Zobellia laminariae: Q5W13_09585
Help
Entry
Q5W13_09585 CDS
T09239
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
zla
Zobellia laminariae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zla00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
zla02000
]
Q5W13_09585
Transporters [BR:
zla02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Q5W13_09585
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKX78578
LinkDB
All DBs
Position
2019428..2021971
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MKGTNVGTTSDFDGNYSIEVTKIPAVLVISSIGFNSKDVDVKSAGEINIALQEGVALDEV
ILVGNRSKPRTILDSPVPIDNIGVSELRNTGQPSVDKMLTYKVPSFNSTTQTVSDATAHF
DPADLRGLGPSRTLVLVNGKRKNQSALVYINDTPGKGEVGVDLKSIPAAAISRIEVLRDG
ASAQYGSDAIAGVINMVLNKNVEYTTVNITSGITTEGDGFKLGADVNTSVNIGDNGGYLN
LTVGYYQQEETNRAGTPGGDLLFGVSADDPQWSSWLAANPDLGMTVGQPKLNKADIFFNA
GVPFKNGKGEFYTFGGLTYRKGKSFALYRPPYWVSDPSNLLHHAGTEYQGFQPTFETDVR
DNNATVGVKGEVLGFDVDLSGTYGRNAIDYEVNNSLNVDLGANSPTSFDVGAYTFSNTLA
NLDFSRVFGQISTAFGAEVKEERFTAEAGEPASYFGGGAQSFYGLQPANAVIAKRNNYGI
YGDLEWEPTEEFLIGGAIRYEDFSDFGENVSWKLNGRYLLGDKGAIRASYSTGFRAPSLH
QIYLSNIQTLVSGGTISNQGTFNNVDPVIREGLGVPQLTAETSKNISAGITFELIKNFTA
SVDFYNVKVDDRVLFTGEIGADGDDTTTNPIEQILNDNSITSLKFFVNAVNTNTSGIDVV
LNYRNIELGSGKFSATLAANFNETKIKGQIDTPPLLAANDYVIFNRKEQSRITSARPKSK
VLLGLDYEIGKLNLSLNNTYFGEVSWMHSSNGLNGVDLGNGPLPTEDEAFDQTFAGKVIT
DLIIGYDFSDKISGSISANNLFNVYPDEIDTKGDFVTDLGGRFRYPWEVNQFGFNGTVIN
AGLTFKF
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attaaaggcactaatgtaggtactacaagtgattttgatggcaattactctatagaggta
actaaaatacctgctgttttagttatttcatctataggatttaattctaaggatgttgat
gtgaaaagtgcgggcgaaattaacattgctttacaagagggagtagctttagatgaagtt
atattagtaggtaacaggtctaagcctagaacaattttagattctcctgttccaatagac
aatataggagtatcggaattacgcaatactgggcaaccttcggttgataaaatgttgacg
tataaagtgccatcatttaattctactactcaaacggtatctgatgccactgcacatttt
gaccctgcggatttgagaggattaggtccaagtagaactttagttcttgtaaatggaaaa
cgaaaaaatcaaagcgccttagtttatataaatgatactcctggtaaaggtgaggtaggt
gtagacttgaagagtatacctgccgcggccatttctagaatagaagttttgagagatgga
gcttctgcacaatatggctctgatgctattgccggggtgataaatatggttttgaataaa
aatgtagagtatactactgtaaatataacttcgggaataactacagaaggagatggtttt
aaattgggtgcagatgtaaatacttctgttaatataggagataacgggggataccttaac
ttaactgtgggctattatcagcaagaagaaaccaacagagctggtacaccgggaggtgat
ttgctttttggtgtttcagcagatgatccacaatggtcttcttggttagcagctaatcct
gatttaggtatgactgtaggacagccaaaattgaataaggcagatatctttttcaatgca
ggagttccatttaaaaatggaaaaggggagttctatacgttcggtgggcttacctataga
aaaggaaagagttttgctttatacagacctccatattgggtgtctgacccatctaacttg
cttcatcatgcaggtacggagtatcaagggtttcagccaacttttgaaactgatgttaga
gataacaatgctactgtaggtgttaaaggagaagtactaggttttgatgttgatttgagt
ggtacctatggtcgaaatgctattgattatgaggtaaataatagtttgaatgttgatttg
ggcgcaaacagccctacttcatttgatgtaggtgcttatacttttagtaatacacttgct
aatttggatttttctcgcgtttttggtcagattagtactgcatttggtgcagaagttaaa
gaagaacgttttacagcagaggctggtgaacctgcatcttattttggaggtggtgcacaa
tctttttatggattacaacctgccaatgccgtaattgcaaaaagaaataattacgggatt
tatggagatttagagtgggagccgacagaggaattcttaattggaggggccattaggtat
gaggactttagtgattttggagaaaatgtctcctggaagttaaacggaaggtatttattg
ggagataagggagcgattagagcttcttacagtacagggtttagagctccttctctacat
caaatttacttaagtaatattcaaacacttgtatctggaggtacaatctctaatcagggt
acgttcaataatgttgatcctgttattagagaagggcttggtgttccacaattaactgca
gagacttcaaaaaatatttctgcaggtataacatttgaactaattaaaaactttacagct
tctgttgatttttataatgtcaaagtagatgaccgggtactttttactggtgaaataggg
gctgatggagatgatacaactaccaatccaatagaacaaattctaaatgataacagtata
acaagtcttaaattctttgttaatgccgttaatacaaatacttcaggaatagatgttgtt
ttgaattatagaaatattgaattgggtagtggaaaattctctgcaactttagctgctaac
tttaatgaaaccaaaataaagggacaaatagacactccacctttattggctgctaacgac
tatgttatatttaatagaaaagaacaatctagaataacatctgcgcggcctaagagtaaa
gtgttgttgggcttagattatgaaattggaaagcttaatttgtccttgaacaatacttat
tttggcgaggtaagttggatgcacagtagcaacggtcttaatggtgttgacttaggtaat
ggtcctttgccaacagaagatgaggcatttgaccaaacttttgcaggtaaggtaattacc
gatttaataataggatatgatttttcagacaagatttcgggttcgatttcagctaataat
cttttcaatgtttatcctgatgaaattgatacgaaaggtgattttgttacagatttagga
gggagatttagatacccttgggaagtaaatcagtttgggtttaacggaaccgttattaac
gcaggcctaacttttaaattctag
DBGET
integrated database retrieval system
