Yersinia frederiksenii: AW19_1143
Help
Entry
AW19_1143 CDS
T03606
Name
(GenBank) bacterial Ig-like domain family protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
yfr
Yersinia frederiksenii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
yfr00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05135 Yersinia infection
AW19_1143
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
AW19_1143
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
IAT_beta
Invasin_D3
CarboxypepD_reg
Glyco_hydro2_C5
MG4
Big_3_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJI86754
LinkDB
All DBs
Position
1226310..1229426
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MQLLLPISMAFTPLISLSVCADELDEIMMKMRSAEILVESTTAPAPIYSEQPKGHIDNSA
VPDKFKPSNPFIAQEEPPLLQPSKTLPDLGSENQTSDISSANKFNFTEDNVANTATQIWG
VMDSENSTKAAESAVRGVSSGLASQAASDWLNQFGHARVQLNSTGTANADILLPLVESQN
NLLFGQLGVRYNGDRTTNNAGLGVRQFTDNWMFGVNSFYDYDLTGKNSRLGAGAEIWTDN
LKFSANGYFRLTDWHQSVLSNMEDYNERPANGFDVRALAYLPAYPQLGGSLMYEKYFGKG
VALNGGTTSPNDLGDSPSALTIGANYTPIPLITVDVAHKNGQNTSNELQLGLNFNYRFGV
PWIDQINKDAVGLMRSLAGSRYDLVDRNYNIVMQYQKQDLINLTLPTTISAHALENVTLT
GAVSSKYGTDRVEWSAPVLITAGGALAALTTESAAVRLPAYQHRQNINSYQVSAVAYDIR
GNKSNTATTQIIVQESPHQIALSVVGSSATATADGAALVTYRASVLDTANGSNTPMAGMN
VAFNSTLGDVVSSSATTDSGTATILSGALTVTHDNAIANGVATNAIKAIVTDATGNVVPN
QAVTFSADNNATIVGNGTTGVDGSVTVSLTNTKASVTHVTATVNGNSQSVDITFIADSTT
ATFLSGALTIIHDNALANGTAQDEVKAIVTDATGNVVPNQVVTFRANNNAIIAASGTTGA
DGSVTVSLTNATAGGARVTATVNSNSQSVDVTFIADSSTAVIISGALTITRDNAIANGTA
QNEVKAVVTDATGNKVPNQLVTFSANNNAIIAASGTTDSGGVVTLPLTNSTAGVTQVTAT
VNGNSQSVDVTFIPDSTTATILSGALTLTHDNAIANGVAQNEVKAMVTDATGNGVPNQVV
TFSANNNTVIAASGTTDSQGVVILPLTNTTAGVIRVTATVNGNSQSVEATFIADESTATI
IRGAFSIEDDGAVANGVATNSVKAVVTDALGNRVPNMLVNFSANNNTVIAASGTTDANGS
ATLTFTNIKSGITQGTAK
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaattactgctgcctatatccatggcatttactccactaatatcattatcggtgtgc
gctgatgagctagatgaaataatgatgaagatgcgatcagccgagatattggttgaatcc
acaacagcgccagcaccaatatattctgagcagcctaaaggtcatattgataactcagca
gttcctgacaaatttaaaccctcgaatcctttcatcgcgcaagaagagccacctctgtta
cagccgagtaaaacgctacccgatttgggatctgaaaatcagacatcagatatttcttct
gccaataaatttaattttactgaagataatgttgccaatactgctacccaaatttggggc
gtaatggacagtgagaattctaccaaagccgcagaaagcgcggtgagaggcgtatcttcc
ggtttagcttcacaagcggcctccgattggcttaaccaatttggccatgccagggttcag
ctcaattctacaggaacggccaatgcagatattttactgccgctggttgaatcgcaaaac
aacctgttatttggtcagctaggagtccgttataacggcgaccggacgacaaataatgcg
ggccttggcgtacgccaatttactgataactggatgttcggggttaacagtttttatgat
tatgatctgacgggtaaaaatagtcgtttaggggcaggggctgagatttggactgataat
cttaagttctccgccaatggctatttccggttgacagattggcaccagtcagtgctgtcg
aatatggaagattataacgaacggccagcgaatggttttgatgtccgggccttggcatat
ttgccagcataccctcagttgggtggctcattaatgtatgaaaaatactttggtaaaggc
gttgcgctaaacggcggaactaccagcccaaatgacttaggtgattcgccgtcagcgcta
acgataggggcgaattacacaccaattccattgataacagtcgatgttgcccacaagaac
ggtcagaacacctcaaatgagcttcagctcggtttgaactttaactaccgcttcggtgtg
ccgtggattgatcaaattaataaagatgctgtcggtttgatgcgcagccttgcgggcagc
cgctatgatttggtcgatcgtaactacaatattgttatgcagtatcagaaacaagacctg
atcaatttaactctgcccaccacaatttcagctcatgcgctggaaaatgtcactctgaca
ggggcagtatcatcaaaatatggcactgatcgggttgaatggagcgcgccggttctgatt
actgctgggggagccttagccgcactgaccaccgaatcggccgccgttagacttcctgcc
tatcaacatcggcaaaacatcaatagctatcaagttagcgctgttgcctatgatattcgc
ggtaataaatcgaacactgccaccactcagattattgtccaggaatcaccgcatcagata
gcactgagtgtcgtgggttcaagtgccacggccacggctgatggtgcggcgttagtgact
tatcgagcctctgtgctggataccgccaatggttctaatacacctatggctggcatgaat
gtggcattcaactccactctgggtgatgtggtctcatcgagtgcgaccactgatagcggt
acggcgactatcctcagtggtgcactgaccgtcactcatgacaatgccattgccaatggt
gtggcgaccaatgcaataaaagctatcgtgactgatgccaccggtaatgtggtgccgaat
caggcggtgacatttagtgccgataataacgccactatagtcggcaatggcacaacgggg
gtcgatggatctgtgacggtgtcactaactaacaccaaggcgagtgtcactcatgtcacg
gcgacagttaacggtaacagccagagtgtggatatcacctttatcgcggacagcacgaca
gcaaccttcctcagcggtgcactgaccatcatccacgataatgcactggccaatggcacg
gcgcaggatgaggtaaaagctattgtcacggatgccactggaaacgtggtgcccaatcag
gtggtgacatttcgtgctaataacaatgcaatcattgccgccagtgggacgaccggagca
gatggttctgtgacggtgtcactaaccaatgcgactgcgggaggggcgcgcgtaacggcg
acagttaacagcaacagccaaagtgtggatgtcacctttatcgcggacagcagtacggcg
gttattatcagcggcgcactgaccatcacccgtgataatgcgattgccaatggcacggcg
caaaatgaggtgaaagcggttgtcactgatgcgacggggaataaagtgccgaatcagttg
gtgacattcagcgcgaataacaatgcgattattgccgccagtggaacaactgatagtggc
ggtgtggtgaccttgccactgactaacagcacggcgggtgtcactcaagtcacggccacg
gtcaatggaaacagccaaagtgtggatgtcacctttattcctgacagcacgacggccact
atcctcagtggcgcacttaccctcactcatgataatgcgattgccaatggggtggcacag
aatgaggtgaaagccatggtcacggatgccaccggtaatggggtaccgaatcaagttgtc
acattcagtgccaataacaatacggtgattgcagccagtgggacaacggatagccaaggt
gtggtgatcttgccactgactaacaccacggcgggcgtgatcagggtaaccgccaccgtc
aacggtaacagtcaaagtgtagaggcgactttcattgctgatgaaagtacggcaactatt
attcgcggggcgttcagcattgaggatgatggcgcggtggcgaatggcgtcgccacgaac
agtgttaaagctgtggtgacggatgctttgggcaatcgcgtgcccaacatgttggtgaac
ttcagcgcaaataacaatacggtgattgctgccagtggcaccactgatgcaaatggctcg
gccacattgacattcactaatataaaatcaggtatcacccaggggacagcaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
