Yersinia rochesterensis: CH54_3655
Help
Entry
CH54_3655 CDS
T03609
Name
(GenBank) autotransporter-associated beta strand repeat family protein
Organism
ykr
Yersinia rochesterensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PATR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJJ34569
UniProt:
A0ABM5SJ58
LinkDB
All DBs
Position
complement(3983627..3984667)
Genome browser
AA seq
346 aa
AA seq
DB search
MTGSGFNLSNDGSIIGGSGGAGGNAFGGAGGRGGQGANNSGRSGDGGDGSSGGTAGNGAA
GATAVTGSNFQLVNRGIINGGNGGRAGLATGGSAGDTDYAGAPLGTIGSVGQAGAEGTSG
TYGAAGVGVVSTGSSTITTSNLIAGGLAGNGTTQANAIEFSGGNNTLTLESGYSFVGNVI
SSGGDTLALGGDTNGSFFVSSLAATSPPSWSGAVQYYGFNDYVKTGNSTWTLNGSTTEVT
AWNINAGTLSVSNDSNLGAAEGGLTFNGGTLENTAAISTARDMLLKTTGTLQTNANLTAT
GLISDLGSLVKTGAATLTLTSNNTYSGGTTGSVVGNIINNITAVMH
NT seq
1041 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagggagtgggttcaacctaagcaatgacggctcaatcatcggtgggtcgggcggt
gccggtggtaacgctttcggtggtgccggtggccgagggggacagggtgcaaacaattcc
ggtcgttccggcgatggtggtgatggaagttctggtgggactgctgggaacggggctgcg
ggtgccactgccgtgacagggagtaattttcagttggtcaaccggggtattatcaacggt
ggaaatggagggagagccggtttagcgaccggtggatcagcgggtgatacagactatgct
ggcgcgcccctaggcactataggttcagtaggacaggctggggccgagggtacgtcaggg
acttatggtgccgccggggtcggtgttgtgtctactggctcaagcaccatcacgacatca
aatcttatcgctggagggctggcgggcaatggaacaacgcaggctaacgcgattgaattt
tccggcggaaataatacgctgacccttgagtccggctacagttttgttggtaatgtcatt
agcagtggtggggacacgctggcgctaggaggagataccaatggcagtttctttgtctcc
agcctcgcggcaacatcaccgccctcatggtcaggtgccgtgcaatattatggtttcaac
gactatgtaaaaaccggtaacagcacctggacacttaacggttcaaccacggaagtcaca
gcatggaatatcaatgccggtactctgtcagtatcgaatgatagcaacctcggagcagca
gagggtgggctgactttcaatggtggcaccctggaaaataccgcagcaataagtacagca
cgagacatgctgctgaagaccactggaacacttcaaaccaacgctaatttaactgcgacg
gggctaatttcagacttgggctcgctggtcaaaacaggcgcagcaacacttactctcact
agtaataacacctattccggcggcaccactgggtcagtggtcggaaatatcatcaacaac
ataaccgcagtgatgcactga
DBGET
integrated database retrieval system