Yersinia aleksiciae: ACZ76_13615
Help
Entry
ACZ76_13615 CDS
T03994
Name
(GenBank) hemolysin secretion protein ShlB
Organism
yak
Yersinia aleksiciae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
POTRA_2
ShlB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP35426
LinkDB
All DBs
Position
3041241..3043019
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MWHHQLFKLSIIIFLVFFCSSLISALPIRYVPNAGTISNEIRQTTIAPLPVPHTADIELP
PLVPPSPLGSRVASTSITLREVRIEGDTLLLSSSSTDSVGSHKELQALITPWLGRALTFS
DLQTMVLAITRFYRQQGWIAAQAILPPQRVRHGSVVVRVIAGRLDKPEVSNQSRLNTPFV
TAVIESNSCSKQVGLFGEKDCAASPAELSRIERTALILNEMPGVAASLALKPGTQSGTTR
IYADITPGQIAMGYLGADNQGNDYSGHNRLFVGGAMNNMMGWSDQLRADLILSSSTDVFS
GQLDYNFPINSYGTRAALDYSHLNYTLNGPFEALDAHGYSDTWGISLRHPWVRNSAARID
VNAGYYNTRMRDSLIIIPEQKRNLNAGEFGVGGSFSPLSRGLSHFNFVGTAGHLSLNDEY
SQSMNNITGISGDFARFNYRIGHDQGLGPYFFFFNQLSGQMASKNLDSSQKLLLGGPLAV
RAYGIGEGSVDKGSLFTTELRARGQPTLPSWAGAGSLVTLAAFFDQGWGSYYRQPFANMS
GNNINLSGFGAYITFTRPADYSLNLTWAHRTGQAVAPNPDNDQIWLSAYKTF
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ctgtggcatcaccaattatttaagttaagcataatcatatttcttgtttttttttgctcg
tcactcatctcagcgctgccaataagatatgtgcctaatgcggggaccattagtaatgaa
ataaggcaaacaaccatcgcgccactgcctgtgccacatacggcagatattgagctaccc
ccattggttccgccatcgcctttagggagtcgcgtggcgtcgacgtctatcactttacgc
gaagttcgcattgagggggatactcttttactgtcgtcatccagtactgatagcgtggga
agtcataaagaactgcaagcgctcataaccccttggttaggccgagcattaacattttct
gatttacaaaccatggtattagcaataacccgtttttatcgacagcaaggatggatcgcg
gctcaggcaatattaccgccgcaaagggttcgtcatggctctgttgttgtgcgcgttatt
gctggcagactcgataaacctgaagtgagtaatcagagccgcttgaatacaccattcgtt
actgctgtcatcgaaagtaatagctgtagcaagcaagtgggcctctttggtgaaaaagat
tgtgctgcctcaccagcagaattatcccgtattgaacggaccgcactgattcttaatgag
atgccgggtgtcgcggcttcgctggcattaaaaccaggaacgcaatcgggaacgacacgg
atttatgccgatattacgccaggccaaatagccatggggtatctcggtgcggataatcag
gggaatgactactcgggccataatcggttattcgttggtggtgcaatgaataatatgatg
ggctggagtgaccaactacgagcagacttaattttatccagctcgacagatgtttttagc
ggacaattagattataacttccctattaatagctatggcactcgtgcggcacttgattat
agtcatttgaattataccttgaacgggccattcgaagccttggatgcccatggttattcc
gacacctgggggattagtttacgacatccgtgggtgcgtaattccgctgcgcgcattgat
gtgaatgccgggtattataatacccgaatgcgtgattcactcattattatacccgaacaa
aaacgtaatcttaatgcgggtgagtttggtgttgggggatcctttagcccattatctcgc
ggactcagtcattttaattttgtgggtacagcaggccatctttcgttgaatgatgaatat
agccagagcatgaataacatcaccggaatcagtggggattttgcccgctttaattatcgt
attggccatgatcagggcttgggtccctacttctttttcttcaatcaattgagtggccaa
atggccagtaagaatcttgatagctcgcaaaagctattattgggcgggccgctggctgtc
cgcgcctatggtatcggcgagggttccgtggataaaggttctctgttcaccaccgaactc
cgtgctcggggacaacccacactgccctcatgggcgggggcgggaagtctcgtcaccctt
gctgcattctttgatcagggatggggctcttattatcgccaaccgttcgcgaatatgtct
ggaaacaacatcaacttatcgggttttggtgcctatatcactttcacgcgcccggcagat
tactccttaaatctgacttgggcacaccgaaccggtcaagcagtggcacctaatccggat
aacgaccagatttggcttagtgcttacaaaacgttttag
DBGET
integrated database retrieval system