Zingiber officinale (ginger): 122006091
Help
Entry
122006091 CDS
T08725
Name
(RefSeq) receptor-like protein EIX1
KO
K13466
EIX receptor 1/2
Organism
zof
Zingiber officinale (ginger)
Pathway
zof04626
Plant-pathogen interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zof00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04626 Plant-pathogen interaction
122006091
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
LRR_14
LRR_4
LRRNT_2
LRR_Zer-1
LRR_At5g56370
LRR_At1g61320_AtMIF1
LRR_SKP2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122006091
NCBI-ProteinID:
XP_042417372
LinkDB
All DBs
Position
7B:78632074..78635622
Genome browser
AA seq
1102 aa
AA seq
DB search
MPLHSLYYSLLLCGLIMILAFSLKEAAVATPTRGCSEVERDALLDFKTNVKDPSHRLASW
SPQIDCCKWSGVVCKTTNNATLFGGHRVVELNLQNPNVDNEQTFHTALRGEILSPSLLNL
TRLERLNLSWNDFEGAQIPQFMGSFLNLKYLELSWSNFSGVIPFQLGNLSSLYHLGLQSA
RWLATPIAHRLDWLSGLSSLRYLDLSYVNLSTVSQNWLSDVNMLPSLRELYLVYCHLNNI
PSSFNSHLNLTSLEILDLEANPFYSSSLPNWLWRLTNLSLLRIDASGLIPAGISNLTRLI
QLDISGNISSPLPVEIWSLNHLVLLDLSDNTMLTGHIPAEIANLSSLQSLFLSYCSLNSQ
IPSEMGNLNSLTTLHLYFNSLSGPIPSDIGNLTSLISLDLSYNSLSGPIPSEIGNLTSLI
SLDLYSNSLSSLIPIEMGNLSSLINLDLSYNSFSGPIPTEIGKLSKLQVLFLYNCSLNGQ
IPFEIGNLTSLISLDLSYNSLSGPIPTEIGKLSKLQVLFLSNFSLNGQIPFEIGNLTSLI
SLDLSYNSLSGPIAIEIGKLSNLKDLYLRGNSRITISLDYDWIPSFQLERLDLASCTAVG
PRFPQWLHSQKSMSELSLSNTSINDILPDWFWNSSSSTFSVIDLSHNKLRGTLPSSIEVI
RSLEYINLRSNKLEGLVPRWTLQIWALDLSFNDFSGPIPSSKISPSYLILSNNHFNGCIP
SFICKSEQLEGLDLSYNKLSGEIPKCWQEANMNLYFTHLGNNKLTGEIPSSIGNLIGLVS
LHLDNNDLSGQLPMSLQNCTKLRVIDLTANNFLGSIPTWMGQNLQQLTILILRSNMFSGI
IPSNLGELSKLHVLDLANNNLRGSIPCSFGNFSAIRLTSRATDDTISIEGSIDGFEYGES
DSVSIVTKGYKYRFSSILYLVKIIDLSSNSLTGEFPTTLGSLVGLQTLNLSRNFLRGRIP
DTIGGMKSSETLDLSFNNLSGVIPQDLSKLTALDHLNLSYNNLSGDIPSGFQLQTLLDAS
IYMGNAYLCGDLINKSCSNDVDNNVTKEELQKSKSQIFLSIYFGASLGYVIGLWSVFIIL
LSKHNWRNLYFHLIDKVHVPLI
NT seq
3309 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctctgcactcgctctactactctttgttgctttgtgggcttattatgatccttgcc
ttttctttgaaagaagcagcagtagcaacacctacaagaggctgctcggaagtggaacgg
gatgccctgctcgacttcaaaaccaacgtcaaagacccttcccaccgtttggcctcctgg
tctccacagatagactgctgcaaatggagtggcgtcgtatgcaagacgaccaacaacgca
actttgttcggaggccaccgtgtggtggagctcaaccttcaaaatccaaatgttgataat
gagcaaactttccatacggctctgcgaggtgagatactgagtccttctttgttgaacttg
actcggttagagcggttgaatctaagttggaatgacttcgaaggagctcaaattccacaa
ttcatgggctcttttttgaatctcaagtatcttgagctttcttggtccaatttttctgga
gtcattccttttcaacttggtaatctgtcgagcctttatcatcttggactgcagtcagct
agatggcttgcgactccaattgcccatcgtttggattggctctcaggactctcttctttg
aggtacctcgaccttagctatgtgaatctcagtacagtctctcaaaattggttgtcggac
gtcaacatgctcccttccctacgagaactctatttggtctattgtcatcttaataacatc
ccctcttcatttaattctcatctcaatctcacttctctagaaattcttgacctggaagcc
aatcccttctactcctcctccttgcccaattggttgtggcgactcactaatctctcattg
cttagaattgatgcttcaggactgatacctgctggaatcagcaacttaactagactaatt
caacttgatatttctggcaacatatctagtcccctacctgttgaaatctggagtctgaat
catctagtactacttgaccttagtgacaatacaatgctaacaggtcatatacccgcagaa
attgcaaatttaagtagtctacaatcattatttctttcttattgttcacttaatagtcaa
ataccttctgaaatgggaaacttgaatagtctaacaacactccacctttattttaattca
ctttcgggacccatacctagtgatattgggaacttgactagtctaataagtcttgacctt
tcttataattcactttcgggtcccatacctagtgagattgggaacttgactagtttaata
agtcttgacctttattctaattcactttcaagtctcatacctattgaaatggggaacttg
agtagtctaataaatcttgacctttcttataattcattctcgggtcccatacctactgag
attggaaaactttccaagttacaagttttatttctttacaattgttcacttaatggtcaa
ataccttttgaaattggaaacttaactagtttaataagtctcgacctttcttataattca
ctttcgggtcccatacctactgagattggaaaactttccaagttacaagttttatttctt
tccaatttttcacttaatggccaaataccttttgaaattggaaacttaactagtttaata
agtctcgacctttcttataattcactttcgggtcccatagctattgagattggaaaactt
tccaatttgaaggatttatacttaaggggaaactctcgaattaccatttccttagactat
gactggatcccttcttttcaattagaaaggcttgacttggcatcttgtacagcagtgggt
cctaggtttccacaatggctccactcacagaaatccatgtctgagttgagtttgtccaat
acaagcattaatgacatcctacctgattggttttggaattcatcttcttccaccttttcg
gttattgatctctctcataataagcttaggggtactttgccatcatcgatcgaggtcata
cgaagccttgaatatataaatctacgttctaataaactggaaggacttgttcctcgttgg
acacttcaaatctgggccctagacctatcttttaatgatttttctgggcctataccatca
tcaaaaatttcaccatcctacttaatcctttcgaataatcatttcaatgggtgcatacca
tctttcatttgcaaatcggagcaattagagggtttggatttatcctacaacaaattatcc
ggagagatacccaagtgttggcaagaagcaaatatgaacctttactttactcacttggga
aacaataagctcaccggtgaaattcctagctccattggaaacttgattggattggtgtct
ttgcatttggacaataatgatctcagtggacaacttccaatgtcattacaaaattgcact
aaactacgtgtcattgatctcacggccaacaactttttaggaagtatacctacatggatg
ggacaaaatttgcaacaattgactattcttatattacggtcaaatatgttttctggcatt
attccttcaaatctcggagaactgagcaagcttcatgttcttgaccttgccaataacaat
ttaagagggtctataccatgttcctttggcaatttcagtgcaataagattgacatcaaga
gcaaccgatgacacaatttcaattgaaggatcaatcgatggttttgaatacggagaaagt
gatagtgtatcaatagttacaaagggatataaatatagattttcatctattctctatttg
gtaaagattatagatctttcaagtaatagtcttacaggtgagtttcctacgacattagga
tctcttgtaggacttcaaactttgaatttgtcaaggaactttttaagaggcaggattcca
gatactattggtggaatgaagtcatcggaaacattggatttatctttcaacaacttatca
ggcgttattcctcaagatttgtcaaaattgactgctttggaccatttaaatctttcttac
aataatttgtcaggggatattccttccggatttcaacttcaaacacttctagatgcttcc
atttatatgggcaatgcttatctttgtggggatttgattaataaaagttgctctaatgat
gtcgacaacaatgtgacaaaggaagagttgcaaaagagtaaatcacaaatatttctatca
atttactttggtgcctcacttggttatgtgattggattatggagtgtgtttataatccta
ctatccaaacacaattggaggaatttgtattttcatttgattgacaaagttcatgtacca
ttaatttag
DBGET
integrated database retrieval system