Xenopus laevis (African clawed frog): 108706791
Help
Entry
108706791 CDS
T01010
Symbol
fbn3.S
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
xla
Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xla00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
108706791 (fbn3.S)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
108706791 (fbn3.S)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
108706791 (fbn3.S)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
EGF
TB
FXa_inhibition
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108706791
NCBI-ProteinID:
XP_041435769
Xenbase:
XB-GENE-17333678
UniProt:
A0A8J1M260
LinkDB
All DBs
Position
1S:complement(82217271..82358804)
Genome browser
AA seq
2867 aa
AA seq
DB search
MALIWLAKFMLGYTALWYVEQAQGQLEQGDLQVDRFAGQEDKLIPQRVRRRGQDTLRGPN
VCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSTTCGAGIVI
NCNVRCMNGGSCNEESCICQKGYTGTHCGQPICENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQC
ERDYRTGPCFTQISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPSQPHPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSETSQKCEDIDECSTIPN
VCDGGECTNTAGSYVCVCPRGFTTSRDGSRCIDQRVGSCFSALIGGRCAGELPGQFTKAH
CCCESGRCWAIGQIPEMCPVRGSDAFRRLCFEGLPLGPGFGPEVGPGDMRPGETGGNGLR
PVRPGPGGPNGPEVLPGLSIGIGTATLNQTGDICKLFTNLCQNGRCIPTPASYRCECNMG
YKQDSRLECIDVDECSSSPCVHGDCVNTPGSYHCRCHEGYQSNPTKQACIDIDECIMNGV
MCRNGRCVNTEGSFQCICNAGFETTPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICK
PGFVLAPNGRYCVDVDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLGGLTIGIDGRVCVDTHMRS
TCYGVIKKGTCASPFPGAVTKSECCCASPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQALCSSGIGITA
DGRDINECALNSEICPNGICENLRGSYRCICNLGYESDASGKNCVDVDECAVNRLLCDNG
LCRNTPGSYTCTCPKGYVFKLESETCEDINECASNPCVNGVCRNNAGSFVCECSFGSKLD
PTGTICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCEIDPACPRG
YSRKKGVACEDVNECEVFPGVCPNGRCVNTAGSFKCECPEGLTLDGSGRNCVDVRVEQCY
MKWDEDECTGQLPGKYRMDMCCCSVGGAWGIDCEECPKLGSDEYKTLCPRGPGFANRGDV
LSGRPFYKDVNECKVFSSLCIHGTCRNSIGSFRCICDSGFALDAEERNCTDIDECRISPD
LCGHGTCVNTPGSFDCECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGTCINTDGSFECI
CPPGHELTSEGNSCVDINECSLSDNLCRNGRCVNMIGTYQCSCDSGFQSTPDRQGCVDID
ECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSEGYALMPDQRSCADIDECEDNPDICDGGQCTNIPG
EYRCLCFDGFMASLDMKTCIDVNECDLNPNICLHGDCENTKGSFICHCQLGYFVKKGTTG
CTDIDECEVGAHNCDVHASCLNVPGSFKCQCQTGWVGDGLNCVDLDECTTEDHKCNVNAN
CVNTPGSYRCACNEGFNGDGFTCSDVDECADNVNLCENGHCLNAPGGYRCECEMGFTPTE
DSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCICDDGYELDRSGGNCTDVNECADPVNCIN
GLCVNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLETQPRGDGGLSCSAEIGVGVTRA
SCCCSLGRAWGNPCEFCPFANSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGG
NCVNTFGSFQCECPAGYYLNEETRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYM
QVNGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSSNMTKKMCCCSYNIGKAWNKPCEPCPLPATP
EYIFLCGNQAPGFIIDIRTGKPMDIDECSEIPAICSNGVCINQIGSFRCECPMGFSYNNI
LLICEDIDECSSGENLCQRNADCINIPGSYRCECSSGYKLSPSGACVGRNECQEIPNVCS
HGTCMDTEGSYICVCHNGFKASGDQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFE
LTHNNDCMDIDECFSLVGQVCRNGQCINNVGSFQCLCQEGYEITPDGKNCMDINECTSLP
GTCSPGTCQNLEGSFRCICPPGFEVQNDNCIDINECDEEPNICLFGTCTNTPGSFQCVCP
PGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGDPCELCP
QEGSVAFQELCPYGHGSIPGMGDTREDVNECSESPGICVNGICINTDGSFRCECPFGYNL
DYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGGFECACDEGFEPGPMMTCEDINECTNPLLCA
FRCVNTYGSYECTCPSGYTLREDRRMCKDLDECSEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPP
GMQRRQDGEGCMDENECRTKPGICANGRCVNTIGSYKCDCNEGFQVSSSGTECADTRKGF
CFTEVLQIMCQLSSTNRNMVTKSECCCNSGRGWGNQCEICPLPGTGAYKKMCPHGPGFTT
DGRDIDECKVLPNVCKNGQCINTIGSFRCHCKLGYTTDLTGTTCVDLDECAQSPKPCNFI
CKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSFTCKCPPGFIQH
QSSCIDNNECNAQPNLCGSRGICQNNPGSFTCECQKGFSLDSSGSNCEDVDECDGNHRCQ
HGCQNVLGGFRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECASQSTCGSASCYNTLGSFKCVCPSGFD
FDQSFGGCQDVDECSSGGGNPCSYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRAGQGHCVSGMGFGKGSY
LQAPLEEDEENVLSPETCYECKINGYPKRGRQRRNADDINGNEIQNVSLASVDIDAPLNL
TLNISDLANKQHILEFIPALESLENRVRYIISHGNEGGIFRIHQKDGISYLHLGHKKVSM
GIYNLEIASIPLYRKKELQKLEDEKDHNYLSGEVGQTLKMKLHIHLY
NT seq
8604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgcttatatggctggctaaattcatgctgggatatacagcattatggtatgtggaa
caagctcagggtcagctggagcaaggagatcttcaagtggacaggtttgcaggccaagaa
gacaaacttattccccaaagagtacggaggaggggacaagacactctgagagggcctaat
gtttgtggatccagatttcactcatactgttgccctggctggaaaacattaccaggagga
aatcaatgcattgttccaatctgtcgaaactcatgtggagatggcttttgttcacgacct
aacatgtgtacatgctctaatggacagttatctacaacttgtggggctggcatagttatt
aactgtaatgttcggtgcatgaatggaggaagctgtaatgaagagtcttgtatttgccag
aaaggatacactggaactcactgtggacagcctatctgtgaaaatgggtgtcagaatgga
ggacgttgcattggccctaatagatgtgcttgtgtctacggatttactggtcctcagtgt
gaaagagattatcgaactgggccatgcttcacacaaatcagcaaccagatgtgccagggc
cagcttagtggtattgtttgcacaaagactttgtgctgtgctaccattggtcgtgcctgg
ggtcatccatgtgaaatgtgtccttctcaacctcacccttgccgcagaggattcataccc
aatatccgcactggagcttgccaagatgtagatgaatgtcaagccataccaggtctgtgc
cagggaggcaactgtatcaacacggtgggctcctatgaatgtaaatgcccagctggacat
aagcagagtgagacatcccaaaagtgtgaagacattgatgaatgtagcacaatccctaat
gtatgtgatggtggggaatgtactaacacagccggaagttatgtctgtgtgtgtcccaga
ggtttcactacaagccgtgatgggtcgcgttgtattgatcagcgggttggctcgtgtttc
tctgctctgataggtggcagatgtgcaggagaactacctggtcagtttaccaaggctcat
tgctgctgtgaatctgggcgctgctgggccattggccaaatacctgaaatgtgtcctgta
agagggtctgatgcatttcgaagactttgttttgaaggattgcccttaggccctggcttt
ggacctgaagtcggacctggtgacatgcggccaggagaaactggaggaaatgggcttagg
ccagttcgccctggacctggtggaccgaatggacctgaagttttgcctggcttgagcatt
ggcattggaactgcaactttgaatcagactggagatatctgcaaattgttcactaatctg
tgtcagaatggacgctgcatcccaactccagccagctatcgatgcgaatgcaatatggga
tataaacaagatagtcgtttggagtgtatagatgtggatgagtgttcaagtagtccatgt
gtccatggtgattgtgttaacacccctgggtcctatcactgtaggtgtcatgaagggtat
cagagcaaccccaccaaacaggcttgtatagacattgatgagtgcattatgaatggtgtt
atgtgccgaaatggacgctgtgtaaacacagagggaagtttccaatgtatttgtaatgca
ggctttgaaactactccagatggaaagaactgtgttgatcatgatgaatgtgctactaca
aacatgtgtcttaatggaatgtgtatcaacgaggatggcagttttaaatgtatctgtaaa
ccaggatttgtgctggcaccaaatggacgctactgtgttgatgtggatgaatgccagacc
ccaggcatctgcatgaacgggcgctgcatcaataccgaaggctctttccgctgtgaatgt
cttggtggcctaaccatcggcatagatggaagggtctgtgttgatactcacatgcgcagc
acttgttacggtgttatcaaaaagggtacttgtgctagtccttttcctggagctgtcaca
aagtctgaatgttgctgtgccagtcctgatcatggatttggtgagccctgccaaccttgt
ccagccaaaaactctgctgaattccaggctctttgtagcagtggcattggcatcacagca
gatggtagagatattaatgaatgtgccctaaactctgaaatctgccccaatggtatctgt
gagaacctgcgtggcagttatcgatgtatatgcaatctgggctatgaatcagatgctagt
ggaaagaattgtgtggatgttgatgagtgcgctgtgaaccgcctgctctgtgataatggc
ctgtgccgtaacactcctggcagttacacctgcacctgtccaaaaggttatgtcttcaaa
cttgagtcagagacctgtgaagatatcaatgagtgtgcctcaaacccctgtgttaatggt
gtgtgccgaaataatgcaggctcatttgtctgtgagtgctcatttggaagcaaactggat
ccaacaggaactatttgtgtggacagtatgaagggaacatgttggctaaatatacaggat
ggccgctgtgaggtcaacattaatggggcaacattgaagtcagagtgttgtgcaaccttg
ggagctgcctggggtagtccctgtgagcgctgtgagattgatccagcatgcccaagaggg
tattccaggaaaaagggagttgcatgtgaagatgtgaacgagtgtgaggttttccctgga
gtgtgtccaaatggacgttgtgtgaacactgctggctcttttaaatgcgaatgtcctgaa
ggtcttacactggatgggtctggcagaaactgtgtggatgttcgtgtggagcagtgctat
atgaaatgggatgaagatgaatgtacaggccaactgcctggtaaataccggatggacatg
tgctgttgctctgttggaggcgcctggggcattgactgtgaagaatgtcccaaacttggc
agtgatgagtataaaacactctgcccaagaggacctggttttgcaaatagaggcgatgtt
ctctcaggccgtcccttctataaagatgtgaatgaatgtaaagtgtttagtagcctctgc
attcatggaacatgcaggaacagcattggcagctttagatgcatctgtgacagcggtttt
gcactggatgccgaggagaggaattgtacagatattgatgaatgcagaatttcccctgac
ttgtgtggacatgggacttgtgtaaacacacctgggagctttgattgtgaatgttttgat
ggctacgagagtgggttcatgatgatgaagaactgcatggatattgatgagtgcgaaagg
gacccactgctctgcagaggagggacttgcattaatactgatggcagctttgaatgtatt
tgtccacctggccatgaactgacttctgaaggaaattcctgtgtagatataaacgagtgc
tctttaagtgacaatctctgtcgtaatggccgttgcgtcaatatgattggaacttaccag
tgttcatgtgactcaggcttccagtctactcccgataggcaaggttgtgtggacattgat
gaatgtaccatcatgaatggaggatgtgatactcattgtacaaattctgaaggcagttac
gagtgcagctgcagtgaaggttatgctttgatgccggaccagagatcctgtgcagatatt
gatgagtgtgaagacaatcctgatatttgtgatggaggacagtgtaccaacatccctgga
gaatacagatgcctgtgctttgatggtttcatggcctccctagacatgaaaacctgtata
gatgttaatgaatgtgacctcaaccctaatatttgcctacatggagactgtgagaatacc
aaaggttctttcatttgccactgccagctaggttactttgtgaagaaaggaaccacaggc
tgcacagatatagatgaatgtgaagttggagctcataactgtgatgttcatgcctcatgc
cttaatgttcctggaagcttcaaatgccaatgtcaaactggttgggttggagatggatta
aattgcgttgaccttgatgaatgcacaactgaagaccacaaatgtaatgtaaatgctaat
tgtgttaatacccctggatcataccgctgtgcttgcaatgagggatttaatggtgatggc
ttcacttgttccgatgttgatgagtgtgcagacaatgtgaacctctgtgaaaatggtcat
tgcttgaatgctcctggaggatacagatgtgaatgtgagatgggatttactcctactgag
gacagtaaagcatgtcaagatattgatgagtgcacattccagaatatatgtgtttttggg
acatgccagaatttgcctggaatgttccgttgcatctgtgatgatggttatgagctggac
agaagtggaggaaactgcactgatgtaaatgaatgtgctgacccagtgaactgtatcaat
gggctgtgtgttaacactccaggcagttatctgtgcaattgtccacaagactttgagttg
aaccctactggagttggatgtgttgataccagagttggaaactgcttcttggaaacacag
ccccgaggtgatggaggcttatcttgcagtgctgagattggagtgggtgtcacacgagca
tcctgttgctgctctctgggccgtgcttggggcaacccatgtgaattctgtccttttgcc
aactccactgaatacaaaacactttgtccaggaggggagggattcagaccaaacccaatc
actgttattttggaagatattgatgaatgccaagaacttccaggtttgtgccagggagga
aattgtgtgaacacctttgggagcttccagtgtgaatgcccagctggatattacctgaat
gaggaaactagaatctgtgaagatattgatgagtgttctgcacatattggcatttgtggt
cctggcacctgctataacacccttggcaattacacctgtgtttgcccaccagagtatatg
caagtcaatggaggaaataattgcatggatatgagaaaaagcgtttgctatcgcaactat
aatgatacttgcgagaatgagctgtcgtccaatatgaccaagaaaatgtgctgctgttca
tataacattggcaaggcttggaacaagccatgtgaaccatgccctttacccgcaactcct
gaatatatatttctttgtggaaaccaggcccctggattcattattgatatccgtactggc
aaaccgatggatattgatgaatgcagtgaaattccagcaatctgcagcaatggtgtttgt
ataaaccagattggaagcttccgctgtgaatgtccaatgggcttcagctataataatatc
cttcttatctgtgaagatattgatgagtgcagcagtggagaaaatctatgtcagagaaat
gcagactgcatcaacattcctgggtcttataggtgtgaatgctccagtggatacaaattg
tcccccagtggagcctgtgtgggtcgcaatgagtgtcaggagattcctaatgtctgcagc
catggaacatgtatggacacagaaggcagctacatctgtgtctgtcacaatgggtttaaa
gccagtggggaccaaactatgtgtatggatattgatgagtgtgatcgtcagccatgcgga
aatggaacttgcaagaacacagttggttcatacaactgcctctgttttccaggatttgaa
ctcactcacaacaatgactgcatggatattgacgagtgcttttctcttgtgggacaagtc
tgccgcaatggtcaatgcatcaacaatgttggttctttccagtgtctctgtcaagaaggt
tatgagatcactcctgatggcaagaactgcatggatattaatgagtgtaccagtctgcca
ggaacgtgctctcctggaacttgccagaacctggaaggctcttttcgatgcatttgcccc
cctggatttgaagtacaaaatgacaattgtatagatatcaatgaatgtgatgaggagcct
aacatatgcttatttgggacatgtacaaatacacctggtagtttccagtgtgtctgccct
cctgggtttgttctatctgataatggacgtcgatgctttgacacccgccagagtttctgt
ttcactcgattcgataatggaaaatgctctgtcccaaaagctttcaacacaacaaaagca
cggtgctgttgcagcaagatgcctggagagggttggggtgacccttgtgaattgtgccca
caagaaggaagtgttgcctttcaggaactttgtccttatggtcatggctccattcctggc
atgggtgacaccagagaagatgtgaatgaatgttctgagagcccaggaatctgtgtcaat
ggaatctgtattaatactgatggctccttccgatgcgaatgtccgtttggatataatctg
gattacacaggagttaattgtgttgatactgatgaatgctctattggaaacccatgtggc
aatggaacctgttcaaatgttgttgggggctttgagtgtgcttgtgatgaaggttttgaa
cccgggcccatgatgacttgtgaagacattaatgagtgtacaaacccacttctgtgtgct
ttccgctgtgtaaatacatatggctcatatgaatgtacatgtccatctggatataccctg
cgagaggaccgtaggatgtgcaaagatctggatgagtgttccgaaggactgcatgactgt
gaatcacgtggaatgatgtgcaaaaatcttattggtacttttatgtgcatctgcccacct
ggcatgcaacgtcgacaagatggagagggatgtatggatgaaaatgagtgccgtaccaag
ccaggtatttgtgcaaatggccgttgtgtaaataccatcggcagctacaagtgtgactgt
aatgaaggttttcaagtcagcagttctgggacagagtgtgctgatactcgtaaaggattc
tgtttcactgaagttctccaaatcatgtgccaactctcctccaccaaccgtaacatggtc
actaaatctgaatgctgctgtaatagtggacgaggatggggcaatcaatgtgaaatatgc
cccctgcctgggactggagcctacaaaaagatgtgcccacatggacctggtttcaccact
gatggaagagacattgatgagtgcaaagttctgccaaatgtgtgcaagaatggccagtgt
atcaacaccattgggtctttccgctgtcactgcaaactgggctataccaccgaccttact
gggaccacctgtgtggatctggatgaatgtgcccagtcccccaagccatgcaatttcatc
tgcaagaacactgaaggaagttatcagtgctcctgccccagaggctacattctgcaagaa
gatggaaaaacctgcaaagaccttgatgaatgctcaaccaaacagcacaattgtcagttc
ttgtgtgtaaataccattgggagcttcacctgcaagtgtccacctggctttattcagcac
cagtcctcttgtattgataacaatgaatgcaatgctcaacccaacctgtgtggttcacgt
ggaatctgccagaataacccaggtagctttacttgtgaatgtcagaaaggattctcttta
gacagcagtggcagcaactgtgaagatgtcgatgaatgtgatggaaaccaccgatgtcaa
catggctgccaaaatgtccttgggggttttcgatgtgggtgcccacagggctatgttcaa
cactaccaatggaatcagtgtgtagatgagaatgaatgtgcttcccagtctacctgtggg
tctgcctcctgctataacacactgggaagctttaagtgtgtctgcccatctgggtttgat
tttgaccagtcatttggtggctgccaggatgttgatgagtgctcctctggaggaggaaat
ccttgcagttatggctgctccaacacagatggcggttacctgtgtggctgcccagggggt
tactttcgagccggacaagggcactgtgtctcaggaatgggatttgggaagggctcttac
ctacaagctccacttgaagaagatgaagaaaatgtcttgtctccagaaacctgctatgaa
tgcaagatcaatgggtaccccaagagaggaaggcagagacgaaatgcagatgacattaat
ggaaatgagatccagaatgttagccttgctagtgttgacatagatgctccacttaatttg
accctaaacatctcagatcttgccaacaagcagcatatcttggagttcattccagccctg
gaatcactagagaaccgcgtacgctacataatctcccatggtaacgagggtggcattttc
cgcatacatcaaaaagatggtattagctatctacatttaggccataagaaagtttccatg
ggcatatacaacctggagattgccagcataccattatacagaaagaaggaacttcagaaa
ctggaggacgagaaggaccacaactacctcagtggagaagtaggccagacactcaagatg
aaacttcatatacatctttattga
DBGET
integrated database retrieval system