Yersinia rochesterensis: CH54_2189
Help
Entry
CH54_2189 CDS
T03609
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15350
secreted effector protein SseF
Organism
ykr
Yersinia rochesterensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJJ34715
LinkDB
All DBs
Position
complement(2381792..2382670)
Genome browser
AA seq
292 aa
AA seq
DB search
MSLITASEINQCPEVISTFNSMEKSVNPASDDKKPILLALTELMKKLENNAIKEANIGVN
RLGDTQDCELVELKSARVKLAKKQFFINVIESIISLTSFVVGVGISICSGGVATPVAVIA
GLNLMLSLSNLACAYHNWSCASQNKEELTMGSDAIQQAVFMLARHCQASPINAKKIARFT
SYFIRAGIVISLGVIGGFIHPVINNSLCLLAKNYAPILTSMMSVVAAGALGTWMNHDSDA
KDAIITKLVTTEKETVESLASLAGEKKILAALKEFIKLSGESQQNIINGIKV
NT seq
879 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcctaataactgcatccgaaataaatcagtgtccagaggtcatctccacatttaat
tctatggaaaaaagtgtcaatccggcatctgatgataaaaaacctattcttcttgcttta
actgaattgatgaaaaagcttgagaataatgctattaaagaggcaaatattggcgttaat
agattaggtgacactcaagactgtgagcttgttgaattaaaaagtgccagagtaaaatta
gctaagaaacaattttttattaatgtgattgaatcgattatttctctgacttcgtttgtt
gtcggggttgggatcagtatttgtagcggtggtgtagcaacccctgttgctgttattgcg
ggcttaaatcttatgctctcactgtctaatttggcctgtgcttatcataactggagttgc
gccagtcaaaataaagaagaactgacgatgggcagcgatgccatacaacaagctgttttt
atgctagctaggcattgccaggcatcaccgataaatgctaaaaaaattgcccgcttcact
tcgtattttattagagctggaattgtgatttctctcggcgtaatcggagggtttatccat
ccggttattaataatagtttatgcttactcgctaaaaattatgccccaatattaacctcc
atgatgagtgtggtcgcggcgggggctttaggaacctggatgaatcatgacagtgatgcg
aaagacgctattataacaaaattggtcacaactgaaaaagagactgtcgaaagcttagcc
tctcttgcgggggagaagaagatattagccgcacttaaagagttcattaagttatcagga
gaaagtcaacagaatattattaatgggattaaggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
