Xenopus tropicalis (tropical clawed frog): 100494368
Help
Entry
100494368 CDS
T01011
Symbol
fbn2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
xtr
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Pathway
xtr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xtr00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
100494368 (fbn2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xtr00536
]
100494368 (fbn2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xtr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100494368 (fbn2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_PEAR1L
EGF_MSP1_1
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100494368
NCBI-ProteinID:
XP_002931771
Xenbase:
XB-GENE-494557
UniProt:
F6WQA1
LinkDB
All DBs
Position
1:167581303..167724491
Genome browser
AA seq
2891 aa
AA seq
DB search
MLAVTSPSPMPGGARRPVLLLGCLLALLGCATVPGVGGQYAFSAESSRGAQDAREGTISA
ASRVRRRGQQDALRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMC
TCSTGQISPNCGSKTIQQCSVRCMNGGTCVEDHCQCQKGYVGAHCGQPVCENGCQNGGRC
IGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVSNQMCQGQVTGIVCTKTLCCATIGRAWGHP
CEMCPAQPQPCRRGFIPNIRSGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTDGSYECRCPVGHKQS
ETTQKCEDIDECTTIPGVCNGGECSNTIGSYYCICPRGYVTSGDGSRCIDQRSGVCFSSL
VNGHCAQEQAGRFTKMQCCCESGRCWALGSIPEMCPIRGTDEYRRLCIEGVPFGGPGGFV
PNGFGPGGTGFIPGPGGNGFHPGIGGTGIDGQGPVINGGVATLNQTIDICKQYPNLCLNG
RCIPNLNSYRCECNMGYKQDTQTECIDVDECTSNPCTNGDCVNTPGSYYCKCHSGFQRTP
TKQACIDIDECIQNGILCKHGRCVNTEGSFQCICNAGFELTPDGKNCADHDECSTTNMCL
NGMCINEDGSFKCICKPGFVLASNGRYCTDIDECQTPGICMNGHCINTEGSFRCDCPPGL
AIGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGLCVRPFPGAVTKSECCCANPDYGFGEPCHPCPPRN
SAEFQGLCSGGVGITVDGRDINECALDPDICANGICENLRGSFRCNCNSGFESDSTGKNC
IDIDECLVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFRSDSETCEDINECESSPCVNGACRN
ILGSFNCECSPGSRLDATGLICIDSLKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAW
GSPCERCEIDPACPRGFARVKGVSCEDVNECEVFPGVCPNGLCLNTKGSFLCECPDGLTL
DGTGRLCLDLRMEHCFLKWDEDECVHPVPGKFRLDACCCAVGAAWGTECEECPKPGSQEF
ELLCPRGPGFTNRGDVLSGRPFYKDINECKAFPGICTNGKCRNTIGSFKCKCNNGFALDM
EERNCTDIDECRISPDLCGSGTCINTPGSFECECFEGFESGFMMMKNCMDIDECERNPLL
CRGGECINTEGSFLCNCPNGHELTPSGDACVDINECALSDNLCRNGKCVNIVGTYQCSCN
PGYQATLDRLGCTDIDECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCLEGYALMPDKRTCTDIDECE
DNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASMDMKTCIDVNECDINSNICMFGECENTKGSF
VCHCQVGYAVKKGTTGCTDVDECEIDTHNCHLHATCLNVPGSFKCTCKEGWIGNGIKCND
LDECLNGTHRCSVSAHCLNTPGSYHCSCAEGYTGDGFTCSDVDECTENINLCENGQCLNI
PGSYRCECDMGFTPASDSRSCQDIDECAFQNICVFGTCSNLPGMFRCICNEGYELDRTGG
NCTDVDECADPINCVNGFCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDTRVGNCYLNHGARGD
GTISCSTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCEICPPVNSSEYNTLCPGGEGFRPNPITIIL
EDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEETRICEDIDECFTHPGVCGPGTC
YNTLGNYTCICPSEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRTYNGTTCDNELPFNVTKKMCCCTYNI
GKAWSKPCEPCPTPGTANFKHLCGSIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICTNGVCINQI
GSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSSGDYFCQRNADCINSPGTYRCECSTGFKLLPNG
ACIDRNECLEIPNVCSHGTCVDTEGSYHCVCNNGFKVSPDQTMCMDIDECERQPCGNGTC
KNTVGSYNCLCYPGFEITHNNDCLDIDECSSLYGQVCRNGHCFNEIGSFICLCNEGYELT
PDGKNCIDINECVAFPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVERENCIDIDECIEEPNICL
FGACSNTPGSFQCICPPGFVLSENGRRCFDTRQSFCFTRFENGKCSVPKAYNSTKAKCCC
SKMPGEGWGDPCELCPKEGEVAFQDLCPYGHGTIPGIGDTREDVNECLENPGICANGHCI
NTDGSFRCECPMGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCTNAIGTFECLCDEGFEPGPM
MVCEDINECILNPLLCAFRCINTYGAYECTCPAGYILREDQKMCKDLDECIEGFHDCESR
GMVCKNLIGTFMCICPPGMVRRPDGEGCMDENECRTKPGICENGRCVNTIGSYRCDCNEG
FQSTPSGTECLDTRQGFCFSEVLQTMCQMSSSSRNHVTKSECCCNGGRGWGNQCEICPLP
GTAQYKKMCPHGPGYTTDGKDIDECKVMPNLCRNGQCINNIGSYRCFCNPGYTTDIGGTA
CVDLDECSQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKSCKDLDECQTKQHNCQFLCV
NTIGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGTQSNVCGLKGVCQNSPGSFTCECQRGYSLDST
GMNCEDVDECGGNHRCQHGCQNIVGGYRCSCPQGYIQHYQWNQCVDENECASQNTCGSAS
CFNTLGSYKCACPTGFTFNQFSSACHDVDECTSSKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRV
GQGHCVSGIGFNRGQYLPVGKENSEDNALSPEGCYECQLNGYTKKTGRMRRNAKNPELER
GANNTEQAMNGQISLKSLDMDLPLKMVLNISHLNSKKHILELLPAIQPLTNHVRYVITQG
NTNMFRINQRDGLSYLHASQKILPGTYTLEITSIPLYKKTDLIELEQKKEENYLLGELGE
SLNIRLQIELF
NT seq
8676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttgctgtcacctctccctccccgatgcctggaggagccaggcggccggtgctgctg
ctgggctgcttgcttgcccttctgggatgtgccactgtgccaggagtcggggggcagtac
gccttcagcgccgagtccagccggggagcgcaggatgccagggaaggaaccatcagtgca
gcgagtagggtccgcaggagaggccagcaagatgctctgcgcgggcctaatgtatgtggt
tctcgcttccactcctactgttgccctggatggaaaacacttcctggaggaaaccagtgc
attgttccaatttgtagaaatagctgtggtgatggattctgttcccgcccaaacatgtgc
acttgctctactggacaaatatctccaaactgtggttcaaaaacaatacagcagtgcagt
gtcagatgcatgaatgggggaacttgtgttgaggatcattgtcagtgccaaaaaggctat
gttggagcacactgtggacaacctgtctgtgaaaatggctgccagaatggggggcgatgt
attgggccaaacagatgcgcctgtgtttacggatttactggacctcagtgcgaaagagac
tacagaacagggccctgttttacacaagttagcaatcagatgtgccagggtcaagtcact
ggtatagtgtgcacgaaaactctttgctgtgccactattggacgtgcttggggacaccct
tgtgaaatgtgccctgctcagccacagccttgcagacgtggttttattccaaacatacgg
agtggagcatgccaagatgttgatgaatgtcaagcaattccagggctgtgccaggggggc
aactgcataaacactgatggatcttatgagtgcagatgccctgtgggacacaagcaaagt
gagacaacacagaagtgtgaagacattgatgagtgtaccactatccctggtgtttgcaat
ggaggagaatgttcaaacacaattggtagttactactgcatctgcccacggggctatgtc
acatctggggatggctctcgctgtattgaccagaggtccggtgtgtgcttctccagtctt
gtcaatggccattgtgcccaagagcaggctggcaggtttacaaagatgcagtgctgctgt
gaatctggccgttgctgggcattagggtcaattcctgaaatgtgtcctatcaggggtaca
gatgaatatcgtaggctgtgcattgaaggagttccatttgggggccctgggggatttgtt
cctaatggatttggaccaggaggtacaggatttatcccaggacctggtggtaatggattt
catcctggtattggaggaactggaatagatggacaaggcccagtgatcaatggaggggtt
gcaacgctaaatcagacaatagacatctgcaagcaataccccaatctttgtctaaacgga
cgatgtattccaaaccttaacagttacaggtgtgagtgcaacatgggatacaaacaggac
acacaaactgaatgcattgatgttgatgaatgcacatcaaatccatgtactaacggagac
tgtgttaacacgcctggatcatattattgcaaatgccattcaggttttcaaaggactcca
acaaaacaagcttgcattgatattgatgaatgtatccagaatggaattctttgcaaacat
ggccgatgtgtgaacaccgagggaagcttccaatgtatatgtaatgctgggtttgaattg
acccctgatggcaaaaactgtgcagatcatgacgagtgctccaccacaaatatgtgttta
aatggaatgtgtataaatgaggatgggagttttaaatgcatatgcaagcctggctttgtg
ctcgcatccaatggccgctattgcaccgatattgatgagtgtcagactccaggcatctgc
atgaatggtcactgtatcaacactgaaggttcgttccgttgcgattgccctccaggattg
gccattggagtggatggccgtgtttgtgtggacacacacatgcgtagtacatgctatggg
ggaatcaaaaaaggcctctgtgtacgtccttttcctggagctgtgaccaaatctgaatgt
tgctgtgccaatccagactatggatttggggaaccttgccatccttgcccaccccggaat
tccgctgaatttcaaggcttatgcagtggaggagtcggtattactgttgatggacgagat
atcaatgagtgtgctttggaccctgatatctgtgccaatgggatttgtgaaaacctgcgt
gggagtttccgttgtaactgcaatagtggctttgaatcagattctacaggcaaaaattgt
atagatattgatgagtgcttagtgaacaggctgctatgcgacaatgggctttgccgaaac
acaccaggaagctacagctgtacatgccctaaaggatatgttttcagaagtgatagtgaa
acctgcgaagacataaatgaatgtgaaagtagcccttgtgtaaatggggcttgcagaaat
attcttggctcgttcaactgtgagtgttcacctggaagcaggctggatgctactggcctc
atctgcatagacagcctcaaaggaacatgttggcttaatatacaagatggacgatgtgaa
gttaacataaatggagcaacactgaagtcagaatgctgtgctactctgggagctgcctgg
ggaagtccatgtgaacgatgtgaaatagaccctgcctgccccaggggattcgcaagagtg
aaaggtgtctcatgtgaagatgtcaatgagtgtgaagtgttcccgggtgtgtgtcccaac
ggcctgtgcctcaacaccaagggatcttttctttgtgagtgcccagatggcttgactttg
gatggaactgggagactgtgtctagatctccgaatggaacattgctttttaaaatgggat
gaagatgaatgtgttcacccagttcctggcaagtttcggctggatgcctgctgttgcgct
gttggagctgcctggggtacagaatgcgaggaatgtccgaaacctgggtctcaagaattt
gaacttttgtgtccaagaggaccaggctttactaacagaggagatgttctgtctgggaga
cctttctataaagatattaatgaatgcaaggcgttccctggaatctgtactaatggaaaa
tgtagaaacacaattggaagttttaaatgtaaatgcaacaatggctttgctttggatatg
gaggaaagaaattgtacagatattgatgaatgccgcatctcccctgacctgtgtgggagt
ggcacttgcattaataccccaggaagctttgaatgtgagtgcttcgaaggctttgagagt
ggtttcatgatgatgaagaactgcatggacatagatgaatgtgaaaggaaccctttgctt
tgtcgaggtggagaatgtataaacactgagggcagttttctctgcaattgccctaatggg
catgaacttacaccttcaggggatgcctgtgtagatatcaacgaatgtgccctaagtgac
aatctttgcagaaatggcaaatgtgtaaacattgttggaacataccaatgctcttgcaat
ccgggataccaagctacactggacagacttggttgtactgatattgatgagtgcaccatt
atgaatggtggttgcgatacacattgcacaaactcagaaggcagctatgaatgtagctgc
cttgaaggctatgccttgatgccagataagaggacctgcacagacattgatgaatgtgag
gacaacccagatatctgcgatgggggccagtgtaccaacattccaggagaatatcgctgc
ctctgctttgatgggtttatggcttccatggatatgaaaacatgtattgatgtaaatgaa
tgtgatataaactccaacatttgtatgtttggggaatgtgagaataccaaaggatcattt
gtatgtcactgtcaggttgggtatgcagtgaaaaagggaacaacgggatgcacagatgtg
gatgagtgtgaaattgacacccataactgtcatctacatgctacatgtttaaatgtacca
ggaagctttaagtgtacttgcaaagaagggtggattggaaatggcataaaatgtaatgat
ctggatgagtgcttaaatggaacccatcgatgtagtgtatctgcccactgtcttaataca
cctggttcataccattgctcttgtgcagaaggatatactggagatggatttacttgctca
gatgttgatgagtgcaccgaaaatattaatctatgtgagaatggacagtgcctgaatatc
ccaggctcctatagatgtgaatgtgacatgggattcactccagcttcagacagcaggtct
tgccaagatattgatgaatgcgctttccagaatatatgtgtgtttggaacctgcagcaac
cttccaggaatgtttcgttgtatctgcaatgagggttatgaactggacaggactggagga
aactgtacagatgtcgatgagtgtgctgatccaattaattgtgttaatggcttttgtgtt
aacactcctgggagatacgaatgtaactgtccaccagattttcagctcaaccctacagga
gtgggttgtgttgatacaagagttggcaattgctacctgaaccatggtgcccgtggcgat
ggaacaatctcttgcagcacggagattggagttggagtcagccgttcatcatgctgctgt
tctctggggaaagcatggggaaacccatgtgagatctgcccccctgtaaacagctctgaa
tataatacattgtgcccaggaggagaaggctttcgacccaacccaataaccataatttta
gaagatattgatgagtgccaggagttaccaggtctctgccaaggtggtaactgtataaat
acctttggaagcttccagtgtgaatgcccacagggctactatcttagtgaggagacacgc
atttgtgaagatattgatgaatgctttacccaccctggtgtatgtggaccaggaacttgt
tataataccctggggaattacacgtgcatttgcccttcagagtatatgcaagtaaatgga
ggacataactgcatggatatgcggaagagtttttgctatcgaacttacaatggaacaaca
tgcgataatgaacttcctttcaacgtaacaaaaaagatgtgctgctgcacctataatatt
gggaaagcctggagcaagccttgtgagccatgccccaccccaggaacagctaattttaag
catctctgtggatctatccctggtttcacttttgatatacacactggcaaagctgttgac
attgatgagtgcaaggagatccctggaatctgtacaaatggagtttgcatcaatcaaatt
gggagcttccgctgtgaatgcccaacaggattcagctacaatgacttactccttgtttgt
gaagatattgatgagtgcagcagtggggattatttttgtcaaagaaatgctgattgcatt
aacagtcctggaacctatcgatgtgaatgctccacaggcttcaagctattacccaatggt
gcctgtattgaccgcaatgaatgcctggaaattccaaatgtttgtagtcatggtacatgt
gtggacaccgaagggagctatcattgtgtatgtaacaatggatttaaagtttctcctgat
cagacaatgtgcatggatattgatgagtgtgagcggcagccatgtggtaatgggacttgt
aaaaacacagttggctcatataactgtctgtgctacccaggctttgaaatcactcacaat
aacgactgcttggatattgacgagtgcagctcattgtatgggcaggtgtgcaggaacggg
cattgtttcaatgagatcggctccttcatatgtttgtgtaatgaaggttatgaacttact
ccagatggcaagaactgcatagatattaatgaatgtgtggcttttcctggttcatgttcc
cctggaacctgtcagaatcttgaagggtcttttagatgcatctgccctcctggatatgaa
gttgagcgtgaaaattgcatagatattgatgaatgtattgaagaacccaatatctgcctt
tttggagcttgttccaacacccctgggagttttcagtgtatctgtccaccaggatttgtt
ctgtcagaaaatggccgaaggtgctttgacacacgtcagagtttttgtttcaccagattt
gaaaatggaaaatgttctgtacctaaagcatataacagcactaaagcaaaatgctgctgc
agcaaaatgccaggagaaggctggggcgatccatgtgaactgtgtccaaaggagggagaa
gtggcattccaagatttatgtccgtatggacatggaaccatcccaggcattggagatacg
cgagaagatgtcaatgagtgcttagaaaacccaggaatttgcgcaaatgggcattgtata
aatacagatggctcttttcgatgtgaatgcccaatggggtataatctagattatactggt
gtgaactgtgtagatactgatgaatgttccattggtaatccatgcggaaatggcacatgt
acaaatgccattggtacttttgagtgtttatgtgatgaaggctttgaacctggaccaatg
atggtctgtgaagatattaatgaatgtatattgaatccattgctgtgtgcattccgttgt
attaacacttatggggcttatgagtgcacgtgcccagcaggatacattctaagggaggac
cagaaaatgtgtaaagatcttgatgaatgcatagaaggtttccatgactgtgaatctcga
ggaatggtttgcaaaaacttgattgggacatttatgtgtatttgcccacctggaatggta
cgaagaccagatggagaaggctgtatggatgaaaatgaatgccgcactaagcctggcatc
tgtgaaaatggccgatgtgtcaataccattggaagctacagatgtgattgcaatgaagga
tttcagtcaactccatctggaaccgagtgtcttgatactcgccagggattttgcttttct
gaagtgttacaaaccatgtgtcagatgtcatcaagcagccgaaaccatgtcactaagtct
gagtgttgctgtaatggaggaagaggctggggcaaccagtgtgagatctgcccacttcca
ggcactgcgcagtacaaaaaaatgtgcccacatggcccaggatatacaaccgatggaaaa
gatattgatgaatgcaaagtgatgccaaatctctgtcgaaatggccaatgtatcaacaac
attggctcttataggtgtttctgcaaccctggctacacaactgacattgggggcacagca
tgtgttgatctcgatgaatgctcgcagtctcccaagccctgtaacttcatctgcaagaat
acagaaggcagctaccagtgttcctgtccacgtggttatatcttgcaagaggatggaaaa
agctgtaaagatctggatgaatgtcaaaccaaacagcataactgccagttcctctgtgtc
aacaccattggaggtttcacttgtaaatgtcccccgggttttacacaacatcacactgct
tgcatcgacaacaatgaatgtggcacacaatctaacgtgtgtggacttaaaggggtctgt
cagaattcacctggcagttttacttgtgaatgccaaagaggatattcattggattcgact
ggaatgaattgtgaagatgttgatgagtgtggtgggaatcacagatgtcaacatggttgt
cagaatatcgttggtggatacaggtgcagctgtccccaaggctatatccagcattaccag
tggaatcaatgtgttgatgaaaatgaatgtgcttctcaaaacacatgcggttcagcttcc
tgcttcaacacattaggcagctacaaatgtgcttgtccaactggatttaccttcaaccag
ttttcctccgcatgccatgacgttgatgaatgcacaagttcaaagaatccctgcaattac
ggctgttccaacacagaaggaggttatctctgtggatgtccccctggatactacagagtt
gggcaagggcattgtgtgtcaggaataggctttaacagaggccagtatctgccagttggc
aaagaaaatagtgaggacaatgcactgtccccagaaggttgttatgaatgccagctcaat
ggctacacaaagaaaactggaagaatgagaagaaatgctaaaaatcccgaacttgaaaga
ggtgctaataatacagagcaggcaatgaatgggcaaataagcctgaagagcctagatatg
gatttgccactcaaaatggtgctaaacatttctcatttaaactcaaagaagcacatcctg
gaacttctgccagccatccaaccactcactaaccatgtacgctatgtaattacccaaggc
aataccaacatgttccgcataaaccagagggatggactaagctacctccatgcatcacaa
aagatattgccaggaacgtacacactggaaatcactagcattccactttataagaaaacc
gacttaattgaactagagcagaaaaaggaagaaaactacctccttggagaacttggggaa
tctctcaatataagacttcaaatagagttgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
