Yersinia enterocolitica WA: CH47_2788
Help
Entry
CH47_2788 CDS
T03643
Name
(GenBank) bacterial Ig-like domain family protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
yew
Yersinia enterocolitica WA
Pathway
yew05100
Bacterial invasion of epithelial cells
yew05135
Yersinia infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
yew00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05135 Yersinia infection
CH47_2788
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
CH47_2788
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Invasin_D3
IAT_beta
Glyco_hydro2_C5
Filamin
CarboxypepD_reg
LysM
Big_2
LysM_RLK
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJI83324
LinkDB
All DBs
Position
complement(2999067..3006539)
Genome browser
AA seq
2490 aa
AA seq
DB search
MGSIFKGIERYLCAGFMKKAIAYTQIILQILLGTLPLYSMSFSTQANSDITKKTVLFKQL
HTLTPTDTLESVAASYGLSVDELWALNINLYNNRSAFDAVKYGAVVYVPNQEEEQRATQQ
ASLVASHLSQVGNSLSSENRVDAFSRLAKGMLLSSTAKTVEEWLGHIGQAQVKLQTDDKN
DFSGSEIDLFIPLYDQPDKLAFSQFGFRRIDQRNIMNIGLGQRHYVSDWMFGYNIFFDQQ
ISGNAHRRVGFGGELARDYLKLSANSYHRLGGWKNSARLEDYDERAANGYDIRTEAYLPH
YPQLGGKLMYEQYFGDEVALFGINERQKNPSALTAGVSYTPIPLVSLGLDHTIGNGGKKK
TGVNVAVNYEINTPWPQQIDPAAVQATRTLAGSRMDLVDRNNNIVLEYRKQQVVTLNLPE
KVSGKEKQVVPINYTFNARHGLDRIEWDAADVIKAGGQVSNVGNLAYHVAMPPYIDGAAN
AYVLSGRAIDKKGNYSTSSSTNIYVTGVNINRINSTISLNPATLPANGTSRSIIQLKLNT
DAGQAVSGASGQMTFAIRDSSGRVFKARTLLQPLVIDDVQEVQSGVYEASITSGFLTGRF
EITPTVRGVQLNPIILTQSADKTTATITDSSAVTISTPSITTNATDKTKLEVLVTDALGH
PVPGVEVKWVSDLKSPGLEHAISITNEHGIAENNFSSTVTGTANITVQVGTEAPVQAGAI
EIKADNSTMTVKANDFTVAATPVVADGTSKAVYKLKVTDKQGNVVPGAAVEWSSNIGSFV
QGSSTTTDTNGETFIELVSTKAETAKVTATVGGKPYNAGKVVFVADRQSGKITLLPVSKN
SAAANGIDSITLNAKILDANGNPIKNEEIEWDAASHKVTFSPATGKTQTNDLGETQITLT
STDVGDITLNAQVVKNNLLVNQASEKLSFTADTVTANISAWSAPSVKTLIADGQSQVIYK
VVVKDKNGHVVANSPVLWETNLGEFVPAQPTTTMTSTNSQGEATVVLASIKAGFATVKAS
VNGNKNTSPTQVEFTANRSTAKITLAPMTQRDFVANDKDKVTYSVTVVDANNNPVKAEAI
SWKAENGHPVKIEPASSQTDEQGKATVNIGSVKAGKTQIRATLGNAATAIADAITFEADR
KTAVIKTVEVKGDNKPAPDGSSSVSYVTTVVDANGNPVGGMTLSWDSNINKIASQITTTD
INGQSSQTITGTQVGKVEVSVALTEGDNAKIKKENIGEAEFVAITPVASNAELLLQPNVI
ISDGKQTATLRFTLRDANHNPVSGLASKINITQSVADHVNVGTISETTAKGVYQATITGM
KEGAVDLTTTVKGSNVSKIQTLTLQADNKTATLKSVTSDIKKAAADGTASITYTATVVDA
KGNASLADVSVAWITSLGNIAVMTRTNASGKATVTLTSKQTGNATVTAIVSSTSQMDAAP
VTFTAGGISIAHSSTSFSSVDLVADGVTTTKLTVKVNDINGNPLTGQGGKIKVTAANFPG
LKLPTAFTEVSTGVYSATITGTKAGDGEIVTQLDGTELAKQKLKVIADVLTAKIAQVESL
QAGPVTVGNKVTYQATLKDANDNLLGAGIPVHWSVNRDTLMSGKLISLTNRAGVAEVEIS
RDLVGDALVTAAVGNNSLQATAVKFISGGVDISKSSMQLLQGNITADNLDIATIQVDIRD
SKGNPLPNLANQITTSPKSGEHGLKIETTANPSGDGYLVKMKGTKAGNHTVTVSVAGKPL
SAKVDMVLKGDATTAKLEWVKSSSITFKADNVDTVTYTAKVVDANNNLLENIAVSWRLAQ
GGGQYQGQSYTGKTGVAETKLRASILGTYKMEAQVRQQVKAAADVNSTAGDIDPAQSDFV
GDVTSIDASGSTKAKLTATLKDKFGNLLIGQIVKLTDSNNLKGIKFTADPMKDNGDGTYS
TEVSATAKGNTQIIASINGVNLTQQPQLLVGNIIPQLSFDNKNVARVFTRALQPKQLLKG
LPKGVTVHWSSGNSDVAKVNPTTGEIELLKAGIVEISAMTLADSTYAVGIASYQLEVERA
DPKLAFAKRVSSTTWGQAVTKEQPNVGNSDWVSSQPQLKWSSSALDVAKVDSSGSITLLK
AGDTLIKATTEQTDQFKASEAEYVLNINKANLVLNFSQSLKQYSVDSQPSNVQSLNLPSD
LPTRAVRWSSSNPSVMNIDSYGRINRVSAGETDIKIEIDKNDFYLENSAKYLAEVYKKPS
ISISSTNIVSKGISSSNSSEWKPAFKGDQMVVNWRVSGSGKFEGPQKVVVQFIEENSGNK
LFEKESTSNLASGSTTIEDIRVKNLVGKRGRFVVKTEGISGLSSQEKTKVIDVKRLYPDE
IWNKVRFRSGYSIYHKGKSVGDCRLSKLLWNAEHHVNMNWDVGIDLGNNELIEGMEVKLR
IDKVKSTYISPRVIAIRNILKTFNEKSEPGSSGVPETLHTDCFLSHNDLVELVLDVDYLG
KTTMYNAGEVYWEGEGRYKESFVEAKVERK
NT seq
7473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttcaatttttaaaggcatagaacgttacttgtgtgctggcttcatgaagaaagcc
attgcctacacgcaaataattttacaaatattattgggtacgcttccactgtattcgatg
agttttagcactcaggcgaacagtgatatcacgaagaaaacagtgctttttaagcaactc
catacgctcaccccaactgacactctggagtcagttgcagcaagctatggcttatctgtt
gatgagctttgggcgttaaatatcaatttatataacaatcgcagtgcgtttgacgcagtc
aaatacggtgcggtggtttatgttcctaatcaggaagaagagcaacgggccacccagcaa
gcctctttggttgcttctcatttgtcccaggtagggaattcgttgagcagcgagaaccgt
gtcgatgcattctctcgtttagccaaggggatgttgttatcgtctacggcgaaaacggtc
gaggaatggttaggccatattggtcaggcccaagttaaattacagactgatgataagaat
gatttcagtggctcagaaatagatttatttatccctctctatgatcaacctgataagtta
gccttcagccagtttggttttcgtcgtattgaccaacgcaatattatgaatattgggttg
gggcaacgccattatgtgtctgactggatgttcggttataacattttctttgaccaacaa
atatccggtaatgcccatcggcgcgtaggatttggcggtgaattagcgcgggattacctt
aagctgtcagccaatagttatcatcgtttgggcgggtggaaaaattctgctcgactggaa
gattatgacgagcgtgcggctaatggttacgacattcgtaccgaagcctatttacctcat
tacccgcagttaggcgggaagttaatgtatgagcaatacttcggtgatgaagtcgccttg
tttggcattaacgaacggcagaaaaacccatcggcattaactgctggtgtcagctatacc
ccgatcccactggtaagtttaggtcttgaccatactattggtaacggcggtaaaaagaaa
actggagtgaatgttgccgtcaattacgaaattaataccccttggccgcagcagatagat
cccgcagcggtgcaagcgacccggactctggccggtagccgcatggatttggtcgatcgc
aataacaatattgtactggaataccgtaagcagcaggtggtgacattaaatttaccggaa
aaagtcagcggtaaagaaaaacaagttgtaccgataaattatacttttaatgcccgtcat
ggattagatcgtatcgagtgggatgctgccgatgtgattaaggccggtgggcaagttagc
aatgtgggtaatttggcctatcacgtcgctatgccaccctatattgatggtgcggcgaat
gcctatgtattaagcgggcgtgcgattgataaaaaagggaattactccacttccagctcc
accaatatttatgttaccggcgtcaatattaatcgtattaacagtactatttctttgaat
ccggccaccttgccagctaatgggaccagccgcagtatcattcaattgaaattaaatacc
gatgctggtcaggcggtcagtggcgcgtcaggtcaaatgacatttgcgatacgggattct
tctggccgagtatttaaagccagaactttgctacagcctttggttattgatgatgtgcag
gaagttcagagcggtgtttatgaggcttctattaccagtggtttcctgactgggcgtttt
gaaattaccccaactgtgcgtggggttcaactaaacccaattattcttacccaatcagcc
gataaaacgacggcgactattactgatagctcggcggtgactatttcgacgccatcaatt
actaccaatgcgaccgataaaaccaaacttgaagtgttagtgactgacgcactgggccat
ccggtgccgggcgttgaagttaagtgggtcagcgatttaaagtcgccgggccttgaacat
gccatcagtatcactaacgagcacggtattgcagaaaacaatttcagttcaaccgttacc
ggaactgccaatattacagtgcaggtaggcactgaggccccggttcaagcgggtgcgatt
gaaataaaagcagataacagcaccatgacggtgaaggccaatgactttactgttgcggcc
acaccagtggtggctgatggcaccagtaaagcggtttataaactgaaggttaccgacaag
cagggcaatgttgtccctggtgccgcggtggaatggtcgagcaatatcggctcctttgtt
cagggcagcagcacaacaaccgacactaacggcgaaacctttattgagctggtgagcacc
aaggcagaaacggccaaagtcacggcgactgtcggcggcaagccctataacgcaggtaag
gtggtctttgttgctgatcgtcaaagcggcaagattacgttacttcctgtgagcaaaaac
agcgcagcggccaatggcatagatagcattactctcaatgccaaaattctcgatgccaac
ggcaacccgattaaaaatgaagaaattgaatgggatgcagccagccataaggtgacgttc
agtcccgcaaccggaaaaactcaaaccaacgatttgggtgagacacaaattactcttacc
agcactgatgtgggtgatatcacccttaacgcgcaggtcgtgaaaaacaatctgttagtt
aatcaggccagtgaaaagctgagcttcactgctgacactgtcactgccaacatctctgcc
tggtcagcgccaagtgttaagactcttatcgccgatggtcagtcgcaggtgatttacaaa
gtggtggtaaaagacaaaaacggccacgttgtggcgaacagtccggtgctgtgggaaacc
aacctgggcgagtttgttccagcacagccgacgaccacaatgactagcactaatagtcag
ggtgaagctacagtggtgcttgccagtattaaggcgggttttgccacggttaaggcctcg
gttaatggtaataaaaacacatcgcctacccaggttgagtttactgctaaccgcagtacc
gcaaaaatcactttagcaccaatgactcaacgcgatttcgttgctaatgataaagacaag
gtgacttatagcgttacagtagttgatgccaataacaacccggtgaaggcggaagcgata
agctggaaagccgagaacgggcatccggttaaaattgaacctgcctccagtcaaacggat
gaacagggtaaggccactgtcaatattggttctgtgaaggctggcaagacgcagattcgc
gcgacacttggcaatgccgccacggctattgctgatgccattacctttgaagccgatcgt
aagactgcggtgattaaaaccgtggaagtgaaaggtgacaataaaccggcacctgatggt
tccagttctgtcagttatgtgacgaccgtggtagatgccaatggcaacccagtgggtggg
atgactctaagctgggacagtaatattaataagattgccagccagatcactaccaccgat
atcaatggtcaaagtagccaaactatcaccggtacgcaggtgggtaaggttgaggtttca
gtcgcgctaaccgaaggcgataatgcaaaaattaagaaggaaaacattggtgaggctgag
tttgtcgcgataacaccggtggccagcaacgcagagctgttgttacaaccgaatgtgatc
atttccgatggtaaacaaactgctacgttgagatttacgctgcgtgatgccaaccacaac
ccagtttcgggcctggcgtcgaagatcaatatcactcagtcagtagctgatcatgtgaac
gtaggcaccattagtgaaacaacagcaaaaggggtttatcaagccactatcactggtatg
aaggaaggtgcagtagatttgaccaccacagttaagggaagcaatgtaagcaaaatacaa
acgctaaccctacaggctgataataaaaccgccacattgaaatcggtcacatcggatatc
aaaaaagcggctgctgatggcactgccagtattacttataccgccaccgtggtagatgct
aagggtaacgcaagccttgctgatgtttcagtggcctggataaccagtttgggtaacata
gcggtaatgaccagaaccaatgcatcgggtaaggcaactgtcaccctgaccagcaaacaa
accggtaatgcgacagttaccgcgattgtcagtagcaccagtcagatggatgcagcacca
gtaacctttaccgctggtggcatttccattgctcactcatccactagtttctcctctgtg
gatctggtagcggatggtgttaccaccaccaaactgacggttaaagtcaatgatatcaac
ggcaatccattaaccggtcaaggtgggaagattaaagtcactgcggctaatttccccggt
ttgaaattgccaacggcatttactgaagtgtctacaggggtctatagcgccactatcact
ggtactaaagcgggtgacggtgaaattgttactcagttggatggtactgagttagctaaa
cagaagctgaaagtgattgctgatgtgcttactgccaaaattgcgcaagtggaatcgttg
caggctgggcctgttacggtgggtaataaagtcacttatcaggcgaccctcaaagatgct
aacgataacctgctgggtgccggtattccggtgcattggtcagtcaaccgcgacactctg
atgagtggcaagttgattagcctaaccaaccgtgctggcgtggcagaagttgaaatcagc
cgtgatttggttggtgatgctctggtcactgcggcggtaggcaataacagtttgcaggct
acggcagttaaatttatcagtggcggagtggacatcagcaaatccagcatgcagttactg
caaggtaatatcactgccgataatctcgatattgccactattcaggttgatatccgtgat
agcaaaggcaatccgttacctaatctggcaaaccagataaccacatcaccaaaaagtggg
gaacatggcttgaaaatcgaaaccactgctaacccatccggtgacggttatctggtcaag
atgaaaggtactaaagccggtaatcatacagtgaccgtctctgtggcgggcaagcctttg
tcagctaaggtagatatggtgctgaagggggatgcaaccacggctaaattagagtgggtg
aaatcaagcagcattacatttaaagccgataatgtggatacagtgacctataccgctaag
gtagtggatgctaataataatctgttggagaatatcgcggttagttggcgtttggcgcag
ggcggaggccagtatcaaggccagagctacactgggaaaaccggtgttgcagaaaccaaa
ctcagagccagcattctgggcacatataaaatggaggcgcaggttcgccaacaggttaaa
gcggcagcagatgtcaacagcaccgcaggggacatcgatccagcacaatctgattttgtg
ggagatgtgaccagcattgatgccagtggcagcactaaggctaagttaaccgccacgcta
aaagataagtttggtaacttattaatcggccagattgttaagctaactgacagtaataac
ctgaaaggcataaagttcactgctgatccaatgaaagataatggtgatggcacgtatagc
actgaggttagcgcaaccgccaagggtaatactcaaataattgccagcattaacggtgtt
aatttgactcagcagccgcaactgctggtggggaatattattccgcagttgagttttgat
aataaaaacgtggcgagagtctttacaagagcactacagccaaaacagttgctaaagggc
ttacctaaaggggttaccgtacactggagcagtggtaattcggatgtcgccaaagttaat
cccactaccggtgagattgaattgctcaaagcgggcatagtggagatttcagcgatgaca
ttggcagatagtacctatgccgtgggcattgccagttatcaacttgaggttgaacgggct
gatcctaaacttgcctttgctaaacgggttagtagcacaacttggggacaggctgttaca
aaagaacaacctaatgtgggtaactctgattgggtaagctctcagcctcagcttaagtgg
agcagttctgcgttggatgtcgctaaagttgattccagtggcagcattacattgttgaaa
gctggtgatacgctgattaaagcgacaacagaacagacagatcaatttaaagccagtgag
gcggagtatgtattaaatattaacaaggcaaatttagtgttgaattttagtcaatcgttg
aagcaatactcggtagatagccaaccaagtaatgtccaatcattaaatttaccaagtgat
ttaccaactcgcgctgtacgctggagttcaagtaatccaagtgttatgaacatcgattca
tatggccgtataaatcgcgtttcagctggtgaaacggatattaaaatagaaatagataaa
aatgatttctatttggaaaatagtgctaaatacttagcagaagtctataaaaaacctagt
atatccataagtagtaccaatatagtcagtaaaggtatatctagctctaactcctcagaa
tggaaacctgcatttaaaggtgaccagatggtggttaattggagagtgtcaggttccggt
aagtttgaaggccctcagaaagttgtcgtgcaatttattgaggagaattcagggaataaa
ctgtttgaaaaagaatctacatctaacttagcttctggctctacaacaattgaagatatt
agagttaaaaatttggtaggcaagcggggacgatttgtcgtcaaaaccgaaggtatatct
ggcttaagctcccaagaaaaaactaaagtcattgatgtgaaaaggctttatccagatgaa
atctggaataaagtgcgtttcaggtcagggtatagcatataccataaaggcaaatcagtt
ggcgattgtaggttgtcaaagctactgtggaacgcagagcaccacgttaatatgaactgg
gatgttggtattgatcttggtaataatgaattgatcgaagggatggaagttaaactacgt
attgataaagttaagagtacatatatctctcctagagttattgctattaggaatatactt
aagacctttaatgagaagagtgaacctggctcaagtggtgttcctgaaacattacataca
gattgttttctttctcataatgatttagtagagttagtcttggatgtggattatctcggt
aaaacgacaatgtataatgctggtgaggtctattgggagggagaaggacgatacaaggaa
agttttgttgaggctaaggtagagcgtaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
