Xenopus laevis (African clawed frog): 108707192
Help
Entry
108707192 CDS
T01010
Symbol
fbn2.S
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
xla
Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xla00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
108707192 (fbn2.S)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
108707192 (fbn2.S)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
108707192 (fbn2.S)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108707192
NCBI-ProteinID:
XP_041436345
Xenbase:
XB-GENE-17330968
UniProt:
A0A8J1M5L9
LinkDB
All DBs
Position
1S:155588597..155724193
Genome browser
AA seq
2893 aa
AA seq
DB search
MLAVPSPSTMPGGDRRTMLLLLGCLLAMLGCATVPGAAGQYVFSAEPSRGAQEAREGTIN
AASRVRRRGQQDALRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNM
CTCSNGQISPNCGSKTIQQCTIRCMNGGTCAEDHCQCQKGFVGAHCGQPVCENVCHNGGR
CIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVSNQMCQGQVTGIVCTKTLCCATIGRAWGH
PCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRSGACQDVDECQAIPGLCLGGNCINTDGSYECKCPVGHKQ
SETTQKCEDIDECTTIPGVCNGGECSNTIGSYYCICPRGYVTSGDGSHCIDQRSGVCFSS
LVNGHCAQEQTGRFTKMQCCCEFGRCWALQSIPEMCPIRGTDEYRSLCIEGVSFGGPGGF
VPNGFGPGGTGFIPGPGGNGFHPGIGGTGIDGQGPIINGGVATLNQTIDICKQYPNLCLN
GRCIPNLPNSYRCECNMGYKQDTQTECIDVDECTSNPCTNGDCVNTPGSYYCKCHSGFQR
TPTKQACIDFDECIQNVIICKHGRCVNTEGSFQCICNAGFELTPDGNNCADHDECSTTNM
CLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLASNGRYCTDIDECQTPGICMNGHCINTEGSYRCDCPP
GLAIGVDGRVCVDTHMRSSCYGGIKKGLCVRPFPGAVTKSECCCANPDYGFGEPCHPCPP
RNSAEFQGLCSGGIGITVDGRDINECALDPDICANGICENLRGSFRCNCNSGFESDSSGK
NCIDIDECLVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFRSDSETCEDINECESSPCVNGAC
RNILGSFSCECSPGSKLDSTGLICVDSLKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGA
AWGSPCERCEIDPTCPRGFARVKGVLCEDVNECEVFPGVCPNGLCLNTKGSFLCECPYGL
TLDGTGRLCQDLRMEHCFLKWDEDECIHPVPGKFRLDACCCAVGGAWGTECEECPKPGSQ
EFELLCPRGPGFTNRGDVLSGRPFYKDINECKAFPGICTNGKCRNTIGSFKCKCNNGFAL
DMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCINTPGSFECECFEGFESGFMMMKNCMDIDECERNP
LLCRGGECINTEGSFLCNCPNGHELTPSGDACVDVNECALSDNLCRNGKCVNIVGTYQCS
CNPGYQSTLDRLGCIDIDECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCLEGYALTPDKRTCTDIDE
CEDNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASMDMKTCIDVNECDINSNICMFGDCENTKG
SFVCHCQVGYAVKKGTTGCTDVDECEIDTHNCHLHATCLNVPGSFKCTCKEGWIGNGLRC
DDQDECLNGTHRCSISSHCLNTPGSFHCSCTEGYTGDGFTCSDVDECSENINLCENGQCL
NIPGSYRCECDMGFTPTTDSRSCQDIDECAFQNICVFGTCSNLPGMFRCICDEGYELDRT
GGNCTDVDECADPINCVNGFCVNTPGRYDCNCPSDFQLNPTGVGCVDTRVGNCYLNHGPR
GDGTISCSTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCEICPPINSSEYNTLCPGGEGFRPNPITI
ILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEETRICEDIDECFTHPGVCGPG
TCYNTLGNYTCICPSEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRTYNGTTCDNELPFNVTKKMCCCTY
NIGKSWSKPCEPCPTPGTANFRNLCGSIPGFTLDIHTGKAVDIDECKEIPGICTNGVCIN
QIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSSGEYFCQRNADCINSPGTYRCECSTGFKLLP
NGACIDHNECLEIPNVCSHGTCVDTEGSYHCVCNNGFKASPDQTMCMDIDECERQPCGNG
TCKNTVGSYNCLCYPGFEVTHNNDCFDIDECSSFFGQVCRNGHCFNEIGSFICLCNEGYE
LTPDGKNCIDINECVAFPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVERDHCIDIDECIEEPNI
CLFGTCSNTPGSFQCICPPGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFENGKCSVPKAYNSTKAKC
CCSKMPGEGWGDPCELCPKEGEVAFQDLCPYGHGTIPGIGDTREDVNECLENPGICTNGH
CINTDGSFRCECPIGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCTNVIGTFECLCDEGFEPG
PMMVCEDVNECILNPLLCAFRCINTYGAYECTCPAGYTLREDQKMCKDLDECIEGFHDCE
SRGMACKNLIGTFMCICPPGMVRRPDGEGCMDENECRTKSGICENGRCVNTIGSYRCECN
EGFQSTPSGTECLDTRQGFCFSEVLQTMCQMSSSSRNHVTKSECCCNGGRGWGNQCEICP
FPGTAQYKKMCPHGPGYTTDGKDIDECKVMPNLCLNGQCINNIGSYRCFCNPGYTTDIGG
KACVDLDECSQSPKPCDFICKNTEGSYHCSCPRGYILQEDGKSCKDLDECQTKQHNCQFL
CVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQANLCGLKGVCQNSPGSFTCECQRGYSLD
STGMNCEDVDECVGTHRCQHGCQNINGGYRCSCPQGFIQHYQWNQCVDENECTTPNTCGS
ASCFNTLGSYKCACPPGFTFDQFSSACHDVNECSSSKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYY
RVGQGHCVSGIGFNRGQYLSVGKENGEDDALSPEGCYECQVNGYTKKTGRIKRDAKDQEL
KRSANNTELPMHGQISLKSLDMDLPLKMALNISYLNSKKHILELLPAIQPLTNHVRYVIT
QGNTNMFRLNQRDGLSYLHASQKILPGTYTLEISSIPLYKRNDIIELEQKHEENYLLGEL
GESLNIRLQIELF
NT seq
8682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttgctgtgccctctccctccacaatgcctggaggagacaggcggacgatgctgctg
ctgctgggctgtttgcttgcaatgctgggatgcgccactgtgcctggagccgcggggcag
tacgtcttcagcgcggaacccagccgaggagcgcaagaggcaagggaaggaaccatcaac
gcagcaagtagggtccgcaggagaggacagcaagatgctcttcgcgggcctaatgtatgt
ggttctcgtttccactcctactgttgccctggatggaaaacacttccgggtggaaatcaa
tgcattgttccaatttgtagaaatagctgtggtgatggattctgttcccgtccaaacatg
tgcacttgctctaatggacaaatatctccaaactgtggttcaaaaacaatacaacagtgc
accatcagatgcatgaatgggggaacttgtgctgaagatcattgtcagtgccaaaaaggt
tttgttggagcacactgtggacaacctgtctgcgaaaacgtctgtcacaatggggggagg
tgtattggaccaaacagatgcgcctgtgtttatggatttactggacctcagtgtgaaaga
gactacagaacaggaccctgttttacgcaagttagtaatcaaatgtgccagggtcaagtc
actggtatagtttgcaccaaaactctttgctgtgccaccattggacgtgcttggggacac
ccgtgtgaaatgtgccctgctcagccacaaccttgcagacgtggttttattccaaacata
cgtagtggagcatgtcaagatgttgatgaatgtcaagcaattccaggtctttgcctgggg
ggcaactgcattaacactgatggatcttatgagtgtaaatgccctgtgggacacaagcaa
agtgaaacaacacagaagtgtgaagatattgatgagtgtaccactatccctggtgtttgt
aacggaggagaatgttcaaacacaattggtagttactattgcatctgtccacgtggttat
gtcacatctggggatggctcgcactgtattgaccaaaggtccggtgtatgtttctccagc
cttgtcaatggtcattgtgctcaagagcagactggcaggtttacaaagatgcagtgctgc
tgtgaatttggccgttgctgggcgttacaatcaattcctgaaatgtgccccatcaggggc
acagatgaatatcgtagtctgtgcattgaaggagtttcattcggaggcccagggggattt
gtccctaatggatttggaccaggaggtactggatttatcccaggacctggtggaaatgga
tttcatcctggtattggaggaactggaatagatggacaaggtccaattatcaatggaggg
gttgcgacactaaatcagacaatagacatctgcaaacaataccccaatctttgtttgaat
ggacgctgtattccaaaccttccaaacagttacagatgtgaatgcaacatgggatacaaa
caggatacacaaactgaatgcattgatgttgatgaatgcacatcaaatccatgcactaac
ggagactgtgttaacacgcctggatcatattattgcaaatgccattcaggttttcagagg
actccaacaaaacaagcttgcattgattttgatgaatgtatccagaatgtaattatttgc
aaacatggccgatgtgtgaacacagagggaagctttcagtgtatatgtaatgctgggttt
gaattgacccctgatggcaacaactgtgcagatcatgacgaatgctccaccacaaatatg
tgtttgaatggaatgtgtataaatgaggacggcagtttcaaatgcatatgcaagcctggc
tttgtactcgcctccaatggtcgctattgcactgatatagatgagtgtcagaccccaggc
atctgcatgaacggtcactgtatcaacactgaaggttcataccgttgtgattgcccacca
ggtttggccattggagtggatggccgtgtttgcgtagacacacatatgcgtagttcatgc
tatgggggaatcaaaaaaggcctctgtgttcgtccttttcctggagctgtgaccaaatct
gaatgttgttgtgccaatccggactatggatttggggaaccttgccatccttgccctccc
cggaattccgctgaatttcaaggtttatgcagtggaggcatcggtattactgttgatgga
agagatatcaacgagtgtgctttggaccctgatatctgtgccaatggaatttgtgaaaac
cttcgtggaagctttcgctgcaattgtaatagtggctttgaatcagattcttcaggcaaa
aattgtatagatattgacgagtgcttagtgaacagactgctatgcgacaatggactttgc
cgaaacacaccaggaagttacagctgtacatgccctaaaggatatgttttcagaagtgat
agtgaaacatgtgaagatataaatgaatgtgaaagtagcccttgtgtcaatggggcttgc
agaaatattcttggctcattcagttgtgagtgttcacctggaagcaaactggattcaact
ggcctcatctgtgtagacagccttaaaggaacatgttggcttaatatacaagatggacga
tgtgaagtcaatataaatggagcaacattgaagtcagaatgctgcgctactttgggagct
gcctggggaagtccatgtgaacgatgtgaaatagaccctacttgccccaggggatttgca
cgagtgaaaggagtcttgtgtgaagatgtcaatgagtgtgaagtgtttccaggtgtgtgt
cccaatggcctgtgtcttaacaccaagggatcttttctctgtgagtgcccgtatggcttg
acattggatggaactgggagactgtgtcaggatcttcgaatggaacactgctttttaaaa
tgggatgaagatgaatgtattcacccagttcctggcaagtttcgcctggatgcttgctgt
tgtgctgttggaggtgcctggggtacggaatgtgaggaatgtccgaaacctggttctcaa
gaatttgaacttttgtgtccaagaggaccaggctttactaatagaggagatgttctatct
ggaagacctttctataaagatattaatgaatgcaaggcgttccccggaatatgtactaat
gggaaatgtagaaacacaattggaagttttaaatgtaaatgcaacaatggctttgctttg
gatatggaggaaagaaattgcacagatattgatgaatgtcgcatctcccctgacctgtgt
ggaagtggcacttgcattaataccccaggaagctttgaatgtgagtgcttcgaaggcttt
gagagtggtttcatgatgatgaagaactgcatggacatagatgaatgtgagaggaaccct
ttgctttgtcgaggtggagaatgtataaacacggagggcagttttctttgcaattgccct
aatgggcatgaacttacaccctcaggagatgcctgcgtagatgtcaatgaatgcgccctt
agtgacaatctttgcagaaatggcaaatgtgtaaacattgttggaacatatcaatgttct
tgcaacccaggataccaatctacactggacaggcttggttgcattgatattgacgagtgc
acaattatgaatggggggtgtgatacacattgtacaaactcagagggcagctatgaatgt
agctgccttgaaggatatgccttgacgccagataagaggacctgcacagacattgatgaa
tgtgaggacaacccagatatctgcgatgggggccagtgtaccaacattcctggagaatac
cgctgcctctgctttgatggatttatggcttccatggatatgaaaacatgtattgatgta
aatgaatgtgatataaactccaacatttgtatgtttggggattgtgagaataccaaagga
tcatttgtatgtcactgtcaggttgggtatgcagtcaaaaagggaacaacaggatgcaca
gacgtggatgagtgtgaaattgacacccataactgtcatctacatgctacatgtttaaat
gtacctggaagctttaagtgtacttgcaaagaagggtggattggaaatggcctaagatgt
gatgatcaggatgagtgtttaaatggaacccatcgatgtagtatatcttcccactgccta
aatacacctggttcattccattgctcttgtactgaaggctacactggagatggatttact
tgctcagatgttgatgagtgctcagaaaatattaatctatgtgagaatggacagtgcctg
aatatcccaggctcctatagatgtgaatgtgacatgggattcactccaactacagacagc
aggtcttgccaagacattgatgaatgcgctttccagaatatatgcgtgtttggaacctgc
agcaaccttccaggaatgttccgttgtatctgtgatgagggatatgaactggatcggact
ggaggaaactgtacagatgtcgatgaatgtgccgatccaattaattgtgttaatggcttt
tgtgttaacactcctgggagatatgattgtaattgtccttcagactttcagctcaaccct
acaggagttggttgtgtcgatacaagagttggcaattgctacctgaaccatggcccccgt
ggcgatggaactatctcttgcagtactgagattggagttggagtgagccgttcttcatgc
tgctgttctcttgggaaagcatggggaaacccatgtgagatctgcccaccaataaacagc
tctgaatacaatacattgtgtccaggaggagaaggattcagacccaaccccataaccatc
attttagaagatattgatgagtgccaagagttaccaggtctctgccaaggtggtaactgt
ataaatacatttggaagcttccagtgtgaatgtccacagggctactatcttagtgaggag
actcgtatttgtgaagatattgatgaatgctttacccaccctggtgtttgtggaccagga
acctgttataataccttagggaattatacatgcatttgcccttcagagtatatgcaagta
aatggaggacataactgcatggatatgcggaagagtttttgttatcgaacctacaatgga
acaacatgtgataatgaactgccttttaatgtaacaaaaaagatgtgctgctgcacctat
aatattgggaaatcctggagcaagccttgtgagccatgcccaaccccaggaacagctaat
tttaggaatctctgtggatctatccctggtttcacgttggatatacacactggcaaagct
gttgacattgatgagtgcaaggagatccctggaatctgtaccaatggagtttgcatcaat
caaattgggagcttccgctgtgaatgcccaacaggatttagctacaatgacttactcctg
gtttgtgaagatattgatgagtgcagcagtggtgaatatttttgtcagagaaatgctgat
tgcattaacagtcctggaacctatcgatgtgaatgctccacaggcttcaagctgttaccc
aatggtgcctgtattgatcacaatgaatgcctggaaattccaaatgtttgtagtcatggt
acatgtgtggacaccgaagggagttatcattgtgtatgtaacaatggatttaaagcttct
cctgatcagacaatgtgcatggatattgatgagtgtgagcggcagccatgtggaaatggg
acttgtaaaaacacagttggctcatataactgtctgtgctaccctggctttgaggtcact
cataataacgactgctttgatattgatgagtgcagctcctttttcgggcaggtgtgcagg
aatggacattgttttaatgaaatcggctccttcatatgtttgtgtaatgaaggttatgaa
cttactccagatggcaaaaactgcattgatattaatgaatgtgtggcttttcctggttca
tgttcccccggcacctgtcagaatcttgaaggctcttttagatgcatctgccctcctgga
tatgaagttgaacgtgatcattgcatcgatattgatgaatgtattgaggagcccaatatc
tgcctttttggaacttgttcaaatacccctggaagttttcagtgtatctgcccaccagga
tttgtactgtcagacaatggaagaaggtgctttgacacgcgtcagagtttctgttttacc
agatttgaaaatggaaaatgttctgtacctaaagcatataacagcactaaagcaaaatgc
tgctgtagcaaaatgccgggtgaaggctggggcgatccatgtgaactatgtccaaaggag
ggagaagtggcatttcaagatttatgtccgtatggacatggtaccatcccaggcattgga
gatacacgagaagatgtcaatgaatgcttagaaaacccaggaatctgtacaaatgggcat
tgtataaatacagatggctcttttcgatgtgaatgcccaattggatataatctagattat
actggtgttaactgtgtagatactgatgaatgttcaattggtaatccatgcggaaacggc
acatgcacaaatgtcattggtacttttgagtgtctatgtgatgaaggctttgaacctgga
cctatgatggtctgtgaagatgttaatgaatgtatattgaatccactactatgtgcattc
cgttgtattaacacttatggggcttatgaatgcacatgtccagcaggatatacgcttagg
gaggaccagaaaatgtgcaaagatcttgatgaatgcatagaaggtttccatgactgtgaa
tctcgaggaatggcttgcaaaaacttgattggaacctttatgtgtatttgcccacctgga
atggtacgaagaccagatggagaagggtgtatggatgaaaatgaatgccgtactaaatct
ggcatctgtgaaaatgggcgatgtgtcaataccattggaagctatcgatgtgaatgcaat
gaaggatttcagtctactccatcaggaacagagtgtctggatactcgccagggattttgc
ttttctgaagttttacaaaccatgtgccagatgtcttcaagcagccgaaaccatgtcaca
aagtctgaatgttgctgtaatggaggaagaggctggggcaaccagtgtgagatctgccct
tttccaggcactgctcagtacaaaaagatgtgcccacatggcccaggatacacaactgat
ggaaaggatattgatgaatgcaaagtgatgccaaatctctgtctaaatgggcaatgtatc
aacaacattggctcttatagatgcttctgcaaccctggctacacaactgacatcgggggt
aaagcgtgcgttgatctcgatgaatgctcacaatctcccaagccctgcgacttcatctgt
aagaatacagagggcagctaccactgttcttgtccacgaggttatattttgcaagaggat
ggaaaaagctgtaaagatctggatgaatgtcaaaccaaacagcataactgccagttcctc
tgtgtcaacaccattggaggttttacttgtaaatgtcccccgggttttacacaacatcac
actgcttgcatcgacaacaatgagtgtggctcacaggctaatttatgtggacttaaagga
gtttgtcagaattcgcctggcagttttacttgcgagtgccaaagaggatattcgctggat
tcgactggaatgaattgtgaagacgttgatgagtgtgttgggactcacagatgtcaacat
ggttgtcagaatatcaatggcggatacaggtgtagctgcccccaggggtttattcagcat
taccagtggaatcaatgtgttgatgaaaatgaatgtactaccccaaacacatgtggttct
gcttcttgcttcaacacattaggcagctacaaatgtgcttgtccacctggatttaccttt
gaccagttttcctctgcatgtcatgatgtcaatgaatgctcaagttcaaagaatccgtgc
aattatggctgttctaacactgaaggaggttatctctgtggatgtcctcctggatactac
agagttgggcaagggcattgtgtgtcaggaataggctttaacagaggccagtatctgtca
gttggcaaagaaaatggcgaggatgatgcgttgtccccagaaggttgttatgaatgtcag
gtcaatggctacacaaagaaaactggaagaatcaaaagagatgctaaagatcaagaactt
aaaagaagtgctaataatacagagcttccaatgcatgggcaaataagcctgaagagccta
gatatggatttgccgctcaaaatggcgctaaacatttcttatctaaactcaaagaagcac
attctggaacttctgccagccatccaaccgctcactaaccacgtacgatacgttattact
caaggcaatactaacatgttccgcctaaaccagagggatggactaagctacctccatgca
tcacaaaagatattgccaggaacttacacactggaaatctctagcattccactttacaag
agaaatgacatcattgaactagaacaaaaacatgaagaaaactacctccttggagaactt
ggggaatctctaaatataagacttcaaatagagttgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system