Zobellia laminariae: Q5W13_06945
Help
Entry
Q5W13_06945 CDS
T09239
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
zla
Zobellia laminariae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zla00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
zla02000
]
Q5W13_06945
Transporters [BR:
zla02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Q5W13_06945
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKX77728
LinkDB
All DBs
Position
1462787..1464772
Genome browser
AA seq
661 aa
AA seq
DB search
MKSFFLALFSIFLTQITKAQSPSQKDSITVLEEVILTDTVLTKNATGFVPSSVIGTKSFQ
NYSPIDMVSAINQIPGVFVLSGALNTNKITIRGIGARSQYGTDKLQLYYNDIPLTNGTGS
STIETYDLENLDGIEVIKGPKGTAYGTGLGGAIILHSGENTKEATSLENNFTTGSYGLLK
NNLSFSHSDTKLSLMVRYGHMETDGYRENNRFERDGILVNTSYKINSKNKVSFLLNHIDY
SAQIPSSISRSAFDENPKQAAFTWKASQGHEDNNYTLAGFSYQHEFSSKLKNTTSVFYTY
LDHYEPRPFNILDEITNGYGFRSRFLGNFNFLQRKAEYTFGAELYKDEYNWGTFENLYEE
NNSNGSLKGGRISDNKEFRRKFNGFGSLTLPITDKFTAQIGLNINKTHYDFRDKFNSGSD
NKNAKRDFNAIVLPSLDLNYKLNEYHFIYANISRGFSNPSLERSLTPEGVINPDIAQETG
INYELGGQFNLFKKNLHVDLAVYRMDIKNLLVDQRIGEDQYIGKNAGSTKHQGIDLELSY
TIALTPQLQLRPFINYTLSDFSFVEFIDGENDFSGNPLTGVPKNRLNSGLQMQMNNGFYW
NTTHQYVDKISLTDANTLYSDAFNVLNTKIGYRKELSSRFTIGLNFGINNIFDTKYAQSV
L
NT seq
1986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtccttttttctagccctattttccatttttcttacacaaattacaaaggctcaa
agcccgtcacaaaaagatagcataaccgtgttagaggaagtaatcctaaccgataccgtt
ctaactaaaaatgcaactggatttgttccgtcttctgtaattggtacaaaaagctttcaa
aattatagtcccatagatatggtttcggctatcaatcaaattcccggggtgttcgttctc
tccggagctttgaacactaacaaaattacaattaggggtattggcgctcgttcccagtat
gggacagacaaacttcagctttattataatgacattcctttgacaaatggaacaggttcc
tctaccattgagacttacgatttagaaaatttagacggtatagaggttattaaagggcca
aaaggcactgcttacggcacaggtcttgggggagccattattcttcattcaggagaaaac
acaaaggaagctactagccttgaaaataattttacaacaggttcatacgggcttttgaaa
aataatcttagcttttctcattcagacaccaagctttctttaatggttcgttatggacat
atggaaactgatggttaccgtgagaacaacaggtttgaacgcgatgggattttagtaaat
acatcgtataaaattaactcaaaaaataaggtttcatttttactaaaccatattgattat
tctgctcaaatacctagctccataagtcgttctgcatttgatgaaaatccaaaacaagct
gcatttacatggaaagcatctcaaggtcatgaggataacaattacacattagccggattc
tcataccagcatgaatttagctcaaaattaaaaaacactaccagcgttttctacacctac
cttgaccattatgagcctagacccttcaatatcttggatgaaattaccaatggctatggt
tttagaagccgatttctggggaattttaattttctacagcgaaaagcagaatacactttt
ggtgccgaactttataaagatgaatataattggggtacgtttgaaaatctatacgaagag
aataacagtaatggcagcttaaagggagggcgcattagtgataataaagaatttcgcaga
aaatttaatggttttggttccttaacgcttcccattacagataagttcactgcccaaata
ggcctaaatatcaacaagacccattatgattttagagacaaattcaattcaggttctgat
aacaaaaatgctaaacgcgattttaacgcgatagtactaccgagccttgatttaaattac
aaactgaacgagtaccattttatatacgccaatattagccgcggcttctccaatccaagt
cttgaaagatcactcactccagaaggtgtcatcaacccggacatagctcaagaaacaggc
attaattatgaacttggaggtcagtttaatttattcaagaaaaatcttcacgtagaccta
gccgtctatcgcatggatattaaaaaccttttggtggaccaaagaattggtgaagaccag
tacattggaaaaaatgcaggaagcaccaaacaccaaggaatagatttagaattaagctac
actattgcactcacacctcaacttcaactaagaccattcataaattatacgttgagcgat
ttcagctttgtagaatttattgatggagaaaatgatttttctggaaacccgttaacaggt
gtgccaaaaaaccgattaaattctggtcttcagatgcaaatgaacaacggattctattgg
aataccactcaccaatatgtagacaaaatatctctgacagatgctaacacgttatacagt
gatgcattcaatgttcttaacacaaaaattggatatagaaaggaattatcctcgcgtttc
acgattgggcttaatttcggtatcaataatatttttgatacgaaatatgcccaatcggtt
ctataa
DBGET
integrated database retrieval system
