Yersinia kristensenii: HRD70_17315
Help
Entry
HRD70_17315 CDS
T08672
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
yki
Yersinia kristensenii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PATR
AC_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKJ16792
LinkDB
All DBs
Position
complement(3830242..3835113)
Genome browser
AA seq
1623 aa
AA seq
DB search
MNNTHSIVLNGKSNVLPALSQFRLHPIVLACAAALALGATTFPVRAADCSINGTTYANCT
QGQAGTSGINASGVEGTTGSNGNTAGNPTNAGTHGNNGGDATNTATSGGAGDVAATGGTL
NVTTGSLLAGGAGGSGGNANGGNGGNGGWPVQGSNANGGNGGDAGLSGIAQNGGMGGNAI
AGSGFTVNNGGSIFGGAGGAGGNALGGAGGRGGQGANNFGHSGDGGDGTAGGIAGNGAAG
GIAVTGSHFDLVSQGIIRGGNGGGAGLATGGAAGSTDLAGAPGGTMGSAGQAGADGTAGS
YGAGGVGVISTGSSTITTSNIIAGGLAGDRKTQANAIELSGGNNTLTLESGYSFVGNVIN
SGGDTLVLGGDTNSSFSVASLAASSPSSWTGDVQYYGFNNYVKTGNSTWTLSGSTTEVTA
WNINAGTLSVSSDSNLGATESALTFGSGTLENTAVISTARDMLLNTSGTLKTDANLTAAG
KISGPGSLVKTGTAALILTNNNTYAGGTTINAGTLQIGNGGTTGSVVGDITNNSALSFNR
SDALTYGGVISGSGSLNQAGNDVLTLTGDNTFTGATTISAGTLQIGNGGTTGSVVGDIIN
NSALSFNRSDALTYDGVISGSGSVVKTGNDVLTLTGDNTFTGDTTISAGTLQVGNGGTTG
AMAGNIINNSALAFNRSDTLVYGGVISGSGSLAKAGNGVLILTGDHTFTGDTTISAGTLV
VGNNTTGSVAGNIINNSTLVFNRSDALTYDGVISGSGSLNQAAIGVLTLTGNNTFTGGTT
ISAGTLQIGNGGTTGSVVGDITNNSALSFNRSDELTYDGVISGSGSVVKTGNDVLTLTGD
NTFTGATTISAGTLQVGNGGTTGSVAGDIINNSALSFNRSDALSYSGVISGSGSLVKAGN
DVLTLTGNNTFTGNTTISAGTLQVGNGGTTGAMAGNIINNSALSFNRSDALTYSGVISGS
GALAKAGTGVLTLTGNNTFTGATTINTGTLQIGNGGTTGSVVGDIINNSVLEFNRRDALA
YGGVISGSGSVVQAGNGVLILTGNNAYSGGTVVNSGTLILQGVNAAGTGDITNNDKMHFW
DTNGELSHNIYGTGSITFSGNSEVRADAEARVSAVNIDAGSKLTLLDSQAWQAGNGFSNA
GTLVLSHQSWLLGNVDNSGVLALSNQQNVASFIDGNLTNHGSLVLNPSSTSAGNNLIING
DYVGGQGSSLSLGAVLADDNSLTDQLTILGNSSGTSTLYMVNEKGYGGQTLQGLKLITVQ
GTSDAVFTQGNRITAGLYDYSLVKKENDWYLDSYPNQIRPEAASYSANLQAANTLFTLSL
HDRAGETQYEDLVTGETRSTSMWMRNEGGRSKVSMTDGQNNTNTNRYVLQLGGDVLQVSS
EPMGKFNLGVMAGYANARGQTYNSLKGYSSRNTITGYSTGVYSSWYANDQVKGGLYADSW
LQYNWFRNQVNGQEMAEEKYDSQGLTASLETGYDWLVNSWTSAPGIKNTLWLQPHAQAIW
MGVKADGHTENQGSYVEGLGNNNVQTKLGLRAYLNGKSELDRNTERKFQPYVEANWVHNT
HQYGVRIDGVDDHIKGARNAGELKTGVEAKLTERLSIQGGVSGQIGGNSYSDIAASLGGK
FNF
NT seq
4872 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaacacccacagcattgttttaaatgggaaatctaatgttttaccggcactatct
cagtttcgacttcatccgatcgtgcttgcttgcgctgccgcattggcattgggagccacc
acattccccgtgcgtgcggccgactgcagcataaacggcaccacttacgctaactgcaca
cagggtcaggcaggaacttccggtattaatgcctccggcgtggaggggactacagggagt
aatggtaacacggctggaaacccaactaatgctgggactcatggtaataacggaggagat
gccaccaataccgcaacatcaggtggcgcaggtgacgtggccgcgacaggcggtaccctc
aatgtcaccactggtagcttacttgcgggcggtgcgggcggttctggtggtaatgccaat
ggcggcaacggcggtaacggcggctggcctgtacagggaagcaatgccaacggcggaaat
gggggagatgcgggtctgtccggaattgcccaaaatggcggtatgggtggcaacgcgatt
gcggggagcgggttcaccgtaaacaatggcggctcaatctttggtggggcggggggggct
ggtggtaacgctctcggcggtgcaggtggccggggagggcaaggtgcaaacaatttcggt
cattccggcgatggtggtgatggaactgccggtggtattgccgggaatggggcggcgggc
ggcattgccgtgacagggagtcatttcgatctggtcagccagggtattatccgaggtgga
aatggcgggggagccggtttagcgaccggtggggctgcaggtagcacagaccttgcgggt
gcgcccggaggcactatggggtcagcgggacaggcaggtgccgatggtactgcaggatct
tatggtgctggtggggtcggtgttatatctactggctcaagcaccatcacgacatcgaat
attattgctggggggctcgcgggcgacagaaagacgcaggctaacgcgattgaactttca
ggcggaaataacacgctgacccttgaatccggctacagttttgttggcaatgtgattaac
agtggtggggacacgctggtgctaggcggagataccaacagcagtttttctgtcgccagt
ctcgcggcgtcatcaccatcctcatggaccggtgatgtgcaatattatggcttcaacaac
tatgtaaaaaccggtaacagcacttggacactgagcggctcaaccacagaagtcacagca
tggaacatcaatgctggcactctgtcagtgtcgagtgatagcaacctcggagcaacagag
agcgcgctgactttcggcagcggtacgctagaaaataccgctgtaatcagtacagcacga
gacatgctgctgaataccagtggaacacttaagacggacgctaatttaaccgcggcgggg
aaaatttcaggcccgggttcgctggtcaaaacaggcaccgcagcgcttatcctcacgaat
aacaatacttacgccggtggcaccaccatcaacgcgggtactctgcaaatcggtaacggc
ggcaccaccggatcagtggttggagatattaccaacaacagtgcgctgtcgtttaaccgc
agcgatgcactgacctacggcggcgtgatatctggctcaggttctctgaatcaggcgggc
aatgacgtgctgacattgaccggtgacaacacctttaccggcgctaccaccatcagcgcg
ggtaccctgcaaattggcaatggcggtaccaccgggtcagtggttggggatatcatcaac
aacagtgcgttgtcatttaaccgcagcgatgcattgacttacgatggcgtgatatccggt
tcaggttctgtggttaagaccggcaacgacgtgctgacattgactggtgataacaccttt
accggcgataccaccatcagcgcgggtaccctacaagtcggtaacggcggcaccaccggg
gcaatggccgggaatatcatcaacaacagtgcgctggcatttaaccgcagcgacacactg
gtttacggtggcgtgatatctggctcaggttctctggctaaggctggcaacggtgtgctg
atactgaccggtgaccatacctttaccggtgataccaccatcagtgcgggtactttggtc
gtcggtaacaacaccaccgggtcagtggccgggaatatcatcaataacagtacgctggtg
tttaaccgtagcgatgcattgacttacgatggcgtgatatccggctcaggttctctgaat
caggcagctatcggcgtgctgacgctgaccggtaacaacacctttaccggcggtactacc
atcagcgcgggtactctgcaaatcggtaacggcggtaccaccgggtcagtggttggagat
attaccaataacagtgcgttgtcatttaaccgcagcgatgaattgacttacgatggcgtg
atatccggttcaggttctgtggttaagaccggcaacgacgtactgacattgactggtgat
aacacctttaccggcgctaccaccatcagcgcgggtactctgcaagtcggtaacggcggt
accaccggctcagtagccggggatatcatcaacaacagtgcgttgtcatttaaccgcagc
gatgcactgagctacagcggtgtaatatctggctcaggttctctggttaaagccggcaac
gacgtactgacattgaccggtaacaacacctttaccggcaataccaccatcagcgcaggt
accctacaagtcggtaacggcggcaccactggggcaatggccgggaatatcatcaacaac
agtgcgttgtcatttaaccgcagcgatgcactgacctacagcggtgtgatatctggctca
ggtgctctggctaaggctggcaccggtgtgctgacattgaccggtaacaacacctttacc
ggcgctaccaccatcaatacgggtactctgcaaattggcaatggcggcaccacggggtca
gtggtcggggatatcatcaacaacagcgtgctggagtttaatcgcagagatgcattggct
tacggcggcgtgatatccggctcaggctctgtggttcaggctggcaatggtgtactgatc
ctgacaggaaataacgcctattctggtggtaccgttgtgaattcgggcacactgatcctg
cagggagtgaacgcggcgggaaccggagatatcactaacaatgataagatgcatttttgg
gacacaaatggtgaactgagtcataacatctacgggaccggtagcatcacgttctctggt
aattcagaggtcagagctgatgctgaggcccgagtgtccgcagtaaatatcgacgccggc
agtaaactgacgctgctggattctcaggcgtggcaggccgggaatggtttttcgaacgca
gggaccctggtgcttagccaccagagttggttgttagggaacgtagacaatagcggtgta
ttagcattgtcaaaccagcaaaatgtcgcctcattcatcgacggtaatctcactaaccac
gggagtctggttcttaatccctcatcaaccagcgcagggaataacttgataatcaacggt
gactacgtgggcgggcagggcagctcactctccctgggtgcagtgctggcagacgataac
tcgctgaccgaccagttgacaatactggggaattcctccggcacaagtacactctacatg
gtcaatgaaaaaggctacggcgggcaaactcttcagggtctcaagctgattactgtacag
ggtacctcggacgccgtctttacgcagggtaacaggatcactgccgggttatatgattac
tctctcgtgaaaaaagagaatgactggtatctggatagctatcccaaccagatcaggcct
gaagccgccagctattcagccaaccttcaggcggcgaatacgctgtttacgctgagcctg
catgatcgtgcgggagaaacacaatatgaggatctggtcaccggtgaaacgcgttcaacc
tcaatgtggatgcgtaacgaaggtgggcgcagtaaggtatcgatgacggatggtcagaac
aataccaacaccaaccgttatgtcttacaactggggggcgacgtattacaggtatcatct
gaacccatgggcaaattcaatctgggggtgatggcggggtatgctaacgccagaggccag
acctataacagcctgaagggctacagctcgcgtaataccataacgggttacagcactggg
gtctatagctcttggtatgcaaacgaccaggtgaaaggcggtttgtatgctgacagctgg
ctgcaatacaactggttcaggaatcaggtgaatggccaggaaatggcagaggaaaaatat
gacagccagggtctgaccgcatcacttgaaacaggctatgactggttggtaaatagctgg
acgtcggcccctggaatcaaaaacaccctttggttacagccgcacgcccaggcaatttgg
atgggtgttaaggctgacggtcatacggaaaatcagggttcgtacgtggaggggctgggc
aataataacgtgcagaccaagttgggtctgcgtgcctatctgaatggaaaaagtgagtta
gatcggaatactgagcgcaagttccagccttatgtagaggctaactgggtacataatacc
caccagtacggcgtgcgaattgacggtgtggatgaccacatcaaaggggcgcgtaatgcc
ggagaactcaaaacgggggtggaagctaagttgacggagcggctgagcattcagggcggc
gtttcagggcagattggtggtaacagctactccgatatcgccgcttctctgggtgggaag
tttaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
