KEGG   Ziziphus jujuba (Chinese jujube): 107418995
Entry
107418995         CDS       T04794                                 
Name
(RefSeq) phytochrome B
  KO
K12121  phytochrome B
Organism
zju  Ziziphus jujuba (Chinese jujube)
Pathway
zju04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:zju00001]
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    107418995
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c HisKA PAS_4 PAS_9 PAS_8 PAS_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 107418995
NCBI-ProteinID: XP_015883189
UniProt: A0A6P4AC09
LinkDB
Position
11:join(27660542..27662609,27662962..27663769,27664288..27664581,27664910..27665132)
AA seq 1130 aa
MASSSKAAAHSQQQAQSSGTSNVRAHNTESVSKAIAQYTVDARLHAVFEQSGESGKSFDY
SQSIRTTTQSVPEQQITAYLSKIQRGGHIQPFGCMLAVDEATFRVIGYSENARDMLGLTP
QSVPSLEKPEFLKVGTDVRTLFTPSSAVLLEKAFGAREITLLNPVWIHSKNSGRPFYAIL
HRIDVGIVIDLEPARTEDPALSIAGAVQSQKLAVRAISQLQSLPGGDIKLLCDTVVESVR
ELTGYDRVMVYKFHEDEHGEVVAESKRADLEPYIGLHYPATDIPQASRFLFKQNRVRMIV
DCHAMPVRVVQDEGLMQPLCLVGSTLRAPHGCHAQYMANMGSIASLAMAIVINGNDDESV
GGRNPMRLWGLVVCHHTSARCIPFPLRYACEFLMQAFGLQLNMELQLASQLSEKHVLRTQ
TLLCDMLLRDSPTGIVTQSPSIMDLVKCDGAALYYQGKYYPLGVTPTETQIKDIVEWLLA
FHGDSTGLSTDSLADAGYPGAALLGDAVCGMAVAYITKRDFLFWFRSHTGKEIKWGGAKH
HPEDKDDGQRMHPRSSFKAFLEVVKSRSLPWENAEMDAIHSLQLILRDSFRDAEASNTKA
VINAQIEDLELQGMDELSSVAREMVRLIETATAPIFAVDVDGRINGWNAKVAELTGLSVE
KAMGKSLVHDLVYKESEETVDKLLSRALKGEEDKNVEIKMKRFGAEHHNDPIFVVVNACS
SKDYTNNIVGVCFVGQDVTGQKVVMDKFIHIQGDYKAIVHNPSPLIPPIFASDDNTCCSE
WNTAMEKLTGWTRADIIGKMLVGEVFGSCCRLKGPDALTKFMIVLHNAIGGQDEDKFPFS
FFDRNGKYVQALLTANKRINMDGQIIGAFCFLQIASPELQQALKVQRQQEKKCFSRMKEL
AYICQEIKNPLSGIRFTNSLLEATDLTDDQKQFLETSSACEKQMLKIIRDVDLESIENGS
LELDKAEFLLGSVINAVVSQVMILLRERNIQLIRDIPEEIKTMAVYGDQVRIQQVLADFL
LNMVRYAPSPEGWVEIHVRPSLKRVPDGLTLLHTEFRMVCPGEGLPPDLVQDMFHSSRWM
TQEGLGLSMCRKILKLMGGEIQYIRESERCYFLIILELPIPRSGSKSVVD
NT seq 3393 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcttcgagtagtaaagcagcagcacattcacagcaacaagctcagtcttcgggcaca
agcaatgtgagagcccacaatacagagtctgtgagcaaagccattgcacagtacaccgtg
gatgctcggctacatgcagtgttcgagcagtcaggcgagtcaggtaagtcttttgactac
tctcaatccattaggaccaccacacagtcagtacctgagcagcaaattacggcttacttg
tccaaaatacaaaggggtgggcatattcagccatttgggtgtatgttggctgtggacgag
gccacttttagagtaatcgggtatagtgaaaatgccagggatatgctgggtcttacccca
caatcggttccaagccttgaaaagcctgagttcctcaaggttggaactgatgtccgtacc
ctttttacgccctctagtgccgttttgctcgagaaggcttttggggccagggaaattacg
ttgttgaaccctgtttggattcattccaagaattctggaaggcccttttatgcaattttg
cataggattgatgtggggattgtgattgatttggagcctgcaaggacagaagaccctgct
ctgtccattgctggggcggtgcagtcgcagaagctggcggtgagggccatttcgcagttg
cagtcgcttcccggtggggatattaagctcttgtgtgatactgtggtggagagtgtgaga
gagcttactggttatgacagggttatggtgtataagttccatgaggatgagcatggtgag
gttgttgcagagagcaaaagagcagacttggagccttacattgggctgcattatcctgcc
actgatattcctcaggcgtcaaggtttttgttcaagcagaaccgggttaggatgatagta
gattgccatgccatgccagttcgcgtagttcaggatgaagggctaatgcagcctctatgc
ttagttggttcgacgcttcgtgctcctcatggttgtcatgcccagtatatggctaatatg
ggttctattgcctccttagcgatggcaattgtcattaatggaaatgatgatgaatcagtt
ggtggaaggaacccaatgagactatggggcctagtagtttgtcatcacacttcagctagg
tgcattccattcccactacgctatgcatgtgaattcctcatgcaggcttttggacttcag
ttaaatatggaattgcagttggcatcgcaattgtcagaaaaacatgtattaagaacccaa
actctcttgtgtgacatgcttcttcgtgactcacctactggtattgttacccaaagtcca
agcattatggaccttgtgaagtgcgatggagctgcactctattaccaagggaagtattat
ccacttggtgtgaccccaactgaaacccaaataaaggatattgttgagtggttgttggct
ttccatggagattcaacaggtttaagcacagacagtttggctgatgctgggtaccctggt
gcagccttgcttggtgatgcagtctgtggaatggctgttgcatatattactaaaagagat
ttcctattttggtttcgatcccatactggaaaagagataaaatggggtggtgcaaagcac
catccggaggacaaggatgatgggcagaggatgcatccaagatcttcattcaaggcattc
ctggaggtggtgaaaagccgtagtttgccatgggaaaatgctgagatggatgcaatacac
tctttgcagcttattctgcgagactcatttagggatgctgaggcaagtaatacaaaagct
gtaataaatgctcagattgaggatctggagttgcaagggatggacgagctaagttcggtt
gcacgagaaatggttaggttgatagagactgcaactgctcccatatttgctgtagatgtt
gatggccgtataaatggttggaatgcaaaggttgcagaattgacaggtctctcagttgag
aaagctatgggaaagtccttggtacatgatcttgtgtacaaggaatctgaagaaactgtt
gacaaacttctttcccgcgctttaaaaggagaagaagataaaaatgtagagataaagatg
aagagatttggtgcagaacatcataatgaccctatttttgtggtggttaatgcttgctct
agcaaggattacacaaataatatagttggagtttgctttgtgggtcaggatgttactggt
caaaaagtggtaatggacaaatttatccacatacaaggcgattacaaggctatcgttcat
aatcctagtcctctgattcctcccatatttgcttcggatgataacacgtgttgctcagaa
tggaatactgcaatggaaaagctaactgggtggactcgagcggatatcattgggaaaatg
ctggttggagaggtttttggcagttgctgtcgcctcaagggtccagatgctttgactaag
ttcatgattgtcttgcacaatgccattggagggcaggatgaggacaaattccccttctcc
ttctttgataggaatggaaaatatgtacaagctctcttgacagcaaataagaggataaat
atggatggccagatcattggagcattctgcttcctgcagattgctagtcctgaattgcag
caggctcttaaagtccaaaggcaacaggagaaaaaatgtttttcaaggatgaaagaatta
gcttatatttgccaggaaataaaaaatcctttaagtggtatacgctttactaactcactt
ttggaggcaacagacttaactgatgatcaaaagcagttccttgagactagttctgcttgt
gagaagcaaatgctgaagattataagggatgttgatttggagagcattgaaaatggatca
ttggagcttgataaggcagaattcctacttggaagtgtcatcaatgctgtggttagtcaa
gtaatgatactgttaagggaaaggaatatacagttgattcgggatattccagaagaaata
aaaacaatggcagtttatggtgatcaagtgagaattcaacaggtattggctgatttcttg
ttgaatatggtgcgttatgctccatctcctgaaggttgggtggagattcatgttcgtcca
agcttgaagagagttcctgatggactcactctgcttcatactgaattccggatggtatgt
cctggtgaaggccttcctcctgatttggttcaagacatgttccacagcagtcgttggatg
actcaagaaggcttagggctgagcatgtgcaggaagattctaaagcttatgggtggtgaa
atccaatacatcagagagtcagaaagatgttacttcttaatcattcttgaacttcccatt
cctcgatcaggctctaagagtgttgttgactag

DBGET integrated database retrieval system