Zobellia laminariae: Q5W13_15050
Help
Entry
Q5W13_15050 CDS
T09239
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
zla
Zobellia laminariae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_9
PAS
PAS_3
PAS_4
PAS_8
PAS_11
FliH
YhzD
KH_PARP14_5
Med4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKX75055
LinkDB
All DBs
Position
3144236..3146422
Genome browser
AA seq
728 aa
AA seq
DB search
MRVDGVVGRSEYLDGKLTRLFGIIQDINNTKLAEQQLNKAHSELQAIFNSKAIAIITTGR
DGIIHNFNSGAEVLLGYPAAEIVGISNPMRFIAEKELVAFKNQLKEKYGEKPSSLNHFED
ISKYIDISKRDMDDTREWTHRRKDGSTFPCQTTVSSIKDVHGEHTGFIAVLSDISEIKNA
EEELLEKNERLNFAEQISMLSNWKWDTIADKVEWSQNFYKILELDETITELKFDSYFRFV
HPEDIEIVNQHFKKVEKDKKWESFTHRIITTSGKVKIIQLLGEVHTNEKDEIVEMVGTCQ
DVTESKMAERNLQKAHSELTAIFNSNSISIITTDKNGVINRFNDGAEAILGYSAAEVVGK
EKPELYLLKEEHSKFKSDIARQNGKDPATFNYYVDSLDHDLNDTREWMYRRKDGVIVPVL
ATTSAIKNIDNSNEGYIAISKDISEIKNAESELLKKNQLLNYAEQISKMANWQWDPITDE
GKSSKNLYNIIELDEKITDLKLDIYLDFVHPEDKEITAQHFENAVKDKNWESFTHRIITT
SGKLKIIQLLGEVFTNEKDEVILISGTCQDVTEIKMAERNLQKAHSELQAIFNSESILII
TTDKNGVINRFNHGAELLLGYSAAEMVGIEKPRKYIHEAEITKFRNDIAVLNGENPGTYD
HYANLFKKELNDTREWTYYKKDGSPVSVLSTITTIKNGDNANEGFIAISKDISEIKNAES
ELLKKMSN
NT seq
2187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtgttgatggggtagtggggagatcagaatacttggacggaaaactaacacgactt
tttggaataattcaagatataaataacacaaagcttgcggaacaacaattaaataaggcc
cattctgaattgcaagctatattcaattcaaaagccattgcgattataaccactggtaga
gatggtattatccataattttaatagtggtgcggaggttttattaggttatcctgctgca
gaaattgtgggaatcagtaaccctatgcgatttattgcagaaaaagagttagtagcgttt
aaaaaccaattaaaggaaaagtacggggaaaagccatccagcttaaatcattttgaagat
atttcaaaatatatagatatctcaaaaagagatatggatgataccagggaatggacacat
cgcagaaaagatggttcaacatttccctgtcaaacaacagtctcatccattaaggatgtg
cacggtgaacacacgggctttattgctgtgttgtccgatatttcggaaatcaaaaatgca
gaggaagaacttctggaaaaaaatgagagattaaattttgccgaacagatttcaatgttg
tccaattggaaatgggatacgattgcggataaagtagagtggtcgcaaaatttttataaa
attctagagcttgatgaaaccataacggaacttaagtttgattcgtattttaggtttgtt
catccagaagatatagaaattgtcaatcaacattttaagaaagtagaaaaagataaaaaa
tgggaaagttttacacatcgtattattaccacttcaggtaaggtaaaaataattcaactt
ttaggagaggtccataccaacgaaaaagatgagattgtggaaatggttggtacgtgccaa
gatgtaaccgaaagtaaaatggcggaacgtaatttgcaaaaagcccattctgaattgaca
gctatattcaattcaaattctatttcaatcataacaacagataaaaatggtgtcattaat
cgatttaatgatggagcggaagctatattgggctactccgcggctgaagtagtagggaaa
gagaaacctgaactctatcttcttaaagaagaacactccaaatttaaaagtgatattgca
aggcaaaatggtaaagaccctgctacgtttaattattatgtagatagtttagatcatgat
ttaaatgatacccgagaatggatgtatcgccgaaaagatggcgttattgttccggtactt
gctacaacatcggctattaaaaatatagacaatagtaatgaaggttatatagcaatctcc
aaagatatttctgaaattaaaaatgcggaaagtgaacttctgaaaaaaaatcagctttta
aattatgcggaacagatttcaaagatggctaattggcaatgggatcctattaccgatgaa
ggaaaatcttcaaaaaatctatataacattattgagcttgacgaaaaaattaccgatctt
aaattagacatatatttagattttgttcatccagaagataaagaaattactgctcaacat
tttgagaacgcagtaaaagataaaaactgggaaagttttacgcaccgtattattactact
tcgggaaaattaaaaataattcaactattaggagaagtttttactaacgaaaaagatgag
gtaatattaataagcggtacctgccaagatgtaaccgaaattaaaatggcggaacgtaat
ttgcaaaaagcccattctgaattacaagctatattcaactcagaatctattttaattata
acaacagataaaaatggtgtcattaatcgtttcaatcatggtgcagagttgttattgggg
tattctgcggcagaaatggttgggatagaaaaacctagaaaatatattcacgaggctgaa
atcacaaaatttagaaatgatattgcagtactaaatggtgaaaatccaggtacatatgat
cattatgcaaacctttttaaaaaggagttaaacgacactcgtgaatggacctattacaaa
aaagatggttcgccagtttccgtactttctacaataaccactattaaaaatggagacaat
gccaatgaaggatttatagcaatctccaaagatatttctgaaattaaaaatgcggaaagt
gaacttctgaaaaaaatgagcaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
