Ciona intestinalis (yellow sea squirt): 104266451
Help
Entry
104266451 CDS
T01056
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: von Willebrand factor-like
KO
K03900
von Willebrand factor
Organism
cin
Ciona intestinalis (yellow sea squirt)
Pathway
cin04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cin00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
104266451
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
cin03110
]
104266451
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
cin04147
]
104266451
Chaperones and folding catalysts [BR:
cin03110
]
Intramolecular chaperones
Others
104266451
Exosome [BR:
cin04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
104266451
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWD
C8
TIL
VWC
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104266451
NCBI-ProteinID:
XP_026693636
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2880 aa
AA seq
DB search
MKTQFVFMGCLVLASITQGISESQNEQRNKRNIGELDIPDSLLSIQHQSQSQVSVSCDPP
CANGACVGENQCKCEEGYSGPACNEFECTESCGHGKCVAPNTCECNTGWGGESCHTATCD
DECLNGGSCSAPNTCTCLKGWSGDNCGSAVCDVKCANGGTCDSPNVCLCKQGYQGTLCQI
AQQPGCKFPFEYNGELYMTCTTVDATDGQPWCSTTTAFEGDKKICDFTSMCSAAGQKLEI
PGECGKYYECADDMTVSVVPCPAGTVFNALVGGCDTADNVPMCKDDASQGPTKGEDSTSC
PAPTHSSNVCSYWEKENFYTFDGALFASSGRCNYQLVSDCVGNTFDISLSFTSGGNPSLK
LTSQTGVSVVVTGGKAYNEGEEIAIPSLSNGFSLYKLPNTDYTIINSSAGFAVAWSGNDN
FFIAVHNKNLVGHLCGLCGNFNGFTVDDMVPKYGETPTTNVETLMDSWLLASGEECTTGT
STDYCGLLTTQQLSDIAKVCAEVVTGLSFTSCNVPTSVLEETCVRDLCQCEGDYKDCLCA
SATHYSKLCVATGANVKEWRTDKFCPKSCPNGMVYSECGTACPRTCKNKGLMHMCASLCV
DGCFCPAGTILDVGGCVAEEECSCSHLGEVYSSGQKRTEDCRECTCNGGSWSCTDLMCAG
ECSATGDPHYQTFDGSSYSFNGDCRYVLATDSCGSGSNYTFAVVVENVKCEASDSGSCTK
SATIVIKNALKETKYKLKQEGVVGVDENDVTLPYTHGDISIMRLSSMMVQVKTSNGIEVD
WDGEMRLYIRLDPLWRNRVCGLCGNFNGKATDDMKTPQSIVETNPASFGNSWKVSSECAA
VPSIPESCSANQEKIEEANQLCDVIKSDVFKPCHQVVDYELHYSMCRSDVCGCSGDNCMC
SSLSDNARKCVEKGVVIQWRSNTTCGVTCESGLEYRECGGDCVSKCSTLGGIMCDRMCHP
GCYCPQNLYLNDDGTCVEMEKCGCIYQGVKYTAGEAMETSSTVCECKDGLMTCHDKQEAP
SCEEPLVYIDCVSSSGTACQDTCQSKKTFCMAESCVAGCGCPEGTIKDENTNTCVKPDQC
SCTHNGQVYEPNSVMSPDSCNDCTCVEGGWSCTEMACPAECSAVGDPHFTSFDGLRYNFQ
GACSYVMSQDFCNNKTGGFRVVVENIPCGNNGVTCTKSVTVHLYNVVIKLTKGDGEPVVS
ESVSIGSPAPPSGFQYNIRKGSIYYIVETNNGLSVLWNKENAAKVQLQPNYMGQVCGLCG
NYDGDTGNDFQTRDGDIAVNPNDFGNDWKTDDTCPDGTRDPNPCLESPERAPWAEKKCAI
INSEVFAECHAKVDPTHYYDNCMYDTCGCNFGGDCECFCTAVAVYAQECAAAGVCINWRN
NEVCPVMCEVFNPGFGSSYDNETCEWKYNACGNPCPPTCDNPNPTNCPWESLEGCYVSCK
DDEVWDEIKNKCIPKSECPVVTTTTPVITTTTTEKTTTTTEVTTTTPEPEIITTTPEVTH
PDEEITTTTPKWCNCVDSDGIAHSPGETWPLRNDESLCVDLTCVEEAPGVCKTESVDTTV
KCTAENKPTCLNGFPAVAVTDGCSCQWECQCYCFGQGDPHFFTFDGKYYPFQGNCTFVLS
RDMNEHHSNHPHDYEIWMENEACPEAPETTCTRKMTIRYGPTHVVLYKNYTFTVNGGNLK
HRAQMPYTFGDIRIELRGFNLFYVTIPDLGITLTYTGLDYSWSLIVPYSVYFNKTEGLCG
VCNNDQGDDFTTRKGTVVKDIEIFGESWLVYNESKHCFKEDNKTCFPAAPECDIITSDVF
KDCHALVDPEVYLKICRFDTAQCGNYSYCEALYGYARICQHAGVCVDWRTDSICPMECGD
DEIYMACQPNCEQTCDNFISGEQCASEEVVEGCFCPPGTVLDGGECVAEETCTDCVDADG
NIFGYGESWVSENASCTICSCMEGQNVVCTNKPCSPGWTDAVPSCHSCFVPELERGSDPC
CPTYKCVCNYELGKGDDECDVVTIPTCDPGYIPIQTNPGKCIPSYECTCNASRNPCPVPP
TCGELEHLVSTDGECCPTHKCVCNECPEKSPSCGVCQNTLTTVDKCDCKHYTCENKGVCN
INGTEKLPGDSWNTDPCTTCTCHETSVDNDGCYNVGCVVMSCSTYCPPCSTYTPVAGQCC
GMCVQTACSVADENNSTQCKPIGDHWQDLDKCISSICVANPNGHTTVTTAPITCPPVAMP
TCTPCYKIATYTEDCCEKYHCIPDDVCCLSGPAIKLPGETWEPDACNECQCTNNMNHTSG
FHVVDCSPKPCPPFDIDDCESHGGQSALSDDGCCMHCVANVCVDAKNQTHSFGETWYPDV
CTICSCVAGHEIVCNPVTCPPSKQAPMNCAPCEVPLRRLSSDPCCPQYDCVCNYELIKGE
PNCDAVPVPKCPPGYVASQTNVGQCIPDYDCFCNKSRNPCPEAPECPELHELVTTETECC
PLYGCVCKKCNEAPTSCSPCQDAITTIDACGCRHVTCQSKNICYVDDVAHLPGDIWNPDV
CTQCVCQSDVTNPDTACHVESCFAQSCDPTCPPCHDYVVGAGECCGTCVQRACQVAGANG
TVECKNVGDNWWYESTCEQYMCTTDNDGNIGIVEVAYACPVPEVPTCSSCYKLESYVEGC
CSKLRCVQENVCCADGMGKLPGSTWAPDACHLCQCTEDKDLDTGFLAEQCYHNPCPPFDS
DACVANGGTVISSDDGCCLKCQETECFECDKRMSTKPEYMLVDGCASNEPVSLSYCDGFC
RGHYFWTDHGAENDCSCCNPTSTATRVVSMKCKNGTEVQYSFTDVLSCGCTATCTPNPPT
VTPAPETPAPTTTAPEAPVPTTTVPVKPTPTTEETGSGETTVPEAPVTTTTVPVKPTPNN
NT seq
8643 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagactcagtttgtcttcatgggatgcctggtgcttgcttctatcacgcaaggtatc
agtgaatcacaaaatgaacaacggaacaagcgaaacattggtgaacttgatatacctgac
tcactactgagtattcagcatcaatcacaaagtcaagtcagtgtgtcatgcgacccccca
tgtgccaatggtgcgtgcgttggggaaaaccaatgtaaatgtgaagaaggttatagtggg
cctgcatgcaatgaattcgaatgcacagagagctgtgggcatggtaaatgcgttgcaccc
aatacgtgtgaatgtaacacagggtggggaggagagtcctgtcatacagccacatgtgat
gatgaatgtttaaatggaggttcgtgctcagcaccgaacacctgtacctgtttaaagggc
tggtcaggtgataactgtggatcagctgtatgcgatgttaaatgtgcgaacggtggaact
tgcgactcccctaatgtttgtctttgtaaacaagggtatcaaggaacactttgtcaaatt
gcccagcaacctggttgcaagttcccattcgaatacaatggtgaattatacatgacttgt
acaactgttgatgcaactgatggacaaccatggtgttctacaactactgcgtttgaagga
gataagaagatctgtgacttcacatcaatgtgttccgctgctggccaaaaactcgagatt
cctggtgaatgtggaaagtattacgaatgtgctgatgatatgacagtgtctgttgtccca
tgtccagcgggtaccgtgttcaatgccctggtaggggggtgcgacactgctgacaatgtc
ccaatgtgcaaagatgatgcatcacaaggtccaactaaaggagaagacagcaccagctgt
cctgcccccacccattcatcaaacgtatgcagttactgggaaaaagagaacttctacact
ttcgatggcgctctattcgcatcaagtgggaggtgtaactaccaacttgtatcagactgc
gttggaaatacctttgatatttctctttccttcacaagtggtggaaacccctcacttaaa
ctgacatcacagactggtgtgtcggtcgtagttacgggagggaaggcttacaatgaaggg
gaagagattgcgatcccaagcctcagcaatggtttctccttgtacaagttacccaacact
gactacacgatcatcaacagcagtgcggggttcgctgtggcttggtccgggaatgataat
ttcttcattgctgttcataacaagaacttggttggacatctgtgtggattgtgtgggaac
tttaatggattcactgtggatgatatggtcccgaaatatggtgaaaccccgacaaccaac
gttgaaactttgatggactcatggctgttggcaagtggtgaggagtgtacaacaggaaca
tctactgattattgtggattgctcactacacagcaattatcggacattgcgaaagtctgc
gctgaagtagtgaccgggctttccttcacatcttgcaatgttccaacctcggtacttgag
gagacttgcgtacgtgacttatgccagtgtgagggggattataaggattgtttatgtgca
tcagccacccactacagcaagctatgtgtggcaactggagctaatgttaaagaatggagg
actgacaagttttgtcccaaatcgtgccctaacggtatggtatacagtgaatgcgggacc
gcatgcccaaggacatgtaagaacaagggattgatgcatatgtgtgcgtcgctatgcgtc
gatggatgtttctgtcctgctggtaccatccttgatgttgggggttgcgtggcagaagag
gaatgctcgtgctcacatcttggtgaagtttattcatccggtcagaagaggacagaagac
tgtagagaatgcacatgcaatggtggttcatggtcatgcacagacctcatgtgcgctgga
gaatgctcggcaaccggcgacccacattaccaaaccttcgatggttcttcgtattcgttt
aacggagattgtcgatatgtgctcgctactgactcatgtggtagtggaagcaattacacg
tttgccgttgttgttgagaacgttaaatgcgaggcaagtgacagcgggagttgtacaaag
tcagcgacaatcgtcatcaagaacgcactgaaagaaacgaaatacaaacttaaacaagaa
ggagtcgttggggttgatgaaaatgacgtgacgttgccatacactcatggtgacatctcc
attatgaggttatccagcatgatggttcaagttaaaacatccaatggtattgaggttgat
tgggatggtgagatgagactttatatcaggttggatcccttatggagaaacagagtgtgt
ggtttgtgtggaaactttaacgggaaagccaccgatgatatgaagacaccacaaagcatc
gttgaaaccaatccagctagctttggaaactcgtggaaggtttcttctgaatgcgcagcc
gtgccctctatccccgaatcttgctcggctaaccaggagaaaatcgaggaagcgaatcag
ctttgtgatgtcataaagagtgatgtgttcaaaccatgccaccaagtggtggattatgag
ttgcattactctatgtgccgatctgatgtatgcggatgtagtggcgacaactgcatgtgt
tcatcattgtccgacaatgcaaggaaatgtgtggagaaaggggttgttattcagtggaga
agcaatactacttgtggtgtgacttgcgaatctggacttgagtaccgagaatgcggtgga
gactgtgtttccaagtgttcgacattaggtggcatcatgtgtgacagaatgtgtcaccct
gggtgttactgtccgcagaacttatatctcaatgatgacggtacatgtgtggagatggaa
aagtgcggatgtatttaccaaggagtgaaatatacagcaggggaagcaatggaaacttca
tcaacagtttgcgaatgcaaagatggtttgatgacatgccatgataaacaagaagcccca
tcatgcgaggaaccacttgtttatattgactgtgtttcgtcaagtggaacagcatgccag
gacacctgtcaatcaaagaagaccttctgcatggctgagagctgcgtagctggatgtggt
tgtcctgaaggaactattaaagatgagaacacgaacacttgtgtgaagcccgaccaatgt
tcatgcacgcacaatggacaagtatacgaaccaaactctgttatgagccctgatagttgc
aatgattgtacttgtgttgagggtggatggtcgtgtacagagatggcttgtcctgctgaa
tgctctgctgtaggagatccacatttcacttcatttgatggacttagatacaacttccag
ggtgcttgttcttatgtgatgtcacaagacttctgcaacaacaaaactggaggcttccgt
gttgttgttgagaacattccatgcggtaacaacggtgtgacgtgcaccaagtcagtcacc
gtccatctctacaatgttgtcatcaaacttacaaagggagatggagaacctgtcgtatca
gaaagtgtttccatcggctccccagccccacccagtggcttccaatacaacattagaaag
gggagtatttattacatcgttgaaaccaacaatgggttgtccgttctatggaacaaagaa
aacgcagctaaagttcaacttcaacctaattacatgggacaggtgtgtggattgtgtggt
aattatgacggcgacactgggaatgatttccaaacaagagatggagatattgccgtcaat
cctaatgattttggcaacgactggaagactgatgacacgtgcccagatggcacaagagac
ccgaacccgtgcctggagtcccctgagcgcgcaccgtgggctgagaagaaatgtgccatc
atcaacagtgaggtgttcgctgaatgtcacgccaaagttgaccccacccattattacgat
aactgcatgtacgatacctgtggatgtaactttggtggagattgtgaatgcttttgcaca
gctgtggcggtatatgctcaggaatgtgcggctgccggcgtttgcatcaactggcgtaac
aacgaggtttgtcccgtcatgtgcgaagtgttcaaccctgggtttggatcatcttatgat
aacgagacgtgtgaatggaaatacaacgcttgtggcaacccgtgcccacccacatgcgat
aaccccaaccccacaaactgtccatgggaaagtttggaaggatgttatgtctcctgcaaa
gatgatgaagtctgggatgaaattaaaaacaaatgtattccaaaaagtgaatgcccagtt
gttacaactacaacaccagtgataacaaccacaacgactgaaaaaacaacaacaacgaca
gaagttacgacaacaacacccgaaccagaaataatcaccacaacgccagaagtaactcat
ccagatgaagaaataacaacaacaacaccaaagtggtgcaactgcgtggatagcgatggc
atcgcacattcacctggtgagacttggccacttagaaacgacgaatcactttgcgtcgac
ctcacttgcgtggaagaagcaccgggtgtttgtaaaacagagagcgtcgacaccaccgtt
aaatgcacggctgagaacaaacctacgtgcttgaacggattccctgccgtggctgtcact
gacggttgtagttgtcaatgggagtgccaatgttattgcttcggccagggtgaccctcac
ttcttcacattcgatggtaaatattatccgttccaaggaaactgtacgtttgtattatca
cgggatatgaatgaacatcacagtaaccacccacatgattatgagatttggatggagaat
gaagcttgtcccgaagctcctgaaacaacttgtacacgaaagatgacgatcagatacgga
ccaacacacgttgtgctgtataagaactacacattcacagtgaatggaggaaacttgaaa
caccgcgcgcaaatgccatacacgtttggagacatccgtatcgagttgcgaggattcaac
ctcttctatgtaacgattcccgacctcggcatcaccctcacttacactgggctggattac
agctggagtttgatcgtcccttattcagtttacttcaataaaactgaaggactgtgtggt
gtttgtaacaatgaccaaggtgatgatttcacgacaagaaaaggaacggttgtcaaggat
attgaaatatttggcgaaagttggttggtgtacaacgaatcaaagcattgcttcaaggaa
gataataaaacttgttttcccgccgcacctgagtgtgatatcatcacgtctgatgttttt
aaagactgccatgcgttagtggatcccgaagtatatttaaagatttgccgatttgatacg
gcacagtgtgggaactatagttactgtgaagctttgtacggatacgcgaggatctgtcaa
catgctggcgtatgcgtggattggagaactgactctatttgccccatggagtgtggtgat
gatgagatatacatggcttgccaacccaactgtgaacaaacttgcgataattttatctcg
ggtgaacaatgcgcgtccgaggaagttgttgagggctgtttctgtccaccgggtaccgtg
cttgatggtggggaatgtgtggctgaggaaacttgcactgactgtgtggatgctgatggg
aatatatttgggtatggggagagctgggtatcagagaacgcttcatgcacgatatgctct
tgtatggaaggacagaatgtggtttgtacaaacaagccatgttcacctggttggacagat
gccgtaccaagctgtcactcatgttttgtgcctgaacttgaacgaggttctgacccatgt
tgccccacctacaagtgtgtatgtaactacgagttaggcaaaggcgatgacgaatgcgac
gttgtaacgatcccaacatgcgatcccgggtacattcccatccaaaccaaccccggtaaa
tgcatcccctcgtatgaatgtacttgcaatgcttctcgcaacccttgccctgtaccgccc
acatgtggagaacttgaacacctcgtttcaaccgacggagaatgttgtccaacacataaa
tgcgtttgcaacgagtgccccgaaaaaagcccatcttgcggagtttgtcaaaacacatta
acaactgttgataaatgtgattgcaaacattatacttgtgagaacaagggtgtctgcaat
attaatgggacagaaaaactgccaggagatagctggaacactgacccctgcactacatgt
acgtgccatgaaacatcagttgataatgatggttgttataatgttggatgtgtggtgatg
tcatgtagcacctactgcccgccatgcagcacatacacaccagtagctggccagtgttgc
ggaatgtgcgttcaaactgcgtgcagtgttgccgacgagaataattcaactcagtgtaaa
ccgattggagatcactggcaagacttggacaaatgtatttcatccatctgcgtggcgaac
cctaacggtcacacaacggttacaactgccccaatcacgtgtccgcccgttgccatgcca
acatgcaccccatgttataagatagccacatacactgaagattgctgcgagaaatatcat
tgcattcctgatgatgtatgttgtcttagtggaccagcaatcaaactgccgggtgagaca
tgggagcccgacgcatgcaatgaatgtcaatgtaccaacaacatgaaccatacaagcggt
ttccacgttgttgattgctcacctaaaccttgcccaccctttgatattgatgattgtgaa
tcccatggaggacaatctgctttatctgacgacggatgttgcatgcattgtgtcgctaat
gtttgtgtggatgcaaagaaccaaacacactcttttggtgaaacctggtacccagatgta
tgcaccatctgttcatgtgttgctggccatgagatcgtatgtaacccagtcacgtgccca
ccatcgaaacaagcccctatgaactgcgcaccatgcgaggtcccacttagaaggctctca
tcggatccatgctgtccacaatacgactgtgtttgcaactatgagttgatcaagggtgag
cctaattgtgatgccgtacccgtgccaaaatgcccacctgggtatgtagcaagtcagacc
aatgttggccaatgtattcctgattatgattgcttctgcaacaagtcacggaacccatgc
cccgaagctcctgaatgtcccgagttacatgaattggtaacaacagaaacagaatgctgc
ccattatatggatgcgtttgcaagaaatgtaacgaggcccccacctcatgctcaccatgc
caagatgccatcacaacaattgatgcttgtggttgccgtcatgtgacctgtcaatcaaag
aacatttgttatgttgatgatgtcgctcaccttcctggtgacatctggaaccctgatgtt
tgcactcagtgtgtgtgtcaatcagacgtcaccaaccccgatactgcatgtcatgttgaa
agttgttttgcacaaagttgcgaccccacttgcccgccatgccatgattatgtggttgga
gccggcgaatgctgcggaacatgcgtgcagagagcgtgccaggtggctggggcgaatgga
accgtggaatgcaagaatgttggagataattggtggtacgaatccacatgcgaacaatac
atgtgtaccactgataatgatggaaacattggtatcgtggaggttgcatatgcttgccca
gtgcctgaggttcccacatgctcatcatgttataaacttgaatcttatgtggaaggatgt
tgctccaaacttagatgtgtacaagaaaacgtctgttgtgccgatggaatgggaaaactg
cctggatcaacatgggcaccagatgcttgtcatctttgccaatgtaccgaagataaggat
cttgacactggcttcttagcagaacaatgctatcacaacccatgccctccattcgattct
gatgcttgtgtagccaatggtggaacagtcatatcatctgatgatggatgttgcctaaaa
tgccaagaaacagaatgctttgaatgcgataaacgtatgagcaccaaacctgagtatatg
ttggttgatggatgtgcctcaaatgaacccgtctctctatcttactgtgatggattctgt
cgcgggcattacttctggaccgaccacggcgcagagaatgattgttcttgttgcaaccca
acttccacggctaccagagttgtttcaatgaaatgtaagaacggaacagaagtccaatac
tcattcaccgatgttttatcttgtgggtgtaccgctacctgcacccctaaccccccaact
gtcacccctgctccagaaacaccagcgccaactactactgctccagaagcaccagtaccc
acaaccactgtaccagtaaaaccaacccccacaactgaagaaactggttctggtgagacc
actgtaccagaagcaccggtaaccacaaccactgtaccagtaaaaccaacccctaacaac
tga
DBGET
integrated database retrieval system
