Zunongwangia profunda: ZPR_2902
Help
Entry
ZPR_2902 CDS
T01216
Name
(GenBank) putative LacI-family transcriptional regulator
KO
K02529
LacI family transcriptional regulator, galactose operon repressor
Organism
zpr
Zunongwangia profunda
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zpr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
zpr03000
]
ZPR_2902
Transcription factors [BR:
zpr03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
LacI family
ZPR_2902
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peripla_BP_4
LacI
HTH_Tnp_ISL3
HTH_3
HTH_28
SpoIIID
HTH_26
HTH_38
HTH_17
HTH_23
HTH_5
HTH_7
Sigma70_r4_2
HTH_29
Sigma70_r4
DUF3853
DNA_pol3_delta_C
TetR_N
HTH_Tnp_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADF53222
UniProt:
D5BGP1
LinkDB
All DBs
Position
3130366..3131418
Genome browser
AA seq
350 aa
AA seq
DB search
MLMKKNYTIKDIAELAGVSKGTVDRVIHKRGKVSSKALEQVNKVLDQIEYKPNPIAKSLK
NNKVYNIAILLPDADNDPYWLPCYDAIKQIENEFSHFGIKIKKGIFNPQSTESFTKSAEI
ILAEKPDAILMVPLFYKEAKDFAKNCVDANIKMATFNNYIKDQKIDLQIGQDLFQSGRVA
AKLFNMLLGTKASLAILHIDEAFQNASHMQEKELGFKTYYLQKELDYDISVYNLKKEAKI
PFKKTIDHFLKSITPVDGLFVTTSKAYLLANCMTESFSKPLIIGYDLVAENIDHLAHDKI
AFLIHQDPKKQVYLSLTKLIEYFLFGKPLQESLSLPIDIINSENYPQYLK
NT seq
1053 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttaatgaaaaaaaattacaccattaaagatattgcagagttagctggcgtatctaaa
ggcactgtagatcgtgtaattcataaacgcggaaaagtatcttctaaagcattagagcag
gttaataaagttcttgatcaaattgagtataaacctaaccctattgcgaaaagcctaaaa
aacaataaagtttataatattgctatattgttaccagatgcggataacgatccctattgg
ctcccctgctatgatgcgataaagcagatcgaaaatgaatttagtcattttggaattaaa
ataaaaaaaggaatatttaatccccaatcaactgaatcatttactaaatcggcagaaatt
atccttgcagaaaagccggatgctatattaatggtgcctttattctataaagaagcaaag
gatttcgctaaaaattgtgtggatgccaatattaagatggcaacatttaataattatata
aaagatcagaaaattgatctgcaaattggtcaggatttatttcaaagtggacgcgtagct
gctaagctttttaatatgctattaggtacaaaagcttctttagctattctacatattgat
gaagcttttcaaaatgcatcccacatgcaggaaaaagaacttggttttaaaacctattat
ttacaaaaagaattagattacgatattagcgtatataatttaaaaaaagaggctaaaatt
ccttttaaaaaaaccattgatcattttctaaaatctataactcccgttgatgggttgttt
gtcactacatcaaaggcttaccttttagctaattgtatgacggaaagcttttctaaaccg
ttaatcataggttatgatcttgtagcagaaaatatcgatcatttagcacatgataaaatt
gcatttttaattcaccaggaccccaagaaacaggtatacctaagcttaactaagctcatt
gaatattttttatttggcaaacccctgcaggaatccttaagtcttcctatcgatatcata
aatagtgaaaattacccacagtacttaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system