Yersinia pestis Antiqua (biovar Antiqua): YPA_1335
Help
Entry
YPA_1335 CDS
T00369
Name
(GenBank) haemin storage system, HmsF protein
KO
K11931
poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine N-deacetylase [EC:3.5.1.-]
Organism
ypa
Yersinia pestis Antiqua (biovar Antiqua)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GHL13
Polysacc_deac_1
GHL10
A-sol_ELP1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG13302
UniProt:
A0A0E1NRK0
LinkDB
All DBs
Position
1500922..1502943
Genome browser
AA seq
673 aa
AA seq
DB search
MAKLLIFIKSLIVGMMIVSTMGCAEKPTFVPPAQRALPQSERPWQKNTFVVIAYHDVEDD
SADQRYLSVRSSALNEQFVWLRDNGYHVVSVDQILAARNGGPTLPDKAVLLTFDDGYSSF
YRRVYPLLKAYKWSAVLAPVGTWIDTATDKKVDFGGLSTDRDRFATWKQITEMSKSGLVE
IGAHTYASHYGVIANPQGNTEPAAANLQYDPKTKQYETVEAFKQRMEKDVALITQRIVQA
TGKQPRVWVWPYGAPNGTVLNILRQHGYQLAMTLDPGVANINDLMNIPRILISNNPSLKD
FALTVTSVQEKNIMRVAHVDLDYLYDPDPAQEKENLDKLVQRISDLRVTHVFLQAFSDPK
GDGNIRQVYFPNRWIPMRQDLFNRVVWQLASRPDVEVYAWMPVLAFDMDPSLPRITRIDP
KTGKTSIDPDQYRRLSPFNPEVRQRIIDIYRDMAYSAPIDGIIYHDDAVMSDFEDASPDA
IRAYEKAGFPGSITTIRQDPEMMQRWTRYKSKYLIDFTNELTREVRDIRGPQVKSARNIF
AMPILEPESEAWFAQNLDDFLANYDWVAPMAMPLMEKVPLSESNEWLAELVNKVAQRPGA
LEKTVFELQSKDWTQPEGNNAISGPILAGWMRQLQLSGAQSFGYYPDNFITGEPPLKDVR
PVLSSAWYPLYDR
NT seq
2022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaagctattaatttttatcaaatcgctcattgttgggatgatgatcgtgtccact
atggggtgtgcggagaagccaacgttcgttccgcctgcacaacgtgcattgccgcaaagt
gaaagaccgtggcaaaagaatacatttgttgtgattgcttatcatgacgttgaagacgat
tcagccgatcaacgctatctgtcggtaagaagcagcgcattaaatgagcagttcgtgtgg
ttgcgtgataacggttaccacgtggtttctgttgatcaaattttggcagcccgtaatggt
ggccctacattgccggataaggcggtgctcctcacctttgacgatggttacagcagtttt
tatcggcgcgtttatcccttactgaaagcatacaaatggagtgccgtattagcgccagtg
ggcacttggattgatactgccaccgataaaaaagtggattttggtggcttgagcactgat
cgggatcgttttgccacatggaagcagattactgaaatgtctaaatcagggttggttgaa
atcggggcgcatacttacgcttctcactatggtgtgattgctaacccacaggggaatacc
gaaccggcggcggccaatctgcaatatgatcccaaaacaaaacagtatgaaactgttgaa
gcctttaagcagcgaatggagaaagacgttgcgttgataactcagcgtattgtccaggca
acagggaaacaaccacgggtttgggtttggccatacggtgcgccgaatggtacggtgcta
aatattttacgccagcatggttatcaactcgccatgaccctagatcctggtgtggctaat
attaatgacttgatgaatataccgcgcattttaatcagtaataatccgtcactgaaggac
tttgccctcacggttaccagcgtgcaggaaaaaaatatcatgcgggtggcgcatgttgat
ttggattatctctacgatccagacccggctcaggaaaaagagaatcttgataagttggtt
cagcgaatttctgacctacgtgtcactcacgttttcctgcaagcattttctgatccgaag
ggggatggcaacattcgccaggtttacttcccgaaccgttggatcccgatgcgtcaggat
ttgtttaaccgggtggtatggcaattggcttcacggcctgatgttgaagtctatgcctgg
atgccggtattggcgtttgatatggacccgtctttacctcggatcacgcgtattgaccct
aaaaccggtaaaacgagtatcgacccagatcaatatcgccgtttatcaccttttaaccct
gaagtaagacagcgcattattgatatctatcgtgatatggcctatagcgcgccgattgac
ggaattatctatcacgatgatgcggtgatgtctgattttgaagatgcttcccccgatgct
atccgggcctatgaaaaagcgggcttccctggttcgattaccacgatacgccaagatcca
gagatgatgcagcggtggactcgttacaagagtaagtatctgattgattttactaatgag
ttgacccgcgaagtccgtgatatccgtggcccacaggtaaaatcggcgcgtaatattttc
gctatgcctattttagaaccagaaagcgaagcatggtttgcacagaatcttgatgatttc
ctcgctaactatgattgggtcgcaccaatggccatgccgttaatggagaaagtgccgcta
tctgaatctaatgaatggttagcggagctagtcaataaagttgcgcaacgccccggtgct
ttggagaaaaccgtgtttgaactgcaatctaaggactggacccaacctgagggcaataac
gccatcagcggcccaatactggcgggatggatgcgccagttgcagttaagtggtgcgcaa
agttttggttactacccggataactttattactggcgaaccaccgctaaaagatgtccgc
cctgtgctgtcttctgcctggtaccctttatatgatcgatag
DBGET
integrated database retrieval system