Ziziphus jujuba (Chinese jujube): 107411014
Help
Entry
107411014 CDS
T04794
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
zju
Ziziphus jujuba (Chinese jujube)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107411014
NCBI-ProteinID:
XP_015874004
UniProt:
A0A6P3Z9T9
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(join(8889106..8889143,8889740..8889914,8890353..8890547,8891144..8891254,8891344..8891556,8892071..8892178,8892267..8892408,8892496..8894069,8895193..8895849))
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMVGGNDGSFGDELEKEIGLLLREQRRQEADDREHELNLYSRSGSAPPTVEG
SLSAVGGLFGGGSVPGVGSGGGGAAAFPDFPGAKNGNGFVSEEELRSDPAYLSYYYSNVN
LNPRLPPPLLSKEDWRFTQRLKGGNPVLGGIGDRRGSRADDGCGISLFSMPPGFNSRKQE
GEIESDKLRGSAEWGGDGLIGLPGLGLGNKQKSLAEIFQDDLGRAAPVSGLPSRPASRNA
FDENVDTVASAEADMVHLHRELLTSDALRSGANGQGSSAMQSMGPPSSYTYAAALGASLS
RSTTPDPQLVARAPSPCITPIGGGRVGASEKRGITSPNSFNGVSSNMNESADLVAALSGM
NLSTNGMVDDDNHLPSQIGQDVDNHQNFLFGLQGGESQNKKHPYLKKSESGHVHMPSVPH
PAKGSYSDLGKNNGGGSADLSNSSSNRSVELQKSAVPSNNPYLKGSPTSTLNGGGGLPVQ
YQQLDGTNSSFSNYNLGGYSMNPALASMMANQLGTGNLPPLFENIAAAAPGIDSRVLGGL
ASGQNAAAAASESHNLRRIGSQMTGNALQSPFIDPMYLQYMRTSEYAAAQLAALNDPSSD
RNYLGNSYMNLLELQKAYLGTLLSPQKSQYGVPLGGKSSGSNHHSYYGNPAFGVGMSYPG
SPMASPVIPNSPVGSGSPMRHNDLNLRFPSGMRNLAGGVMGAWHLDAGCNMDESFASSLL
EEFKSNKTKSFELLEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVYQEIMPQALALM
TDVFGNYVIQKFFEHGLAPQRRELGNKLFGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKM
VEELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEDAIHFIVSTFFDQVVSLSTHPYGCRVIQRV
LEHCKDPNTQSKVMDEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQM
SQQKFASNVVEKCLTFGGPAERELLVNEMLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCD
DQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPHPA
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattgggaagaagaccaatggttggaggtaacgacggatcatttggggat
gagctggagaaggagattgggctgttgcttcgcgagcagcgtcggcaagaggccgacgat
cgtgaacacgagctcaatttgtatagtagaagtggatcagcacctccaactgttgagggt
tctctaagtgccgttggaggattgtttggaggtggcagtgttcccggtgttggcagtggt
ggtggtggtgctgctgcctttcctgacttccctggagctaagaatggaaatgggtttgtg
tctgaggaggagctgaggtctgatccagcttatctttcttactattattcgaatgtgaat
ctgaatccccggctcccacctcctttgctgtcaaaagaggattggaggtttacacaaagg
ctgaaaggagggaatcctgtgttgggtgggattggagacaggagaggaagtagggctgat
gatggctgtggtatatcattgttttcgatgccaccagggtttaactccaggaaacaagag
ggtgagattgaatccgacaagctacgtggctctgcagaatggggtggtgatggattgatt
ggattacctggcttaggacttgggaacaaacaaaaaagccttgctgaaatctttcaggat
gacttgggtcgtgcagctcctgttagtgggcttccttctcgtccagccagtcgaaatgct
tttgatgaaaatgtagacactgtagcttctgcagaagctgacatggtgcatttgcaccgt
gaactgttgacctctgatgccttaagatctggtgcgaatggtcaaggttcatctgcaatg
caaagtatgggcccaccttcttcatacacttatgctgcagcgcttggtgcttccctgtca
agaagcacaacccctgatccccaacttgttgctagagctcctagtccttgtattacacct
attggaggagggagagttggtgcatcagaaaagagaggaattactagtccaaactccttc
aatggtgtctcatccaacatgaatgagtctgcagatctggttgctgcattgtctggcatg
aacttgtcaacaaatggtatggtagatgatgacaaccatttaccatcacaaattggacag
gatgttgacaatcaccagaattttctctttggtctgcaaggtggtgagagtcaaaataag
aaacatccgtacttaaagaagtctgaatctgggcatgtgcatatgccttctgttccacat
ccagcaaaaggttcatactctgatttgggtaagaacaatgggggtggatcagcagatttg
agcaactcatcgtccaataggtcagttgaacttcaaaaatcagctgttccttctaacaac
ccatacttgaaaggatcgcctacatccaccctcaatggtggaggtggcttacctgttcaa
taccagcaattagatggtacaaattcatccttttccaactacaatttgggtgggtactcc
atgaatccggcattagcatccatgatggcaaaccagcttggcactggtaatctgccaccc
ttgtttgaaaatattgctgcagcagcccctggaatagactcaagagttcttggaggtttg
gcttctggacaaaatgcagcagctgctgcatctgaatcacataatcttcgtagaatagga
agtcagatgacaggaaatgctcttcagtcaccttttatagatcctatgtatctccaatat
atgaggacatctgagtatgctgcagcacagcttgctgctcttaatgatccgtcttctgat
aggaactacttaggtaattcatacatgaatttacttgaactccagaaagcttaccttgga
actcttttgtccccccagaagtcacaatatggtgtcccgttaggtggcaagtctagtggt
tcgaaccatcatagttattatggaaatcctgcatttggtgttggcatgtcttatcctgga
agtcccatggcaagtcctgtgattccaaactcaccagttggctctggtagtccaatgagg
cacaatgatcttaatttacgctttccttctggaatgaggaacttagctggaggtgtcatg
ggagcgtggcaccttgatgctggatgtaacatggatgaaagctttgcgtcctcactgctg
gaagaatttaagagtaataaaaccaagtcttttgaacttttagaaattgcaggacatgtt
gttgagttcagtgcggatcaatatggtagtcggtttattcaacaaaaacttgaaacagcc
acaacagaagagaagaacatggtttatcaggaaatcatgccccaagctcttgctttgatg
actgatgtgtttggtaattatgtgattcagaagttttttgagcatggacttgcaccccag
agaagggagttgggcaacaagctttttggtcatgttctgacacttagccttcaaatgtat
ggttgtcgggtgatccaaaaggcaatagaagttgttgatcttgaccagaagatcaaaatg
gtggaagagcttgatggtcatgtgatgcgctgtgtacgtgatcagaatggaaaccatgtc
atccagaagtgtattgaatgtgtccctgaagatgcaattcactttattgtctcaacattt
tttgaccaagttgtttcactttctacccacccatatgggtgtcgcgtgatacagcgagta
ctggagcattgcaaggatccaaatacacagagtaaggttatggatgagattttgggagct
gttagcatgttggctcaagatcagtatggcaattatgttgttcagcatgtgctggagcat
ggaaaacctcatgagcgctcagctatcatcaaggaattagctgggaagatagttcaaatg
agtcagcagaaatttgcttctaatgttgtagagaagtgtttaacatttggtggccctgcc
gagcgcgagttactagtgaatgaaatgcttggctctaccgatgaaaatgaacctcttcag
gcaatgatgaaggatcaatttgctaactacgttgtacaaaaggtgttggagacttgtgat
gaccaacaacgtgagctgatcctttcgcgtatcaaagttcatttgaacgcactgaagaaa
tatacttatggaaagcatattgttgcacgtgtagagaaacttgttgctgctggggaaagg
agaattgctgctcagtctccacaccctgcatag
DBGET
integrated database retrieval system
