Ziziphus jujuba (Chinese jujube): 112492238
Help
Entry
112492238 CDS
T04794
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
zju
Ziziphus jujuba (Chinese jujube)
Pathway
zju03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zju00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
112492238
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
zju03019
]
112492238
Messenger RNA biogenesis [BR:
zju03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
112492238
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112492238
NCBI-ProteinID:
XP_048333116
LinkDB
All DBs
Position
3:join(21375274..21375495,21376872..21378020)
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKDYFASYGDVLQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLEDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSARSGNAYPARNAGNGGNMRTKKIFVGGLPPT
LSEEGFREYFEGYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGSRGGGGGGGYQGYGASDGNQNSYDGRMDSSRYMQSQNAGGGFTPY
GSSGYNAPSYGYGPSNNGIGYGGYGGYGGPASAGYGNPNAPNAGYASGLPGAHRSSWNTQ
TPSGYGAMGYGGAGPWGVPGAGAAAGSGGPGSAPAGQSPSGAAGYGAQSYGYGGYGGSEG
SYGNSAGYGAVGGRSGSAGSVGGQSGGELPGSGGGYMGGGYGDANGNTGYGNAAWRSDSS
QGSGTYGAPQANGPQGGQIGYGGWYGGAQARQAQQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagctattcattggtgggatttcatgggaaactacggaggag
aagctaaaagactactttgctagctatggggatgttttgcagacagtagtgatgagggac
aaagtcactgggaggcccagaggtttcgggtttgtggttttttcagatccttctgtcctc
gatagggttcttgaggataagcataccattgatgggagaacggttgaggctaagagggcc
ttatcaagagaggagcagcaaacatcagccagatctggaaatgcttatcctgctagaaat
gctgggaatggtggaaatatgaggactaagaagatatttgttggagggttgcctcccact
ttatctgaagaaggatttcgtgagtattttgagggttatggccatgtaactgatgtggta
gtcatgtatgaccaaaatactggacgacctcgtggatttggatttatttcctttgatact
gaagatgcagtcgatagggttttgcacaagacatttcatgatttgaacggtaagcaagtg
gaagtaaagcgtgctcttcctaaagatgccaatcctggaggaggtagccgtgggggtgga
ggtggtggtggttaccagggctatggggcatccgatggcaaccaaaattcttatgatggt
cggatggattccagcaggtacatgcaatcccagaatgctgggggtgggtttacaccttat
ggttcctctgggtataatgcacctagttatggttatggtccttcaaataatggcattggt
tatgggggttatgggggttatggtggccctgctagtgctggatatggaaaccctaatgct
cctaatgctggttatgcaagtggtctaccaggtgcccatagaagttcatggaacactcaa
accccctctggatatggtgcaatgggctatgggggtgctggtccttggggtgtaccaggt
gccggtgctgctgcaggcagtggtggccctggttctgcacctgcagggcaatctcccagt
ggagctgctggatatggggctcaaagttatggttatggtgggtatggtggaagtgagggg
tcctatgggaattcagctgggtatggtgctgttggagggcgttctgggagtgctggtagc
gttggtggtcaaagtgggggagaactaccagggagtggtggtggctacatggggggtggc
tatggtgatgcaaatggaaatacaggctatggaaatgctgcatggaggtctgattcgtcg
caaggttctggaacttacggggctcctcaggcaaatggtcctcaaggggggcaaattggt
tatggtggttggtatggtggtgcacaggcgcgacaagcccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
