Alteromonas stellipolaris R10SW13: AVL56_15145
Help
Entry
AVL56_15145 CDS
T04403
Name
(GenBank) transporter
KO
K18299
multidrug efflux pump
Organism
aaw
Alteromonas stellipolaris R10SW13
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aaw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aaw02000
]
AVL56_15145
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
aaw01504
]
AVL56_15145
Transporters [BR:
aaw02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AVL56_15145
Antimicrobial resistance genes [BR:
aaw01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexEF-OprN [MD:
M00641
]
AVL56_15145
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ95507
LinkDB
All DBs
Position
complement(3527164..3530286)
Genome browser
AA seq
1040 aa
AA seq
DB search
MNFSQFFIRRPIFAGVLSLLIFIGGAIAVWQLPITEYPEVVPPTVVVTANYPGANPKVIA
ETVATPLEQEINGVEDMIYMSSQATSDGRMTLTITFAIGTDPDDATTLVQNRVNRATPRL
PQEVQRLGIVTEKSSPDLTMVVHLTSPDKRYDMLYLSNYADQFVKDELARVEGVGQVRLF
GAGEYSMRVWLDPNKLASLQMNPGDVVAAISEQNQQAAAGSLGAQPTGTSEFQLLINVRG
RLEDESEFENIIVKTGDNGQITRLKDVARIELGADYYTLRSLLNNNPAAALPIFQAPGSN
AIQISDDVRARMAELEKMFPEGLEYDIVYDPTVFVRGSIEAVVNTLLEAVLLVVLVVVLF
LQTWRASIIPLVAVPISLVGTFAFMQLMGFSLNALSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVER
NIADGKAPFDATVQAMKEVTGPIIATTLVLAAVFIPTAFMSGLTGQFYKQFALTITISTF
ISAINSLTLSPALSALLLKPHGQSKDWLSRGMDKVFGRFVFTPFNKMFDRGAKKYTGAVG
GLIRKSGVVVVLYAGLLGLTYFQFANTPTGYVPPQDKQYLIAFAQLPNASSLDRTEEVVR
EMSRIAMEHPGVSDAVAFPGLNINGFTNSPSSGVLFTPLKPFNERQSPELSAGAIAMQLN
QQFGSIKGAYVAIFPPPPVMGLGTIGGFRLQVQDRGNLGFAELEKVTQEVIGKAWAHPAL
TGNFTSFTVNVPQLNVDVDREKAVSQGVNIGTLFDTMQAYLGSVYVNDFNLFGKTYQVNV
QADAQYRQDVENITQFKVRNDKGDMIPLGSFLNIEHSAGPDRVMHYNGYVTAEVNGSPAP
GYSSDQAKAAIEQILDETLPLGMTYEWTELTYQQILAGNASAFIFPLVVLLVFLVLAAQY
ESLRLPLAIILIVPMTLLSALIGVVIYGGDNNIFTQIGLIVLVGLATKNAILIVEFAKEL
QDNGMDALSAIKEASKLRLRPILMTSIAFIMGVLPMVLSTGAGAEMRQAMGVAVFSGMIG
VTVFGLILTPVFYYLLKRNG
NT seq
3123 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttttcgcaatttttcattcgccgcccaatttttgcaggtgtactaagcctgctc
attttcattggtggtgcgatagctgtttggcagctacctataacagaatacccagaagtg
gtgccgcctacggtagtggtaacggctaactatcctggcgctaaccccaaagttattgcc
gaaaccgttgctacgcccttagagcaagagattaatggcgtggaagacatgatttatatg
tcttcacaggccacatctgatggccgtatgacgcttaccatcacgttcgctattggtacc
gatcctgatgatgctactacgctggttcaaaaccgtgttaaccgtgcgacaccgcgattg
ccacaggaagtacagcgcttaggtattgttaccgaaaaatcatcaccagatttaaccatg
gtggtgcatttaacctcacctgataaacgttacgacatgctttatttgtcgaactatgcc
gaccaattcgtaaaagatgagctcgcgcgagttgaaggggtagggcaagttcgtttattt
ggcgctggtgaatacagcatgcgtgtttggctagatccaaacaagttagcttcactgcaa
atgaacccaggcgatgtggttgcggctatttccgagcaaaaccaacaagcagcggcaggt
agcctaggcgcacagccaacgggcaccagtgagtttcagctacttattaatgtgcgcggt
cgccttgaagatgaaagtgaatttgaaaatatcatcgtcaaaacgggcgataatggtcaa
attacccggttaaaagacgtagcccgaattgagttaggtgccgattattacaccttgcgt
tcattactaaataataatccagcagctgcattacctatatttcaggccccaggctcaaac
gctattcaaatctctgacgacgtgcgtgctcgcatggcagaacttgaaaagatgtttcca
gaagggttggaatacgacatcgtttacgaccctaccgtattcgtacgtggctcaattgaa
gccgtggtaaatacgttacttgaagctgtgctattggttgtattagtagtagtactgttt
ttacaaacctggcgcgcgtctattattcctttagtagcggttcccatttcattggtaggt
acctttgcgtttatgcaattgatgggcttctcgttaaatgcgctatcgttgtttggcttg
gtactggctatcggtattgtggttgatgatgccatcgtggtggtggaaaacgtagagcgg
aatattgccgacggcaaagcgccattcgatgctaccgtgcaagcaatgaaagaggtaaca
gggcctattattgccactaccttggtattggctgcggtatttatccctactgcctttatg
agcggcttaaccggtcagttctataagcagtttgcgttaaccattactatttctaccttc
atctcggcaattaactcgttaaccttaagccctgcattatcggccttgttattgaagcct
catgggcaatcgaaagattggctaagccgaggtatggataaagtgtttgggcgctttgta
tttacgccatttaataaaatgttcgatcgcggtgcgaaaaaatacactggcgctgtaggt
gggcttattcgcaaaagtggtgtggtagtcgtgctttacgctggtttgttagggttaacc
tacttccagtttgctaacacgccaactggttatgtaccgcctcaagataagcagtatctt
attgcatttgcacagcttcctaatgcgtcgtcgttagatagaactgaggaagtcgtgcgt
gaaatgtcgcgtattgcgatggaacaccctggtgtatctgatgcagtggcatttccaggg
ttgaacataaacggcttcaccaacagcccaagttcgggtgtgttgtttactccgcttaaa
ccgttcaatgagcgtcaaagccctgagctttcagccggtgcaattgctatgcaattgaac
cagcaatttggctctattaaaggtgcttatgtggctatcttcccgccaccaccggtaatg
ggccttggcaccattggtggtttcaggctacaagtgcaagacagaggaaacttaggtttt
gctgaacttgaaaaagtaacccaagaagtgattggcaaagcgtgggcacaccctgcgcta
accggtaacttcaccagttttacggttaacgtacctcagttaaatgtggatgtagatcgc
gagaaagccgttagccaaggtgtaaacataggtaccttgtttgacaccatgcaggcgtat
ttgggctcggtgtatgtgaacgactttaaccttttcggcaaaacctatcaggtaaatgtt
caggccgatgctcagtatcgtcaagatgttgaaaacatcacccaatttaaagtgcgaaac
gataaaggcgatatgatcccgctaggttcatttcttaatattgagcacagcgcagggcca
gaccgagtgatgcattacaacggctatgtcaccgctgaagttaacggctctccggcgccg
ggttacagttcagatcaagctaaagcagcgatagagcaaattcttgatgaaaccctgccg
ttaggcatgacctacgaatggaccgagctaacttatcagcaaatattggcaggcaacgcc
tcggcctttatcttcccgctggtggtgcttttggtgttcttagtattggcagcgcagtat
gaaagtttacgcttaccgctggccattatattgattgtccccatgaccttgctaagcgca
ctaattggtgtggtgatatatggtggtgacaacaacatatttacccaaattggcttaatt
gtgctggtggggctggcgactaaaaacgccattcttattgtggaatttgccaaagagcta
caagacaacggtatggatgcactatcagccattaaagaggccagtaagttgcgtcttcgc
ccaatcctaatgacgtctatagccttcattatgggtgtgttgcctatggtactttctaca
ggcgcaggtgcagagatgcgtcaagccatgggcgtagcagtgttctcaggcatgattggg
gtaactgtgttcggcttaattcttactcctgtattttactatttgttgaaacgtaacggt
taa
DBGET
integrated database retrieval system