Xiphophorus hellerii (green swordtail): 116736099
Help
Entry
116736099 CDS
T07363
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2-like
KO
K20995
Notch 3
Organism
xhe
Xiphophorus hellerii (green swordtail)
Pathway
xhe04330
Notch signaling pathway
xhe04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xhe00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
116736099
04371 Apelin signaling pathway
116736099
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
EGF_3
Notch
NODP
NOD
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
cEGF
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116736099
NCBI-ProteinID:
XP_032444235
LinkDB
All DBs
Position
16:9659809..9688435
Genome browser
AA seq
2471 aa
AA seq
DB search
MEGNMQWIIFSLLLCFHIGEGFRCVDKNRPCQNGATCIDSPSRCICRPGFIGPFCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSDVVNDIPQYKCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNNHY
NCSCPPGYQGKNCRSDIDECRKPGACLNGGLCLNSIGSFRCQCPLGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFQGHNCENNVDDCPGHKCMNGGLCVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAI
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECHSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYTGTFCEIDIDDCESNPCVNDGICQDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGRLCEINVNNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCNCDPGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDRVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGTCIDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCREDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDKLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNNNECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCFPNPCANHAVCTHTPDYLGYQCNCQPGWQGQLCNIDMNECMSNPCKNRGT
CTNTLGGFVCSCRAGFTGLTCETDINDCFPNPCLSGGSCTDGVNSFHCSCLPGFTGPRCA
LEINECQSFPCKNLGTCTDYVNSYTCSCPPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYACTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGTCQDALESFRCSCPKGFEGSRCQTPIDWC
RRLSLCLNGGRCRQKDASFSCDCPNGWSGRYCDIPNMSCETAARKRGIQTDELCHHGGHC
VNSGNTHICKCPADYTGSYCEIQVDQCEDKPCRNGATCRSYVGGYQCDCMPGYTGQTCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPPLRLRGAPPKCLNNG
TCVDRVGGHRCNCPPGFTGDRCEGDINECLSNPCSSTNSLDCIQLSNDYLCVCKPGFTGR
RCQSRFSVCESQPCHNGGACSVTSIAPLGYTCTCQLGYAGPNCERSMSCQELSCYNGGSC
ALTKRGTRCVCLSGFGGPQCQHHSNDGCSSKPCQNGGLCTEETSSPFFHCQCLSGFMGKR
CEQSKSELPSLSCPRADCQGKANDGVCDKECNTLPCRWDGGDCSLAANPWAHCADPRCWR
AFNNSQCDEFCNNPECLYDNFDCRSKEKICNPIYASYCNAHYADGQCDQGCNTEECGWDG
LDCAETVPEDLANGVLVLVVLLPPDKLLLTGKAFLQKLSAILHTSVRFRLDKNGDAMILP
YTRREARLKRELGHQHEVVGSIVYLEIDNRLCIRDSEDCFPTAKSAADYLGALSATEMLD
FPYPLREVREEKIPVDPISPTEWWYLLTRWMVPCLVFIFILVILVIGMLITRRKREHSTL
WFPEGFFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGLKHMPKTVEESLLGDHSDQWMDSDCPEAKRLK
VEEPSMLSDSEDAVDCRQWTQHHLVAADIRVPPTIALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFT
PLMLASFCGGGLEPEVTEEEESEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYAR
ADAAKRLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALI
LAARLAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLK
EETPLFLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIALERMHHDIVQLLDEYNTVR
SPQGHGAAGHQLAGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKHTPQSKKNRRPGAKGSSLGGQHAASLK
ESVKARNKKLTLDMQSALLDSSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFH
SSMSVPNTPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQINDIGAGAMSMQGRVSMASDVSHGYVLSSGQL
GVNMGMVSPVSVPFDWHNRMPPSSQCGQQVVNIVQSSQAGMHVQSPAMQQQNMLMHQQQL
YRSPMLQPTPVTSAPTISPVKLPSIAEQQQLINHNITNQPSMGPMGRSTPPTPQTSQPPP
SFFQQHQQQLPQQSSQPPVQPTQGAAAAAQPAQVLSSQPSSSAAGNEDYPTPPSQHSFSS
TLDATPKRFHNLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVTVPNQTQITQI
PEANGKMQVFA
NT seq
7416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatatgcaatggattattttctcgcttttattgtgctttcatattggtgaa
gggttccgctgtgtggataaaaacaggccctgtcaaaatggagcgacatgcatagattca
ccctctcgatgcatatgtcgtcccggattcattggccctttctgtcaacacctggatccc
tgtcatcgatccccatgtctgaatggagcagcttgcaagagtgatgtggtcaatgatatt
ccacagtacaaatgtgtgtgccaaagaggtttcagaggccaagactgctccctcattgat
gcttgtgccacaagtccatgtgctaacggggctcgctgtgtcaattggaataaccattac
aactgttcttgcccacccgggtatcaaggaaagaattgccgcagtgacattgatgagtgt
cgcaaacctggtgcttgtctcaatggtggcctgtgtcttaactcgattgggtccttccgc
tgccagtgtccactagggtacagtggtcgtacgtgtgaggtgtctaccttaccctgtgcc
ccatctcagtgtctcaatgggggcacctgtcgccagacaagtgaccattcctatgagtgt
gcttgcctaccaggatttcagggacacaactgtgagaacaatgtggacgactgcccaggt
cacaagtgcatgaatgggggactatgtgtggatggagtcaatacatacaactgccagtgt
ccaccagaatggacgggacaatactgtgctgaagatgtcaatgagtgcctcatgcaacct
aatgcatgccataatggaggcacttgcttcaacactatcggtggtcatacatgcgtctgt
gtcaatggttggactggagatgactgtagtgagaacatcgatgactgtgcaatagctatt
tgcttcaatggtgccacatgccatgaccgtgtagcatccttcttctgcgagtgtccagtt
gggaagacaggtctgctttgtcatctggatgatgcatgtgtcagcaacccttgcaatgag
ggggccgtgtgtgacaccaatccccttaatggtcgtgctatttgcacctgtcccgctggt
tttgttggtggtgcctgcaatcaggatatggatgagtgttccattggtgcaaacccttgt
gagcattttggaaaatgtgtaaacacagaaggctcctttcagtgtcagtgtggtcgtgga
tatgctggcccacgttgtgaaattgacatcaatgaatgccattccatgccctgtcagaat
gatgccacctgcttggaccgcattggagagttcacttgcatatgcatgccaggttatacg
gggactttctgtgaaattgacattgatgactgtgagagcaacccatgtgtgaatgatggc
atctgtcaggacatggtcaacggcttcacttgcacctgtcagccagggtttactggcacc
atgtgtcaaattgacatagatgagtgtgctagcactccctgccagaatggagcaaaatgc
tatgaccggcccaatggatttgagtgccggtgcgctgaaggttatgaagggagactctgt
gaaattaatgtcaacaactgtcaacctgacccatgccaccatggtacttgcatagatggc
attgctagctacacttgtaattgtgatcccggatatacaggctatcgctgtgaaaaccaa
cttaatgagtgccacagcaatccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggatagggtcaat
aagtacatctgtcagtgccagcatggaacttcaggtacaaactgtgagataaactttgat
gattgtgccagtaacccttgtgattatggcatctgcaaagatggcatcaaccgctatgat
tgtgtttgcaaacctggctttacaggtcctaaatgtaacgtggaaatagatgagtgtgca
tctagcccctgtagaaatgggggaacgtgtattgatgaagaaaatggatttcactgtcag
tgtcctgaaggctttaaacccccttactgttactcccaggtggatgagtgtggcagcagc
ccatgtgtccatggctcctgcagagaggacataaacggataccgttgtgactgtgaacct
ggatgggttgggaagaactgtgacctggacaggaatgactgtttaccaagtccttgtcaa
aatgctggaacttgcatagataaacttaatggttttacctgcaagtgtcgccaagggttc
agaggtaacctctgccaggtgaacaacaatgaatgtgcttccagcccctgtctaaacaag
ggaacttgtgtggatggtgttgcaagtttcacatgtctgtgtgagctcccctatagtgga
cctacttgtgctgaggtcctcacaccttgcttccctaacccttgcgccaatcatgcagtc
tgcacccacaccccagactacttgggttatcagtgtaactgccagccagggtggcaaggt
cagttgtgtaacatagatatgaatgaatgcatgtcgaatccctgcaaaaaccgtgggacc
tgcacaaacacgctgggaggctttgtgtgttcctgtagagcaggatttacagggctgact
tgtgaaacagatatcaatgactgttttcccaacccttgcttaagtggaggttcatgtaca
gatggtgtgaactcctttcactgtagttgcttgcctggcttcacaggccctagatgtgcc
ctggaaatcaatgaatgtcaaagtttcccctgtaaaaatttaggcacctgtacagactat
gtcaactcttacacatgtagctgcccacctggctttactggcatccactgtgaaaccaac
attccggattgcactgaaagctcttgctttaatggagggacttgcacggacaaaatcaat
ggctatgcttgcacctgtcgctctggcttcactggctcccactgccagtatgaagtaaac
gaatgtgactctcagccatgtctaaacggaggcacctgtcaagatgccctggagtccttc
cgctgttcctgtccaaagggctttgaaggcagcaggtgccagacaccaattgactggtgc
cgacgcttgtctctgtgcctgaatggaggacgttgccgccaaaaggatgcgtctttcagt
tgtgattgtcctaatggttggtctggacgttactgtgacatcccaaacatgtcttgtgaa
acagcggctcgcaagaggggaatccaaacagatgagctttgccaccatggtggtcactgc
gtcaactctggcaatacacacatttgtaaatgccctgctgactacactgggagctattgt
gaaatacaagtggaccaatgtgaagacaaaccttgtcgcaatggtgccacctgcaggtca
tatgttggcgggtaccagtgtgattgcatgcctggctatactggacagacctgcgagatt
gaaatcaatgagtgccagtctcatccttgccagaatgggggcacttgtattgatttagtt
ggacattatatctgctcctgtccccccggcacactgggtgttctctgtgagattaatgag
gatgactgtgcaccaccactgaggctacgaggtgctccacccaagtgcctcaataacgga
acctgtgtagacagagttggtggtcatcgctgcaattgtccaccgggtttcacaggagac
agatgtgagggagacataaatgagtgtctctcgaacccttgtagttccaccaacagtctt
gactgcatccagttgtccaatgattacctgtgtgtctgcaagcctgggtttacaggacga
aggtgtcagagcaggttcagtgtgtgtgaatctcagccttgtcataacgggggtgcctgt
tcagtaactagcattgcccctctgggatacacctgtacatgtcaacttggttatgctggt
ccaaactgcgaaaggagcatgtcttgtcaggagctgtcttgctacaatgggggaagctgt
gcccttaccaagaggggaacacgctgcgtatgcttgtcaggctttggcgggccccaatgt
cagcatcacagtaatgatgggtgctcttccaagccatgccagaatggaggcctgtgcact
gaagaaaccagctccccatttttccactgccagtgtctaagtggatttatgggaaaacgg
tgcgaacaaagcaaatctgagcttccgtctctctcctgccctagggcagactgtcaaggc
aaagccaatgatggtgtttgtgacaaggaatgtaatacacttccttgtcgttgggatggt
ggtgactgctccctggcagcgaatccctgggctcattgcgcagacccccgctgctggcgt
gccttcaacaatagccagtgtgatgaattctgtaacaaccctgagtgtctgtatgacaac
tttgactgcagaagcaaagagaaaatttgcaatccaatatatgcaagttactgcaacgcc
cattatgctgatggtcagtgtgaccagggctgcaacacagaagagtgtggttgggatggc
ttagattgtgcagagacggttccagaggatcttgccaatggtgttttggtgttggtcgtc
cttctgcctccagacaagctactccttactggcaaagcttttttgcagaaattgagtgct
atcctgcacacttcagtacgcttcagattggacaaaaatggagacgcaatgattcttccc
tacacccgtcgagaggcacgcctcaaacgagaacttggacatcaacatgaagttgttggg
tccatagtctatctggagatagacaaccgtttgtgcattcgggattcagaggactgtttc
ccgacagctaaaagtgcggcagactatcttggagctctatctgcaacagaaatgctcgac
ttcccttatcctcttcgagaagtcagagaagaaaagatccccgttgatcccatttcacca
acggaatggtggtatctacttacccgatggatggtgccatgtttagtgtttatttttatt
ttggtcatccttgtgattggcatgttgataactcgtcggaagcgtgaacacagcaccctt
tggttccctgaaggcttctttcttaagaaggaacccagcagtaacaaaaaccgcagggaa
cctgtgggtcaagatgctcttggactgaaacacatgccaaaaacagttgaggaatctctc
ctcggtgatcacagtgatcagtggatggactcagattgcccagaagccaaacgactcaag
gttgaggagccgagcatgctctctgacagcgaagatgcagtggactgcagacagtggacc
cagcaccatctcgtagctgcagacatccgtgtaccacccacgatagccctcacaccacct
caaggagaatttgaaagtgactgcatggacgttaatgtccgaggcccagatggttttaca
cctctgatgctggcatcattctgtggaggcggcctagaacctgaggtgacagaggaggag
gagagtgaagagtgctctgccaacattatctctgacttaatctaccagggtgcatcgctc
gctgcacaaacagaccgtaccggtgagacagcactccacttggctgctcgctacgcacgt
gctgatgctgcaaagcgcctgctggatgccggagcagacgccaatgctcaagacaacacg
ggacgaacaccgctacatgctgctgtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattttg
attcgaaatcgcgccactgatctggactcccgtatgtacgatggctctactgctctaatc
ctggcagcacgactggcagtggaaggcatggttgaggaactcattacatgccatgcagat
gttaatgcagtcgatgaattgggtaaatctgctttgcattgggctgcagctgtaaacaat
gtagatgcaactattgctctgctgaaaaatggcgccaacaaagatatgcaagatctgaag
gaggagacccctctgttccttgcagcccgtgaaggaagttgtgaggcagtgaaggtgcta
cttgctcactttgcaaatagagaaattacagaccacatggacaggctgccgagagacatt
gctctagagcgtatgcaccacgatattgtacaacttcttgatgaatacaacacagtaagg
agtccccagggtcatggagcagctggacaccaactcgcaggaggccacactctatctcct
ctcatgtgccctcccagtgccttcctccctagtctgaagcacaccccacagagcaagaag
aaccgccggcctggggccaaaggttccagccttggaggccagcatgctgcaagtctcaag
gagtcagtaaaggctcgcaataagaagctaactctggacatgcagagtgccttattggat
agctcggttactctgtccccagtggactccctagactcaccgcacgggggagctagcaat
gctggctacatcaccaatccaacgtcacctgttgccatgcagtcaccaggtcttttccat
tcctccatgtctgttccaaacaccccaatggttcacagtagcatgttggaaggagggggc
ccatttgcggtatctcttgcacaaattaatgacattggagcgggagcaatgtccatgcag
ggccgtgtctctatggcctcagatgtcagccatggctatgtgctgagttctggccagctg
ggggtcaacatgggcatggtcagtcctgtcagtgtgccatttgactggcacaatcgcatg
cctccatcctctcagtgtggtcagcaggttgtgaatattgtgcagagtagtcaagcaggc
atgcatgtccagagtccagccatgcagcagcagaacatgctgatgcaccaacagcagctc
taccgcagtccaatgctgcagcccacaccggttacctcagcgccgaccatcagcccagtg
aagctgccttccattgcagagcaacagcagctcattaatcacaacatcaccaaccagcca
agcatgggtcctatgggaaggtccactccacctaccccccaaacctcacagcctccacca
tcattcttccagcagcatcagcagcagctgcctcagcagtcctctcagcctcctgttcag
cccacccaaggagcagcagcagcagcccagccagctcaggtcctgtcctcccagccaagt
agtagcgctgcagggaacgaggattatccaacacctccttcccaacacagtttttcatcc
acattagatgccacacccaaacgtttccacaatttgcccagtgagcacccctatctgaca
ccctctccagagtctccagagcactggtccagtccctctccccactgcgtctctgattgg
tcagattccacaccaagcccagctgtcactgtccccaaccagacccaaattactcaaatc
ccagaggccaatggcaagatgcaggtgtttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
