Xenopus tropicalis (tropical clawed frog): 100494244
Help
Entry
100494244 CDS
T01011
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
xtr
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Pathway
xtr04330
Notch signaling pathway
xtr04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xtr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
100494244 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
100494244 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
Notch
EGF_3
NODP
Ank_4
NOD
EGF_2
Ank_3
Ank_5
EGF_Teneurin
cEGF
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100494244
NCBI-ProteinID:
XP_017948007
Xenbase:
XB-GENE-6450008
UniProt:
F6XA19
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(132666237..132713319)
Genome browser
AA seq
2413 aa
AA seq
DB search
MGRPGLCELIWVTAVLLSRKGIHGFQCLDSYRPCQNGGRCTMYSNGEAACVCLTSWIGEL
CQFKDPCVPSPCINGGACQSSIRGGTVQYECSCAKGFRGQDCSLIDACASNPCENGARCT
NWNGRYNCTCPPGYQGRSCRVDIDECRTPGLCQNGGQCVNTPGSFRCRCPSGYTGQFCEA
IYVPCAPSQCQNGGTCRQTGDLTYQCACLPGFEGPNCEINVDDCPGHKCMNGGTCVDGVN
TYNCQCAPEWTGQYCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTQGGHTCVCVNGWTGESCSENID
DCATAVCFNGATCHDRVASFYCECPMGKTGLLCHLEDACVSNPCHKDAMCDTNPVNGRAI
CTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHFGRCVNTQGSFQCQCGRGYTGPRCETDVNECL
STPCQNDATCLDRIGEFTCICMAGFTGTFCELNINECESSPCVNGGVCKDVVNGFTCSCP
AGFTGSMCQIDIDECASTPCKNGAKCVDRPNGYECRCAEGFEGPLCDRNIDDCSPDPCHH
GKCRDGIASFTCTCEPGYTGYRCENQINECHSNPCMHGGKCIDLVNKYLCYCQQGTSGVH
CEHNYDDCASNPCDYGECRDGINRYDCVCKAGFTGPLCNIEVSPCASNPCRAGGTCQVTQ
NGFRCLCPEGRGTRDFLCNPTQDPDKELCPPGCVHGVCRRLSDGYSCDCKVGWTGRMCDR
RGSDVCTPNPCQNGGNCIDHQGVPICRCRDGFRGPTCMIDIDECASAPCLNGGKCMDGIA
GYSCLCTLPYTGQKCETILDPCAPDPCHNGGICSPTPDYESHMCQCSPGWRGETCDDDID
ECARSPCKNGGFCTNMQGGYSCACLSGFNGQDCETDINDCNPNPCLNGGACKDGINSFAC
SCIPGFTGSRCTDEINECLSNPCRNGATCKDYVNSYVCSCAPGYTGPICETNIQDCTESS
CFNGGTCVDGVNSYTCRCRPGFTGSHCQNEVDECASRPCQNGAMCVDGVESYRCICPYGY
TGAQCQNLVDLCRRSPCQNGGRCTQTGPSFRCECPAGWAGSYCDVPRVSCEVAAARRNVR
ADQLCHSGGICMNAGSSHHCICRGGYTGSYCENPINQCDPDPCHNGGACHSYLGGYVCEC
PSGYEGKNCEYDINECQSHPCQNGGTCIDLIGRYICSCPPGTLGVLCEINEDDCSPLSIS
GPPKCLNNGTCIDKVGGYRCNCPPGYTGERCEGDINECLSGPCHAQNTRHCVQLANDYQC
VCKSGYTGRRCQSVMNTCESRPCQNGGVCSVTVNTPLGYTCRCPLGFTGPSCERPPLSCR
ELSCPSGSTCLPPPLGPRCICPPGVLCRTPNNSSAPTPAPLPCSNSPCRNGATCIPNIHF
PYYQCKCHPGMIGPRCDIRTPRILTQTPAPGCTPSHCPGKAGDGHCDRECNVAACKWDGG
DCSLSVDDPWRNCPRQECRSLFNNSQCDKECTSADCLYDNFDCRGREERSCNPVYEKYCM
DHYGDGRCDKGCNSEECGWDGLDCAKNSDKEVLADGVLVVVVLVPPNEFLKQSTAFLQRL
SSLLHTSLRFCTDSNGNYKIKPYRKSQTWDGRKKRELDSDIIGSEVMLEIDNRICVKEMP
DCFPNTETAARFLAALSVLERLQFPYPIKAVRSEKIEEVIDNFRFLPLFAVAGVLILIVA
VLGVIVSRRKRAHSTLWFPEGFILKKERDRREPVGQDALGLKNIAKAERLMEDPSEDWTE
TDCPETKKLKTEELSPCRQDPVDPRPWTQHHLAAADIRLPPATALTPPQGDYESDGMDVN
VRGPDGFTPLMLASFLGGGLEPESQEEEEEGEASAITDLICQGASLGAQTDRTGETALHL
AARYARADAAKRLLDAGADPNAQDHTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRSTDLDARMGD
GSTALILAARLAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNIEATLALLKNGANK
DMQDSKEETPLFLAAREGSYEAAKVLLDHYANREITDHMDRLPRDIAQERLHHDIVQLLE
EHNTVRNSQGPMGGHTMSPLLCPPNGFMGSVKQTPQGKKNRRANAKANGASLSRAEAKDA
KGRGKKLSLDCHPGSGGLLESSVTLSPVDSLDSPRAYSANPGSPVMPVPGTFNLGSMSVP
STPLVNGLMEGPFAVSLARLNELGEIQGGGMMALQGRVPLQRAPSCVVNGLNLGMVNTNA
MPFIWQTGVPTSHPHRNVMTGAPAASVPNLHQLHAQQVLMLQNQMAMQSPVKMAMDQQCQ
MVSMPPNPVHMRQQSMPHVAERSVQPLTPTEGSYFKQQSVPNDVTMQTSPAMSAPPQQTF
APSQEDTPKHYLHIPNEHPYLTPSPESPEQWSSPSPHSVSEWSDATPSPMVVGATHGQAP
HLPEQGSNMQVFA
NT seq
7242 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggccggccggggctgtgtgaacttatctgggttaccgctgtactactcagtcggaaa
ggaattcatggttttcagtgtctggattcctacagaccatgccaaaatggaggccgatgt
acaatgtattccaatggagaagctgcctgtgtctgtctcacgtcatggattggggagctg
tgccaattcaaagacccctgtgttccctcaccctgtattaatgggggggcctgccagagc
tccatccgaggcggcactgtacagtatgaatgcagctgtgccaagggatttagaggacaa
gattgttccctcattgatgcttgtgcttcaaacccctgtgagaatggtgcacgctgcact
aactggaatggccgctataattgcacttgccctcccggctatcagggccgcagctgccgt
gtggatatagatgaatgtcgcacccctgggctctgccaaaatggaggacagtgcgttaat
acccctggttccttccgctgccgctgccccagtggttacactgggcagttctgtgaagct
atttatgtgccttgtgccccatcccagtgccaaaatgggggaacctgcagacagactgga
gacctgacctaccagtgtgcctgcttgcctggttttgaaggacctaactgtgagataaac
gtagatgattgcccaggacacaagtgtatgaatggtggcacatgtgtggatggcgtgaac
acctacaactgccagtgtgccccagaatggacaggtcagtactgcacagaggatgtcgat
gaatgccagcttcagcccaacgcctgtcacaatggaggcacctgctttaacacccagggg
ggccacacttgtgtttgtgtaaatggctggacaggggagagctgcagcgagaatattgat
gactgtgctacagctgtgtgcttcaatggagccacctgccatgatcgagtggcctccttc
tactgcgagtgtcccatgggcaaaacaggtcttctgtgtcatctggaagatgcgtgtgtc
agtaacccttgccacaaggatgccatgtgtgataccaaccccgtgaatgggcgagctatc
tgcacctgcccacctggattcacgggcggagcctgtgatcaggatgtggatgagtgctct
ataggtgctaacccctgtgaacactttggacgctgtgttaacactcagggctccttccag
tgtcagtgtgggcggggctatacaggtcctcgttgtgagaccgatgtaaatgagtgcctt
tccaccccgtgtcaaaatgacgccacctgtttagatcggattggagaatttacttgtatc
tgcatggctggattcactggaaccttctgtgaattaaatatcaatgagtgtgagagcagc
ccatgtgtaaatgggggagtctgcaaggatgtggttaatggattcacttgcagctgtcca
gccggattcaccggctccatgtgtcagatcgatatagatgagtgcgccagtacgccatgc
aagaacggagctaaatgcgtggatagacccaatgggtacgagtgtcgttgtgccgagggt
tttgaggggccactttgtgaccgtaatattgacgactgctcccctgatccctgtcaccat
ggaaaatgtcgggatggcattgccagtttcacgtgcacgtgcgaaccagggtacacaggc
taccggtgtgaaaatcagataaacgagtgccacagcaacccatgtatgcatggaggaaag
tgtattgaccttgtcaacaagtacctctgttactgtcaacaaggaacctctggtgtgcac
tgtgagcacaattatgatgattgtgccagtaacccatgtgactacggggagtgcagagat
ggcatcaacagatatgactgcgtgtgcaaggcagggttcacaggtcctctctgcaacatt
gaggtgtctccctgtgcatccaacccatgccgtgctgggggcacctgccaggttacacaa
aatggcttccgatgcctgtgccctgaaggacgaggaacacgtgactttctgtgcaacccc
acccaagatcctgataaagagctctgtccaccaggttgcgtgcatggggtttgccgcaga
ctttcagacggatactcatgtgattgtaaggtgggctggactggaagaatgtgtgatcga
aggggtagtgatgtctgcactcccaatccttgccagaatggaggaaattgtattgaccac
caaggagtgcctatctgccgctgcagggatggatttcgaggtcccacgtgtatgattgac
attgatgagtgtgcctcagcaccctgcctgaatggagggaagtgtatggacggtatcgca
ggatacagctgcctctgtactttgccctatacaggccagaaatgtgaaaccatcctggac
ccttgtgctcctgatccctgtcataatggtggcatttgctcacccacccctgactatgaa
agccacatgtgccagtgttcacctggatggagaggagaaacttgtgatgatgacattgat
gagtgtgcccggagtccatgcaagaatggaggcttttgtaccaacatgcaaggtggatac
agttgtgcgtgcctctctggattcaatgggcaagactgtgaaaccgatattaatgactgt
aatcccaatccctgcctcaatggtggtgcctgtaaagatggaataaactccttcgcctgc
tcctgcattccgggcttcaccggatctcgctgcacagatgagataaacgagtgcctgagc
aatccctgccgtaatggggccacctgcaaagattatgtcaacagctatgtgtgttcatgt
gctcctggctacactggccctatctgtgaaaccaacatccaggactgcacagaaagttcc
tgtttcaatggcggcacgtgtgtggatggagtcaactcttacacctgtcggtgccgacct
ggctttacgggctcccactgccagaatgaagttgatgaatgcgcatcaaggccctgccag
aatggagctatgtgtgtggatggagtggagtcttaccgctgcatctgtccatatggatac
actggcgcccagtgtcagaatttggtcgatctctgccggcgctccccttgccagaatgga
ggccgttgtacacaaacaggcccttccttccgctgtgaatgtcctgccggttgggctgga
agttactgcgatgtcccacgagtgtcctgtgaggtggcggcagccagaagaaatgtacgt
gccgatcagctctgccactctggtgggatctgtatgaatgctgggagctcccaccattgt
atctgcagagggggttatacaggcagctactgtgagaatccaatcaaccagtgcgaccca
gacccctgtcacaacggaggggcttgccacagctatctcggtggctatgtgtgtgagtgt
ccctctggatatgaagggaagaactgtgaatatgatataaacgaatgccagtctcaccca
tgccagaatggtggtacatgcattgatctaattggtcgctatatatgttcctgcccacct
gggacacttggtgtgctgtgtgaaattaatgaggatgactgctctccgctctcaatctct
gggccacctaagtgcttgaataatggaacgtgtatagacaaagttggaggctaccgctgt
aactgcccaccagggtacacaggcgagaggtgcgagggcgatatcaacgaatgcctatcc
ggaccctgtcacgctcagaacacccgtcactgcgtccaactggccaatgactaccagtgt
gtctgcaagagtggctatactggacgacgctgccaaagtgtcatgaacacatgtgagtcc
cgtccatgccagaatggaggagtgtgcagtgttactgttaacacaccacttggctacacc
tgtcgttgtcccctgggtttcacgggtccctcctgtgagcgaccaccactttcttgccga
gagctttcctgtccttctggttctacttgtctccctcctccactaggccctcgttgtatc
tgcccccctggggtactctgtcgcacacccaacaactcctccgctccaacccctgctccc
ttgccctgttctaactcaccttgtcgtaatggagccacctgcattcccaatatccatttc
ccctactaccagtgtaagtgccatcctggaatgatagggccacgatgtgatataaggacc
ccccgtattctcacccaaacaccagctccagggtgtacaccatcacactgcccaggaaag
gcaggagatggacattgtgaccgcgagtgtaatgttgccgcttgcaagtgggatggagga
gactgttccctgagtgtggatgatccttggaggaactgcccacgtcaagaatgccgatca
cttttcaacaactctcagtgtgataaagagtgtacatctgccgactgcctgtacgacaac
tttgactgccggggaagggaggaacggagctgcaaccctgtgtatgagaagtactgtatg
gatcattatggcgatggccgctgcgacaagggatgtaactcggaggaatgtggctgggac
ggcctggactgtgccaaaaactcagataaggaggttttggcagacggagtactggtcgtg
gttgtgctggttccacctaatgagttcttgaaacagagcacggccttcctgcagcggctt
agctccctcctacataccagtttgcgcttctgcacagatagcaatggcaattacaagatt
aaaccttaccggaagagccaaacatgggatgggaggaagaagagggaactggacagcgat
atcatagggtcagaagttatgctggagattgataaccgaatttgtgtgaaggagatgccc
gactgcttcccgaacactgaaactgcagctagatttcttgcagctttgagtgtactggag
aggctacagtttccctatccaatcaaagctgtgcgcagtgaaaaaattgaagaagtgata
gataacttccgctttctgccattatttgcggtggctggtgtgctcatcttgatcgtcgca
gtactgggtgtcatagtttctcgcagaaagagagcccacagcaccctgtggttccctgag
ggctttatattgaagaaagaacgagaccgacgtgagcctgtgggacaggatgctctaggg
ctcaaaaacattgctaaagcagaacgtcttatggaagacccttcagaagactggacagaa
acagattgccccgagaccaagaaactaaagactgaggagctttctccgtgcagacaggac
cctgtggacccacgtccttggacccagcatcacctggcagctgctgacatcaggcttcct
cctgccactgcacttaccccaccacagggtgactatgaaagtgacgggatggatgttaat
gtgagaggaccagatggcttcacacccttgatgctcgcctccttcttgggtgggggactg
gaacccgagtcacaggaagaagaggaggaaggagaagcttcggccattactgaccttatc
tgccagggggcatctcttggagcccagactgatcgtactggtgaaacggccctacacctc
gctgcacgctatgcccgagctgatgctgccaaaagactcctggatgctggtgcagacccc
aatgcccaagatcacacaggccgcaccccactccatgctgctgtggctgctgatgcacag
ggtgtcttccagattctgatccgaaatcgatccacagacctggatgcacgaatgggcgac
ggttctactgctctaattctggcagcacgattggctgtggaaggcatggtggaagaactg
attacttgtcatgctgatgttaacgctgtagatgagctcggtaaatcggctcttcactgg
gcagcagctgtaaataacattgaggccaccctggctctgctaaagaacggagccaataaa
gacatgcaggacagcaaggaggagaccccactctttcttgctgcccgggagggtagttac
gaagctgctaaagttcttcttgaccactacgccaaccgggagatcactgaccacatggac
cggcttcctcgtgacattgcacaagagaggttacaccatgacattgtccagcttctggaa
gaacacaacactgtcaggaactcccagggccccatgggaggacacaccatgtcaccactc
ctctgccctcctaatggcttcatgggcagcgtaaagcaaaccccacaaggcaagaagaac
cgtagggcaaatgccaaagctaacggagcaagcttgagccgggcagaagcaaaggatgca
aaaggcaggggcaagaagttatctcttgactgtcaccccggaagtggggggttgttggag
agttcggtcactctctcacccgttgactcccttgattcgcctcgtgcgtatagtgccaat
ccaggatcccccgtgatgcctgtcccagggaccttcaaccttggctccatgtccgtgccc
tccacccctcttgtgaatgggctgatggaagggccctttgccgtgtccctggcaaggctc
aatgagttgggtgaaatccaagggggtggaatgatggcattacagggcagagttcctttg
cagagagccccaagctgtgtggtgaatggtctgaatctgggtatggtgaacacaaacgcc
atgccgtttatatggcagacgggggtgccaacttctcacccccatcgcaatgtaatgaca
ggagctcctgccgcatctgtgcccaacttgcaccagctacacgcccagcaggtgttaatg
ctgcagaatcagatggccatgcagagccctgtgaagatggccatggatcagcagtgccaa
atggtgtccatgcctcccaaccctgtgcacatgaggcagcagagtatgccgcacgtggcc
gagaggtcagtccagccgctgacgcccaccgaaggcagttacttcaaacagcagagcgtg
cccaacgatgttaccatgcagacctcgccagccatgtctgctccaccccagcagaccttt
gcaccctctcaagaggacacacccaaacactatctgcacattcccaacgagcacccctac
ctgacaccctctcctgagtcccctgagcaatggtccagtccgtcccctcactctgtgtcg
gagtggtccgatgccacccctagccccatggtggtgggggcaacacatggacaggcaccc
cacctaccagaacagggcagcaacatgcaggtgtttgcctga
DBGET
integrated database retrieval system
