Yersinia pestis PBM19: CH59_852
Help
Entry
CH59_852 CDS
T03716
Name
(GenBank) tonB dependent receptor family protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ypw
Yersinia pestis PBM19
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ypw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ypw02000
]
CH59_852
Transporters [BR:
ypw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CH59_852
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJI92375
UniProt:
A0AAX2I0G7
LinkDB
All DBs
Position
complement(962607..964679)
Genome browser
AA seq
690 aa
AA seq
DB search
MMVFYRKFFTVTVLISLPCLAWSQSHNNSKDELDTITVVAQKINQQQQKTPISISVLTGF
DLERENIENIYESIMRIPNVYMVKAGNPSDAGFFTMRGTTPGMEGIQSVGFFIDGVYANT
FDTELLDVDRIEVLRGPQATLYGRNTESGVINVITKDPEFSPEYKIGLSYGNYNRTQVTT
VLGGSINDSEQFSYRAALKYLYGNGYFKRDYDGKNNVDNLNDFSGRFKLRWQPMDDGWDV
MTTFDIQNRRNGNTSFTALDKIKSGQKYVDSNYIGKSDVDAYKGQVNAVYTFDDIDFTSV
SAYVDERKVDNQDLDFTRLSISELLMNRKTKQFSQEFRLNSKYSGPFNWLIGSYYFYQDD
ENEIDFRYLPYNLAQLRKSDIKTNNYAVFGNVNYYLLNDVELVAGARYDYEKKKLNFLMD
NGFNPYQPYSHDNNSNSFGAFLPKVGLNYYITGDAMLYTSIARGYKSGGFNTLGPQSSRA
YNAEYMTTYEAGVKTEWFDRTVRWNTSLFWNDMKDQQVEVAYYPISYSVNSGKSLSRGLE
SELAWRITRGLTVSANVGYTDAYFKNFPTEIKVDNNYIPVNYKGNRPANSPGYTYSIGAD
YNFLNGYFVNATYNVKGSTYLDNANSKKQPAYGLLDLTAGYENKDYGVNVWIKNILDETY
VTRAFKMDDGIWYGRAGEPINFGVNFNVKF
NT seq
2073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggtattttatcggaagttttttactgtaacggttttaatttcattaccctgcctg
gcatggtcacaaagtcataataacagtaaggatgaattagatactattacggtagttgca
caaaaaattaatcaacagcagcaaaaaacacccataagtataagtgtattaacgggcttt
gatttagaaagagaaaatatagaaaatatctacgaatcaataatgcgcatccctaatgtc
tatatggttaaagcgggcaatccatctgacgcaggtttttttaccatgcgaggtacgacc
cccggaatggaagggattcaatcagtaggtttctttattgatggtgtttatgctaatact
tttgatacggaattattggatgttgatagaatcgaagtattaagaggcccgcaagcgacg
ctatatggtcgtaatactgaatctggggtaatcaatgtcattactaaagatcctgaattt
tcacctgagtataaaataggtctatcttatgggaattataatcgtacacaggtaaccacg
gttttaggtggaagtattaatgacagtgaacagttttcttatcgtgcagcattgaaatat
ctttatgggaatggctactttaagcgtgattatgacggtaaaaataatgtagataatctc
aatgattttagtggtcggtttaaactacgttggcaacctatggatgatggttgggatgtg
atgacgacctttgatatccaaaataggcgtaacggaaacacttcttttaccgcattagat
aaaataaagtcgggtcaaaaatatgttgactcaaattatattggcaaatctgatgttgat
gcttataaaggtcaagtaaatgcagtttatacctttgatgatattgattttacctcggtt
agtgcttatgtagacgaaagaaaagttgataatcaagacctcgattttacgcgattatca
attagtgaactattgatgaatcgaaaaacaaaacaattttcacaagagtttcgtttgaac
tctaaatacagcgggccatttaattggttgatagggagctattatttttatcaagatgat
gaaaatgaaattgatttccgctatctgccctataacttagcacaactccggaaatccgat
atcaagaccaataactacgcagtgtttggcaatgttaattattacctgctgaatgatgtt
gagcttgtggcgggtgcaaggtatgactatgagaaaaagaaacttaactttttgatggat
aatgggtttaacccatatcagccgtattctcatgataataatagtaattcatttggggct
tttttgcctaaggtagggttgaattattatattactggcgacgccatgctatataccagc
atagcacgggggtataaaagtggcgggtttaacacgttagggcctcaatctagtcgcgct
tataatgcagaatatatgacgacttatgaggccggtgttaaaaccgaatggtttgataga
acggttcgttggaatacgtctctattctggaatgatatgaaagatcagcaagtcgaagtg
gcgtattatcctatttcttattcggttaacagcggtaagtcattaagccgtgggttggag
tctgaacttgcgtggcgtattacgcgtggcctgactgtatctgcaaatgtaggctatact
gatgcgtattttaaaaatttcccaacagaaataaaagtagataataactatattcctgtt
aactataaaggtaatcgaccggctaattcgccagggtacacttatagtattggtgccgat
tataacttccttaacggttattttgttaatgctacttataatgttaaaggaagtacttat
cttgataatgcgaatagtaaaaaacaaccagcttatgggctattagatcttactgccggt
tatgagaataaagattatggtgtcaatgtttggataaagaatattcttgatgaaacttat
gtgactcgtgctttcaaaatggatgatgggatatggtatgggcgcgcgggtgaacctatt
aattttggggttaatttcaatgttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
