Yersinia enterocolitica (type O 5) YE53/03: YE5303_26361
Help
Entry
YE5303_26361 CDS
T03739
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
yee
Yersinia enterocolitica (type O:5) YE53/03
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
yee00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
yee00536
]
YE5303_26361
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
yee00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
YE5303_26361
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
DUF637
Fil_haemagg_2
EndoU_bacteria
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCQ41949
LinkDB
All DBs
Position
complement(3962004..3967610)
Genome browser
AA seq
1868 aa
AA seq
DB search
MAEFSNTRTRIASWLLIYLTAVQPLHPAIAAQQRQLPVVNIATPDPSGISHNYYKSFNID
STGAVLNNATEAGQSVLAGQLAANPNLNGNSAKLIINEVQSSDSTTLAGKLEVFGKKAEV
IIVNPNGLQCNGCSFINTNKHTLIDGKLNINMLQITARGQTPIVNILAPNPAGISHNHFK
SFNVDAPGMVLNNSTEAGQSSLVGQLAANRNFYEGNSAKLIINEVIGRDYSELTGTLEVF
GPKADVIIANPNGLYCNGCNFSNASGITLTTGRPVFNSQGELDSLNITKNTAIIVGSKGV
NALNQNNTAIITGGLKLHGEIRANQLDVILGTNQVGYQNGDIQPLLSTETKPLIALDTKE
LGGMYANSIRLISTEKTNTVNAKNIVSHKGDIRFDVAGDLNLGNITAKNNLNMTSKKTSL
AQGDKLLSGRDITLVNTEFNNLGQVTAEGDLRIFSDQVRNSGQQAHIIASNNMWIQKDAD
GNKNTLVENKSGTIKTKSGDLIIRTEKLENSRPMVTAGWQKLTPDSRQLNDYDDDSDSPG
KVIITLEYDWPTRALPEKWFGAIETGEWQSGVWRVNTEKNIWQLNAPSPAATLHSGSNLY
INASQLENKSSHIGAAKDIFLTGNDFLNSSASNWVKDEFRYYRVDYQWPDYYVFHDERLY
YQLTEAEKYRATVVAGGNAVLDFNNKIQLQRPVPEIDKTAPISLSEFTPPVLKGHNILLH
GKTISSSDLIQASGDITFIAEDRIALANSSLRGQDISLTALNDINSSSSEFLGRNILLLS
REGDIKTNSPDRSSRQPDDAQVFNRIKASHDFTAIAAKDIQLTDTLIHPAANISLSAGHD
INISHVLKPEEILITDGFLEPEKYLKQINQLLSLSNRLTSSGDITLNAGNNLMLQGIKLN
AGQEINLHAARDIQLEPYNRTVWSDLMGRYNNNHQGSVFFNIFPRSETPDYTVQINAKGN
ALINAGRDILTRGSNINADNNLTLLAGQHIQLAALPYTGTDWTDRSRYTRHAATRLKAGN
TLNAVANHQLITQGAELAAGGDMTLTSGGDMRFESVLNESHYGGGDNSSYRKLQQSTQLN
SGGALTLISNGSMLFQATQLMVKKVMDIAAKGGYLFAQAMEETSHSEQHWQTRKWWGRKK
SHHNVQHVATNKVTEFTAEGDISLLSRDDSTYQASKIAAGQNAKLTSTHGKVIFEAVKDI
TFQQKTELSKGFYIKYTDKGYLDEKWVLPTIHTGGELTVDAAQGIRADVKVKNGESLRSA
ITALSKTPGNEWLNDLNLRDDVQWQKVMDAYHHWDHKNEHLNPVVAAVIAIAIAAATAGS
GLVVAAGAAAGGGVAGGAVSAGMSALASQAAVSLMNNKGDISKTFKDMGSKSSVKSLVTS
MAIGGALSGFDAAIGGDSAAKGAKTASTTSARLPQLSHGDWSKVAQRVAGQSIISSSLNT
AINGGSFKDNLATALLTSVGSQLHAEGAHLIGNNGDVLGVSGKALSHALVAGVAAEIGGG
TAKGAAAGALAAELAGVVMGENIIGSQQWQEKQAQFSRVAGAIAGVLATGKVEGAYSGAN
AGEVVDRFNRQLHLDEIKAVNELAKGSNVKQERFLAASCRQVNCTAQEALNSAERARAEL
LMAKYPETPEEDGILRNYWIQKEKKRFGNYPALTGFEQIQLFTYADTDKLSDSQKFAKNQ
WVEEASNLTGWSREAVEALGISASLAGVVRGKRFGQTGAAYPTGISFNINQKNHLANFDG
FSQRKGIHGTHNADAFNQAVSSNGVKIISRTSGSVNGITHIKYQIPAKDRAGNTVGYKAE
ILEKTIYDPKVFSDQKMLMLGQQAAANGYQSARNSGVREYKAISDGVKFQIYLDQQTGSV
INFFPVIK
NT seq
5607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaattcagtaatacacggacgcgaatcgccagttggcttctgatttatcttacc
gcagtacaacctctacatccggctattgctgcccagcagagacagctgccagtggttaat
attgctacaccggacccatctgggatctctcataactactataaatctttcaatatcgat
tcaactggagcagtgctcaataatgcaacagaggcagggcagtcagtattagcgggccag
ttagctgccaatcctaatttaaatggcaacagtgcaaaattaatcattaacgaggttcag
agtagtgattccacaacattggcagggaaactggaggtttttggtaagaaagctgaagtg
attattgtcaatcctaatgggttgcaatgtaacggctgtagttttattaacaccaataag
cacacgttaattgacggtaaactgaatatcaatatgttacagattaccgcccgtgggcaa
acgccgatcgttaatatccttgcacctaatccagccggtatttcccataaccacttcaaa
agttttaatgtcgacgcacccggtatggtgctgaataattccaccgaggcgggccagtca
tcgttagtcgggcaattggctgccaaccgtaatttttatgaaggtaatagtgcaaaatta
atcattaatgaggtgataggtcgcgattactccgagctgaccggcacgctggaagttttc
ggcccgaaagcagatgtgattattgctaacccaaatggtttgtactgcaatggctgcaat
tttagtaatgccagtggcatcactttaaccacaggtaggccggtattcaattctcagggt
gaattggatagtctaaatattaccaaaaataccgctattattgtggggagcaagggggtt
aatgccctcaatcagaataatacggcaatcatcactggtgggttaaaacttcacggtgaa
atccgtgctaatcagcttgatgtgatactgggtaccaatcaggttggctatcaaaacggt
gatattcagccgctattatcaacagagacaaagcccttaatagcattagataccaaagag
ttgggcggtatgtatgctaatagtattcgattaatatcgacggaaaaaacgaacactgtt
aatgctaaaaatatcgtcagccataaaggtgatattaggtttgatgtcgccggtgatctt
aatttaggtaatattacggcgaaaaataatctgaatatgaccagcaagaagaccagcctt
gcccagggcgacaaattgctcagcgggcgtgatattacattggtaaacactgaatttaat
aacttagggcaggtaacagcagagggtgacctgcgtatttttagtgatcaagtgcgtaat
agcggtcaacaagcacatattattgctagtaataatatgtggatacaaaaagatgctgat
gggaataaaaatacgctagttgaaaataagtccggcaccattaaaacaaaaagtggtgac
ttaattattcgcaccgaaaaactggaaaatagtcgcccgatggtaactgccgggtggcag
aaactaacgccagattcgcgccagcttaatgattacgatgacgatagcgattctccgggc
aaagttattatcacattagaatacgattggcccacccgagcactgcccgaaaaatggttt
ggtgctatcgaaaccggtgaatggcaaagcggtgtctggcgggtcaacactgaaaaaaat
atctggcaactgaatgcaccatcaccggctgccaccctgcattcagggagtaatctgtat
attaatgccagccagttagagaataaaagtagtcatataggagcagcaaaagatattttc
ctgaccggtaatgattttttaaacagcagcgccagtaactgggtgaaagatgaatttcgt
tattatagagtggattatcagtggccggattattatgtttttcatgacgaacgattatat
taccagttaactgaggctgaaaaatacagagcgacagtcgtggcaggcggaaatgccgta
ctggactttaacaacaagattcagttacagcgcccggtgccggagatagataaaactgct
cctatatcattatccgaattcacaccgccggtattaaaagggcataatattttactgcat
ggtaagactatttccagcagtgatttaatacaggccagtggcgatattacctttattgca
gaagaccgcattgcattagccaacagcagtttgcgtggtcaggatatttcactgacggca
ctgaatgatattaactcatcatcaagtgagtttttggggaggaacattttattactgagc
cgagagggggatattaaaacaaattcacctgacaggtcttcgcgtcagccagatgatgcg
caggtatttaatcgcattaaagccagccacgattttactgccattgccgctaaagatatt
caattaaccgatacccttatccatccggcagctaacattagcttgtccgccggacatgat
attaatatttcacatgtgctcaagcccgaagaaatcctaattaccgatggatttttagaa
ccagaaaagtatctgaaacagattaaccaactattatcgttatccaatcgattaaccagt
agtggcgatatcacactgaatgccggtaataatctgatgttacaggggattaagctaaac
gctgggcaagaaattaacttgcacgctgcccgtgatattcaactggaaccctataataga
actgtctggtcagatcttatggggcgttataataacaaccatcaaggttctgtatttttt
aatatatttccccgctccgaaactcctgattatacagttcagataaatgccaaaggcaat
gccttaattaatgcgggccgcgatattctgacccggggcagtaatattaatgcggacaat
aatcttaccttattagccgggcaacatattcagctagcggcgctgccatacactggtact
gattggactgatcgctcacgctacacccgccatgccgctactcgcctcaaagccggcaac
actctgaatgcggtggccaatcaccagcttatcacccagggtgcagaactcgctgctggc
ggtgatatgacactgacttccggcggcgatatgcgctttgaatcggtattgaatgagagt
cattacggcggtggcgataattccagctacagaaaactccagcaatccactcaactcaac
agcggcggtgcgctgacgttaatttcaaacggcagcatgttgtttcaggccacccagttg
atggttaaaaaagtgatggatatcgccgccaaaggcggctacctgttcgcgcaagcaatg
gaggaaaccagccattcggagcagcactggcagacccgcaagtggtgggggcgcaaaaaa
tcacaccacaatgtgcagcatgtggccaccaacaaagtcactgaatttaccgctgagggt
gatatcagtttactcagccgtgatgacagcacctatcaggccagcaaaattgccgccggc
cagaacgccaaactgaccagtacccacggcaaagtgatatttgaagcggtcaaagacatc
acttttcaacaaaaaaccgagctatcgaaaggcttctatatcaaatataccgataagggg
tatctggatgaaaagtgggtgttacccacaatccacaccggcggtgaattaactgttgat
gccgcgcagggtatccgtgctgatgtaaaagtgaagaatggtgagtcattgcgcagtgct
attactgcattgagcaagacccccggtaatgaatggcttaatgatttaaatctgcgcgat
gatgtgcagtggcaaaaagtcatggatgcctaccaccattgggatcacaaaaatgagcac
ctgaaccctgtagtggcggccgtgatagcgattgcaatagcagctgctacggcggggtcg
gggctggtggtcgctgccggagcggctgccggtggtggggtggctggtggtgcggtttct
gctggaatgtcggcactggcatcgcaggccgcggtgtctttgatgaataacaagggcgat
atctccaaaactttcaaagacatggggagtaaatcgtcggtcaaatctctggtgacctcc
atggccattgggggcgctttatctgggttcgatgctgcgatcgggggcgatagcgcggct
aaaggtgctaaaacagcgagcacgaccagtgccagattaccgcagcttagtcatggcgac
tggagcaaggtcgcccaacgggtggccggtcagtcgattatcagttccagcctgaacacc
gccatcaatggtggcagctttaaagataatctggccacggcattactaaccagtgtgggg
tctcagttgcatgctgagggcgctcatttaatcggcaataatggcgatgtattaggcgtg
tcgggcaaagccttaagccatgcgctggttgctggggttgcggctgaaattggtggcggt
actgcgaaaggcgccgccgccggagcactggccgccgagctggccggtgtggtgatgggt
gagaatatcatcgggtcacagcaatggcaggagaaacaggcgcagtttagccgtgtcgcg
ggggctattgctggtgtattagcgactggaaaagttgagggggcatatagcggtgctaat
gctggcgaagtggttgatagatttaaccggcaattgcatctggatgaaattaaagcggtt
aatgaactggctaagggcagtaacgttaaacaagagcgttttctggcagcatcttgtcgt
caggtaaattgcacagcacaagaggctctcaactcggctgaacgtgcgcgtgctgaatta
ttaatggcaaagtatcctgaaacgccagaagaagacggtattctgcgcaattactggata
caaaaagagaaaaaacgttttggtaattaccctgccctgactggttttgagcaaatccag
ttattcacctatgctgatactgataaactctctgatagtcaaaagtttgccaaaaatcag
tgggttgaagaggcttctaatctaactggttggtctagagaagcggtagaagcccttggg
atttcggcgtcgctggctggcgtggtgcgcgggaaaaggtttgggcaaacaggagcagct
tatccgacaggaattagctttaatatcaatcagaagaatcatttggctaactttgatggt
ttttctcaaagaaaagggatacacggtacacataatgcagatgcatttaatcaagctgta
tctagtaatggcgtaaaaataattagccgcacgtccggctcggtaaatggcattactcat
atcaagtatcaaattcctgcaaaagatagagcagggaacactgtaggttacaaagcagag
atactagaaaaaactatttatgatcctaaagttttttctgaccagaaaatgttaatgctc
ggacagcaagcagcagcaaatggttatcaatctgccagaaattctggagttagggaatac
aaagcaatatcggatggtgtaaaattccaaatctatttagatcaacaaacaggttctgtc
attaattttttcccggtaattaaatga
DBGET
integrated database retrieval system