Zootoca vivipara (common lizard): 118089507
Help
Entry
118089507 CDS
T07275
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1 isoform X1
Organism
zvi
Zootoca vivipara (common lizard)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Ig_2
ig
THB
V-set
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Ig_J_second
C2-set_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118089507
NCBI-ProteinID:
XP_034980145
LinkDB
All DBs
Position
LG7:complement(32154362..32200407)
Genome browser
AA seq
2468 aa
AA seq
DB search
MAGRKGVKSLKRSAVPGVTITQFVEDIPKGCSIPDFERKPITLTLQEGKNAIFRALVKGE
PKPEVFWKRNNEAVDDPQKYQISFSPATNEFILQVNKITVDDADLYRCTAVNDYGEATCT
AGLKIIQVGFRKKAKQTSSAPQTDLKKEIQDFRKTLKKLAPSSAPKKEIDMEQIWQLLLN
ADKKDYERICLKYGIVDFRGMLRKLQEMKKEREDKQAQYLLNLRNLRHVRVNAVQGNASF
DLEMELKNPESRIYLYKDGQMINFGFDSDNTKHCLRQVGKKYNFFINDLQPEDAGVYQIK
VEDVDVFSTELEAESIPVSFRYPLGEVRCHEQGNAVFQCTLYEPCSNAAWMHRDRILESN
DKYEISVSEDGLTHRLIIKNTHASDKGTYTIDIGNRSSSAWLEVESKGKRKQTEGDSDDI
TGWRKKQLDEDRTKKLRQGQGHDEQDGQYKNGQAGEGESYSSLGKDGSLGRGGANRDGKM
GQFSGVGIDMGEGHEFSGFAGGSSEHMGHTGNGVSGGMAGTGTGSGGTGGLQTSDGSTLD
GAGGPGTGFGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGAGGAGFGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGGAGGV
GGLYGKDGMLGGAGAGGAGGDGGVGGLYGKDGMLGGAGAGGAGSAGIGGLYGKDGTLGGA
GAGGAGGAGSAAVGGLYGMDGMLGGAGAGAGGSGSAGGLYGKDGMLGGAGAGGAGGAGGL
YGKDGMLGGAGAGGPGGAGGLYGKDAMLGGAGAGGLYGKDGMLGGAGAGGSGSVGGLYGK
DGMLGAAGAGGPGGAGGVGGLYGMDGVVGRAGASGPGGTGGVGGPDGVGGLYGKDGMRGG
AGAGGPGGTGGVGGPGGVGGLYGKDGLLGGAGGLEGVGGFGGLYGQDGMLGGASAGVPGG
TSGVGGLGGKDGLPVGAGQLGDAGSVGGPYGKDGMLGRTGPDRPGGPGGVGGLYRQNGML
SGVGAVVGGVGGVGGLLYGQDGMLGGAGAGGLGDAGGVGGLYGKDGVPGGPGAGRPGGVG
GLYGQDGMLAGAGAGGVGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGAGGAGGVGAAGGASGLYGKDGML
GGTGSGGSGGVGGLYGQDGMLAGAGAGGPGGAGGVGGIYGKDGMLGGAGAGGAGGAGGVG
GLYGKDGMLGGAGGAGGVGAAGGAGGLYGKDGMLGGTGSGGPGGVGGLYGQDGMLAGAGA
GGPGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGAGGAGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGGAGGVGAAGGAGG
LYGKDGMLGGTGSGGPGGVGGLYGQDGMLAGAGAGGPGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGAGG
AGGAGGVGGLYGKDGMLGGAGGAGRVGAAGGAGGLYGKDGMLGGAGGLYGKDGMLGGTGS
GGPGGVGGLYGQDGMLAGAGAGGPGGAGGVGGQYGKDGMLGGAGAGGAGGACSASGVGGL
YGQDGMLGGAGAGGPGGAGRVGGAGGVGGHYDKDGILGGAGAGGAGGHHGKDGVLPGVGG
VGLRGIGSTGDLYGQAGTLHGTEAGGADTALGGMGSMMDRTGRAGTKYGISGEGYGEGGI
GKDGRVSGTGAGGLGGEGWLDGSDGRLGGFGVGPGVRGVDGSLYENTSGIPGEEFLGYGQ
SSGLSDAGTHAGDRRRQLSDLDPSQLTSSDISRTRDRKGRGGSLLEEDVRESHPRFNQGL
FDLHAPKGKPAVLSCSLNNDQLEGIWFKDGFKVTGQDGVSIEKEGPVHKLLIDEVQDSHA
GKYKFEAGGVRTEASIFVEDPPNVDSALLEKLKTEPIIVKAGKNAIVKIPFEGRKPVRST
WLKDEGELLDDARISTDYSDNFTRLSISSANRKDCGDYKVKLKNESGSIEATLKLVVIDK
PQPPMGPIEVVECSTNSITIQWKPPKDDGGKPIQGYIIERQQVGRKTWVTLGKTSGSSTV
FTTNKVEHGKSYYFKVRAVNAEGTSEALESDEVMAATKAFPGPPAPPQIVSTHKGAITLS
WAAPRKTGNSRILGYSVEKCKKGSNSWTPVTDVPITDRKYTVTDLKEGLLYEFRVAAINA
AGAGDTSAPSEAAFARDPMKPPGAVRDLKVISTDYCSISLSWMKPKAEEESHAKGYIIEM
RHTDTLKWTQCNSLPIPMTTYTVRGLKAREMYFLRVRAVNDGGFGEPVELDTCVQAVPPT
VHPKLLVKDTTKSFMIVKAGDAICVRIPFEASPPLEVVWLKDGLTVPAKSTTATREGLSQ
LIIPGADFSDSGHYSITLQTERGNKETFSFLVQVLDVPESPGPIQLIEKVPDTVTLIWEP
SPTEKREGTLNYMVMRRDSSKGSWQLVSDLIYTNKCTVSNFVPGWEYYFRVQAKNCMGIS
EPSETVQPWIIHREKGKFAVRSPPYKGINQTQPPRFLVPLKPHVVTLGSDCHMSCAVTGY
PVPQVMWYKDGKNISQDPTFFSKNDFGVCSLVILGVTASDGGQYKVVAINELGQAVSKAV
VTIKEPAF
NT seq
7407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaggtcggaagggagttaaatctctgaagagatcggccgtccctggagtgactatc
acacagtttgtggaggacattccgaaagggtgcagcatacctgactttgagcggaagcca
attaccttaacattacaggaaggtaaaaatgccattttcagagctctggtcaagggtgaa
ccaaaaccagaggtgttctggaaacgcaataatgaggcagtggatgatcctcagaaatac
cagatatcattcagtccagccacaaatgagtttatcctgcaggtaaacaaaatcacggtg
gatgatgctgacttgtaccgttgcacagctgtgaatgactatggggaagccacctgcact
gctggcctcaagatcatacaggtcggcttcaggaagaaagcgaaacagacttcttctgca
ccacagacagacctgaagaaggagatccaggacttcagaaaaacattaaagaaactagca
ccttcaagtgctccgaagaaggaaatcgatatggaacagatctggcagttattgctgaat
gcagataagaaagattatgaaaggatctgcctgaagtatggcattgttgacttccgtggg
atgctgaggaagcttcaggagatgaagaaggagagagaagacaagcaggcacagtatcta
ctcaacctcagaaacctgaggcatgtcagagtcaatgcggtgcaaggaaatgcttcattt
gacctagagatggaactgaaaaatccggaaagcagaatttacctatacaaggatggccag
atgatcaattttggattcgacagtgacaacacaaagcactgcctgcgacaggttggcaaa
aagtacaattttttcatcaacgatctgcagccagaagatgctggcgtgtaccagatcaaa
gtagaagatgtagatgttttctcaactgagctggaagcagaatccatcccagtaagtttt
cgctatcctcttggtgaggtgagatgccacgagcaaggaaatgctgtctttcagtgcact
ctctatgaaccctgctccaacgctgcgtggatgcacagagaccgtattctagagtccaat
gacaagtatgaaatttcggtctcggaagatggcctaactcaccgcctaatcatcaaaaac
acccacgcctctgacaaggggacttacaccattgatattggaaaccgctcttcaagtgcc
tggcttgaggttgaatctaaaggaaagagaaagcagactgaaggagacagtgatgatata
actggatggcggaagaaacagctagatgaagaccgcacaaagaaacttcgccaaggacaa
gggcatgatgagcaggatggccagtataagaatggccaagctggcgaaggagaatcttat
agttccttaggaaaagatgggtctttgggaagaggaggagccaacagagatgggaagatg
ggacagttttctggggtggggatagacatgggagaagggcatgagttttctggatttgct
ggtggtagtagtgaacatatgggacatactggaaatggtgttagtggaggaatggctggc
acaggaactggatctggaggtacaggtggactacaaacttcagatggttccacacttgat
ggagcaggtgggccaggaactgggttcggtggtgctggtggagtaggtggactctacggc
aaggatgggatgctaggtggagctggtgctgggggagctgggttcggtggtgctggtgga
gtaggtggtctctacggcaaggatgggatgctaggtggagctggtggtgctggtggagta
ggtggactctacggcaaggatgggatgctaggtggagctggtgctgggggagctggcggt
gatggtggagtaggtggactctacggcaaggatgggatgctaggtggagctggtgctggg
ggagctggaagtgctggtataggtggactttatggtaaggatggtacattaggtggagct
ggtgctggcggtgctggtggagctggcagtgctgctgtaggtggactttatggtatggat
ggtatgttaggtggtgctggtgctggtgctggtggatctggcagtgctggtggactttat
ggtaaggatggtatgttaggtggagctggtgctggtggagctggtggtgctggtggactt
tatggtaaggatggtatgttaggtggagctggtgctggtggacctggtggtgctggtgga
ctttatggtaaggatgctatgttaggtggtgctggtgctggtggactttatggtaaggat
ggtatgttaggtggagctggtgctggtggatctggcagtgttggtggactttatggtaag
gatggtatgttaggtgctgctggtgctggtggacctggtggtgctggtggagtaggggga
ctttatggcatggatggggtggtaggtagagctggtgctagtggaccaggtggtactggt
ggagtaggtggtcctgatggagtaggtggactttatggcaaggatgggatgcgaggtgga
gctggtgctggtggaccaggtggtactggtggcgtaggtggtcctggtggagtaggtgga
ctttatggcaaagatggtttgctaggtggagctggtggacttgagggtgttggtggattt
gggggactttatggccaggatggaatgttaggtggagctagtgctggtgtacctggtggt
actagtggagtaggtggacttggtggcaaagacggtctgccagttggagctggtcaactt
ggtgatgctggcagtgtaggaggaccttatggtaaggatggcatgctaggtcgaactggg
cctgacagacctggtggccctggtggagttggtggactttatcgccagaatggtatgcta
agtggagttggagctgtagttggtggtgttgggggagtagggggactactttatggccag
gatggtatgttaggtggggctggtgctggtggacttggtgatgctggtggagtaggggga
ctttatggcaaggatggggtgccaggtggacctggtgctggcagacctggtggagttggt
ggactttatggtcaggatggtatgttagctggagctggtgctggcggagtaggtggtgct
ggtggagtaggaggactttatggtaaagatggtatgttaggtggagctggtgctggcggt
gctggcggagtaggtgctgctggtggagcaagtggactttatggcaaggatggaatgcta
ggtggaactggttctggcggatctggtggagttggtggactttatggtcaggatggtatg
ttagctggagctggtgctggcggacctggtggtgctggcggagtaggaggaatttatggt
aaggatggtatgttaggtggagctggtgctggtggagctggcggtgctggtggagtagga
ggactttatggcaaggatgggatgctaggtggagctggcggtgctggtggagtaggtgct
gctggtggagctggtggactttatggcaaggatggaatgctaggtggaactggttctggc
ggacctggtggagttggtggactttatggtcaggatggtatgttagctggagctggtgct
ggcggacctggtggtgctggcggagtaggaggactttatggtaaggatggtatgttaggt
ggagctggtgctggtggagctggcggtgctggtggagtaggaggactttatggcaaggat
gggatgctaggtggagctggcggtgctggtggagtaggtgctgctggtggagctggtgga
ctttatggcaaggatgggatgctaggtggaactggttctggcggacctggtggagttggt
ggactttatggtcaggatggtatgttagctggagctggtgctggcggacctggtggtgct
ggtggagtaggaggactttatggtaaggatggtatgttaggtggagctggtgctggtgga
gctggcggtgctggtggagtaggaggactttatggcaaggatgggatgctaggtggagct
ggcggtgctggtagagtaggtgctgctggtggagctggtggactttatggcaaggatggg
atgctaggtggagctggtggactttatggcaaggatgggatgctaggtggaactggttct
ggcggacctggtggagttggtggcctttatggtcaggatggtatgttagctggagctggt
gctggtggacctggtggtgctggtggagtaggtggacaatatggtaaggatggtatgtta
ggtggagctggtgctggcggtgctggtggagcttgcagtgctagtggagtaggtggactt
tatggtcaggatggaatgctaggtggagctggtgctggcggacctggtggtgctggcaga
gtaggtggtgctggtggagtaggaggacattatgacaaggatgggatactaggtggagct
ggtgctgggggagctggcggtcaccatggcaaggacggtgtgcttcctggggttggtggt
gttgggttaagaggtatagggagcactggtgacctttatggtcaggcaggtactttacat
ggaactgaggctggtggtgctgacactgcattaggaggcatgggcagcatgatggatcga
actggaagagctggcaccaagtatggtatatcaggtgaaggttatggtgaaggagggata
ggtaaggatggcagggttagtggaactggtgctggtggtcttggtggtgaaggatggttg
gatggtagtgatggtagactaggtggatttggtgttggtccaggagttagaggtgttgat
ggatcactgtatgagaacacgtcaggcattcctggtgaagagttcctaggctatggacag
tcttctggcctttctgatgctggaacccatgctggagacagaagaagacagctgtctgac
ttagatcctagtcaacttacttcatcagatatttcaagaaccagggacaggaaagggaga
ggaggaagtcttcttgaagaggatgtgagagaatcgcatccccgtttcaaccaaggttta
tttgacctccatgcaccgaaaggaaaaccagctgtgttaagctgcagcctcaacaatgac
cagcttgagggaatttggtttaaagatgggttcaaggtaacaggccaggatggagtctcc
attgagaaggagggccccgtccacaaactattaatagatgaagtacaagatagtcatgct
ggaaaatacaaatttgaagctggaggtgtccgaacagaggcatctatttttgttgaagac
cctccaaatgttgactctgctcttctggaaaaactgaagacggaacctataatagtaaag
gcaggaaagaatgccatagtcaagatcccatttgaaggccggaagccagtcagatcaact
tggctaaaggatgaaggggaacttctggatgatgccaggatcagcactgactattcagac
aacttcacccggctctccatatccagtgctaatcggaaggactgtggtgattataaagtg
aagctgaagaatgagagtggaagcattgaagctactctcaagctggtagttatagataag
cctcaaccaccaatgggacccatcgaagttgtggagtgctccacaaatagtataactatc
cagtggaagccccccaaagacgatggtggcaaaccaatccagggttatattatcgagagg
cagcaggttggcagaaagacctgggtgaccttggggaaaaccagcggaagcagcactgtc
ttcaccaccaacaaagtagaacatggcaaaagttattacttcaaagtgagagcagtgaat
gccgagggtaccagtgaggcactcgagtctgatgaagtgatggctgctaccaaagcattt
cctggtcctcctgctcctccccaaattgtcagtacccacaagggtgccatcacactctca
tgggcagcaccccgtaagaccggcaactcccgcatcttgggctacagtgttgagaagtgc
aagaagggcagcaacagctggacacctgtcactgatgtgcctattacagacaggaagtac
actgtgactgacctgaaggagggtctgctgtatgaattccgtgtggctgccattaatgct
gctggggcgggtgacactagtgcgccgtcggaagctgcttttgctcgggatcccatgaaa
ccgccaggtgcagtgagagatcttaaagtgatcagtactgactactgcagcatctctttg
tcgtggatgaagccaaaagcagaggaagaaagtcatgccaaaggctacattatagagatg
cggcacactgacactctgaagtggacccagtgtaattctctcccaatcccaatgactaca
tacacagttagagggctaaaagccagggagatgtacttcctacgagtgagagcagtcaat
gatggtggttttggcgagcccgttgaactggacacttgtgtccaagctgtacctcctaca
gttcatcccaaactcttagtaaaggacaccaccaaaagctttatgattgtaaaagcaggg
gatgcaatctgtgtgcgcattccctttgaagcttccccacctcttgaagtggtttggcta
aaggatggtcttactgtgcctgcaaaatcaacaacagctaccagagaaggcctgagccaa
ctcatcatcccaggagctgacttttctgacagtggccattatagcatcaccctccaaact
gagcgtggaaataaagagactttcagcttcctagtccaagttctagatgtcccagaatct
cctggtcctatacagctaattgagaaggtccctgacacggtgactctgatttgggagccc
tcaccaacagagaagagagagggcaccctgaattatatggtcatgagacgtgactccagc
aaaggatcttggcaattggtgtctgacctgatttacaccaacaagtgcactgtctcaaat
tttgtcccaggctgggaatactacttcagagttcaggcaaagaattgcatgggaatcagc
gagccctctgaaacagtgcaaccctggatcattcacagggaaaagggtaaatttgcagtc
agaagcccaccatacaaggggatcaaccaaactcagcctccaagattccttgtcccattg
aaacctcatgtggtaactctaggatctgactgtcacatgagttgtgctgtgactggatat
ccagtccctcaagtgatgtggtataaagatggcaagaatatctctcaggatcctaccttc
ttcagcaaaaatgactttggggtctgctctcttgtgatcctaggagtcacagcatcagat
ggaggccagtacaaggtggtggccatcaatgaactaggccaagcagtcagcaaagctgta
gtcaccataaaagaacctgctttttag
DBGET
integrated database retrieval system
