Xenopus laevis (African clawed frog): 734223
Help
Entry
734223 CDS
T01010
Symbol
fbn3.L
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
xla
Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xla00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
734223 (fbn3.L)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
734223 (fbn3.L)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
734223 (fbn3.L)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
TB
FXa_inhibition
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
734223
NCBI-ProteinID:
XP_018109436
Xenbase:
XB-GENE-1217680
UniProt:
A0A1L8HW58
A0A974I3S6
LinkDB
All DBs
Position
1L:complement(99251870..99385699)
Genome browser
AA seq
2864 aa
AA seq
DB search
MALIWLAKFMLGYTVLWYVKQALGQMEQGDLHVDRFAGQEDKLIPQRVRRRGQDTLRGPN
VCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSTTCGAGIVF
NCNVRCMNGGSCNEDSCACQKGYTGTHCGQPICENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQC
ERDYRTGPCFTQISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSETSQKCEDINECSTIPN
VCDGGECTNTAGSYVCVCPRGFTTSRDGSRCIDQRVGSCFSALIGGRCAGELPGQFTKAH
CCCESGRCWAIGQIPEMCPVRGSDAYRRLCIEGLPLGPGFGPEVGPGDMRPGETGGNGIR
PVRPGPNGPEVLPGLSTGIGTATLNQTGDICKLFTNLCQNGRCIPTPASYRCECNMGYKQ
DSRLECIDVDECSSSPCIHGDCVNTPGSYHCRCHEGYQSNPTKQACIDIDECIMNGVMCR
NGRCVNTEGSFQCICNAGFETTPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGF
VLAPNGRYCVDVDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLGGLTIGIDGRVCVDTHMRSTCY
GAIKKGTCARPFPGAVTKSECCCASPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQALCSSGIGITADGR
DINECALNSEICPNGICENLRGSYRCICNLGYESDASGKNCVDVDECAVNRLLCDNGLCR
NTPGSYTCTCPKGYVFRLESETCEDINECASNPCVNGVCRNNAGSFVCECSFGSKLDPTG
TICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCEIDPACPRGYSR
KKGVACEDVNECEVFPGVCPNGRCVNTAGSFKCECPEGLTLDGSGRNCVDVRVEQCYMKW
DEDECTTQLPGKYRMDMCCCSVGAAWGIDCEECPKPASDEFKTLCPRGPGFANRGDVLSG
RPFYKDVNECKVFNSLCTHGTCRNSIGSFRCICDSGFALDAEERNCTDIDECRISPDLCG
HGTCVNTPGSFDCECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGTCINIDGSFECICPP
GHELTSEGNACVDINECSLSDNLCRNGRCINMIGTYQCSCDSGFQSTPDRQGCVDIDECT
IMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSEGYALMPDQRSCADIDECEDNPDICDGGQCTNIPGEYR
CLCFDGFMASLDMKACIDVNECDLNPNICLHGDCENTKGSFICHCQLGYFVKKGTTGCTD
IDECEVGAHNCDVHASCLNVPGSFKCQCQIGWVGDGLNCVDLDECTTEDHKCNANANCVN
TPGSYRCACNEGFNGDGFTCSDVDECADNVNLCENGHCLNAPGGYRCECEMGFTPTEDSK
ACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCICDDGYELDRSGGNCTDVNECADPVNCINGLC
VNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLETQPRGDGGLSCSAEIGVGVTRASCC
CSLGRAWGNPCEFCPFANSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGNCV
NTFGSFHCECPAGYYLNEETRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQVN
GGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSSNMTKKMCCCSYNIGKAWNKPCEPCPSPATPEYI
FLCGNQAPGFIIDIRTGKPMDIDECSEIPAICSNGVCINQIGSFRCECPMGFSYNNILLI
CEDIDECSSGENLCQRNADCINIPGSYRCECSSGYKLSPSGACVGRNECQEIPNVCSHGT
CMDTEGSYICVCHNGFKASGDQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFELTH
NNDCMDIDECSSLVGQVCRNGQCINNVGSFQCLCQEGYEITPDGKNCMDINECTSLPATC
SPGTCQNLEGSFRCICPPGFEVQNDNCIDINECDEEPNICLFGTCTNTPGSFQCVCPPGF
VLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGDPCELCPQEG
SVAFQELCPYGHGSIPGMGDTREDVNECSESPGICVNGVCINTDGSFRCECPFGYNLDYT
GVNCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGGFECACDEGFEPGPMMTCEDINECTNPLLCAFRC
INTYGSYECTCPSGYTLREDQRMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGLQ
RRPDGEGCMDENECRTKPGICANGRCVNTIGSYKCDCNEGFQVSSSGTECVDTRQGFCFT
EVLQTMCQLSSTNRNMVTKSECCCNSGRGWGNQCEICPLPGTGAFKKMCPHGPGFSTDGR
DIDECKVLPNLCKNGQCINTIGSFRCHCKLGYTTDITGTTCVDLDECAQSPKPCNFICKN
TEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSFTCKCPPGFTQHQSS
CIDNNECNAQPNLCGSRGTCQNNPGSFTCECQKGFSLDNSGSNCEDVDECDGNHRCQHGC
QNVLGGFRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECASQSACGSASCYNTLGSFKCVCPSGFDFDQ
SFGGCQDVDECSSGGGNPCSYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRAGQGHCVSGMGFGKGSYLQA
PVEEDEENVLSPESCYECKINGYPKRGRQRRNADDINGNEIQNVSLASVDIDAPLNMTLN
ISDLANKQHILEFIPALESLENRVRYIISHGNEGGIFHIHQRDGISYLHLGHKKVATGIY
NLEIASVSLYRKKELQKLEDEKDHNYLSGEVGQTLKMKLHIHLY
NT seq
8595 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgcttatatggctggctaagttcatgctgggatatacagtgttatggtatgtgaaa
caagctctgggtcagatggagcaaggagatcttcatgtggacaggtttgcaggccaagaa
gacaaactaattccccaaagagtacggaggaggggacaagacactcttagagggcctaat
gtttgtggatccagatttcactcatactgttgtcctggctggaaaacattaccaggagga
aaccagtgcattgttccaatttgtcggaactcatgtggagatggcttttgttcacggcct
aacatgtgtacttgctctaatggacagttatctacaacttgtggggctggcatagttttt
aactgtaatgttcggtgcatgaatggaggaagctgtaatgaagattcctgtgcttgccag
aaaggatacaccggcactcactgtggacagcctatctgtgaaaatggatgtcagaatgga
gggcgttgcattggccctaacagatgtgcttgtgtctatgggtttactggtcctcagtgt
gaaagagattatcgcacaggcccatgcttcacacagatcagcaaccagatgtgtcagggc
cagcttagtggtattgtgtgcacaaagactttgtgttgtgctaccattggtcgtgcttgg
ggtcacccatgtgaaatgtgtcctgctcaacctcacccttgccgcagaggttttataccc
aacatccgcactggagcttgccaagatgtagatgaatgtcaagccattccaggtctgtgc
cagggaggcaactgtatcaacactgtgggctcctatgaatgtaaatgcccagctggacat
aagcagagtgagacatcccaaaagtgtgaagatattaatgaatgcagcacaatccccaat
gtatgtgatggtggggaatgtactaacacagccggaagttatgtctgtgtgtgtcccaga
ggtttcactacaagccgtgatgggtcccgttgcattgatcagcgggttggctcatgtttc
tcagctctgatagggggcagatgtgctggagaactacctggtcagtttaccaaggctcat
tgctgctgtgaatctggacgctgttgggccattggccaaatacctgaaatgtgtcctgta
cgagggtctgatgcataccgaagactttgcattgaagggttgcccttaggtcctggattt
ggacctgaagtaggacctggtgacatgagaccaggagaaactggaggtaatggcatacgg
ccagttcgtcctggaccaaatgggcctgaagttttgcctggcttgagcactggcattgga
actgcaactttgaatcagactggagatatctgcaaattgtttactaatctgtgtcagaat
ggacgctgcataccaactccagccagttatcgatgtgaatgcaatatgggatataaacaa
gatagtcgtttggagtgtatcgatgtggatgagtgttcaagtagtccttgtatccatggt
gattgtgtgaacaccccagggtcctaccactgcaggtgccatgaagggtaccaaagcaat
cctaccaaacaggcttgcattgacattgatgagtgcatcatgaatggtgtgatgtgccga
aatggacgttgtgtaaacacagagggaagcttccaatgtatttgtaatgctggctttgaa
actactccagatgggaagaactgtgttgatcatgatgaatgtgcaactacaaacatgtgt
cttaatggaatgtgtatcaacgaggatggcagttttaaatgtatttgtaaaccaggattt
gtgctggcaccaaatggacgctactgtgttgacgtggatgaatgccagaccccaggcatc
tgcatgaatgggcgctgcatcaataccgaaggctctttccgttgtgaatgtcttggtggc
ctaaccattggcatagatggaagggtctgtgttgatactcacatgcgcagcacctgttat
ggtgctatcaaaaagggtacttgtgctcgtccttttcctggagctgtcacaaagtctgaa
tgttgctgtgccagtcctgatcatggatttggtgagccctgccagccttgtccagcaaaa
aactctgctgaattccaggctctttgtagcagtggcattggcatcacagcagatggtaga
gatattaatgaatgtgccctaaactctgagatctgccccaatggtatatgtgagaacctg
cgtggcagttatcgctgtatatgcaatctgggctatgaatcagatgctagtggaaagaac
tgtgtggatgttgatgagtgtgctgtcaaccgcctgctttgtgataacggcctgtgccgt
aacactcctggcagctatacctgcacctgtcctaaaggttacgtcttcagacttgagtca
gagacctgtgaagatatcaacgagtgtgcctcaaacccttgtgttaatggtgtgtgtcga
aataatgcaggatcatttgtctgcgagtgctcatttggaagcaaactggatccaacagga
actatttgtgtcgatagtatgaagggaacttgctggctaaatatacaggatggccgttgt
gaggtcaacattaatggggctacattgaagtcagagtgttgtgctaccttgggagctgcc
tggggtagtccctgtgaacgctgtgagattgatccagcatgcccaagggggtattccagg
aaaaagggagttgcgtgtgaagatgtaaacgagtgtgaggtcttccctggagtgtgtcca
aatggacgttgtgtgaatactgctggttcttttaaatgcgagtgtccagaaggtcttaca
ctggatgggtctggcagaaactgtgtggatgttcgtgtagagcagtgctatatgaaatgg
gatgaagatgaatgtacaacccaactgcctggtaaataccggatggacatgtgctgctgc
tctgttggggctgcctggggcattgactgtgaagaatgtcccaaacctgccagtgatgag
tttaaaacactctgcccaagaggacctggttttgcaaacagaggagatgttctttcaggc
cgtcccttctataaagatgtaaatgaatgtaaagtgtttaatagtctctgcactcatgga
acatgcaggaacagtattggcagttttagatgtatctgtgacagtggttttgcactggat
gccgaggagaggaattgtacagatattgacgaatgcagaatttcccctgacttgtgtgga
catggtacttgtgtaaacacacctggcagctttgactgtgaatgttttgatggctacgag
agtgggttcatgatgatgaagaactgcatggatattgatgagtgcgaaagggatccactg
ctctgcagaggaggaacttgcattaatattgatggcagctttgaatgtatttgtccacct
ggtcatgaactgacttctgaaggaaatgcctgtgtggatataaatgagtgctctttgagt
gataatctctgtcgtaatggtcgttgcatcaatatgattggaacttaccagtgttcatgt
gactcaggtttccagtctactcctgatcggcaaggttgtgtggacattgatgaatgtacc
atcatgaatggaggatgtgatactcattgtacaaactctgaaggcagttatgagtgcagc
tgcagtgaaggatatgctctgatgccagaccagagatcctgtgcagatattgatgagtgt
gaagacaatccagatatttgtgatggaggacagtgtacaaacatccctggagaatacagg
tgcctgtgctttgatggtttcatggcttccttagacatgaaggcctgtatagatgttaat
gaatgtgacctcaaccctaatatttgcctacatggagactgtgagaataccaaaggttct
ttcatctgccactgccagctaggttattttgtgaagaaaggaaccacaggctgcacggat
attgatgaatgtgaagttggagctcataactgtgatgttcatgcctcttgcctaaatgtt
cctgggagctttaaatgccaatgtcagattggttgggttggagatggcttaaattgtgtt
gacctcgatgaatgcacaactgaagaccacaaatgtaatgcaaatgctaattgtgttaat
acccctgggtcataccgatgcgcctgcaatgagggatttaatggtgatggcttcacttgc
tccgatgttgatgagtgtgcagacaacgtgaacctgtgtgaaaatgggcattgcctaaat
gctcctggagggtacagatgtgagtgtgagatgggatttactcctactgaggacagtaaa
gcatgccaagatatcgatgagtgcacattccagaatatatgtgtttttgggacatgccag
aatttgcctggaatgttccgttgcatctgtgatgatggttatgagctggacagaagtgga
ggaaactgtactgatgtaaatgaatgtgctgacccagtgaactgtatcaatggtctgtgc
gttaacactccaggcagctatctgtgcaactgtccacaagactttgagctgaaccccact
ggagttggctgtgttgataccagagttggaaactgcttcttggaaactcagccccggggt
gatggaggcttatcttgcagtgcagagattggagtgggtgtcacacgggcatcctgttgc
tgctccctaggtcgtgcttggggcaacccatgtgaattctgcccttttgccaactccact
gaatataaaacactttgtccaggaggggagggattcagaccaaaccccatcactgttatt
ttggaagacattgatgagtgccaagaacttccaggtttgtgtcagggaggaaactgtgtg
aacacctttgggagcttccactgtgaatgcccagctggatactacctgaatgaagaaact
agaatctgtgaagatattgatgagtgttctgcacatattggcatctgtggtcctggcacc
tgctataacacccttggcaattacacctgcgtttgcccaccagagtatatgcaagtcaat
ggaggaaataattgcatggatatgagaaaaagtgtgtgctaccgcaactataatgacact
tgcgaaaatgagctatcttccaatatgaccaaaaaaatgtgctgctgttcatataacata
ggcaaagcttggaacaagccatgtgaaccttgcccttcacctgcaactcctgaatatata
tttctttgtggaaaccaggcccctggattcattattgatattcgtactggcaaaccaatg
gatattgatgaatgcagtgaaatcccagcaatctgcagcaatggtgtttgtataaaccag
attggaagcttccgctgtgagtgtccaatgggcttcagctataataatattcttcttatc
tgtgaagatattgatgagtgcagcagtggagaaaatctatgtcagagaaatgcagactgt
atcaacattccagggtcttacaggtgtgaatgctccagtggatacaaattgtcccccagt
ggagcttgtgttggtcgcaatgagtgtcaggagatccctaatgtctgcagccatggaaca
tgtatggacacagaaggcagctacatctgtgtctgtcacaatggatttaaagccagtggg
gaccaaactatgtgcatggatattgatgagtgtgatcgtcaaccgtgtggcaatggaact
tgcaagaatacagttggttcatacaactgcctctgtttcccaggatttgaactcactcac
aacaatgactgcatggatattgatgagtgctcttctcttgtgggccaagtctgccgcaat
ggccagtgcattaacaatgtgggttcattccagtgtctctgtcaggaaggttatgagatc
acccctgatggcaagaactgcatggatattaatgagtgtaccagtttgccagcgacgtgt
tctcctggaacttgccagaacctggaaggatccttccgctgcatttgcccccctggattt
gaagtacaaaatgacaactgtatagatattaatgaatgtgatgaggagcctaatatatgc
ctgtttgggacatgtacaaacacacctggtagtttccagtgtgtctgccctcccggattt
gttctatctgataatggacgtcgatgctttgacacccgccagagtttctgtttcactcga
tttgataatggaaaatgctctgtcccaaaagctttcaacacaacaaaagcacggtgctgt
tgcagcaagatgcctggagagggttggggtgatccttgtgaactgtgcccacaggaaggc
agtgttgcctttcaggaactttgtccttatggtcatggctccattcctggcatgggtgac
accagagaagatgtgaatgaatgttctgagagcccaggaatctgtgtcaatggagtctgc
attaataccgatggctccttccgatgtgaatgtccgtttggatataatctggattacaca
ggagttaattgtgttgatactgatgaatgctctattggaaacccatgtggtaatggaacc
tgttccaatgttgttggaggctttgagtgtgcttgtgatgaaggttttgaacccgggccc
atgatgacttgtgaagacataaatgagtgcacaaacccacttctgtgtgctttccgctgt
ataaatacatatggctcatatgaatgtacatgtccttctggatataccctgcgcgaggac
caaaggatgtgcaaagatctggatgagtgtgccgaaggactgcatgactgtgaatcacgt
ggaatgatgtgcaaaaacctcattggtacttttatgtgcatctgtccaccaggcttgcaa
cgtcgaccagatggcgagggatgtatggatgaaaatgagtgccgcaccaagccaggtatt
tgtgcaaatggccgttgtgtaaatactattggcagctacaagtgtgactgtaatgaaggt
ttccaagtcagcagctctggaacagagtgtgtcgatactcgtcaaggattctgtttcact
gaggttctccaaaccatgtgccagctgtcctccaccaaccgtaacatggtcactaaatct
gaatgctgttgtaatagtggacgaggttggggcaatcaatgtgaaatatgccccctgcct
ggaactggagccttcaaaaagatgtgcccacatgggcctggtttctctactgatggaaga
gacattgatgagtgcaaagttctgccaaacttgtgcaagaatggccagtgtatcaacact
attgggtctttccgctgtcactgcaaactgggctacaccaccgacattactgggaccacc
tgtgtggatctggatgaatgtgcccagtctcccaagccatgcaatttcatttgcaagaac
accgaaggcagttatcagtgctcctgccccagaggttacattctgcaagaagatggaaag
acctgcaaagaccttgatgaatgctcaaccaaacagcacaattgtcagttcctgtgtgta
aatactattgggagcttcacctgcaagtgtccacctggctttactcagcaccaatcctct
tgcattgataacaatgaatgcaatgctcaacccaatctgtgtggttcacgtggaacctgc
cagaataacccaggtagctttacttgtgaatgccagaaaggattctctttagacaacagt
ggcagcaactgtgaagatgttgatgaatgtgatggaaaccaccggtgccaacatggctgc
caaaatgtccttggggggtttcgatgtgggtgcccacagggctatgttcaacattaccaa
tggaatcagtgtgtagatgagaatgaatgtgcgtcccagtctgcctgtggttctgcctcc
tgctataacacacttggaagctttaagtgtgtctgtccatctggctttgattttgaccag
tcatttggtggctgccaggatgttgatgagtgctcttctggaggtggaaatccttgcagt
tatggctgctccaacacagatggtggttacctgtgcggctgcccagggggatactttcga
gctggccaagggcactgtgtctcaggaatgggatttgggaagggctcttacctacaagct
ccagttgaagaagatgaagagaatgtcttatcccctgaaagctgctatgaatgcaagatc
aatgggtaccccaagcgaggaaggcagaggcgaaatgcagatgacattaatggaaatgag
atccagaatgttagccttgctagtgttgacatagatgctccacttaacatgaccctaaac
atctcagatcttgccaacaagcagcatatcttggagttcatcccagctctggaatcacta
gagaaccgtgtacgctacataatctcacatggtaatgagggtggcattttccacatacac
caaagagatgggattagctatctacatttaggccataagaaagttgccacgggtatatac
aacctcgagattgccagtgtatcattataccgaaagaaggaacttcagaaactggaggat
gagaaggaccacaactacctcagtggagaagtaggtcaaacactcaagatgaaacttcat
atacatctttattga
DBGET
integrated database retrieval system