| Entry |
|
|---|
| Name |
(RefSeq) ABC transporter C family member 13-like isoform X1
|
|---|
| KO |
| K05674 | ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 10 |
|
|---|
| Organism |
zof Zingiber officinale (ginger)
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:zof00001]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
121975516
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:zof02000]
121975516
Transporters [BR:zof02000]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC1, 2, 3, 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13 subgroups
121975516
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
4B:91928491..91958131
|
|---|
| AA seq |
1469 aa
MEFICPNASIVWDVKGFTPCFENMILGFGSNMVIILAVLILAGAQRNCERYNDMRVDHKK
LLVLQIVSCCGAFLALIELSLLMKNTIEGNLTGSHYWFYQISLLFYWIVILLVSRLEHWF
YVLCNNILCFCWIIKPLVQIPHFLRSLLSRKVIICISEGSLFSAELMFGLIIIVIRFTCL
TEKKREVNSVKDSLLSFHTEIKEGQTEYLDGKSGSFCQLFMFKFVNTMMDVGVRKQLDFE
DLVPLPSELMPSLCHTLMLDCWVAEKNKHGSHLLFKAMYNAYGWHYLRLGLLKALNDGVG
FITPLLLNKLIRYLQQGSNSTEGYILALSMGLTSIFKSFLDTQYSFRLMKLKLMLRSSIM
TIIYHKCLNISLAERSTFSDGEIQTFMSVDADRTVNLCNSIHDAWSLPLQIGVALYLLYT
QVSFAFISGVTITVLLIPVNKWISKLIASATEDMMKQKDERIRSSGELLTYIRTIKMYSW
ESLFSQRLMKKRDAEVKHLSTRKYMDAWCVFFWATTPTLFSLFTFGVFALMGYSLDAATV
FTCVALFNTLISPLNSFPWVINGLIDAFISTGRLSKFLSCTEKSCNIIMESMWQIQGQVP
PSSALRRLTNSNMPTAVAFLDACSIWSNNSYVEQMAVLNNVSLEVPNGLLVAVVGEVGSG
KSSLLHSILGEMRLIQGLIISQGSIAYVPQVPWILSGSVRDNILFGDNFDTKRYREILHA
CALDVDISLMIGNDLSYIGEKGINLSGGQRSRLAFARAVYSDSDIYLLDDILSAVDSQVA
SWILHRVILGPLMNQKTRILCTHNFAAISAADIIVIMDGGQLRWVGTSTDFLESPLSKSS
LPKHSSLSSLEFVQNESMGSTSNEIVFVHPVDNELIADLEKANSNDDIELRKEGNVDLSV
YKSYARFASWLIVILICISAIFMQASRNGNDLWLSHWVDANNGTEQTRFYLIILSIFGVM
NSIFTLARAFSFSYGGLRAAVQVHAELLSKLINAPVCYFDQNPNGRILNRLSSDLYAIDD
SLPFIFNILLANFFSLLGIVAVLSYSQVMFLILLIPLGFVYKKLQFYYRCTSRELRRLDS
VSRSPIYSSFTETLDGSCTIRAFKKEEIFMARFLDLVQLYQQTTYSEQTASLWLSLRLQL
LSASVILFIGVMAVIGHGHDFSLTLDTPGLVGLALSYAAPIVSLLSSFLTSFTETEKEMV
SVERVVEYMGIPQEELQGSKSLPTGWPPQGLIEFDHVSLQYRPSLPAALKDLSFSIAAGM
KVGIVGRTGAGKSSLLNALFRLTPICRGRILVDGTDIAVLAPRELRDRFSVVPQSPFLFE
GFLRENLDPFGMTSDAKIWEALEKCHMKEVIETAGGLGIHVKENGTSFSVGQRQLICLAR
AIIKSSKILCLDECTASVDTQTALILQNAISIDCQDTTVLTIAHRISTVLEMDCILVLDH
GILVEHGNPRDLLEDECSRFSKFAKASSM |
|---|
| NT seq |
4410 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggagttcatctgccctaacgcctccatagtatgggatgtaaaaggatttacaccatgc
ttcgagaatatgatattagggttcggatcaaatatggtgattatactcgcggttctcatt
cttgcaggggctcagaggaattgtgaacgatataatgatatgagggtagaccacaagaaa
ctgcttgttttacagattgtgtcttgctgtggggctttccttgctttaattgagctatcc
ttgctaatgaagaacactatcgaaggcaatcttactgggagtcattattggttttatcaa
atctctctgcttttttattggattgtgattcttctagtttcaagattggagcactggttc
tatgtgctttgcaataatatcttgtgcttttgttggatcataaaacctctcgtgcaaata
cctcattttctgaggagtttattatcaagaaaggtgataatatgcatttctgaaggttct
ttgttctcagcggaactcatgtttggtctcattatcattgtgatccgatttacatgcctc
accgagaaaaagagggaagttaattctgtcaaagattctcttctttcattccatacagag
attaaagaagggcaaacagaatatctggatgggaaatctggcagcttttgccagcttttt
atgttcaaatttgtcaacacgatgatggatgttggtgtgagaaagcaacttgactttgaa
gatctagttccgttgcctagtgagctcatgccttctttatgccataccctgatgttggat
tgctgggtagctgaaaaaaataagcatggctcacatcttctgtttaaagccatgtacaat
gcatatggttggcattacttgcgtttgggtttgctaaaggcattaaacgatggtgttggc
tttattactccattgctccttaacaagcttatcagatatctgcaacaaggttctaatagt
acagagggatatattctcgcactatctatggggcttacttccattttcaagtcttttctt
gatacacagtactctttccgtctaatgaaattgaagttgatgctaagatcaagcataatg
accataatctaccacaagtgcctaaatattagtctggctgagcgctcaacattttctgat
ggtgaaattcaaacattcatgtctgttgatgcagacaggactgtcaacttatgtaatagc
attcatgatgcatggagcttgcctttgcagattggtgtggctctgtatcttttgtacacg
caggtcagttttgcattcatatctggagtcacgataactgtgttgcttataccagtgaat
aaatggatttctaagctgatagcaagtgcgacagaggatatgatgaaacaaaaggatgag
agaattaggagttctggagaactgttgacatacattagaacaataaaaatgtacagctgg
gagagcttgtttagccaacgtttgatgaagaagagggatgcagaagttaaacacctctcg
actcggaagtacatggatgcttggtgtgtctttttttgggctacaactccaacactgttc
tccttgtttacttttggtgtctttgcattaatggggtattcattagatgctgctacagtc
tttacctgtgttgcacttttcaacaccttgatctctcctttaaattcattcccatgggtg
attaatgggttgatagatgctttcatttctactgggcgtctgagcaaatttttgtcctgt
actgagaaaagttgtaatattatcatggaatcaatgtggcagatacaaggacaggttcct
ccatcaagtgctttaagaagattgacgaatagtaatatgccaacagctgttgctttttta
gatgcatgttctatatggtccaacaattcctatgtggagcaaatggctgtccttaataat
gtgtctcttgaagttccaaatggccttcttgttgctgtagttggtgaggttggttcaggc
aagtcatccttgttgcattcaattctcggagagatgcgtctcattcagggattaattatt
tctcaaggatcaatagcatatgtgccacaggtaccttggatcctgtcaggttcagtgcgt
gataatattttgtttggagataacttcgacactaaaagatacagagaaatattacatgca
tgtgcacttgatgttgatatttcacttatgattgggaatgatctatcatacattggcgag
aaaggaatcaacttatctggtggacaacgaagccgtcttgcatttgcaagggctgtctac
agtgactctgatatttacttgcttgatgacatactcagtgcagttgattctcaagttgca
tcatggattcttcatagggtaatcctaggccctctgatgaatcagaagacacggattctc
tgtactcataattttgcagcaatttctgcagctgatataattgtaatcatggatggagga
cagctaaggtgggttgggacttccactgatttcttggaatctccactgtccaaaagttct
cttcctaaacattcaagcttgtcatcattggaatttgtacaaaatgaaagcatgggaagc
acttccaatgaaattgtgtttgttcatccggtggacaacgaacttatagctgatttagag
aaagcaaactcaaatgatgatatagagctaaggaaagaagggaatgttgatcttagtgtt
tacaaaagttatgctaggtttgcaagctggctgattgttatactaatatgtatttccgca
atatttatgcaagcatcccgtaacggcaatgacttatggttatcccattgggtcgatgcc
aacaatggaactgagcaaacaagattttatctgattatactctccatttttggcgttatg
aattccatcttcaccttagcaagagcattttcattttcatatggtggcctacgtgctgca
gttcaggtgcatgctgagcttctaagtaagcttatcaatgcaccggtttgctactttgac
caaaatccaaatgggagaatacttaatagattatcctcagacctttatgccattgatgat
tctcttccatttatttttaatattctcctagccaatttctttagcttgttgggcattgtg
gcagttttgtcctattcacaggtcatgttcttgatattgttgattcctctgggttttgta
tataaaaaactgcagttttactacaggtgcacttcacgtgagcttcggagattagacagt
gtttctcgctcacctatatattcatctttcacagaaacattggatggttcatgtactata
agggcgtttaagaaagaggaaatcttcatggcaagattcttggaccttgtccagttgtat
cagcaaactacctattctgaacaaacagcaagtttatggctttctttgcgcctccaattg
ttgtcagcttcagtaatattatttattggagtgatggctgtcattggtcatggacatgat
ttttcacttaccttggatacacctggtctggtaggattggccctatcttatgctgcacca
atagtgtcattgttgagcagttttcttacaagtttcactgaaacagagaaagaaatggta
tctgttgagagagtggttgagtacatgggcattccgcaggaagaactccaaggatcaaaa
tctctgcctactgggtggccaccccaaggactgattgaatttgaccatgttagtcttcaa
tatagaccatcactaccagcagctttgaaggatctttcttttagtattgcagcaggcatg
aaggtgggaattgttgggagaaccggagctggaaagtcgagcttacttaatgcacttttc
cgccttactcccatctgtaggggacgcatactagtagatggtactgatattgctgtcttg
gctcctagagaactccgggatcgtttctcagtagttcctcaaagtcctttcttgtttgaa
ggttttttaagggagaaccttgatccatttggcatgacttctgatgccaaaatctgggaa
gctctcgaaaaatgtcatatgaaagaagtcatcgaaacagctggtgggcttggcattcat
gttaaagaaaatggaacatcattttcagttggtcaacgacaactcatatgtcttgctcgt
gcaatcattaaatcctccaagatactttgcttggatgaatgtacagccagtgtcgacaca
caaacggctttaattctgcaaaatgccatctccattgattgccaggatacaacagttttg
acaattgcacatcgaatttctaccgtgctagagatggattgtattttagttcttgaccat
ggcatcctggttgagcacggtaatccacgagatcttctcgaagatgaatgctctaggttc
tcaaagtttgccaaagcatcttctatgtaa |
|---|
