Xenopus laevis (African clawed frog): 108712669
Help
Entry
108712669 CDS
T01010
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3 isoform X1
KO
K20995
Notch 3
Organism
xla
Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla04330
Notch signaling pathway
xla04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xla00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
108712669
04371 Apelin signaling pathway
108712669
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
Notch
EGF_3
Ank_4
Ank_3
NODP
NOD
Ank_5
EGF_2
cEGF
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
DUF6674
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108712669
NCBI-ProteinID:
XP_018110479
UniProt:
A0A8J0UVV5
LinkDB
All DBs
Position
3S:20843206..20950908
Genome browser
AA seq
2414 aa
AA seq
DB search
MGRSGLCELIWIIAVLISRKGIHGFQCMDSYRPCQNGGRCTMYSNGEASCVCLTSWIGEL
CQFKDPCVPSPCINGGACQSSIRGDTVQYECSCAKGFRGQDCSLIDACASNPCENGARCT
NWNGRYNCTCPPGYQGRSCRVDIDECRTPGLCQNGGQCVNTPGSFHCRCPSGYTGQFCEA
IYVPCAPSQCQNGGTCRQTGDLTYQCACLPGFEGPNCEINVDDCPGHKCMNGGICVDGVN
TYNCQCAPEWTGQYCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTQGGHTCVCVNGWTGESCSENID
DCATAVCFNGATCHDRVASFYCECPMGKTGLLCHLEDACVSNPCHKDAMCDTNPVNGRAI
CTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHFGRCVNTQGSFQCQCGRGYTGPRCETDVNECL
STPCQNDATCLDRIGEFTCICMAGFTGTFCEVNINECESSPCVNGGVCKDVVNGFTCSCP
AGFTGSMCQIDIDECASTPCKNGAKCVDRPNGYECRCAEGFEGPLCDRNIDDCSPDPCHH
GKCRDGIASFTCTCEPGYTGYRCENPINECHSNPCMHGGKCIDLVNRYLCYCQPGTSGVH
CEHNTDDCASKPCDYGECRDGINRYDCVCKPGFTGPLCNIEVSPCESNPCRAGGTCQVTQ
NGFRCLCPEGRGTRDSLCNPTQDPDKELCPPGCVHGVCRKLSDGFSCDCKMGWTGRMCDR
RSSDMCAPNPCQNGGNCIDRQGVPVCHCRDGFRGTTCQIDIDECAMAHCLNGGECVDRIA
GYSCLCALPYTGQKCETILDPCAPDPCHNGGICTPSPNYESYTCLCSAGWKGETCETDID
ECARSPCKNGGFCTNMQGGYSCACISGFKGQDCETDIDDCNPNPCLNGGACKDGINSLAC
TCMPGFTGSRCADEINECLSNPCCNGATCKDYVNSYVCSCAPGYTGPICETNIQDCTESS
CFNGGTCVDGVNSYTCLCRPGFTGSHCQNEVDECASRPCQNRAVCVDGVESYRCICPYGY
TGAQCENLVDLCRRSPCQKGGRCTQTGPSFHCECPAGWAGSYCDVPRVSCEVAAAKRNVR
ADQLCHSGGICVNAGSSHHCICRGGYTGSYCENPINQCDPDPCHNGGACHSYLGGYVCEC
PSGYEGKNCEYDIKECQSHPCQNAGTCIDLIGRYICSCPPGTLGVLCEINEDDCSPFSSS
GPPKCLNNGTCVDKVGGYRCNCPPGYTGERCEGDINECLSGPCHTQNTRHCVQLANDYQC
ICKSGYTGRCCQSVVNTCESRPCRNGGVCSVTVNTPLGYTCRCPLGFTGPSCERLPLSCR
ELSCPSGSTCLPPPLGPRCICRPGVLCRTPNNTSSLTPAPSPCSNVPCRNGATCIPNIHF
PYYQCKCPPGTSGPRCDAQTPRILIQTPAPGCVPSQCPGKAGDGHCDRECNVAMCQWDGG
DCSLSVDDPWRNCPRQECRSLFNNSQCDKECTSADCLYDNFDCRGREERSCNPVYEQYCM
DHYGDGRCDQGCNLEECGWDGLDCAKSSDKEVLADGVLVVVVLISPNELLKQSTAFLQRL
SSILHTSLRYCTDSNGNYKIKPYRRSQMLDGRKKRELDSDIIGSEVMLEIDNRICVKETP
DCFPNAETAARFLAALSALERLQFPYPIKAVRCEIIEEVPDNSRFLPLFGVAGVLILIVA
VLGVVVSRRKRTHSTLWFPEGFILKKDRDRREPVGQDALGLKNIAKAERLMEDPSEDWTE
TDCPETKKLKTEELSPCRQDPVDPRPWTQHHLAAADIRLPPATALTPPQGDYESDGMDVN
VRGPDGFTPLMLASFLGGGLEPESQEEDEEGEASAITDLICQGASLGAQTDRTGETALHL
AARYSRADAAKRLLDAGADPNAQDHTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRSTDLDARMGD
GYTALILAARLAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNIEATLALLKHGANK
DMQDSKEETPLFLAAREGSYEAAKVLLDHYANREITDHMDRLPRDIAQERLHHDIVQLLE
EHNTVRNSQDPMGGHTMSPLLCHPNGFMGNVKQTPQGRKNRRVNAKANGASLSRAEAKDA
KGRGKKLSLDCHSGNGALLESSVNLSPVDSLDSPRAYSANPGSPVMPAPGNFSLGSLSMP
STPLVNGLMEGPFAVSLARLNELGDAQGIEMMALQGRVPLQRTPSCVVNSLNLGMINTNP
MPFIWQNAGPPSHPSSRNVMTGAPAASVPNLHQLHAQQVVMMQNQMAMRSPVKMSMDQQC
QMVSIPLNPVHMRQQSMPHVNERSIQPLTPTEGSYFKQQSMPNDGTIQTSPAMSVAPQQT
FAPSQEDTPKHYLHIPNEHPYLTPSPESPEQWSSPSPHSVSEWSGTTPSPIVVGATHGQA
PHIPEQGSNMQVFA
NT seq
7245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtcggtcggggctgtgcgaacttatctggatcattgctgtactgatcagtcggaaa
ggaatccatggttttcagtgtatggattcctacagaccatgccaaaatggaggccgatgt
acaatgtattccaatggagaagcttcctgtgtctgtctcacttcatggattggggagctg
tgccaatttaaagacccctgtgttccctcgccctgtattaatggaggggcctgccagagt
tctatccgaggggatactgtacagtacgaatgcagctgtgccaagggattcagaggacaa
gattgttccctcattgatgcttgtgcttcaaacccctgtgagaatggtgcacgctgcact
aactggaatggccgctataattgcacttgcccgcccggctatcagggccgcagctgccgt
gtggatatagatgaatgtcgcacccctgggctctgccaaaatggaggacaatgtgttaat
acccctggttccttccactgccgctgccccagtggttacacagggcaattctgtgaagct
atttatgtgccttgtgccccctcccagtgccaaaacgggggaacctgcagacagactgga
gatctaacctaccagtgtgcttgccttcctggttttgaaggaccaaactgtgagataaat
gtggatgattgcccaggacacaagtgtatgaatggcggcatatgtgtggatggcgtgaat
acctacaactgccagtgtgccccagaatggacaggccagtactgcacagaggatgtggat
gaatgccagcttcaacccaatgcctgtcacaacggaggcacctgcttcaacacccaggga
ggccacacttgtgtttgtgtaaatggctggacgggggagagctgcagtgagaatattgat
gactgtgctacagctgtgtgcttcaatggagccacctgccatgatcgagtggcctccttc
tactgcgagtgtcccatgggcaagacaggtcttctgtgtcatttggaagatgcttgtgtt
agcaacccttgtcacaaagatgccatgtgtgataccaacccagtgaatggacgtgctatc
tgcacctgcccacccggattcacaggtggagcctgcgaccaggatgtggatgagtgctct
ataggtgctaacccctgtgaacactttggacgctgtgttaacactcagggctccttccaa
tgtcagtgtggacggggctatacaggtccccgttgtgagacagacgtaaacgagtgcctt
tccaccccatgtcaaaatgacgccacctgtttagaccgaattggagagtttacttgtatc
tgcatggctggattcactggaacattctgtgaagtgaatataaacgagtgtgagagcagc
ccatgtgtaaatgggggagtctgcaaggatgtggttaatggattcacttgcagctgtcca
gctgggtttaccggctccatgtgtcaaatcgatatagatgagtgtgccagtacgccatgc
aagaatggagctaaatgtgtggatagacccaatgggtacgagtgtcgttgtgccgagggt
ttcgaggggccactatgtgatcgtaacattgatgactgctcccctgatccctgtcatcat
ggaaaatgtcgggatggcattgccagtttcacctgcacgtgcgaaccagggtacacaggc
tatcgttgtgaaaatccgataaacgagtgccacagcaacccatgtatgcatggaggaaag
tgtattgaccttgtcaacagatacctctgttactgtcaaccaggaacctcaggtgtgcac
tgtgagcacaatactgatgattgtgccagtaaaccttgtgactacggggagtgcagagat
ggcatcaaccgatatgactgtgtatgcaaaccagggttcacagggcctctctgcaacatt
gaggtgtctccctgtgagtccaacccatgccgtgctgggggcacctgccaggttacacaa
aatggcttccggtgcctctgccctgaaggacgaggaacacgtgactctttatgcaacccc
acccaagatcctgataaagagctctgtccaccaggttgtgtgcatggggtttgccgcaaa
ctctcagacggattctcctgtgattgtaagatgggctggactgggagaatgtgcgatcgg
aggagtagtgatatgtgtgcccccaatccttgccagaatggaggaaattgtattgaccgc
caaggagtgcctgtctgccactgcagggatggatttagaggtaccacatgtcagattgat
attgacgagtgtgctatggcccactgtctgaatggaggggagtgtgtggaccgtattgca
ggatacagctgcctctgtgctttgccctatacaggccagaaatgtgaaaccatcctggac
ccttgtgctcctgatccttgtcataatggtggcatttgcacaccgagccctaactatgaa
agctacacttgcctgtgttctgctggatggaaaggggaaacatgtgagactgacattgat
gagtgtgctcggagtccatgcaagaatggaggcttttgtaccaacatgcaaggtggatac
agttgtgcgtgcatatctggatttaaagggcaagactgcgaaactgatattgatgactgt
aatcccaatccctgcctcaatggtggcgcctgtaaagatggaataaactccttagcttgc
acctgcatgccgggtttcaccggatctcggtgcgcagatgagatcaacgagtgcctgagc
aatccctgctgtaatggggccacctgcaaggattacgtcaacagctatgtttgttcttgt
gctccaggctacacaggtcctatatgcgaaacaaacatccaggactgcacagaaagttcc
tgcttcaatggcggcacgtgtgtggacggagtcaattcttacacctgcctgtgccgacct
ggctttacaggctcccactgccagaatgaagttgatgaatgtgcatcgaggccttgccag
aatagagctgtgtgcgtggatggagtggagtcttatcgctgtatttgtccttatggttac
acaggcgcccagtgtgagaatttggtcgatctctgtcggcgctctccttgccagaaagga
ggccgttgtactcagacaggtccttccttccactgtgagtgccctgcaggttgggctggc
agttactgcgatgttccacgagtgtcctgtgaggtggcggcagccaagagaaatgtacgt
gccgatcagctctgccactctggtgggatctgtgtgaatgctggaagctcccatcattgt
atctgcagagggggttatacaggcagctactgtgagaatccaattaaccagtgtgaccca
gatccctgtcacaatggaggggcttgccacagctatctgggtggctacgtgtgtgagtgc
ccttctggatatgaagggaagaactgcgagtacgatataaaagaatgccagtctcacccg
tgccagaatgctggtacatgcattgatctgattggtcgttatatatgttcctgtccacct
gggacacttggtgtgctgtgtgaaattaatgaggatgactgctctccattctcaagctct
ggaccaccgaagtgcttaaataatggaacatgtgtagacaaagttggaggctaccgctgt
aactgcccaccagggtacacaggagagaggtgtgagggcgatattaatgaatgtctgtct
ggaccctgtcacactcagaatacccgtcactgtgtccaactggccaatgactaccagtgc
atctgcaagagtggctatactggacgatgctgccaaagtgtagtgaacacctgtgagtcc
cgtccatgccgaaatggaggcgtgtgcagtgttactgttaacacaccacttggctacacc
tgccgttgtcctctgggttttacaggtccctcttgtgagcgactacccctttcttgtcgg
gaactttcctgcccttctggttctacttgtcttcctcctccactaggccctcgctgtatc
tgccgtcctggtgttctctgtcgcacccctaacaacacctcttctctgacccctgcaccc
tcaccctgttctaatgtaccttgtcgtaatggagccacttgtattcccaatatccatttc
ccttactaccagtgtaagtgccctcctggcacatccgggccacgatgcgatgcgcaaacc
ccccgaattctaatccaaaccccagccccagggtgtgtcccatcacaatgtccaggaaag
gcaggagatgggcattgtgaccgggagtgtaatgttgccatgtgccagtgggatggtgga
gactgttccctgagtgtggatgatccttggaggaattgcccacgtcaagaatgccgctca
cttttcaacaattctcagtgtgataaagagtgcacctctgccgactgcctgtacgataac
tttgactgccgtggaagggaggaacggagctgcaaccctgtgtatgagcagtactgtatg
gatcattatggtgatggccgctgtgaccagggatgtaaccttgaggaatgtggctgggac
ggcttggactgtgccaagagctcagataaggaggttttggcagatggagtgctggtcgtg
gttgtgcttatttcccctaatgagttgttgaaacagagcactgcattccttcagcggctc
agctccatcctacatacaagtttgcgctactgcactgatagcaatggcaattataagatt
aaaccttaccggagaagccaaatgctggatggaaggaagaagagggaactggacagcgat
atcattggttcggaagttatgttggagattgataaccgaatttgtgtgaaggagacaccc
gactgcttcccaaatgctgaaactgcggcccggtttcttgcagctctaagtgcactagag
aggctgcagtttccctatccaatcaaagctgtgcgctgtgagatcattgaagaagtgcca
gataactcccgcttcctgccattatttggggtggctggtgtgctcatcttgatcgttgca
gtactgggcgtcgttgtttctcgcagaaagagaacacatagcaccctctggttcccagag
ggctttatattgaagaaagacagagaccggcgagagcccgtgggacaggatgctctggga
ctcaaaaacattgctaaagcagaacgtctcatggaagacccttcggaagactggacagag
acggattgccctgagactaagaaactaaagacagaggagctttccccatgtagacaggac
cctgttgacccacgtccatggacccagcatcacctggcagctgctgacatcagactccct
cctgccaccgcacttaccccaccacagggtgactacgagagtgatggaatggatgtcaat
gtgagaggaccagatggcttcactcccctgatgctagcctcattcttgggtgggggactg
gaacccgagtcacaggaagaagatgaggaaggggaagcttctgctattactgatcttatc
tgccagggggcctctcttggagcccagactgaccgaacaggtgagacggccctacacctt
gctgcacgctattcccgagctgatgctgccaagagactactggatgctggagcagacccc
aatgcacaagatcacaccggccgcaccccactccatgctgctgtagctgctgatgcacag
ggagttttccagattctgatccgaaaccggtccacagacctggatgcacgtatgggcgat
ggttatactgcactaattctggcagcgcgattggctgtggaagggatggtggaagaactg
attacttgtcatgctgatgtcaacgctgtggatgaactcggtaaatcggctcttcactgg
gcagcagctgtgaataacattgaggcaaccctagctctgctgaagcacggagctaataaa
gacatgcaggacagcaaggaggagaccccgctgtttcttgctgcccgtgaaggtagttac
gaagctgctaaagttcttcttgatcactacgccaaccgtgagatcactgaccacatggac
cggctccctcgtgacattgcacaagagcggttgcaccacgacattgtgcagcttttggag
gaacacaacactgtcaggaattcccaggaccccatgggtggacacaccatgtcaccactc
ctctgccatcctaacggctttatgggcaacgtgaagcagaccccacaagggaggaagaac
cggagggtaaatgctaaagctaatggggccagtctgagccgggcagaagccaaggatgca
aagggcaggggcaagaagctatctcttgactgtcactctggaaatggggcattgttggag
agttcagtcaatctctcacctgttgactcccttgattcaccccgtgcttatagtgctaat
ccaggatctcctgtgatgccagcaccagggaacttcagccttggttccctgtctatgccc
tctacccctcttgtgaatgggctgatggaagggccctttgccgtgtcactggcaaggctg
aatgagttgggtgatgcccaagggattgaaatgatggcattacagggcagagttcctttg
cagagaacaccaagctgtgtggtgaatagcttgaatctgggtatgataaacacaaacccc
atgccctttatatggcagaatgccgggccaccttctcatccatcatctcgcaatgttatg
accggagctcctgcagcctctgttcccaacttgcaccagctccacgctcagcaggtggta
atgatgcagaatcagatggcgatgcggagcccggtgaagatgtcgatggatcagcagtgc
cagatggtgtccatacccctcaaccccgtgcacatgagacagcaaagtatgccacatgtt
aatgagaggtcaatccagccgctgaccccaaccgaaggcagttacttcaaacagcagagt
atgcccaatgatggcaccatccagacatcaccagccatgtctgttgctcctcagcagacc
ttcgcaccctctcaagaggacacacctaaacactacctgcacattcccaatgagcaccca
tacctgacaccctctcctgagtcacctgagcagtggtccagcccgtcccctcactctgtg
tccgagtggtctggtaccacccctagccccatagtggtgggggcaacgcatggacaggca
ccccacataccagagcagggcagcaacatgcaggtgtttgcctga
DBGET
integrated database retrieval system
