Yersinia pestis Harbin35: CH55_4242
Help
Entry
CH55_4242 CDS
T03717
Name
(GenBank) phospholipase D family protein
KO
K11009
murine toxin
Organism
ypj
Yersinia pestis Harbin35
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ypj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02042 Bacterial toxins [BR:
ypj02042
]
CH55_4242
Bacterial toxins [BR:
ypj02042
]
Not specified
Ymt
CH55_4242
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PLDc
PLDc_2
DUF771
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJK06087
UniProt:
A0A0H2W1R7
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:complement(63074..64837)
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
MLQIDNVINNIGNYFHHLSNINYIRLLDTPHAWGAPFGKEIMQQSYLRQEEFAGAMTEVL
RNSRYRCDISSLNSPDAEWRKVIFKAIDESLSKKMGRTQPTQYRFLFGQSPTVFMNGLSA
ATNGSPDFVAFKSELIQLIKERGQYWEKMPEIWLGRFFRIEEGLATSFMRNVYPDFPPIN
DTRMTWNHTKIMASDGTEALVGGHNMNMDLFRNYPPVHDVSIITHGSSAYGSQLYLNELW
SCNSDLLKKEYFDYESMMWAVGTKFYDKPEDPLKSSVAMNYMKQRQEDLLNLHENFNQKV
ATRISEYENMEEYKKADRVLSVGKYWTGPNMEHDYQRGSEIMKEQLIKNAKRIIRISQQD
LVSAWKKKWKDHFTCNWIIEALLENKDLHIHVVVSALDAAAGAAGDQYSFGSGAERTYEL
FKYYLTHDIDTDEVLDDPDGSRADALKRILIAPFFFTDKVPDENTIEGETYKWPDLEQSA
YTATLKQKPLSEKPPHQGIIGSALMSAIKGSGLFYPKVPVAPGNHAKLMIIDDELYVVGS
DNLYPGYLSEFDYLVEGKDAVNELMKSYWEPLWKYSSPHAFPKLSPN
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttcaaatagataatgtcattaataatattggaaactactttcatcatctaagtaac
attaattatatacgacttctggataccccccatgcttggggagccccatttggtaaagaa
atcatgcagcaatcttacttacggcaagaggagtttgcaggggcaatgactgaagtactg
cggaattcgcgttatcgctgtgatatatcatcacttaatagccccgatgcagagtggcga
aaagtgatttttaaggccattgatgaatccttatcgaaaaaaatggggcgaactcagcca
actcagtataggtttcttttcggccaatctccaacagtatttatgaatgggttatctgct
gcaacaaatggctcccctgactttgttgcttttaaatcagagttaattcagctaattaag
gagcgaggacaatattgggaaaaaatgcctgaaatttggctaggccgtttctttagaata
gaagaagggttggctacatcatttatgagaaacgtgtatcctgatttcccaccaatcaac
gatacaagaatgacatggaatcacacaaaaataatggcctcagatggtactgaagctctt
gttggtggacataacatgaacatggatctatttagaaattatccacctgttcatgatgta
tcaattatcactcatggttcttctgcttatggctcccagctatatcttaacgaactatgg
tcatgtaattcagatttactaaaaaaagaatattttgattatgaaagcatgatgtgggcg
gtcggaacaaagttctatgataagcctgaagatccgcttaaaagctcagttgctatgaat
tatatgaagcaacggcaagaggacctactcaacttgcatgaaaactttaatcagaaggta
gcgactcgtattagtgaatacgaaaacatggaagagtataaaaaagcagacagagtttta
tcagtaggtaaatattggacaggacctaatatggagcatgactaccaaagagggtctgaa
ataatgaaagagcaactgataaaaaatgctaagcgcataattagaatttcacagcaagat
ctcgtgagtgcttggaaaaaaaaatggaaagaccactttacgtgtaattggattattgag
gctttgttagaaaataaagatcttcatattcatgttgtagtctctgctctagatgcagca
gctggagctgctggtgatcagtactcatttggttctggagcagaacggacctatgaatta
tttaagtattacctaacccatgatattgataccgatgaagtattagacgatcctgatggt
agccgtgctgatgccttaaaaagaatattgattgcaccattcttctttacagataaagta
cctgatgaaaatacaattgaaggcgaaacctacaagtggcctgatttagaacaaagcgct
tatactgcaacacttaagcaaaaaccactttcggaaaaacccccgcatcaaggtattatt
ggtagtgcactaatgtcagcaattaaaggtagtggacttttctatcctaaagtccctgtt
gcacctggtaatcacgccaaattaatgattattgacgatgagttgtacgttgttggatca
gataatctttatcccggttatctgtcagagtttgactatttagtcgaaggaaaagatgca
gttaatgaattaatgaaatcttactgggaaccattgtggaaatattctagcccacatgca
tttccaaaattaagcccaaattga
DBGET
integrated database retrieval system