KEGG   Xenopus laevis (African clawed frog): 397738
Entry
397738            CDS       T01010                                 
Symbol
col2a1.L, col11a3, col2a1, col2a1-a, col2a1-b, col2a1a, xcol2a1
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(II) chain precursor
  KO
K19719  collagen type II alpha
Organism
xla  Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla04510  Focal adhesion
xla04512  ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:xla00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    397738 (col2a1.L)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    397738 (col2a1.L)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:xla00536]
    397738 (col2a1.L)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:xla00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   397738 (col2a1.L)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC TILa
Other DBs
NCBI-GeneID: 397738
NCBI-ProteinID: NP_001081258
Xenbase: XB-GENE-6252613
UniProt: Q91717 A0A974DPQ7
LinkDB
Position
2L:151436730..151485461
AA seq 1486 aa
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NT seq 4461 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system