Ziziphus jujuba (Chinese jujube): 107418995
Help
Entry
107418995 CDS
T04794
Name
(RefSeq) phytochrome B
KO
K12121
phytochrome B
Organism
zju
Ziziphus jujuba (Chinese jujube)
Pathway
zju04712
Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zju00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04712 Circadian rhythm - plant
107418995
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HATPase_c
HisKA
PAS_4
PAS_9
PAS_8
PAS_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107418995
NCBI-ProteinID:
XP_015883189
UniProt:
A0A6P4AC09
LinkDB
All DBs
Position
11:join(27660542..27662609,27662962..27663769,27664288..27664581,27664910..27665132)
Genome browser
AA seq
1130 aa
AA seq
DB search
MASSSKAAAHSQQQAQSSGTSNVRAHNTESVSKAIAQYTVDARLHAVFEQSGESGKSFDY
SQSIRTTTQSVPEQQITAYLSKIQRGGHIQPFGCMLAVDEATFRVIGYSENARDMLGLTP
QSVPSLEKPEFLKVGTDVRTLFTPSSAVLLEKAFGAREITLLNPVWIHSKNSGRPFYAIL
HRIDVGIVIDLEPARTEDPALSIAGAVQSQKLAVRAISQLQSLPGGDIKLLCDTVVESVR
ELTGYDRVMVYKFHEDEHGEVVAESKRADLEPYIGLHYPATDIPQASRFLFKQNRVRMIV
DCHAMPVRVVQDEGLMQPLCLVGSTLRAPHGCHAQYMANMGSIASLAMAIVINGNDDESV
GGRNPMRLWGLVVCHHTSARCIPFPLRYACEFLMQAFGLQLNMELQLASQLSEKHVLRTQ
TLLCDMLLRDSPTGIVTQSPSIMDLVKCDGAALYYQGKYYPLGVTPTETQIKDIVEWLLA
FHGDSTGLSTDSLADAGYPGAALLGDAVCGMAVAYITKRDFLFWFRSHTGKEIKWGGAKH
HPEDKDDGQRMHPRSSFKAFLEVVKSRSLPWENAEMDAIHSLQLILRDSFRDAEASNTKA
VINAQIEDLELQGMDELSSVAREMVRLIETATAPIFAVDVDGRINGWNAKVAELTGLSVE
KAMGKSLVHDLVYKESEETVDKLLSRALKGEEDKNVEIKMKRFGAEHHNDPIFVVVNACS
SKDYTNNIVGVCFVGQDVTGQKVVMDKFIHIQGDYKAIVHNPSPLIPPIFASDDNTCCSE
WNTAMEKLTGWTRADIIGKMLVGEVFGSCCRLKGPDALTKFMIVLHNAIGGQDEDKFPFS
FFDRNGKYVQALLTANKRINMDGQIIGAFCFLQIASPELQQALKVQRQQEKKCFSRMKEL
AYICQEIKNPLSGIRFTNSLLEATDLTDDQKQFLETSSACEKQMLKIIRDVDLESIENGS
LELDKAEFLLGSVINAVVSQVMILLRERNIQLIRDIPEEIKTMAVYGDQVRIQQVLADFL
LNMVRYAPSPEGWVEIHVRPSLKRVPDGLTLLHTEFRMVCPGEGLPPDLVQDMFHSSRWM
TQEGLGLSMCRKILKLMGGEIQYIRESERCYFLIILELPIPRSGSKSVVD
NT seq
3393 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttcgagtagtaaagcagcagcacattcacagcaacaagctcagtcttcgggcaca
agcaatgtgagagcccacaatacagagtctgtgagcaaagccattgcacagtacaccgtg
gatgctcggctacatgcagtgttcgagcagtcaggcgagtcaggtaagtcttttgactac
tctcaatccattaggaccaccacacagtcagtacctgagcagcaaattacggcttacttg
tccaaaatacaaaggggtgggcatattcagccatttgggtgtatgttggctgtggacgag
gccacttttagagtaatcgggtatagtgaaaatgccagggatatgctgggtcttacccca
caatcggttccaagccttgaaaagcctgagttcctcaaggttggaactgatgtccgtacc
ctttttacgccctctagtgccgttttgctcgagaaggcttttggggccagggaaattacg
ttgttgaaccctgtttggattcattccaagaattctggaaggcccttttatgcaattttg
cataggattgatgtggggattgtgattgatttggagcctgcaaggacagaagaccctgct
ctgtccattgctggggcggtgcagtcgcagaagctggcggtgagggccatttcgcagttg
cagtcgcttcccggtggggatattaagctcttgtgtgatactgtggtggagagtgtgaga
gagcttactggttatgacagggttatggtgtataagttccatgaggatgagcatggtgag
gttgttgcagagagcaaaagagcagacttggagccttacattgggctgcattatcctgcc
actgatattcctcaggcgtcaaggtttttgttcaagcagaaccgggttaggatgatagta
gattgccatgccatgccagttcgcgtagttcaggatgaagggctaatgcagcctctatgc
ttagttggttcgacgcttcgtgctcctcatggttgtcatgcccagtatatggctaatatg
ggttctattgcctccttagcgatggcaattgtcattaatggaaatgatgatgaatcagtt
ggtggaaggaacccaatgagactatggggcctagtagtttgtcatcacacttcagctagg
tgcattccattcccactacgctatgcatgtgaattcctcatgcaggcttttggacttcag
ttaaatatggaattgcagttggcatcgcaattgtcagaaaaacatgtattaagaacccaa
actctcttgtgtgacatgcttcttcgtgactcacctactggtattgttacccaaagtcca
agcattatggaccttgtgaagtgcgatggagctgcactctattaccaagggaagtattat
ccacttggtgtgaccccaactgaaacccaaataaaggatattgttgagtggttgttggct
ttccatggagattcaacaggtttaagcacagacagtttggctgatgctgggtaccctggt
gcagccttgcttggtgatgcagtctgtggaatggctgttgcatatattactaaaagagat
ttcctattttggtttcgatcccatactggaaaagagataaaatggggtggtgcaaagcac
catccggaggacaaggatgatgggcagaggatgcatccaagatcttcattcaaggcattc
ctggaggtggtgaaaagccgtagtttgccatgggaaaatgctgagatggatgcaatacac
tctttgcagcttattctgcgagactcatttagggatgctgaggcaagtaatacaaaagct
gtaataaatgctcagattgaggatctggagttgcaagggatggacgagctaagttcggtt
gcacgagaaatggttaggttgatagagactgcaactgctcccatatttgctgtagatgtt
gatggccgtataaatggttggaatgcaaaggttgcagaattgacaggtctctcagttgag
aaagctatgggaaagtccttggtacatgatcttgtgtacaaggaatctgaagaaactgtt
gacaaacttctttcccgcgctttaaaaggagaagaagataaaaatgtagagataaagatg
aagagatttggtgcagaacatcataatgaccctatttttgtggtggttaatgcttgctct
agcaaggattacacaaataatatagttggagtttgctttgtgggtcaggatgttactggt
caaaaagtggtaatggacaaatttatccacatacaaggcgattacaaggctatcgttcat
aatcctagtcctctgattcctcccatatttgcttcggatgataacacgtgttgctcagaa
tggaatactgcaatggaaaagctaactgggtggactcgagcggatatcattgggaaaatg
ctggttggagaggtttttggcagttgctgtcgcctcaagggtccagatgctttgactaag
ttcatgattgtcttgcacaatgccattggagggcaggatgaggacaaattccccttctcc
ttctttgataggaatggaaaatatgtacaagctctcttgacagcaaataagaggataaat
atggatggccagatcattggagcattctgcttcctgcagattgctagtcctgaattgcag
caggctcttaaagtccaaaggcaacaggagaaaaaatgtttttcaaggatgaaagaatta
gcttatatttgccaggaaataaaaaatcctttaagtggtatacgctttactaactcactt
ttggaggcaacagacttaactgatgatcaaaagcagttccttgagactagttctgcttgt
gagaagcaaatgctgaagattataagggatgttgatttggagagcattgaaaatggatca
ttggagcttgataaggcagaattcctacttggaagtgtcatcaatgctgtggttagtcaa
gtaatgatactgttaagggaaaggaatatacagttgattcgggatattccagaagaaata
aaaacaatggcagtttatggtgatcaagtgagaattcaacaggtattggctgatttcttg
ttgaatatggtgcgttatgctccatctcctgaaggttgggtggagattcatgttcgtcca
agcttgaagagagttcctgatggactcactctgcttcatactgaattccggatggtatgt
cctggtgaaggccttcctcctgatttggttcaagacatgttccacagcagtcgttggatg
actcaagaaggcttagggctgagcatgtgcaggaagattctaaagcttatgggtggtgaa
atccaatacatcagagagtcagaaagatgttacttcttaatcattcttgaacttcccatt
cctcgatcaggctctaagagtgttgttgactag
DBGET
integrated database retrieval system