KEGG   ENZYME: 1.3.99.28
Entry
EC 1.3.99.28                Enzyme                                 
Name
phytoene desaturase (neurosporene-forming);
3-step phytoene desaturase;
three-step phytoene desaturase;
phytoene desaturase (ambiguous);
CrtI (ambiguous)
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-CH group of donors;
With unknown physiological acceptors
Sysname
15-cis-phytoene:acceptor oxidoreductase (neurosporene-forming)
Reaction(IUBMB)
15-cis-phytoene + 3 acceptor = all-trans-neurosporene + 3 reduced acceptor (overall reaction) [RN:R09691];
(1a) 15-cis-phytoene + acceptor = all-trans-phytofluene + reduced acceptor [RN:R09692];
(1b) all-trans-phytofluene + acceptor = all-trans-zeta-carotene + reduced acceptor [RN:R04787];
(1c) all-trans-zeta-carotene + acceptor = all-trans-neurosporene + reduced acceptor [RN:R04798]
Reaction(KEGG)
R04787 R04798 R09691 R09692
Substrate
15-cis-phytoene [CPD:C05421];
acceptor [CPD:C00028];
all-trans-phytofluene [CPD:C05414];
all-trans-zeta-carotene [CPD:C05430]
Product
all-trans-neurosporene [CPD:C05431];
reduced acceptor [CPD:C00030];
all-trans-phytofluene [CPD:C05414];
all-trans-zeta-carotene [CPD:C05430]
Comment
This enzyme is involved in carotenoid biosynthesis and catalyses up to three desaturation steps (cf. EC 1.3.99.29 [phytoene desaturase (zeta-carotene-forming)], EC 1.3.99.30 [phytoene desaturase (3,4-didehydrolycopene-forming)], EC 1.3.99.31 [phytoene desaturase (lycopene-forming)]). The enzyme is activated by FAD. NAD+, NADP+ or ATP show no activating effect [1].
History
EC 1.3.99.28 created 2011
Pathway
ec00906  Carotenoid biosynthesis
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K10027  phytoene desaturase
Genes
ESA: ESA_00343
CSK: ES15_0618(crtI)
CSZ: CSSP291_01545
CSJ: CSK29544_01598
CCON: AFK62_16830
CDM: AFK67_17395
CSI: P262_00910
CMJ: AFK66_020765
CUI: AFK65_16530
CMW: AFK63_01870
CTU: CTU_35430(crtI)
KCO: BWI95_14430
KOT: EH164_13625
KOB: HF650_09540
LAX: APT61_15375
LEI: C2U54_12120
LEH: C3F35_04355
LEE: DVA44_16445(crtI)
LER: GNG29_07325(crtI)
LEA: GNG26_06950(crtI)
LPNU: KQ929_13920
LEY: DVA43_10555(crtI)
AHN: NCTC12129_03059(crtN)
ASUB: NLZ15_09180
SCOL: KFZ77_09175
PVJ: LMA04_16105
SUPE: P0H77_05620
PSTS: E05_04200
RCB: O1V66_03965
CARU: P0E69_14725
NIG: C1N62_05995
EPI: Q3V30_15805
EGE: EM595_0218(crtI)
PAM: PANA_4161(crtI)
PLF: PANA5342_p10302(crtI)
PAJ: PAJ_p0123(crtI)
PAQ: PAGR_p228
PVA: Pvag_pPag30172(crtI)
PAGG: AL522_02525
PAO: Pat9b_5264
PANT: PSNIH1_p01410
PANP: PSNIH2_15470
PAGC: BEE12_19675
PSTW: DSJ_25965
PALH: B1H58_04570
PANS: FCN45_21420
PEY: EE896_20450(crtI)
PDIS: D8B20_19315
PER: LAC65_17630
PJI: KTJ90_20915
PANO: OJ965_01925
KPIE: N5580_20485
PALF: K6R05_21455
PPHO: CTZ24_20830
PDIP: KFZ74_22960
PGZ: C2E15_03090
PCD: C2E16_03195
MINT: C7M51_04209(crtI)
MTHI: C7M52_02848(crtI)
TATU: EFZ10_13605(crtI)
PLU: plu4342(crtI)
PLUM: A4R40_21515
PAKH: B0X70_02675
PLUI: CE143_02660
LGU: LG3211_5259
LUM: CNR27_10980
DJA: HY57_16870
VHA: VIBHAR_02162
VCA: M892_02515
PFV: Psefu_2396
POR: APT59_08115
PPSL: BJP27_22995
PVD: CFBP1590__2676(crtI)
PCAB: JGS08_13505
PLUL: FOB45_11890
PRH: LT40_12650
PSW: LK03_17180
PPV: NJ69_06680
PGG: FX982_03313
PSMT: MT1_0863
PSA: PST_3873
PSZ: PSTAB_3824
PSR: PSTAA_3966
PSC: A458_02100
PSH: Psest_0404
PSTT: CH92_19210
PSTU: UIB01_01890
PSED: DM292_21280
PCHL: LLJ08_02060
PKG: LW136_02065
PZD: KQ248_07110
ACX: Achr_15280
PNN: KEM63_01760
MBS: MRBBS_2791(crtI)
MPQ: ABA45_13180
AVZ: HWI77_17270
SPSR: EGC80_11295(crtI)
GNI: GNIT_0400(crtI)
GPS: C427_1923(crtI)
HMI: soil367_17420(crtI)
MICY: HUW35_15020
HJA: BST95_01475
AFUS: EYZ66_11070(crtI) EYZ66_11705
PAQM: E0F26_06870
LHA: LHA_1131(crtI)
LGT: E4T54_11415(crtI)
LANT: TUM19329_07870(crtI)
MECH: Q9L42_018660(crtI)
TCY: Thicy_1507
TSJ: L3K52_03415(crtI)
ALV: Alvin_2570
ATEP: Atep_25230(crtI)
TVI: Thivi_2025
TMB: Thimo_3012
MPUR: MARPU_13395
TSY: THSYN_31170
TTP: E6P07_01705(crtI)
THIP: N838_27115
CJAP: GWK36_12675
THIM: KFB96_20325
TBOG: LT988_15485
TLR: Thiosp_01830(crtI)
TFRI: Thiofri_03784(crtI)
TWG: Thiowin_01232(crtI)
HHA: Hhal_1619
HHK: HH1059_06220(crtI)
HHC: M911_05505 M911_10385
EBS: ECTOBSL9_2468 ECTOBSL9_3053
SSAL: SPISAL_04950
SPIU: SPICUR_05680
SROS: BBH56_04785
SPIZ: GJ672_05075(crtI)
SHAI: LMH63_11070(crtI)
HSV: HNO53_17310
HNP: SR894_03590
PLE: B186_263(crtI)
PLY: C530_253
PLR: PAQ_258(crtI)
PLO: C548_253
PLD: PalTV_229(crtI)
PLB: PTV_229(crtI)
PLC: PAD_237(crtI)
PLI: PLF_236(crtI)
PALY: O3E_01525
HAA: A5892_12645
KUS: B9G99_16450
KMA: B9H00_15190
KUY: FY550_10200(crtI)
PAUR: FGL86_00515
GBI: PG2T_09220
SALN: SALB1_1272
CTI: RALTA_B1266
CNAN: A2G96_25965
BPYR: ABD05_25940
BARI: NLX30_20295
BURK: DM992_21005
PDQ: CL55_00013500
PANI: DCO16_03420
PCOS: C2747_06910
PWU: A8O14_08360
PARD: DN92_08750
POLY: PSHI2_19280(crtI)
POLN: PSHI8_19290(crtI)
PPUL: RO07_02395
PIG: EGT29_06770
RAC: RA876_13220
PVAC: HC248_03364(crtI)
AANT: HUK68_21190
CENP: M9799_18910
RTA: Rta_07710
LIM: L103DPR2_00991(crtI)
LIH: L63ED372_00647(crtI)
HYR: BSY239_1295(crtI)
HCZ: G9Q37_00090
MELM: C7H73_12400
METP: C1M51_03615
RGE: RGE_33420(crtI)
RBN: RBXJA2T_09582
RDP: RD2015_1027
ROI: N4261_01160
ATER: MW290_02595
MASW: AM586_05625
MTIM: DIR46_08615
MASY: DPH57_22005
MFY: HH212_04350
MVAR: MasN3_17900
MLIR: LPB04_10355
MASZ: C9I28_27255
MALI: EYF70_25700
MUM: FCL38_23640
MFLA: GO485_19150(crtI)
MPLI: E1742_17810
TCT: PX653_23485
PLUE: EWM63_09930
DZO: SR858_00795
TMJ: P0M04_04495
EHB: E7V67_025150
ACTB: RHM62_15640(crtI)
XYG: R9X41_16955
METR: BSY238_2434(crtI)
MBAC: BN1209_0337(crtI)
MBAT: BN1208_0599(crtI)
SSDC: SSDC_01994(crtI)
BEB: AEM42_10870
RPOD: E0E05_11755(crtI)
PECT: BN1012_Phect1194
AGC: BSY240_3676(crtI)
RROS: D4A92_02600
NEO: CYG48_12270
ABAW: D5400_04870(crtI)
PDES: FE840_002285
BRA: BRADO1610(crtI) BRADO6507(crtI)
BBT: BBta_6445(crtI)
BRS: S23_19090(crtI)
AOL: S58_59260
BRO: BRAD285_5790(crtI)
BRQ: CIT40_23980
BGZ: XH91_02610
BBET: F8237_24635
BROS: QUH67_09680(crtI) QUH67_09790
BOY: LQG66_16010
RPA: TX73_007770
RPB: RPB_4011
RPC: RPC_1261
RPD: RPD_3766
RPE: RPE_1315
RPT: Rpal_1699
RPX: Rpdx1_4009
RHOL: RBJ75_27700
BOS: BSY19_4063(crtI)
XAU: Xaut_3577
XDI: EZH22_22065
MEA: Mex_1p3219(crtI) Mex_1p3670
MDI: METDI3783(crtI) METDI4245
MEX: Mext_3011 Mext_3441
MCH: Mchl_3236 Mchl_3750
MPO: Mpop_3200 Mpop_3637
MZA: B2G69_22615 B2G69_24765
MRD: Mrad2831_2843 Mrad2831_5038
MET: M446_3734 M446_5197
MOR: MOC_3208 MOC_5741
META: Y590_14610 Y590_16900
MAQU: Maq22A_c01760 Maq22A_c17210
MPHY: MCBMB27_02283 MCBMB27_04482
MEE: DA075_04130 DA075_07295
METD: C0214_16670 C0214_18850
METX: A3862_05930 A3862_17580
METS: DK389_00990
METI: DK427_17360 DK427_17940
MMES: MMSR116_03600(crtI) MMSR116_13500
MTEA: DK419_05090 DK419_25670
MIND: mvi_09360 mvi_27450(crtI)
MOG: MMB17_13935 MMB17_18235(crtI)
MTAD: M6G65_16740(crtI) M6G65_29760(crtI)
MOC: BB934_38285
MTEZ: HPT29_002695(crtI)
MLD: U0023_10070(crtI)
MSL: Msil_2029
BBAR: RHAL1_01932(crtI_1) RHAL1_03022(crtI_2)
RVA: Rvan_0155
RLAC: QMO75_01595(crtI)
DRH: JI748_12780
BVR: BVIR_2144 BVIR_593
BLAG: BLTE_02270 BLTE_15820
MROS: EHO51_17000
AUA: M673_17295
AALA: IGS74_06950
AALM: LUX29_07830
AUZ: Sa4125_04000
AUB: LXB15_16110
JIE: OH818_23220
JAV: OXU80_03255
LIZ: LGH83_10625(crtI) LGH83_14105(crtI)
ACUT: MRB58_16505
CAK: Caul_1712
CHQ: AQ619_10250
CMB: CSW64_08140
CFH: C1707_14415
BSB: Bresu_2279
BRD: JL11_05895
BRG: A4249_04380
BRL: BZG35_08070
BVC: CEP68_00750
BRF: E4M01_08550
BREV: E7T10_10695
BGOE: IFJ75_10160
BFQ: JX001_09320
BRES: E4341_10195
BREA: HZ989_10875
RUT: FIU92_10195(crtI)
JAN: Jann_0143(crtI)
RDE: RD1_0120(ctrI)
RLI: RLO149_p940070(crtI)
RPON: G3256_18610
RFU: ROLI_002670(crtI)
DSH: Dshi_3508(crtI)
OAT: OAN307_c45360(crtI)
OAR: OA238_c48270(crtI)
RED: roselon_01116
SUAM: BOO69_19450
SUAL: KDD17_18630
RMM: ROSMUCSMR3_03883(crtI)
ROK: RAK1035_2726
RID: RIdsm_01746(crtI)
ROM: EI983_05400
ROH: FIU89_14280(crtI)
THAA: CFI11_23510
ROT: FIV09_18030(crtI)
RMH: LVO79_17050
MALU: KU6B_16340(crtI)
PLCG: RVY76_00645 RVY76_15975(crtI)
MARU: FIU81_16180(crtI)
RMAI: MACH21_33160(crtI)
RSP: RSP_0271(crtI)
RSH: Rsph17029_1914
RSQ: Rsph17025_1024
RSK: RSKD131_1597
CAZT: LV780_04470
RCP: RCAP_rcc00679(crtI)
RBL: B6K69_03410
FYT: QF092_06640
PYE: A6J80_22065
PARR: EOJ32_07420
PAAK: FIU66_04450
PLIA: E4191_05645
PMAU: CP157_02148(crtI)
PAEX: JHW48_06565
PTP: RCA23_c29550(crtI)
RSU: NHU_00228
RHM: B5V46_02540
RHC: RGUI_1969
LVS: LOKVESSMR4R_03622(crtI)
GEH: HYN69_05485
TAW: EI545_18905
POZ: I0K15_00050
FAP: GR316_05845(crtI)
NSM: JO391_16425
PBAE: P8S53_17175
RBG: BG454_02985
LVR: T8T21_16650(crtI)
FAQ: G5B39_11920
RBX: I3V23_09565
HBC: AEM38_14640
NAR: Saro_1816
NPP: PP1Y_AT8278
NPN: JI59_14790
NRE: BES08_09470
NOV: TQ38_003985 TQ38_008555
NOT: C7W88_11880
NOR: FA702_16865
NGF: FRF71_04735
NOG: GKE62_02570(crtI)
NDR: HT578_08235
NHUM: PQ457_00665
NOL: NSDW_14980
NCP: U0041_12480
SAL: Sala_3134
SPHK: SKP52_02255(crtI)
SPHP: LH20_01375
SMAG: AN936_02665
SMAZ: LH19_18590
STER: AOA14_09210 AOA14_11755
SPHQ: BWQ93_18340
SPHX: E5675_00150 E5675_18400
SINA: KNJ79_03005
SPEG: SPYCW_0243
SPFD: SPYCA_3449
SPBS: L7H23_08095 L7H23_11055
SPHU: SPPYR_3143(crtI)
SPHM: G432_07840
STAX: MC45_14760
SPHI: TS85_20445
SSAN: NX02_00970 NX02_06030
SNJ: A7E77_09415
SMY: BJP26_05325
SPAN: AWL63_06430
SKR: BRX40_04535
SPLM: BXU08_15520
SPLK: AV944_01215
SPKC: KC8_05735 KC8_11310
SPHC: CVN68_16200
SPHF: DM480_06135
SPHA: D3Y57_11040
SPAU: DRN02_014715
SLUT: H9L13_06660
SRHI: H9L12_01845
SLAN: GV829_03330
SDH: H9L15_14560
SPAP: H3Z74_21130
SXA: FMM02_01300
SPAI: FPZ24_16800
SPII: G7077_12795
SSIN: G7078_04430
SSAU: H8M03_07445
SARI: H5J25_18455
SCHY: GVO57_02545(crtI)
SSUA: FPZ54_12800
SBIN: SBA_ch1_01680(crtI)
SAER: NEF64_01875
SMOR: LHA26_07915
SGLC: M1K48_00035
SQO: NMP03_12385
SCAB: LZK98_00105
SRAD: LLW23_07515 LLW23_09615(crtI)
SHAN: PPZ50_03070
SNAP: PQ455_16875
SNOS: K8P63_17455
SDON: M9980_12960
SSAG: KV697_10445
SABI: PBT88_20350
SJP: SJA_C1-01600(crtQ)
SINB: SIDU_17135
SCH: Sphch_1943
SSY: SLG_31730
SYB: TZ53_10665
SBD: ATN00_06060
SPMI: K663_01400
SPHB: EP837_01646
SPHR: BSY17_1789(crtI)
SPHT: K426_20395
SHYD: CJD35_07285
SYA: A6768_23080 A6768_23660
SCLO: SCLO_1020180
SPYG: YGS_C1P2105
SUFL: FIL70_16715
SBAR: H5V43_12655
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Reference
1  [PMID:8830054]
  Authors
Raisig A, Bartley G, Scolnik P, Sandmann G
  Title
Purification in an active state and properties of the 3-step phytoene desaturase  from Rhodobacter capsulatus overexpressed in Escherichia coli.
  Journal
J Biochem 119:559-64 (1996)
DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021278
  Sequence
[rcp:RCAP_rcc00679]
Reference
2  [PMID:11526111]
  Authors
Wang CW, Liao JC
  Title
Alteration of product specificity of Rhodobacter sphaeroides phytoene desaturase  by directed evolution.
  Journal
J Biol Chem 276:41161-4 (2001)
DOI:10.1074/jbc.M105786200
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.3.99.28
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.3.99.28
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.3.99.28
BRENDA, the Enzyme Database: 1.3.99.28
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