Zygosaccharomyces rouxii: ZYRO0A13244g
Help
Entry
ZYRO0A13244g CDS
T01118
Name
(RefSeq) DNA-binding ATPase
KO
K15192
TATA-binding protein-associated factor [EC:5.6.2.-]
Organism
zro
Zygosaccharomyces rouxii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zro00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
zro03021
]
ZYRO0A13244g
Transcription machinery [BR:
zro03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Others
ZYRO0A13244g
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3535
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
HEAT_ECM29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8201552
NCBI-ProteinID:
XP_002494934
UniProt:
C5DP10
LinkDB
All DBs
Position
A:1042525..1048176
Genome browser
AA seq
1883 aa
AA seq
DB search
MTSQVSRLDRQVILLETGSTQFVRNMAADQMGDLAKEHPEDILSLLSRVYPFLLVKKWET
RVTAARAVGGIVCHAPVWDPNENDGEIKTEDADDEETNAKVKLEHEMQVKLEEAEHDELL
LQQEDSRQTLSLSDWSLHELLKSKKVLLASSMNDYGDGNTRKQPKKDLGINGEFYDELKE
INNGNNGVKKEEPGDVPPRQSSPSGTSSNKKSARMLAMAKRKKKMQAKSSSNKPVDLSES
SVSKSLMNQHMSKSKEASMSPTTTPTSLSNPKLEITEQMDNSKIMVESMMAPILEKHEKV
AGLVWQFQGIFELLLDNLINDSWEVRHGSALGLRELLKKHAFSVSRVKGKSRAENNARNK
RSLEDISTRLLTVFAIDRFGDFVYDTVVAPVRESVAQTLAALLIHLDDDLCRKIFGALEQ
LVLQDPQVVMMPNKIWEATHGGLLGVRYFVSIKTDFLLEQHLLNNVVNIVLYGLNQPDDD
VQSVAAAILSPITDQFVKLDLHTIELVLTTIWSLLTHLEDDLSSSVGSVMNLLAKLCKHE
EVLHILKEKAIQHPSEWSFKSLVPKLYPFLRHSISSVRKAVLNLLNAFLSINDDSTKGWL
NGKVFRLVFQNIILEQNREILDLSFQVYIQLLRDYRFKHTEKTLDHVFSKHLQPILHLLN
TPIGENGKNYSMESQYILKISQHYQLHPEKKRSLSESNFDSDIPAPKNSERVNIDEPMIA
GDITLLGAEVIQNTRIMGAEAFGITLSMFQESTLQSFFSNVLVRCFELSYATPRMIAGII
LSTFCSSWSQLHPETEIPSFIQEIFAPVINPQLLNPDDLPTFRELVPSLKALRTQCQSLM
RTFVDVGMLPQHKFPNLPIIVQGEAEAGPEAFNISLAEKVHNEYYDKMFRSMGNSYKLLA
KKPLEDAKYRVFLAIEAAKESRRARNSSILSNYAAASLRFGGLPTKLNPIIRAFMDSIKE
EKNGKLQRLAGDSIIYLIKQLLENDRANVANKICKNLCGFLCVDTSEVPEFAAHSQLKDS
MLTIVKENSPPPSPDDVHLQRLTEEAQIKRRGGLYTLGQLLQLFGSETFQRVTQFHSCLF
EPLDNSSEWKEKDSLTDVVGQSVVDALGALRATYSYMSGELKTNEIWPRFPILLELLRCR
FSVIRYSAARTFADLAKLSPIPVMTFIIREVLPLLNSAGSTIDRQGATELVYHLSISMSH
DILPYVIFLIVPLLGRMSDSNTDVRSLSTTTFALIIKLVPLEAGIADPEGLPEDLMAGRE
RERDFIQQMMDSSKAKPFKLPIAIKATLRKYQQEGVNWLAFLNKYHLHGILCDDMGLGKT
LQAICIIASDQYLRRQDYEKTHSVETRPLPSLIVCPPSLTGHWEAEFEEYSPFLKIVVYA
GGPSTRYPLRDKLHEADIIVTSYDVARNDLSVIAQFDYNYCILDEGHIIKNAQSKLAKAV
KQFRSNHRLILTGTPIQNNVVELWSLFDFLMPGFLGTEKMFQERFAKPIAASRNSKTSSK
EQEAGALALEALHKQVLPFMLRRLKEDVLSDLPPKIIQDYHCELSDLQKQLYEDFSRKQK
TVVQKDIENTADTDNKQHIFQALQYMRKLCNHPALVLSPDHPQLKQVESYLKQTHMDLHD
ISNAPKLLALRNLLFECGIGEQDIDRKSPVNQLPSTVNVISQHRALIFCQLKDMLDMVEN
DLFKRYMPSVTYMRLDGSVEARDRQKVVRKFNEDPSIDCLLLTTKVGGLGLNLTGADTVI
FVEHDWNPMNDLQAMDRAHRLGQKKVVNVYRIVTKGTLEEKIMGLQKFKMNIASTVVNQQ
NNGLSSMNTNQLLDLFDTDNVPSQEKEEKPSQAANGEAGIEEVANETGLSGKAKEALGEL
KELWDPSQYEEEYNLDNFIKTLR
NT seq
5652 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacctcacaggtttcgcggttagaccgtcaggtcatcctactagagacaggttctacg
cagtttgtaaggaatatggcggccgatcaaatgggagatctagcaaaagaacatcctgaa
gatatcctttcgctgctttcaagggtgtatccgtttcttctggtaaagaaatgggagact
agagtgacagcggcaagagctgttggtggtatagtttgtcatgcaccagtatgggatcct
aatgaaaatgacggagaaattaagactgaagatgcggatgatgaggagactaatgctaag
gttaaactggaacacgaaatgcaagttaaattggaggaagccgagcacgatgaacttttg
ctgcaacaagaagattcgagacaaacattatcattatcggactggagtttacatgaatta
ctaaaatctaaaaaagtactactggcgtctagtatgaatgattatggtgatggcaacact
aggaagcaaccaaagaaagatttaggtataaatggggaattttatgatgaattgaaagag
atcaataatggtaataatggagtgaaaaaggaagaaccaggtgatgtaccacctagacaa
tcatcgccatctggtactagtagtaataaaaaatctgcaagaatgttagcaatggcaaag
aggaaaaagaaaatgcaggccaagagctcatcgaataaacctgttgatctttcagaaagt
tcagtatcgaaaagtttaatgaatcaacatatgagtaaaagtaaagaagccagtatgagc
ccgacaacgacgccaacttcgttatcaaatcctaaattagaaattacggagcaaatggat
aatagtaaaatcatggtcgaatcaatgatggcccccatattagaaaagcatgaaaaagtt
gcaggtttagtttggcaatttcaaggtatatttgaattattattagacaatttgattaac
gattcatgggaagtacgacatggttctgcattagggttgagagaattgttgaaaaaacat
gcctttagtgtcagtagagttaaaggtaaatcaagagctgaaaacaatgcaagaaataaa
agatctttggaagatatttcaactagacttttaacagtatttgccattgataggtttggt
gattttgtctatgatacggtggtggcacctgtaagagaatctgttgcacaaactttagct
gccctattaattcatttagatgacgatctatgtcggaaaatttttggtgctctagaacaa
ttggtacttcaggatccgcaagttgttatgatgcctaataaaatttgggaagccacacat
ggtggtcttcttggagtacgatattttgttagcataaagacagattttcttttagaacaa
catttgttaaacaacgtggttaacatcgttctttatggattgaatcagcccgacgatgat
gtacaaagtgtagcggcagctatcttatcaccgatcaccgatcaattcgtaaagttggat
ttacacaccattgaattggtactaacaacaatttggtcgctcttaacccacttagaagat
gatctttcgtcaagtgtaggatcagtaatgaatttattggctaaattgtgtaaacatgaa
gaagttttacacattttaaaggaaaaagctatacaacatccttcagagtggtccttcaaa
tcattggtaccaaaattgtatccatttttaaggcattccatttcatcagtgagaaaagct
gttctcaatcttttaaatgcattcttatccataaacgacgattcaacaaagggttggctc
aacggtaaagtcttccgattggttttccagaatattattttagaacaaaacagagaaatt
ttagatctatcgttccaagtttacattcaactgttacgtgattataggtttaaacatacc
gaaaagacgttggatcatgtctttagtaaacatttacaaccaattttacaccttttgaat
actcctattggtgaaaatggtaaaaactacagtatggaatctcaatacattctgaaaatt
tcccaacattatcaattacatccggagaagaaaagatcattatctgaatctaattttgat
tcggatataccagctcccaaaaatagtgagcgtgttaatattgatgaaccaatgattgca
ggtgacattactctattaggagcagaagtcattcaaaatactagaattatgggtgctgaa
gcctttggtattactttatccatgtttcaagaatctactttacaatcatttttttcaaat
gttctggtacgttgtttcgaattatcctatgcgactccaagaatgatcgcaggtatcatt
ttatcgacattttgttcatcatggagtcaattacatcctgagactgaaataccatcattt
attcaagaaatatttgcacctgtaattaatcctcaattgttaaatcctgatgatttacct
acttttagagaattagtacccagcttaaaggcattaagaactcaatgccagagtttaatg
agaacgtttgtcgacgtggggatgttgccacaacataaattcccaaatttaccaattata
gttcaaggtgaagctgaagctggtccagaggccttcaacatttcacttgcagaaaaagtc
cataatgaatattatgataagatgtttcgatcaatgggtaactcctataagttgttagct
aaaaaaccacttgaagatgcaaaatacagggtgtttttagctattgaggccgctaaggag
tctagaagagctcgtaattcaagcattctttccaactatgcagccgcttccctaaggttt
ggtgggttgccaactaaattgaaccccattattagagcatttatggatagtatcaaggaa
gagaaaaatggtaagttgcagcgcttggcaggtgattctatcatatatctgatcaagcag
ttactggagaacgatagggccaatgtcgctaacaagatctgtaaaaacctttgtggattt
ttatgtgtggatacttctgaggttcctgagtttgctgctcatagtcaattgaaggattct
atgctaactatagttaaggaaaattcaccaccaccctcacctgatgatgtccatttacaa
agattgaccgaagaggcacaaataaaacgtagaggtggtctttacacgttaggtcaattg
ttgcaactatttggatccgaaactttccaaagggttactcaattccacagctgtcttttc
gaaccattggataacagtagtgaatggaaagagaaagattctttgacagatgtagtagga
caatctgtggtagacgcactgggagctttaagagctacttattcttacatgagtggtgaa
ttgaaaacaaatgaaatttggcctcgtttccctattcttttagaattgttgagatgccgt
ttttctgtgattagatattctgctgctagaactttcgcagatttagctaaattatctcca
attccagttatgacttttatcattagagaagtattacctctattgaacagtgcaggttct
actattgatcgtcaaggtgctacagaattagtgtatcacttgtccatttcaatgagtcat
gatattttgccttatgtgatctttttgattgtaccacttttgggtcgtatgagtgattcc
aataccgatgtaagaagcttgtctaccacaacgtttgctctaatcatcaaattggtacca
ttggaagccggtattgctgatcctgaagggttaccagaggatttgatggctggtcgtgaa
agagaaagagattttattcaacagatgatggattcttcaaaggcaaaaccattcaaattg
cctattgctattaaggcaactttgagaaaataccaacaagaaggtgtaaattggcttgca
tttttgaacaaatatcatttgcatggtattctatgtgatgatatgggtctcggtaagact
ctacaggcaatttgtattattgccagtgatcaatatttgcgtagacaagattatgaaaag
actcattctgtagagactagacctctaccatcgctaattgtgtgtccaccttcattaaca
gggcattgggaagctgaatttgaagagtattcaccatttttgaaaattgtcgtttacgct
ggtggtccttctaccagatacccactaagagataaactacatgaggcagatatcattgtt
acttcttatgatgttgcaagaaacgatttatccgtgattgcccaattcgattacaattac
tgtattttagatgaaggtcacatcatcaagaacgcacaatccaaattggccaaggcggtt
aaacagttcagatccaatcacaggttaatcttaactggtacaccaattcaaaacaatgtg
gttgaattatggtcattgttcgacttcttgatgcctggatttttgggaactgaaaagatg
ttccaagaaagatttgctaaaccaattgctgcctctaggaacagtaaaacatcttctaag
gaacaagaagcaggtgccttggctttggaagctttgcataagcaagttttaccattcatg
ttaagaagattgaaggaagatgtcctttctgatttgccaccaaagatcattcaagactac
cattgtgaattaagtgatctacaaaaacaattatatgaagatttctccaggaaacagaaa
acagttgttcaaaaagatattgaaaatacagccgatacggataacaagcaacacattttc
caagcactgcagtacatgaggaagctttgtaaccatccagctcttgtgttatctcctgat
catcctcaattgaaacaagtggaaagttatttgaagcaaacacatatggatttacacgat
atttctaatgcccccaaattacttgcattaaggaacttgttgttcgagtgtggtattggt
gaacaagatatagatagaaaatcaccagtgaaccaacttccttctacggttaatgttatt
tcacagcatcgtgctttaatattttgtcaattgaaagacatgttagatatggtcgaaaat
gatcttttcaaaaggtacatgccctctgtcacttatatgagattagatggtagcgtggag
gctcgtgataggcaaaaggttgtaaggaaattcaatgaagatccatctattgactgtcta
ctgttgactaccaaagttggtggtttaggtttaaatttaacaggtgctgatacagttatc
tttgttgaacacgattggaacccaatgaatgatttacaagctatggatcgtgcacatcgt
ttaggtcaaaaaaaagttgttaacgtttacagaattgtgactaaaggtactttagaagaa
aaaattatgggtctacagaagtttaagatgaatattgcctcgactgtggttaatcaacag
aacaatggtttgtcatcaatgaacactaatcaactgttggatctattcgatacagataat
gtgccatcacaagaaaaggaagagaagccatctcaagccgctaatggtgaagcagggatt
gaagaggttgcaaatgagacaggtttatcaggcaaggctaaagaagcattgggtgaattg
aaagaattgtgggatccttctcaatacgaagaagaatataatttggacaatttcattaag
acacttcgttga
DBGET
integrated database retrieval system
