Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 (serotype 0 3): Y11_18761
Help
Entry
Y11_18761 CDS
T02010
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K10953
RTX toxin RtxA
Organism
yey
Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 (serotype:0:3)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
yey00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02042 Bacterial toxins [BR:
yey02042
]
Y11_18761
Bacterial toxins [BR:
yey02042
]
Type II toxins: Membrane damaging toxins
Pore-forming toxins, RTX
Y11_18761
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RtxA
Peptidase_C80
RtxA_C
Peptidase_C58
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBY26305
UniProt:
A0A0H3NMI0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1883643..1893380)
Genome browser
AA seq
3245 aa
AA seq
DB search
MSKASNRSAEYFFTGVYNGDDNNNDIDAIGLGGVIYARGGNDDIFVGSIAAKVEAGSGDD
TIKGGAAYLEVLDTTGKLTVKGASGVMNIIKEGGGDIDAAVVAGANIINHTGSSGDMNIF
AIGAYNKITRKSNGYGTNGKLTLDDIVLGDARFENKALGISTDKVGAVKKEGYYLYEHKY
YHNKFSAKALTKVYLFQDEKTGDIKTKNTTTIFFLDVKANRWREINDSEYDLNNLVDINY
KVKATEIKNEYSCELPRERLNGDSILLKYEDELLLKEDNLTLNAIKLSDGNTLSAVKSTG
KPGSSYFVSRLYIYEIIITDVYTPVNIDGETMFTPGQTMTIIPYQYSVRKGYASGPNYPR
DKIPDGLVERTGSTDIGRYKRVKDIVNVPSIDSVSYSINKEVMVDKKLNRLEPNTVSNIT
NMNLINSSDDINFEGGGVANVIDSDVINGNVTFKGGGAANIITHTAAKGNTYFIGAGIAN
IIVKSGGEGNLTFNGAGLANVLVHKSQKGDMKVNAGGAVNVMVRLGNGQYDVTLIALGNI
SVHSGDGNSIVKMLGGLNTHTQIGCGNAFWIAAGGLNVMTKKGLGSLFSIVAGGGNIVTN
IDSGDATIVALGLGNIITHLGDEYYSNLSVIGVAAANVVTKKGKGDVQAILGGGINLLTH
IGSGKTDAALLGGGNILTKVGNGDTNVFMFGIGNILTHVNTQKCQTIGVMVGAGNIYTKV
GNGTTIGVMLAAGNIMSHIGTGDTYALMGGVGNIFTKVGDGDVLALMLAKGNILTQVGDG
QTIALMLAKGGNIFTKVGDGTTMVAMVSMANVMTHIGDGETFALMVGKANIFTKVGAGIS
VALMVGNMNIYSQITKVGKESVGVGIFVGKLNVMTKVGNGTTIAIMFGKANIMTHVGNGI
TGAISKAKGNVITKIGDGFTGVLAKAEGNIITHVGKGMSVAVLHGKGNVFTKVGDGISIG
LLISNKGNIMTHVGDGLTVGIVKGKLNIVTKVGHGDGINIAWGDSNVITHVGNGNRYNFI
KGKYNIVTRVGQGKEFTVVKADHNLISKSDGGKLDSYTAAWAESNIITSVGDGQTVVLAK
AKNNVITKVGKGDSYNVLWADKNISTHVGDGTKVTLAKADLNVTTDVGDGLNVTAVYGKA
NVNTKVGDGISVNVVWGKYNVSTKVGNGLNVVVMKGKANANIQVGHGLSVAANYGRNNVV
VKVGNGDFYNLSIASSNTKSNKLASLFGNIKQHLFGRAGSQAINYLMNGNEGNTTGFKNG
RGGYKIIEPNNNPNGFNINDDGLDKEYQSPETSHDFKANSEQLSKIDKPDIDSERKNAEK
ALEDTSNNKNSNNHRMNTDNNVSLENNKSAIQHDKTKAENDGARLRQEEERHRKNLHHVK
NQLDSTDESALAKIGDEYRQQVNQEAAELVNDHQAAIQSLNELSESDTSSSVYGDVGFQV
RDPFANGILSDVDKQVAQARNIANEKLEQTNTDSKRYESHMDEGLAKSESALVEGRKNVE
KAKVEENTRVSAAKDREAEAEEQKINAKTAENKAENDAIQIQGDANSAVNAAENKASAAN
KNAKGVQQKEGDKPAGRKEAGGSGRRVDQMAYVTSAAAVSDESITDSGNTPDSIMLAKAD
NSITGGTNRNTTSDIINSGKNAINQAVVSEPQDTLPIPGQSTPKYTKYGRLSSKYLNLGM
HKFTHGKDDKSLSFKFSQTLKIIRRAWYTNYKLAKQHVSKNEILESLQFNFGTCYALSAK
YMIAERNYGVGGGKAYMSWLQDIAKGSSHKMKISSNVDKTQKSILSGYYREQFESEMISI
LKIQHSLEIYRRSYDFSNEIAKRRDKMAASETVFKEGNAIDIINNLEKKLKHKNELTKSI
FDRLRGEFKHTDTATPSDIIETLSSYSEDEKFRGYDGYYGELARNGVKRAEGFNSFNPKR
SNYIEFINQLENPDKNTFVSFESENHAMSVSIIKKGSGYQWSFFEPNYGGVTFNNYQDFK
SFMDNFTKNRNSYAKSGNSFEVNYNIFTLDEKMKPIREKWDISRSNEQAYLLDRLKTGSI
EFDLGKKTKGKITEYKTETNDNGDEKITSFTVEVFDKKSKKMTSVQVDANEFSSPIKNLI
PHADHLNKLSDGANVRMVVNDDTIRFINTNTSAEVFSVKSPRSRVLGDENYNPVKAERKN
RRRIHSTNGDGKTRYSGQVIVQLEENTAVQEAAVNLAAKRPNSVHVKLDKQGRYQVISGD
PGLLKGNIRWQLVGHGRDKNDGGKGNQTFASQSPNELAKNIKRLRGDLDSDYGIKSTPQY
ISLVGCRLTGENQQQGFATEFMRAVGKEGISADISARRARVLVDDQGRKITLDEQGNQRH
KISEDKIVLRWDEQSKIKHVNDDIRNNIARSEIDIRRIGATSDESTVQRAVDRNIDEYPR
RMNKGVSPTTESETTNNSNQELSYGGNIAIQVGNDEFTSINWGTSNLGIKVGDGGFKTLT
FGDNNVMIHIGDGNSKHSVDIAGYQAFEGVQAFIGSRNLVFNYGHSNDVIFMAEKSIIIP
PLVNPFDHAARMSERLVTIAQDGESEDWLAVQDQQWTLSGAKKYLSDFSGLDANSSVDYD
TLTDFDSQNLRSGRGLTNDIESTLNAKYNQWLSNRSGGQANSLGQTSTKSSQLKNLHNKA
VFNIAVAGEGADIVATNSNWNFVFGDNIQSIMDINVGSLFSLSTQEYTSTGRVKTTMTYK
LDDLPRQMKNKLINRLASVNADTTLGDIFGVDYDKSGRIISRTGTKIDEEAVLKEMLEIV
AEFGGEKLKAISNPEKLLDGIEANLNMGSSAITSFAQSHGLQDKAPDETDNDSVTDIYTN
SPEPKNDKAFGFNSLKIPNLFAVIFNKDRQTELEDMAKNIQKNMAEDLLNMEQKLFEFLK
NSGHLIDDGDLHVSLGNYNFTFGGHGRDLAAYLGDNNNFWGGNGDDVFYGMGISNIFTGG
KGNDVGVLMGRENTMFGDAGDDVAVLAGRVNTAYLGEGNDQVFILGETGVIDTGSGQDYA
VVAGNFNQLSSGAEKDYVVIIGNNNVAELGSGDDYCRVFGNQNQVSGNSGSDKITLMGYS
SIIYGGEGDDELIADSISKFSRIEGGEGNDIIELGGYKNLFSGGAGNDYFVISAAVIDCT
VSDASGGDNILFEDIFWQDIWLQRNGHDLIVLVDRRIGITTEQSEFESIGSVTFSNYFAG
KRANIVVGIEDATSSKTILKDEALDSLVDMMSKYDITESSTDFMHQIDTNLRNNIAAAWS
NVHTV
NT seq
9738 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaagcatctaatcgaagtgcagagtatttttttaccggtgtttataatggtgat
gataataataatgatattgatgcgatcggccttggtggggtgatatatgcccgtggtggg
aatgatgatattttcgtcggatccattgctgcaaaagtcgaagctgggagcggtgatgat
acgataaaaggaggagcagcatatctggaggttttagatactactgggaagttaaccgtg
aaaggtgcatcaggggtaatgaatattattaaggagggaggtggagatattgatgccgct
gtagttgctggtgctaatattataaaccacactggaagtagtggtgatatgaatattttc
gctataggtgcatataacaaaattactcgtaaatcaaatggctatggtactaatggcaag
ttaacattagacgatattgttttaggggatgctcgctttgaaaataaagcgcttggtatt
agcacagataaagttggtgctgtaaaaaaagagggttactatttatatgaacacaagtat
taccataataaattttctgctaaagctttgactaaagtgtacttatttcaggatgaaaaa
acaggagatataaaaactaaaaatactacaactatattttttcttgatgtcaaggcaaac
cgttggcgtgagattaatgacagtgaatatgacttgaataatttggttgatataaattat
aaggttaaagcaacagagataaaaaatgagtactcatgtgagttaccgagagaacggctt
aacggtgacagtatactattgaagtatgaagatgaactacttttaaaagaagataattta
acattaaatgcaattaaactttcggatggtaatacactctcggcagttaaatcaactggt
aaacctggttcttcttattttgtgagtagactttatatttatgaaattataataactgat
gtctatacgcctgtaaatattgacggtgagacgatgtttacacccggtcagacaatgaca
attataccttatcaatattccgtacgaaaaggatatgcttctgggcccaactatccaaga
gataaaattcctgatggattagtagaacgtactggctctactgatattggtcggtataaa
cgcgttaaagacatagtcaatgtaccgagtattgacagtgtttcatatagcattaacaaa
gaggttatggtagataaaaaattaaatagactagaacctaatacagtatcaaatatcaca
aatatgaacttaattaactcaagtgatgatataaactttgaagggggaggtgttgccaat
gttatcgactctgatgttattaatggaaatgttactttcaaaggtggcggtgcagcaaat
atcatcacccatacagcagctaaaggtaatacctattttatcggtgctgggatagccaat
attattgttaagagcggaggagagggtaacctaacatttaacggcgctggtctggcgaat
gtattagtgcataaaagtcaaaaaggcgatatgaaagttaatgctggtggtgcagttaat
gtcatggtgcgtctaggcaatggtcaatatgatgtaacactgatcgctttgggtaatatt
tctgtccacagtggtgatggaaatagtattgtgaagatgctaggtggattaaatacgcat
actcaaattggctgtggtaatgcattctggattgcggcgggtggtcttaatgtcatgacg
aaaaaaggcctgggatcattattctcgatagtcgcgggtggtggaaatatagtcactaat
attgacagcggtgatgcaacgatagttgctcttgggctgggtaatattattacgcattta
ggtgatgaatactattctaatcttagtgttattggtgtagctgccgccaatgtggttacc
aaaaaaggcaaaggtgatgtacaggctattctcggcggcggtattaatttattaacgcat
ataggctcaggtaaaacagatgccgcactgttgggcggagggaatattttaactaaagtg
gggaatggtgatactaatgtcttcatgtttggtataggtaatatattaacgcatgttaat
actcaaaagtgccaaacaattggagtcatggttggagcgggtaatatttataccaaagtc
ggcaatggcaccactatcggtgtcatgctagcagcgggtaatatcatgagtcacattggc
actggtgacacttatgctctgatggggggggtgggaaatattttcacaaaagtaggtgat
ggtgatgttttggcattaatgcttgccaaagggaatatattaacccaagtcggtgatggt
caaactatagctcttatgttggcgaaaggcggcaatatttttactaaggtaggtgatgga
acaactatggtggccatggtcagtatggccaacgttatgactcatattggtgatggtgaa
acatttgcattaatggtaggcaaagcgaacatctttaccaaagtgggggctggtattagt
gtggcgctgatggttggtaatatgaatatttactcacaaataaccaaagtgggtaaagaa
tcggttggtgtaggtatttttgtcggtaaattaaatgtaatgaccaaggtgggaaatggc
acgactatagctattatgttcggtaaggcaaatataatgacccatgtgggaaatggtatc
accggtgctatttcaaaagctaaaggtaatgttattacgaaaataggtgatggctttacg
ggcgttttagccaaagctgaaggtaatattattacccatgtaggtaaaggaatgtccgta
gcagtgctacatggtaagggaaatgtatttactaaagtgggagatggtatttctatcgga
ttactaatatccaataaaggcaatatcatgacgcatgttggtgatggtctgacggtagga
atagttaagggaaaactcaatattgttacaaaagttggtcatggtgatgggatcaatatc
gcttggggggattcgaatgttatcactcatgtaggtaatggtaatcgatataattttatt
aaaggtaaatataatattgttacgcgagtaggccagggtaaagagtttaccgtggttaaa
gctgatcataatttaatctctaaatctgatggcggtaagttggacagctatactgcagcg
tgggcagagagtaatataattacctcggtaggtgatgggcagactgtggttttagctaaa
gctaaaaataatgttattaccaaggtagggaagggcgattcttataatgttttgtgggct
gataaaaatatatcaactcatgtcggagatggcaccaaggttacccttgctaaggctgat
ttaaatgttactactgatgtcggtgatggtttaaatgtgactgctgtctacggtaaagct
aatgtaaacactaaagtaggagatggaatttctgtcaacgtggtttgggggaaatacaat
gtcagtaccaaggtggggaatggcctaaatgtagttgtaatgaaaggaaaggcgaatgcg
aatattcaggttggtcatggtctttcggttgcggctaattatgggcgcaataatgttgtg
gtaaaagtgggtaatggtgatttttataatttatcaatagctagtagtaatacaaaaagt
aataagttagccagtttgttcgggaatattaaacagcatctctttggaagggctggctct
caggctattaattatctgatgaatggtaatgagggcaatactacagggttcaaaaatgga
cgcggtggctataaaataatagagcctaataataatcctaatggatttaatattaatgat
gatggtctggataaagaatatcaatcgccggaaacatcacatgattttaaagcaaatagt
gaacaattatcaaaaatagataagccagatatcgatagtgaaagaaaaaatgctgaaaag
gcgctggaggatacatcaaataataaaaatagcaataatcacagaatgaatacagataat
aatgtgtctctggagaacaataaatcggcaatacaacatgataaaaccaaggcagaaaat
gatggtgcccgactaagacaagaagaagaaagacatcgcaaaaatctccatcatgtgaaa
aaccaactggattcaactgatgaatcggctttagccaaaattggcgatgagtatcgacag
caggttaatcaagaggctgcggaattagttaacgatcatcaagctgcaattcaatcactt
aatgagctttcagaaagcgataccagcagctctgtctacggggatgtcggttttcaagtt
cgtgatccatttgccaatggtattttatctgatgtggataaacaggttgctcaagcaaga
aatatcgcaaatgaaaaattagaacaaaccaacacagacagcaagagatatgaatcgcat
atggatgaaggattagcaaaatctgaatcagctttagtggagggaagaaagaatgtggag
aaagctaaggtagaagagaataccagagtttcagcagcaaaagacagagaggctgaagcc
gaggagcaaaaaattaatgctaaaaccgcagaaaataaagcagaaaatgatgcaatacaa
atacagggcgatgcaaatagcgcggtgaatgcggctgaaaataaagcgagtgcggccaac
aaaaatgctaaaggggtacaacaaaaagagggcgataaacccgcagggcgaaaagaagca
ggaggaagtggccgccgtgtagatcaaatggcttatgtaaccagtgccgcagcggtttct
gatgagtcaatcacagatagcggaaatacacccgatagtataatgttagccaaagctgat
aatagcataacgggaggaaccaacagaaatacaacttcagatataatcaattcaggtaaa
aacgctatcaatcaagccgttgtttcagaacctcaagatactttgcctattcctggacaa
tcgacacctaagtatacgaaatatggaaggttatcatctaaatatttaaatctaggtatg
cataaatttactcatggcaaggatgataaaagtctgtctttcaaattttctcagacatta
aagataataagacgtgcatggtatacaaattataagctagccaaacaacatgtatccaaa
aatgaaattttagaatctttacaatttaattttggtacctgctacgctttatcagcaaaa
tatatgattgctgagcgaaattatggtgttggtggtggtaaagcttatatgagttggtta
caagatatcgctaaagggtcttctcataaaatgaaaataagtagtaatgtcgataagacg
caaaaaagtatcttgtcaggctactatcgtgagcaatttgaaagtgaaatgattagtatt
ttgaaaattcaacatagcttggagatttaccgtcgttcctatgatttttcaaatgagatt
gctaaacgtcgagataaaatggcagcttcggaaacagtatttaaagaaggtaatgctatc
gatattattaacaaccttgaaaaaaaactgaagcataaaaatgaacttacaaaatctata
tttgataggttgagaggggaatttaaacatacggatactgcaacaccatcagatattatt
gaaactctttccagttactctgaagatgaaaaatttcgtggatatgacggatattatggt
gaattggcgcggaatggtgtcaagcgtgccgaaggttttaatagttttaatcctaagcgt
agtaattatattgaatttattaatcaacttgaaaatccagataaaaatacttttgtttcg
ttcgaatctgaaaatcacgccatgagtgtatccattattaaaaaaggcagtgggtatcaa
tggtctttttttgaacctaattatggtggtgttacatttaacaattatcaagattttaaa
agtttcatggataattttacaaaaaatagaaatagttatgctaaatcaggcaatagtttt
gaagttaactataatatatttactttagatgagaagatgaagccgattagagagaaatgg
gatatttctcgcagtaatgaacaagcctacttactggatagattaaaaacgggtagtatt
gagtttgacttaggtaagaaaaccaaaggaaaaatcaccgaatataaaacagaaactaat
gataatggtgatgaaaaaataacttcatttactgttgaagtttttgataaaaaaagcaaa
aaaatgacatctgtacaagttgatgccaatgaatttagttcacctattaaaaatctaata
ccacacgctgatcatctgaataaattatctgatggtgctaacgttagaatggtagtgaat
gacgatacaattcgttttatcaatactaacacctctgcagaagtatttagtgttaagtcg
cctcgttcaagagtattaggtgatgagaattacaatcctgtcaaggctgagcggaaaaat
agaagaagaattcactctaccaatggggatggtaaaacccgttatagtgggcaagttatt
gtacaacttgaagagaatacggctgttcaggaagctgctgttaatttagcagcaaagcgt
cctaattctgtgcatgtcaaacttgataaacaaggtcgttatcaagttatatctggtgat
cctggtctattaaaaggcaatatccgctggcaattggtcggtcatgggcgtgataaaaat
gatgggggcaaggggaatcagacatttgctagccagtccccaaatgaattggcaaaaaat
attaaacggcttcgtggtgatcttgacagtgattatgggataaaaagtacaccgcaatat
attagcctggttggctgtcgattgacgggagagaatcaacagcaaggttttgctaccgag
tttatgcgtgctgtaggtaaagaaggtatcagtgctgatatttccgcaaggcgtgctcgt
gtattagttgatgaccaaggccggaaaattacgttggatgaacagggtaatcaaagacat
aaaattagcgaagataaaattgtattacgctgggacgaacaaagtaaaattaaacatgtt
aatgacgatataagaaataatattgcgcggtctgagatagacattcgcaggattggtgcc
acatcagatgaaagtacggtgcagagggctgttgatcgtaatattgatgaatacccacgt
cgaatgaataaaggggtatcgccaaccacagaatccgagaccactaataactcaaatcaa
gagctaagttatggcggaaatatagccattcaagtcggtaatgatgagtttacttcgatt
aattggggaacttctaatctaggtattaaagttggggatggcgggttcaagaccttaact
tttggcgataataacgtcatgattcatattggtgatggtaatagtaagcacagtgtggat
attgcgggttatcaggcttttgaaggcgttcaggcctttataggtagccgaaatcttgtg
tttaattatgggcacagcaacgacgttatttttatggcggaaaaatcaattattattcct
ccgctggttaatcccttcgatcatgccgcacggatgagcgaaagattagttaccatcgcg
caggatggtgaaagtgaggattggctggcagtacaggatcaacaatggacattatcaggg
gcaaaaaaatatctgtcagacttctcggggctagatgctaacagcagtgtagattatgac
acactaactgactttgattcgcaaaacttgcgcagtgggcgtggtttgacaaacgatatt
gaaagtacgttaaatgctaaatataaccagtggttaagcaatcggagtggtggacaagca
aattcattggggcaaacctcgacgaaatcaagtcaactgaaaaacctgcacaataaggct
gtttttaatattgctgtcgccggagaaggtgccgatattgttgctaccaatagtaattgg
aattttgtttttggtgacaacattcagtctattatggatattaatgttggttcactattt
agcttgagcactcaagaatatacatcaacaggtagagtgaaaaccacgatgacctataaa
cttgatgacttgccaaggcaaatgaagaataagctgattaaccgtttggcgagcgttaat
gctgataccacgttgggtgatatatttggtgtggattatgacaagtcaggccgaattatt
tctcgcactggtacgaaaattgatgaagaggcggtacttaaggagatgttggaaattgtt
gctgagtttggtggtgaaaaactgaaagcaattagtaacccagaaaaattgcttgatggc
atagaagctaatctgaatatggggagcagtgcgattacctcatttgctcagtcacatggt
ttacaagataaagcgcctgacgaaactgataatgattccgtcacagatatttatacaaat
tctccggaacctaaaaatgataaagcatttggttttaactcactgaaaatccctaattta
tttgctgtaatatttaataaagatcggcaaacagaattagaagatatggctaaaaatata
caaaagaatatggcggaagatctgcttaatatggagcagaagttatttgagtttttaaaa
aatagtggtcatttaatcgatgatggagatctccatgtctcgttagggaattataatttc
acctttggtggtcacggacgtgatttagctgcttatctgggggataacaataatttctgg
ggaggtaatggtgatgatgttttctatggtatgggtatttctaacatatttaccggtggt
aaaggtaatgatgttggtgtactgatgggtcgagagaataccatgtttggtgatgccggt
gatgatgttgccgtgcttgccgggcgggtgaatacagcttaccttggcgagggtaatgat
caggtatttatattgggtgaaacaggcgttattgatactggctctgggcaggattatgcc
gtggttgctggtaatttcaaccagctctctagcggggctgaaaaagattatgtggtcatc
attggcaataacaatgtggctgaattaggttcgggggatgattattgccgggtatttggt
aaccagaatcaggtttccggtaatagtggtagcgacaaaatcacgttaatgggatattca
tccattatctacggcggtgaaggagatgatgaacttatcgctgattcgatttctaaattc
agcaggatagagggtggggaaggtaatgacattattgaattaggtggttacaagaaccta
tttagtggtggagctggcaacgattattttgtgatttctgctgctgttattgactgtact
gtgagcgatgccagtggtggtgataatattctatttgaagatattttttggcaagatatc
tggctccaacgcaatgggcatgaccttatcgttctggttgatcgccggatcggaataacg
actgaacagagtgagtttgagagtattggttcagtgactttctcaaattattttgcgggc
aagcgggcaaatatagttgtgggtatcgaggatgcaacgtcgtcgaagacgattttgaaa
gacgaagcactggacagccttgtggatatgatgagcaagtatgatatcactgagagtagt
actgattttatgcatcagatagatacaaacttgcgcaataatattgctgctgcatggagt
aatgtccacaccgtataa
DBGET
integrated database retrieval system