KEGG   Yersinia massiliensis: DA391_19975
Entry
DA391_19975       CDS       T05402                                 
Name
(GenBank) translocation and assembly module TamB
  KO
K09800  translocation and assembly module TamB
Organism
yma  Yersinia massiliensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:yma00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:yma02000]
    DA391_19975
Transporters [BR:yma02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   DA391_19975
SSDB
Motif
Pfam: TamB
Other DBs
NCBI-ProteinID: AVX39732
LinkDB
Position
complement(4317727..4321545)
AA seq 1272 aa
MRWVKRLSIAFLLIILLLVGTLAGLLGTTSGLHFLINSAVRWVPGLDIASVTGGWRDLTL
KGIQYQMPGVTVKAGQFHLSLQLSCLKRSELCVNALTAQDVDVVVDTKALPPAAETPAST
EPMGELSTPYPITLRMLTLNNVKVTIDDTAISLDEFRTGAHWQQRALNLMPTKINGLLIA
LPKTVPAIVPDAAKPAVETAIAVKEAVEQQAVAPIPIEPELPLGERLKALFAEPLLPELP
DFRLPLDLQINAISGQQLRLTGDTDVLISSLLLQASTQDQRITLDTLEIKSPQGGLSAQG
EATLNETWPLSLVVNSTLNVEPLKGEKVKLTVGGALREQLKVALNLSGPVSAQLDAETSL
AQAGLPLALTLQSKQLRWPLAGDSTYQIDNLRMRLNGQATDYALSLRSDVKGTDLPPAVV
MLDGKGNVEQFNLTRLRLAALQGNTDLTGVVDWRQAISWNSVLTLSGINTAKQWPEWPAK
LDGKIVTRGSIHGGSWQLQVPELTLDGNVKQNRVTARGSLTGNAAGQWHIPGINLALGRN
KLDVKGDLNEQWQLDANVDAPQLDGALPGLAGVVNGTLRLRGNLKAPQLLADLTANRLQW
QELSINRVRIEGDVRSTDQIQGQLAIRVEQLKQADLVVSLLTLDARGSEKQHQLRLNMQG
EPVSGQLALEGSFDRQQERWRGTLNNTRFDTPVGEWRLSRAIALDYQNTLERVTIGPHCW
LNPNAELCVPRAIEAGPSGQASVVLNRFDLAMIKPFLGPETTLDGVFTGRADVSWKAGGS
LPDVRVSLSGNGVKVQQVVQGNTLPIAFETLNLNGGLTNGQVRADWLIKLVNNGQFSGQV
QVADPEGRRNLSGNIAINNISLAMINPILSDGEKAAGLLNANLRLGGNAKSPLVFGRLAL
DNVDVDGSWMPFDITEGRLVMNFDGMTSTLDGLIRTSQGQLNLSGDADWRDINAWRARIA
AKGNKLRVTVPPMVRIDVSPDIVFEATPQLFTLNGSVDIPWARITVQEVPETAVGVSSDE
VMLNNDLKPISPRSNSIPINSNLVIRVGNDVRLNAFGLKARLQGDLKMVQDQRGLGLNGQ
INIPSGSFRAYGQDLIVNKGVLLFSGPPDQPLLNIEAIRNPDATADGVTAGVRVTGMADA
PRLEIFSDPSMSQQEALSYLLRGQGLGNSGADSGLMTSMLVGMGVAQSGKLVGKIGEAFG
VTNLALDTQGVGDSSQVVVSGYVTKDLQVKYGVGIFDSLATLTLRYRLMPRLYLEAVSGI
DQALDVLYQFEF
NT seq 3819 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaggtgggtaaagagactcagtatcgcatttttgctcattatcctactgctggtgggg
acgttggcgggtctgcttggtaccaccagtggcttgcacttcttgatcaacagcgccgta
cgttgggtgcctgggttggatattgccagtgtcactggtgggtggcgtgacctgactttg
aagggtattcagtaccaaatgccgggcgttaccgtgaaagcaggccaatttcatctgtca
ttacagctttcttgccttaagcgcagtgagttatgtgtcaatgcgttgaccgcacaagat
gtggatgtggtagtggataccaaagccttgccgcctgcggcagaaacacccgccagtacc
gagccgatgggggagttgagtaccccataccccatcacgttacgtatgctgacgctgaat
aatgtcaaagtcaccattgatgatactgcgatttcgttagacgaattccgtacgggcgca
cattggcagcaacgtgcattgaacttaatgccaacgaaaatcaatgggttattaattgca
ttacccaaaactgtacctgctattgtccctgatgctgccaaaccagcagttgaaacagcc
atcgccgtaaaagaagcggttgagcagcaagctgtggctcccatccccatagagccggaa
ctcccgctcggtgagcgcttaaaagcgttgtttgccgaacctttactgcctgaattaccg
gatttccgcttaccgctggatttgcagattaatgcgatctcagggcaacagcttaggctg
acaggcgatactgatgtgctgatcagtagtctcttgttgcaagctagcactcaagatcaa
cgcatcacactggatacgctggaaattaagtcgccacaaggcgggttgtcggctcagggg
gaggcgacattgaatgaaacatggccgctgagtctggtcgtcaacagcacattgaatgtg
gagccgctaaaaggcgagaaagtgaagctcaccgtgggtggtgcactacgtgagcagctc
aaggtggcactgaacttatctggcccagtcagtgcgcaattggatgcagaaacctcgctg
gcacaagccggtttacctttagccttaaccttacaaagtaagcaactacgttggccactg
gcgggtgactccacataccaaatcgacaatcttagaatgcgcctaaacgggcaagcgacc
gattatgcgctctcccttcgctctgatgtgaaaggcacagatttaccgccagcggtagtg
atgctggatggtaaaggcaatgttgagcagttcaatctcactcgtttacgtctggcagcg
ttgcaaggtaatacggacttaactggggtggtagattggcgtcaggccattagttggaat
tcggtattaaccctgtcagggattaacacggcgaagcagtggccggagtggccggcaaaa
ctggatggcaagattgttacccgaggcagtatccacggagggagctggcagttacaggta
ccagagctgacgctggatggcaacgttaaacaaaatcgcgtgacagcccgtggttcattg
acagggaatgccgcaggtcagtggcatattcctggcatcaatctggcattggggcgtaat
aagctcgatgtaaaaggtgacctcaatgagcaatggcagcttgatgccaatgttgatgcg
ccacagcttgatggggcgttaccggggcttgccggtgttgtgaacggcacactgagattg
cgcggcaaccttaaagcaccacaactgctggctgacctcaccgccaaccgcctgcaatgg
caagaattaagcattaatcgggtcagaattgagggtgatgttcgctcgacggatcaaatt
cagggccagcttgccattcgggtagaacaacttaagcaagccgatttagtggtcagtttg
ctgacgttggatgcccgtggcagtgaaaaacagcatcagttgcgcctgaatatgcagggt
gaacccgtgtctggtcagttggcgttggaggggagttttgataggcagcaagagcgttgg
cgtggcacgctcaataatacccgcttcgacactcctgttggtgaatggcgcttaagtcgt
gcgatagcgctggattaccaaaatacgttagaacgggtcactattgggccacattgctgg
cttaatccgaatgcggagctttgtgtccctagagccattgaagcgggccccagcgggcag
gcgagtgtcgtgctcaatcgttttgatttagcaatgataaagccgtttcttggtccagag
acaaccttagatggcgtgttcaccggccgagccgatgtgagttggaaagcagggggcagc
ttgccagatgtgcgggtatcccttagtggtaatggcgttaaggtgcagcaggtcgtgcag
ggtaatacgttacctattgcattcgaaacgctgaatctcaatggtggcctcaccaatgga
caagtacgtgccgattggctcatcaaactggtgaacaacggccaattctcagggcaggta
caggttgcagacccggaagggcggcgcaatctatccggtaacatcgctatcaataatatc
tccttagcgatgattaacccgattctcagtgatggcgaaaaagcagcgggcctattaaat
gccaatctacgtttgggtggtaatgccaaaagtccattagtgttcggtcgattagcgctg
gataatgtggatgttgatggcagttggatgccatttgatattaccgaaggtcggctggtg
atgaatttcgatggcatgacctcaacgctggatgggttaattcggacgtctcaagggcag
ctcaatttgtctggcgatgctgattggcgtgatatcaatgcttggcgtgcccgaatcgca
gcaaaaggcaacaagttgcgtgtcactgtcccgccgatggtacgaattgatgtttcgcca
gacatagtgtttgaagctacaccgcagttgttcactcttaacggctcggtggatatccct
tgggcgcgtatcactgtgcaggaagtaccggaaactgcggttggtgtgtcttccgacgaa
gtgatgctcaataatgacctaaaaccgatttcaccacggtcaaacagtattcctatcaac
agtaatctggtgatccgagtcggtaacgatgttcgtctcaatgcatttggccttaaagcc
cgtttgcagggcgatttgaaaatggttcaagatcagcgtgggttgggcttgaacgggcag
attaatatcccgtctggtagtttccgagcttatgggcaggatttgatcgtcaataaaggg
gtactactgttctctggaccaccagatcagccgttactcaatattgaagcaatacgtaat
cctgatgccactgctgatggcgtgactgcgggtgtccgagtgacgggaatggccgatgca
ccacggctggaaatattctcggatccgtcgatgtcgcagcaagaggcgctgtcgtacttg
ttacgtgggcaggggttaggcaattcaggagcagacagcggcctgatgacctcaatgctt
gtcggaatgggggttgcacaaagtggcaaacttgtgggtaaaattggcgaggcatttggt
gtcactaacctagcacttgatacgcaaggggttggcgatagctcgcaagtggttgtgagt
ggctatgtcaccaaagatctgcaagtaaaatacggagtaggtatatttgactcgctggca
acgttaacattacgttatcggttgatgccaaggttgtatctagaagcggtgtctggtatt
gatcaggcattagatgtgctttatcagtttgagttctaa

DBGET integrated database retrieval system