
gctgcaatcaaggcgctggtccaggtggccacagacggcaacgatgcactgaccggctat
gccggtgccgatacgctcaacggtggtctgggtgatgactccttgtccggccgtgagggt
gatgatgtcctccaaggcgggatcggcgccgacacgttgtctgctgatgcgggtaacgat
acgctcgatggtggcgaccagaacgatcggctcaacggtggcacaggcaatgacctgttg
cttggtggtgtcggcaatgacagtttgtttggcgaggatggcgacgatgtgctggatggc
ggcgcgggcaacgacacgctcgatggcggctatggcaacgatgtatatcgctttggtcgt
gcgtctggcagcgatcgtatttctagctacgactactcttctagcaatgacaaggtcgtc
tttggaggtggggtcgctatcgatcaaatctggctggcgcgttccggtaatgatcttgtt
ctttcaattgcagggacgaacgatcaattatccatcgcaaactggttcgatgactctggt
tatcaggtagatcagttgcagacggctgatggaaaaatacttgatgcaagcgaactgacg
aatctggtggcggcgatgtctagttacaatgcgctagttggtgggcagatgacactagag
cgtgttatgaactttgaaagagggtggctgcatttccaagcatcaggatcgtga

DBGET integrated database retrieval system