Xylella fastidiosa Temecula1: PD_2044
Help
Entry
PD_2044 CDS
T00113
Symbol
norM
Name
(GenBank) multidrug efflux protein
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
xft
Xylella fastidiosa Temecula1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xft00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
xft02000
]
PD_2044 (norM)
Transporters [BR:
xft02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
PD_2044 (norM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
DNA_ligase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAO29868
UniProt:
Q879Z5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2407639..2408985)
Genome browser
AA seq
448 aa
AA seq
DB search
MISRFGSEVRPTLLLALPLVLGHVSTGLIGFVLNVIAGHHSTVTLAASTIGTALLWLPML
VPMGTLISLTVLVSQLHGAERERDIGPLFRQALWLAMLLGLVMFTFLSVVPALLPLFGIV
PDIVPGAAKFLHVVRWGSLAFPLYFCMRYFCEGMHCTFPTMLLGFGGLLVLVPLSYALTY
GRFGFAEYGVEGLGIATVTVMWLQAVVFALYLWRSRRFAHLQLFAHLELPCWARIRDLLN
IGLPIGISILMEGGLFIVTTLLIGRFGTDEIAAHQIALSVAQLCFMIPMGVAEATTVRIG
HAVGRCDLLVMRRVAWAGYAIVIGTQTLSASVLLLGYDVIVAAYTDDLVVASLASKLLLF
AAIFQFPDGLQMLSSGVLRGMKDTRVPMLLAMISYWGLGMPLGLGLGFALEWNSRGMWIG
LIIGLTAAALLLGWRFRVVSERMFAGIP
NT seq
1347 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgatatcccgctttggttccgaagttcgtcctactcttttgcttgcgctgccgctcgtt
ttgggtcacgtttccactggtctgatcggctttgtacttaacgttattgctggtcatcac
tctaccgtcactctagcggcatcgactatcggcactgcattgctttggttgccgatgttg
gtacccatgggtacgttgatttcgttaacggtgttggtatcgcaattgcatggtgctgag
cgtgaacgggacattgggcctttgttccgccaagcgttgtggctggccatgctgttgggg
ttggtgatgttcactttcctcagtgtggtgccagccttgttgccgctctttggtatcgtc
ccggatatcgttccgggtgctgctaagtttttgcatgtagtgcgttgggggagtttggca
ttccctctttacttctgtatgcgttatttctgtgagggaatgcactgtacttttccaacg
atgcttctgggttttggtgggttgctagtgctggtgccattgagttatgcgttgacatac
ggtcgttttggttttgccgagtatggtgttgagggcttggggatcgcaacagtgacggtc
atgtggctacaggcggttgtatttgcgttgtacttgtggagatcacgtcgcttcgcccat
ctgcagctatttgcgcatctggaattgccgtgctgggcacgtatccgtgatctgttgaat
ataggattacccatcggcattagtattttgatggagggcggattatttattgtcaccacg
ttgctgattggtcggtttggtactgatgaaattgccgcgcatcaaattgccctaagtgtt
gctcaattgtgcttcatgatcccgatgggtgtagctgaggcaaccacggtgcgaatcggc
catgctgtgggtcgttgcgatcttttggtgatgcgccgtgtcgcttgggctggttatgca
atcgtgatcgggacgcagacactctcagcaagtgtgcttttgctcggatatgacgtgatt
gtagccgcttatacggatgatttggtggtggcgtctctggcttctaaattactgttgttt
gcggctatattccagttcccggatggtctccagatgctttcgtccggtgtattacgtggg
atgaaggacacccgggtgccgatgctgctggcgatgatctcgtattggggtttaggtatg
ccgcttggtcttggccttggttttgccttggaatggaattctcgcggtatgtggatcggc
ttaatcattggcttgactgcagctgcattgttgcttggttggcgatttcgtgtggttagc
gagcgcatgtttgccggtattccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
