Xenopus tropicalis (tropical clawed frog): 100486344
Help
Entry
100486344 CDS
T01011
Symbol
notch2
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2
KO
K20994
Notch 2
Organism
xtr
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Pathway
xtr04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xtr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
100486344 (notch2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
EGF_2
NOD
Notch
Ank_5
NODP
Ank_3
Ank_4
EGF_3
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100486344
NCBI-ProteinID:
XP_002939126
Xenbase:
XB-GENE-6046917
UniProt:
A0A6I8RH04
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(117858967..117942761)
Genome browser
AA seq
2455 aa
AA seq
DB search
MGAQYVLGLCVLLLGMPGCDGLQCRGASEPCLNEGKCITNDDGSAYCKCTDAFVGKYCQL
QNPCQETICLNGGTCKVSSDLSKGVCTCAPGFGGENCKQPVANVCSLTQPCMNGGTCHLL
TLELYDCICPFGWRGNDCKFIDACASQPCANGSTCIPNENQYTCSCQAGYTGLKCEVDVN
ECGPPGMCKNGGTCENFPGSYRCQCHPGYTGQRCESPFIPCSPSPCMNGGTCRQTSEFAY
ECNCLPGFDGKNCETNIDDCPSHKCQNGGTCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECQL
QPNACQNGGTCTNSNGGYNCVCVNGWSGDDCSQNIDDCATAACANGSTCIDRVASFICVC
PEGKIGLLCHKNDACFSNPCHMGSLCDTNPLTGQAICTCPSGYKGTACTEDIDECSLVNS
NPCEHAGKCVNTEGSFYCECSKGFTGPRCEMDINECLSEPCQNDATCLDKIGGFTCLCMP
GYKGIHCEIEINECLSNPCVNNGECVDKVNRFVCICPPGFTGSVCQIDIDDCSSTPCQNG
AKCVDHPSGYDCICATGFTGVLCEENINNCEPPPCHYGTCQDGIDSYTCICEPGYMGAIC
SDQIDECLSNPCLNEGRCVDLVNGYQCNCLPGTSGPRCEKNVDDCASNPCTYGNCVDGIN
RYDCVCSPGFTGPQCKDDIDECASNPCHNGGTCVNEQNRFRCICPEGFRQPSCFSQVDEC
VNNPCIHGNCTDDVNGYKCLCQPGWTGKKCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCSCK
KGFKGYNCQIDIDECASNPCLNHGTCRDGINGYTCHCGLPYTGTNCQNILTPCSPEPCHN
GGICQESEDFKSFSCLCATGWHGQRCTIDIDECITNPCKNYGRCQNTKGGYICHCFEGFN
GVNCENNIDDCLSNPCQNGASCVDGINTFSCNCLAGFHGDKCQKDVDECASNPCKNGGSC
TDYVNSYTCKCQPGFDGIHCDNNIDECTDTSCFNGATCVDGINSFTCQCPQGFTGQFCLF
EINECGSHPCINGGTCVDGMGTYHCTCPVGYRGKNCEELVDLCSGFPCKNRGICKQVKTE
PKCICPTGWTGIYCDIPDVSCEVAASQRGVAVQDLCQHAGICINTGFSHRCQCRQGYIGS
YCEGELDECASNPCQNSATCVDRHGGYECKCLPGYQGVNCEYEIDECQIQPCHNGGTCVD
LVNQFRCSCPPGTRGPLCEENIDDCAPSSEGPHCFNGGRCLDKIGGYSCECLPGFAGERC
EGDVNECLSNPCSAKGSLDCIQLDNNYLCKCKPGFTGRHCETIQDLCPTRPCLNGGTCAV
AVNMPEGFTCQCPPGFSGSKCQYSNNTCGHYKCKVGENCIKTPLGPRCYCPTGPAGNACQ
SKLGCASQPCKNNGVCQRKDQPPYYTCNCPNGIVGLQCEILLIDGCHLHHCPDKARDGYC
DQECNTHECLWDGGDCSLTMEDPWANCSSSLKCWEYFNGQCDELCNTPECLFDNFECQEK
ESICKYDKYCEDHYANGHCDKSCNTKECGWDGLDCSTDKPENLAEGTLVIVVLMPPKELL
KNSRNFLRELGSILRTNLRIKRNPDGSPMVFPYFREKSSAQRSRRSLLELRVVRELEEQP
IGSKVSLEIDNQQCVLDSDQCFKTTDSAAAMLAAHAVQGTLNYPLVSVGVEKAPPSSQTL
MYILPVILAIIIVILLLVVVLAKKKRKHGTLWFPEGFLLHRDTSNQKRREPVGQDAVGMK
NLSVPIVDGNLLDSNQNDHWSDDRGPQPKKSKSEGQALLSGGDDQVDSRQWTQQHLVAAD
IRMTPSLALTPPQAEQDMDVIDVNVRGPDGCTPLMLASLRMGSPHIEEDDEEAEDPSANV
ITDLIYQGACLQAQTDRTGETALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANSQDSMGRTPLHAAV
SADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVADLINCQADVNAVDDHGK
SALHWAAAVNNVEATIVLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSFEAAKMLLDYFANREI
TDHMDRLPRDIAKDRMHHDIVRLLDEYNLVHSPQGQPGTMLSNSLSPAVCGSNRSFLNLK
HAAQTKKARRPSAKSVAPRSLPNLAKEPKDTKNRRRKKSDTDSKAQLSESSVTLSPVDSL
ESPHATSSPTITSPGALHTSPGQMIAASTLQPPRTTMSLTNLQPVGCAANNMLPSVGQLL
SHSAQNNVLTAQRQLTMSSDWLSRMERNDTQYNEMFGIVHHDTNNHSCIPQQNGIIQADI
KPTLHMGVARDALPPIMTFQLIPKSGMNQQSGIQTLVQQASHGQNVAAMYQIPDRARITG
SSVPIAMMHQHDGQLSQTMLTAYHPLQNPMGKYPTPPSQHSYTSTDKTPNHNGHLPGEHP
YLTPSPESPDQWSSSSPNSASDWSDVTTSPTPNGNQRMPATHMPEQSHNGMQIYA
NT seq
7368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggcgcagtatgtgctggggctgtgtgtcctgctgctggggatgccgggctgtgac
ggcttacagtgtcgaggtgccagtgagccatgcttaaatgaaggaaaatgtatcaccaat
gatgacggctctgcatactgcaaatgcacagatgcatttgttggaaaatactgccaactg
caaaacccttgccaagaaaccatatgcctcaatggcggcacctgtaaagtcagctctgac
ctgtctaaaggtgtgtgtacttgcgccccaggattcggcggggagaactgcaagcagcca
gttgccaatgtctgctcccttactcagccttgtatgaacgggggcacctgccacctgctt
actctggaactctatgactgtatctgcccctttggatggagaggaaatgattgcaaattc
attgatgcctgtgcctctcagccatgcgccaacggcagtacctgcatccccaatgagaac
cagtatacctgttcttgtcaggctggatacaccggcctcaagtgtgaagtggatgtgaac
gagtgtggcccgccagggatgtgcaaaaatggaggaacttgtgagaattttcctgggtcc
tacaggtgtcagtgtcacccgggttacactggtcagcgctgtgagagccccttcatcccc
tgctctccttccccatgtatgaatggtggcacctgccgtcagactagtgaatttgcctat
gaatgcaactgcctgccaggatttgatgggaaaaactgtgaaaccaacatagatgattgt
cccagtcataagtgccagaatggtggaacctgtgtggatggggtgaacacctacaactgc
aggtgtcctccccagtggactggccagttttgcacagaggatgttgatgagtgccaactc
cagcccaatgcttgccaaaatggtgggacttgtaccaacagcaatggaggctacaactgc
gtctgtgtaaatggatggagtggggatgattgcagccagaatatcgatgactgtgccact
gctgcctgtgccaatgggtctacttgtattgatcgagttgcttcctttatatgtgtttgc
ccagaaggaaagattggactcctgtgtcacaaaaatgatgcctgctttagtaatccttgc
cacatgggctctttgtgtgataccaaccctctgactggacaagccatttgcacttgcccc
tctgggtacaaagggactgcctgcacagaggacatagatgaatgctctttggttaacagc
aatccctgtgagcatgcaggaaaatgtgtcaatactgaaggttccttttattgtgaatgc
tccaaaggattcaccgggccccgctgtgaaatggacattaatgagtgcctatctgagcca
tgccagaatgatgccacctgtctggataaaatcggaggcttcacatgtttgtgtatgcca
ggttacaagggaatacactgtgaaattgagatcaatgaatgcctaagcaacccctgtgtg
aacaatggagagtgtgttgacaaagtgaatcgctttgtgtgcatttgccctccaggtttc
actggatcagtgtgccagattgatatagacgactgctctagcactccatgtcagaatggt
gccaaatgcgttgatcatccatctggctatgactgtatatgtgcaacaggcttcacaggt
gttttgtgcgaagaaaatatcaacaactgtgaaccaccaccctgtcattatggaacatgc
caagatggcattgattcctatacgtgcatttgtgagcctggctatatgggtgccatttgc
agcgaccagatcgatgaatgcctgagtaacccttgtctcaatgaaggccgctgtgttgac
cttgtcaatggctatcagtgtaactgcctacctggaacatctgggccaagatgtgagaag
aatgttgatgactgtgcaagcaacccgtgcacctatgggaactgtgtggatgggataaac
cgctacgactgtgtctgctccccaggatttacaggccctcagtgtaaagatgacattgat
gagtgtgcctcaaacccctgccataatggaggaacgtgcgtaaatgaacagaacagattt
cgctgtatctgtccggagggatttcgccagcccagctgtttttcgcaggtggacgaatgt
gtcaataacccatgtatccacggcaactgcacagatgacgtcaatgggtacaagtgtctc
tgccaaccaggctggacaggcaagaaatgcgaggtggataaaaacgagtgtctttccaac
ccctgtcagaatggggggacatgcgataacctggtgaatggatacagatgctcctgcaag
aaagggttcaagggttacaactgtcagattgacatcgatgaatgtgcttcaaatccatgt
ttaaaccatgggacgtgcagagatgggatcaatggttacacgtgccactgcgggctgccg
tatactggtacaaactgccagaacattctgaccccctgtagccctgaaccgtgccacaat
ggtggaatttgtcaggaatctgaagatttcaagagtttcagctgtctgtgtgcaactggc
tggcacggtcagaggtgtactattgatattgatgaatgtataaccaacccctgcaaaaac
tatggtcgctgccaaaataccaaaggcggatacatttgccattgctttgaaggctttaat
ggagtcaactgtgaaaacaacattgacgattgcctttctaatccgtgtcagaatggggct
tcctgtgtagatggaatcaacactttctcttgtaactgcctggcggggttccatggggac
aagtgccagaaagatgtggatgaatgtgcaagcaacccttgtaaaaatggaggctcctgc
acagactacgtcaacagctacacgtgcaagtgtcagccgggatttgatggaatccactgt
gataacaacattgatgaatgcacagacacgtcctgcttcaatggtgctacctgcgtggat
ggcattaattccttcacctgccagtgccctcagggatttacaggacaattttgtctgttt
gagatcaatgagtgtgggtcccacccctgcattaatggaggcacttgtgtggatggaatg
ggaacatatcactgcacttgtcctgtcggatacagaggcaagaactgtgaggagttggtt
gatctgtgcagtggctttccatgtaaaaacagaggcatctgcaagcaagtgaaaacagaa
cccaaatgcatttgtccaacgggttggactggcatttactgtgatatcccagatgtctct
tgtgaagtggctgcgtctcagaggggtgtggcagtgcaagatctatgtcagcatgctggc
atttgcatcaatactggcttcagtcaccgttgccagtgccgacaaggctacatcggcagt
tactgtgagggggaactggatgagtgtgcctccaatccatgccagaatagcgctacttgt
gtggatcgtcatgggggatacgagtgcaagtgcttgccagggtaccaaggagtaaactgc
gagtatgagatagacgagtgccagatccagccttgccacaatggtgggacatgtgttgac
ttggtaaatcaattccgatgctcctgccctccaggaacacgaggtcccctctgtgaagaa
aatatagatgactgtgctccaagttctgaagggccgcactgtttcaatggtggaaggtgc
ttagataaaattggcggctacagctgtgaatgcctccctgggtttgcaggggagaggtgt
gaaggcgatgtgaatgaatgcttgtccaatccttgtagtgcaaagggcagcctggactgc
attcagctggataacaactatctttgcaagtgcaagcctggattcacaggtcgccactgt
gagacgatacaagatttgtgcccaactcgaccttgtctgaatggtgggacatgcgctgtt
gctgtgaatatgcctgaaggatttacctgtcagtgtccaccaggcttttctggttctaaa
tgccagtacagtaataatacatgtggacactataagtgcaaagttggggaaaactgtatt
aaaactcctttgggaccaaggtgctactgtcccacgggaccagctgggaatgcatgccaa
tctaaattaggctgtgccagccagccctgtaaaaacaatggagtttgccagagaaaggat
cagcctccctattatacatgcaattgccctaatggaattgttggactccagtgtgaaatt
ctattgattgatgggtgtcacctccaccactgtcctgataaagcaagagacgggtactgc
gatcaggagtgtaacacgcatgaatgcctttgggatggtggagactgctctttaacaatg
gaagacccatgggccaactgttcctcctcattgaaatgctgggaatattttaatggccaa
tgtgatgagctgtgtaatacacctgagtgcctgtttgacaactttgagtgtcaagaaaaa
gagtcaatctgcaagtatgataagtactgtgaagatcactatgcaaatggtcactgtgac
aaaagctgtaacacaaaagaatgtggctgggatggactcgactgctctacagacaaacct
gagaatcttgctgagggtaccttggtcatagtagtgctaatgcccccaaaggaactgcta
aaaaattccagaaatttcctccgggagttaggcagcattcttcgcaccaacctaaggatc
aaaaggaatccagatgggagccccatggtctttccatattttagagaaaaatcaagcgca
cagcgttcacgtagatctctcttagaattacgcgtagtccgggagcttgaggagcagcca
attggctcaaaagtctcattagaaattgacaaccaacagtgtgtcctggattcagatcag
tgctttaagactacagactccgctgctgccatgctggctgcccatgctgtacagggtaca
cttaattatcccctggtctcagtgggggttgaaaaggcgccaccatcgtcccagacactg
atgtacatattgcccgttatattggccatcattattgtcattctgctgctggttgtggta
ctggccaaaaagaagcgcaaacatggcaccctttggttccctgaaggtttcctcctgcac
cgggacaccagcaaccagaagcgcagagagcctgttgggcaggatgctgttggaatgaaa
aatttgtctgtgcccatagtggatggaaacttactggattctaatcagaatgatcactgg
tcagatgatcgaggaccacagccaaagaaatccaagtctgaaggtcaggctctcctgtcg
ggaggagatgaccaagttgatagccgtcagtggacacagcagcacctggtggctgcagat
attcggatgaccccatcattggctctcacacctcctcaagcagagcaagacatggatgtc
atagatgtcaacgtgcgagggccagatggctgcacaccacttatgttggcctccctgcga
atgggaagccctcacatagaggaagatgatgaggaggcagaagatccatctgctaacgtc
attactgacctgatttatcagggagcttgtttgcaggcccagacagatcgcacaggagaa
actgccctgcacctggcagctcgctactcaagggccgatgctgccaagcgattgctggat
gctggagctgatgccaactctcaggacagtatggggcggacccctctacatgcagcggtc
tctgctgatgcacagggggttttccagattttgatccgtaacagagtcacagacctcgat
gcgaggatgaatgatggtacaacccctctcatcttagctgcccgccttgctgtggaaggg
atggttgcagacttaataaactgccaggctgatgttaatgcagtggatgatcatggtaaa
tctgcacttcactgggctgctgcagtaaacaatgttgaggctacaattgttctgctaaag
aatggagcaaatagggatatgcaagacaacaaggaagaaacacccttgtttcttgctgct
agagagggtagttttgaagcagccaaaatgcttttggattactttgcaaaccgagaaatc
actgaccatatggatcgtcttccccgtgacattgccaaggacagaatgcatcatgacatt
gtgcgcctgttggacgagtataacttggtgcacagcccacaaggacagcctggtacaatg
ctttcaaattccctgtcgccagcagtgtgtggctccaacagatctttcctgaacctgaaa
catgccgcacaaacaaagaaggccagaaggccaagtgccaaaagtgtagcacctcgaagt
cttccaaacttagccaaagaaccaaaagataccaaaaacaggaggaggaaaaagtcagat
actgacagtaaagcgcagctttctgaaagctcagtaacattatcccctgtggattctctt
gaatccccccatgctacttcatctcctaccattacatctcctggagcgctgcatacgtcc
cctggacagatgattgcagcctctacgttgcagccaccacgcacaacaatgtctttaact
aatcttcagcccgttggttgtgcagccaataatatgctgccttctgttggacagttgtta
tcacactcggctcaaaataatgttcttacagcacaaagacagctcactatgtcatctgat
tggctgagccgcatggaaaggaatgacacccagtataatgaaatgtttggtatagtccac
catgacacaaataaccactcatgtattcctcaacaaaatggtattatccaagcagatatc
aagccaacactgcatatgggtgtggctcgggatgctttgcctcctattatgactttccag
cttatcccaaagagtggaatgaaccagcagtctggcatccagacacttgtgcagcaggct
agtcatggtcagaatgtggctgccatgtatcagattcctgatagagcacggatcactggc
tcttctgttcctatagcaatgatgcatcaacatgatggacagttatctcaaactatgctc
acagcttaccatccccttcagaacccaatgggaaaatatccaaccccaccatcacaacac
agctacacttccactgataaaaccccaaaccataatggacatttacccggagagcaccct
tacttgaccccttcaccagaatctccagatcagtggtccagctcctcacctaactctgcc
tctgattggtcagatgtaactacaagtccgacccctaatggcaatcaaagaatgcctgcc
acacatatgcctgaacaatcacacaatggcatgcagatttatgcatag
DBGET
integrated database retrieval system
