KEGG   Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100210786
Entry
100210786         CDS       T01080                                 
Name
(RefSeq) putative uncharacterized protein DDB_G0282133
  KO
K15185  AF4/FMR2 family member 4
Organism
hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg03250  Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09125 Information processing in viruses
   03250 Viral life cycle - HIV-1
    100210786
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:hmg03021]
    100210786
Transcription machinery [BR:hmg03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Super elongation complex (SEC)
     100210786
SSDB
Motif
Pfam: AFF4_CHD AF-4 Synaptobrevin
Other DBs
NCBI-GeneID: 100210786
NCBI-ProteinID: XP_047141913
LinkDB
Position
2:5658614..5701244
AA seq 1224 aa
MIREHLSDPLWSSSTNRMSNKSISEIKLLKEQAMKERHKKATAQAASQAFKRFDGMFNIE
PRRPQDESFLSTTIKHVLGDYATFMNLIEAKETAQYLGLDNTVPGTPEVKDIDFENTSNG
YTNLMIKGKNGFSSHSSVPLKKTLENIKIEKNDHTFLEPIKTSNGPENDQSLKLKIPNSN
STSNHLTNNKHSQGKTPNEIESILKEMTQGLPPLLTEIQTPRSENDFFSFPSKVNVASNC
LATVDLSVSSSANDLSKNVSNEYVQYDGLNDSNNMASELKEFKSCDEIKNKKLQDKTKLS
LRKVSVSSSSSSNSESSSTSESDSDLEEQATQCYISSDNFQENSTNNNYLLEKDNASVPE
SSSTLNSYQNLNSINEDIGIIDNDDKIDPLNKRSILDDATFKNIEDSFHIGIEKTVSPIS
EISFDDLDLINSLPYDQNHEELDNKSDTLNRNALSFLRTNNKNYNQDCMQSISNDSIYTI
KNNDVRNAASNKINETKDKNKTKSTRTPPEYNTRTPPEYNTDIQQTLPIPLFKQNTSLES
TLYIVDQYTESSLWVPHVTPLPNSPVLSQLPDNIIKTDCTFNTNNEIYASASPHIDNSMY
VVTENNITNIETNINVIKHDEPNEYEKISCLDKNIKVENLQTSCITPFKIINDSQNVTQE
LTCKPINDSQNVTQELTCKPINDSQNVTQELTCKPINDSQNVSRELTCKPINDTQKSQDL
ITEVKMEAKDLDISTNLLKLNNSSADISFSKMEEPNNFYNDLVSNEKPELKLSNDRNMNS
SLVVKIPLKKIKLKAKSFRDDQKESVEADELVRVDNNPVCVKKLQSYKRKLIDDDSDSCS
ESAFKLPHSSKFDDLLVKINLSRLKRNPTAKTIQSEVQSDLNITPIKNEITLDIDEEASS
DCSSNSVNIGLKKKNGCPLIDNKMELAFKNTNNKVDVKRCSECGILNADSGKDPIKLSGY
KVYRPFLNEGVMKKRKADNLKSPMERAHTYTEAVLNYIRYLIGYEVAGKLMTKQGIDELM
RICSDCIRLIDYVVELCRRKTNDSNRSDRRFLFLCFRLQSMLHMKLFKTRSDSVWKVKKI
MTDYFTQYKPSSRSTQLAEGNASTPLPSSPSFGPSPGQSVGSNGSAGSSSSASSNDSKTN
LGLAMVSIPSDMHEKSLQYLEFTKHIIEAHRLWSNAETLIPYCEDFIIDVTRKVGPLTLY
SSLAQMVDYMTFGLQVILDSPYPS
NT seq 3675 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattagagagcatttatctgatcctctctggagcagcagcacaaatagaatgtcaaac
aaaagcatatctgaaatcaagttacttaaagaacaagcaatgaaagagagacacaaaaag
gctactgcacaagctgcatctcaagcctttaagaggtttgatgggatgttcaatattgaa
ccaaggcgtccacaagatgaatcatttctgtccacaactattaagcatgtgttgggtgac
tatgcaacatttatgaatttaattgaagcaaaggaaactgctcagtacttaggacttgat
aacactgtgccaggaactcctgaagtaaaggatattgattttgaaaacacaagcaatggg
tatacaaatttaatgataaaaggaaaaaatggattttcttcccattcatcggttccacta
aagaagactctagaaaatatcaaaattgagaaaaatgatcacacttttttggaacctata
aaaacaagtaatggacctgaaaatgatcaatctttaaagttaaagatcccaaatagtaac
tcaacaagtaaccatttaacaaataataaacactcacagggtaaaacaccaaatgaaata
gaaagtattttgaaggagatgacacagggtttgccacctttacttacagagattcaaaca
cctcgttctgaaaatgattttttttcttttccatctaaggtgaatgtggcgtccaattgt
cttgctacagtagatctaagtgtaagttcttctgcaaatgacttatcaaaaaatgtttcc
aatgaatatgtacagtatgatggattaaatgactcaaacaacatggcatctgaattaaaa
gaattcaaatcttgcgatgaaatcaaaaataagaaactgcaagataaaacaaagttgtct
ttacggaaagtttctgtgtcgtcaagttcttcaagcaattcagaaagttctagcacttca
gaatctgatagtgatctagaagagcaagctactcaatgctatatttcatcagataatttt
caagaaaattctactaataataattacttacttgaaaaagataatgcatcagtccctgaa
tccagttcgactttgaatagctatcagaatttaaatagtattaatgaagatattggtata
attgataatgacgataaaatagatccactaaataaaagatcgattctagatgatgcaact
tttaaaaatattgaagattcatttcacattggaatagaaaagactgtaagtccaattagt
gaaatttcttttgatgatttagacttaataaacagcttgccctatgatcaaaaccatgag
gaattagataacaaaagtgatactcttaatcggaatgccctttcatttttaagaactaac
aacaaaaactataatcaagattgcatgcaatcaatttcaaatgactcaatttatacgata
aaaaataatgatgtaaggaatgctgcaagtaataaaattaatgaaactaaagataaaaat
aaaacaaaatctacaaggactcctcctgaatataatacaaggactcctcctgaatataat
actgatatacaacaaactttacctattccactctttaaacaaaacacttcattagaatca
acactttatattgttgatcaatataccgaaagttcattgtgggttccacatgtaactcct
ttacctaactctccagttttgtctcaattacctgacaatataataaaaacagattgtact
tttaatactaataatgaaatatatgctagtgctagtcctcatattgataatagtatgtat
gttgttacagaaaataatataacaaatattgaaacaaatataaatgttattaagcatgat
gaacctaatgaatatgaaaaaattagttgtcttgacaaaaatattaaagttgaaaatctt
caaacatcttgtataacaccctttaaaataataaatgattctcaaaatgtaacacaggag
ttaacctgtaaaccaataaacgattctcaaaatgtaacacaggagttaacctgtaaacca
ataaacgattctcaaaatgtaacacaggagttaacctgtaaaccaataaatgattctcaa
aatgtatctcgggagttaacctgtaaaccaataaacgatactcaaaaatcacaggattta
attacggaagtaaaaatggaagctaaagacttagacattagtacaaacctgctaaaatta
aataatagctcagctgacatatctttttctaaaatggaagaaccaaataatttttataat
gacttagtatctaatgaaaagcctgaattaaaattaagcaatgatagaaatatgaacagc
tctttggttgtcaaaatacctctaaaaaaaatcaagttaaaagctaaaagttttcgagac
gatcaaaaggaaagtgttgaagcagatgaattagttagagtagataataatccagtttgt
gttaaaaagcttcaatcttataaacgaaaattaatagatgatgacagcgatagttgcagt
gagagtgctttcaagttacctcatagttcgaaatttgatgatcttttagtaaaaattaat
ttatcaagattaaagcgaaatccaactgcaaagaccatccaatcagaagtacaaagtgat
ttaaatattactccaatcaaaaatgaaattactttggatattgatgaagaggcttcatct
gactgttcatctaacagcgtcaatattggtttaaagaaaaagaatggttgtcctcttata
gataataaaatggagttagcatttaaaaacactaataataaagttgatgtaaagagatgt
agtgaatgtggaattttaaatgctgattcaggaaaagatcctataaaactctctggatat
aaagtttaccgaccttttcttaatgaaggtgttatgaaaaaaagaaaagcagataatctt
aaaagtcctatggaacgtgcacatacttacactgaagcagttctaaattacatcaggtat
ctaattggttatgaagtagcgggtaaactaatgacaaaacaaggaattgatgagctaatg
cgtatttgcagtgattgtattcgcttaatagattatgtagttgaattgtgcagacgaaag
acaaatgattctaacagatcggatcgtaggtttttgtttctatgttttcgtcttcaaagt
atgttacacatgaaactttttaagacaaggagtgattcagtatggaaagtgaaaaaaatt
atgacagattattttacacaatataaaccttcgtcaagaagcacacaattagctgagggt
aatgctagcacacctttaccttcttcaccaagttttggaccttctcccggtcaaagtgtt
gggtctaatggaagcgctggtagctccagcagtgcaagtagtaatgatagtaaaacaaac
ttaggtttggctatggttagcatcccatcagacatgcacgaaaagtcattgcaatatcta
gagttcaccaaacatataatagaagctcatcgcttatggagtaatgcagaaactttaata
ccttactgtgaagattttatcattgatgtaactcggaaagttggtccacttacgctttat
agttctctggcgcaaatggttgactatatgacttttggcctgcaagtgattttagattcg
ccttacccctcatga

DBGET integrated database retrieval system