Yersinia ruckeri Big Creek 74 (serotype O2): UGYR_09615
Help
Entry
UGYR_09615 CDS
T03887
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16152
heme acquisition protein HasR
Organism
yrb
Yersinia ruckeri Big Creek 74 (serotype O2)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
yrb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
yrb02000
]
UGYR_09615
Transporters [BR:
yrb02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
UGYR_09615
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKA38624
LinkDB
All DBs
Position
complement(2118028..2120523)
Genome browser
AA seq
831 aa
AA seq
DB search
MNNIYVKRINFKRLINITLFWLFSLISIKGYSNQFVNNPIHPKSNKNDVELETIKIEGSS
NEHSSDWIYDEPRSISEITKEQLDNRPARHAADILEQTSGVYSAVDQQDPALSVNIRGIQ
DFSRINMNIDGMRQNFTKSGHGGRNGVMFIDPEILSTVVIEKGSTNGIGSGGVIGGITTF
NTINAEDFLEPGKEIGGRLRAMTGDNGTYFIGGGVLALGNETGDLLLAASERNFGDYWPG
NIGDLAGVRFGYKSWKKNAVGEELKHMQVLNSGYKMHTRLAKVGWNLPAEQRLVASYLQT
QAYSPNGGFLVSVKNAPNKSGVGWRTSSISDVMTRNIALDYQLQPGHLSWLDIMAKAYYV
DTDDRTNTLCSDWVRCDKYFTRTRLTTRGLQWQNTQLLNLPDNHLLSFKYGIDWFSDRSS
GHSTKDSMVGVTPEGKRSLTSVFTQLDYHYDNWLRLDGGLRFDKSHLQGHTWLPTWHLPH
TIDNPCKRPANYYKLGYNPIDPCVRQRLIMTWDVDRHEQQLLPTVAMGIKPGVQWLEFFG
NYGKSWRPPGITETLATGSAHGSGRFFPNPRLAIERSRTWEAGFNIQQSDLLVNGDKFAA
KMAYFDTRVTNYINLELGKQLPKLGRSSFAYAAFGNNLLKSRFRGFEYQLSYDAGLFYTN
LSYTRMLGHNDSCSKPAWLGGVQAVGYSRAKGIYTVEQRWQDHRVVCSHGEIFGSSAYLP
GDRGSLTLGGRALNKLLDFGTVIRYNRGYQDLSVLNSAGYPGTSYVADWPKYTIFDLYAS
YKLTNNFTLRGSIENINNRAYLVNYGDSLSFSASRGRTIQGALNTNFKVFR
NT seq
2496 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatatttatgtaaagagaataaactttaagaggttaataaatataactttgttt
tggcttttttcattgattagtattaaaggttactctaatcaatttgttaataaccccata
catcccaaaagcaataaaaatgatgttgaattagaaacgataaaaatagaagggagcagt
aacgagcattctagtgattggatatatgacgagccgcgatcgattagtgaaataactaaa
gaacaattagataaccggcctgccagacatgccgctgatatattagaacaaacttctggt
gtgtattccgctgtggatcaacaggatcccgcgctgtcggtcaatattcgtggtattcag
gattttagccgcatcaatatgaatattgacggtatgcggcaaaattttacgaaaagtggt
catggcgggcgcaatggcgtgatgtttattgatcctgaaattctcagcactgtcgtgatt
gaaaaagggtcgaccaatggtattggcagcggcggagttattggtggtatcacaacattt
aataccattaatgcagaagattttcttgaaccgggaaaagagattggtggcaggctgcga
gccatgaccggtgataatggaacctactttattggcggtggggtgctggctctcggtaat
gaaaccggtgatttactgctggccgcaagcgagcgtaattttggtgattactggccgggc
aatattggcgatctggctggggtacgttttgggtataagtcctggaaaaaaaacgctgtt
ggtgaagagctgaaacatatgcaggtgctgaattccggctataaaatgcatacgcggctc
gcgaaagtgggttggaacctgccagccgagcaacgtttggtcgccagttacctgcaaact
caagcctacagccccaacggcggtttccttgtttccgtaaaaaacgcacctaacaagagc
ggagtcggctggagaaccagcagcataagtgatgttatgaccagaaatatagctctagac
tatcagttgcaaccggggcatctatcttggttggatatcatggcgaaggcctattacgtt
gatactgatgatagaaccaataccctttgctctgactgggtacgctgtgataaatacttc
acccgtactcgtttaaccacccgtggtctacagtggcaaaatactcagttactaaactta
cccgataaccacttactcagctttaaatacggtattgactggtttagcgaccgttccagt
ggccactcaaccaaagactcaatggtcggtgtgaccccggaaggtaagcgtagcctgacc
agcgtctttacccagctcgattatcactatgacaactggttgcggctggatggcgggctg
cgtttcgataagtcccatttacaagggcatacttggctacccacctggcaccttccccac
accattgataatccttgcaagcgaccagcgaattattacaaactaggttataaccccatc
gacccttgcgttcgtcaacggctaatcatgacgtgggatgttgatcgccatgaacagcaa
ctcttaccgacggtagccatggggattaagcccggagtgcaatggctggaatttttcggt
aattacggtaaatcatggcggccaccgggtattacggaaaccttggccacgggcagcgct
cacggctcagggcggtttttccccaatcctagactggcaatcgaacgctcccgaacctgg
gaggcgggattcaatattcagcaatcagacctattagttaacggggataaatttgccgct
aaaatggcttactttgatactcgagtgactaattatattaatcttgaattgggtaaacaa
ttacccaaactgggccgcagttcttttgcctatgccgcctttggtaataatctattaaag
agccgctttcgtggattcgaatatcagctaagttatgacgccggtttattttataccaat
ctgagttatacccgaatgctgggtcataatgatagttgttctaagccggcctggttggga
ggggtacaagcagtgggatattcaagagctaagggtatatataccgttgaacaacgttgg
caagatcaccgggttgtatgtagtcatggggagatattcggttcatcggcttatttaccc
ggtgatcgtggcagtttaaccctcggcggacgagcattaaataaactgttagattttggt
accgtgatccgttataaccgtgggtatcaagatttgtctgtccttaatagtgctggctac
ccaggtacaagctatgttgcggactggccgaaatacacaatatttgatttatatgccagc
tataaattaacaaataactttacattgcgtggttctatagaaaacatcaacaatcgtgct
tatttggttaattatggtgattctctttcattttctgccagccgtggtcgcactatccag
ggggctttgaatacaaattttaaagtcttcaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system