Aliarcobacter butzleri ED-1: ABED_0435
Help
Entry
ABED_0435 CDS
T01823
Name
(GenBank) outer membrane component of efflux system
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
abt
Aliarcobacter butzleri ED-1
Pathway
abt01501
beta-Lactam resistance
abt01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
abt00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
ABED_0435
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
ABED_0435
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
abt02000
]
ABED_0435
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
abt01504
]
ABED_0435
Transporters [BR:
abt02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
ABED_0435
Antimicrobial resistance genes [BR:
abt01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
ABED_0435
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK70152
LinkDB
All DBs
Position
complement(441401..444427)
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MYKIAISRPITTLMFVFALVFFGYTQIQKMPIAFLPNVDYPVVSVITTYDQGSTEIIESK
ITDKIEEAISGISGIDIIRSDTSKNQSIVIAQFELSKPVEEAANDVRDKVSTVDLPKEAD
KPIIEKFSSSSAPIITLFLSTKLDNLDKLMLHANEVVKPILQSIEGVGKVEIAGFRDKII
KIYPNTTLLSKYNLDLNELALKIDEENIKKDGGRVVQEKEELNISIDSDAINVEQLENIK
IKDGVRLKDVATVQETIKDERTFANYNQQKGVLLQVKKISGANEVNIANVVKEKIPYIKS
LSNDFDINLLFDTTTFIESTYKSVQFDLILGCFLASLIVFVFLRNFTFTIIAAISLPISI
LGVLAIMGWSNQTLNILTLTALTLSIGIIIDDAIVVIENIYKKLELGKSRYEAALEGVKE
ISFSVLAISAMLLAIFIPIANMSGIVGKFFKSFGITIVASVIISYIIAITVIPMISSLLV
NPKHSKFYLMTESIFLSMDKIYKNLLIKAINFKLTTLIVAFTIFVISIILSSNLGMVFMP
KEDRSQFTISIKANADISMDEMKKTTMNIQEDLLSINEVDYSSLTIGLDGNIYESSIYVR
LVPIDKRTKNQDEIMEEIREKSKKFRNLEINVNQTDDMNSGAEIMTPFQLILKANDSKLA
EESANKLIDYLKSIEGTTNIQNNIQPKKTEISIEILKQNSSKFGVKSSDIAKVIAMAYSG
EIAISNFNKNGKEYDIVMRLSDDLRMNKDVINQLNVKNDKEELIALSSLININSKELASV
IKRYDRQKQVTIGSDITNGLALDVLVNLVVENQEKWLLDGVTYTFEGDAKDMQDTANAFG
VAIVAALIMIYLILASLYESPLQPVIIMSAMPLSFTGAFLGLYLANMNMSLFSMMGLFLL
LGLVGKNSTLIVDAANRNRENNTTLDEAIIEAGISRLRPILMTTISMCLGMLPLALSVGE
GSSIKAPMAISVISGLIISTMLSLFVVPALYKLIAPLDDKIRKLYTHK
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacaaaattgctatttcaagaccaattacaactttgatgtttgtatttgctttagtt
ttctttggatatacacaaattcaaaaaatgccaattgcatttttgccaaatgttgattat
cctgttgttagtgtaataactacatatgaccaaggttcaactgaaattattgaaagtaaa
ataactgataaaatagaagaagctataagtggtatttctggaattgatataataagatca
gatacttcaaaaaatcaatcaattgtaattgctcaatttgagttaagtaaacctgttgaa
gaagctgcaaatgatgtaagagacaaggtttcaacagtagatttaccaaaagaagctgat
aaacctataatcgagaaattctcaagtagttcagctccaataataactctttttttatca
acaaaacttgataatcttgataaattaatgcttcacgcaaatgaagtagtaaaacctatt
ttacaaagtattgaaggtgttgggaaagttgaaattgcaggttttagagacaaaataata
aaaatatatccaaatacaactcttttgagtaaatataatcttgatttaaatgaactagct
ttaaagattgatgaagaaaatatcaaaaaagatggaggaagagttgttcaagaaaaagaa
gaattaaatatttcaattgactcagatgcaataaatgttgaacaactagaaaatataaaa
ataaaagatggagtaagattaaaagatgtagcaacagttcaagaaacaataaaagatgaa
agaacttttgcaaactataatcaacaaaaaggtgttttattacaagttaaaaaaatttca
ggggcaaatgaagtaaatatagcaaatgtagtaaaagaaaaaattccttacataaaaagt
ttatcaaatgattttgatataaatttactatttgatacaacaacatttatagaatcaact
tataaaagtgttcaatttgacttaattttaggttgttttttagcttctttaatcgtattt
gtatttttaagaaatttcacttttacaatcatcgcagctatttctcttcctatttcaatt
ttgggagttttagcaataatgggttggagcaatcaaactttaaatattttgacacttaca
gctttaactttatcaataggaattatcattgatgatgcaattgttgtaatagaaaatatt
tataaaaaacttgaattagggaaaagtagatatgaagcagctttagagggagtaaaagag
atatctttttctgttttagctatttcagctatgcttttagctatttttattcctattgca
aatatgagtggaattgtaggaaaattctttaaaagttttggtataactattgttgcttcg
gtaataatctcttatattattgcaattacagttattcctatgattagttcacttttagta
aatcctaaacattcaaaattttatttaatgactgaatcgatatttttatcaatggataaa
atatataaaaatcttttaataaaagcaataaactttaaacttacaactttaattgttgca
tttacaatatttgttatttcaataatactctcttcaaatctaggaatggtttttatgccc
aaagaagatagaagtcaatttacaatttctattaaagcaaatgctgatatttctatggat
gagatgaaaaaaaccacaatgaatatccaagaagatttactttcaataaatgaagttgat
tactcttctttgactattggattagatggaaatatttatgaaagttcaatctatgtaaga
ttagttccaatagataaaagaactaaaaatcaagatgaaattatggaagaaattagagaa
aaatcaaaaaaatttagaaatcttgaaataaatgtaaaccaaactgatgatatgaactca
ggtgctgaaatcatgactccttttcaacttatcttaaaagcaaatgattcaaaactcgct
gaggaatcggctaataaattgattgattatttaaaatctatagaaggaacaacaaatatt
caaaataatattcagcctaaaaaaacagaaatctcaattgaaatattaaaacaaaactct
tcaaaatttggagtaaaaagtagtgatattgcaaaagtaattgcaatggcatattcagga
gaaattgcaataagtaattttaataaaaatggtaaagagtatgatattgtaatgagacta
tcagatgatttaagaatgaacaaagatgttataaatcaattaaatgtaaaaaatgataaa
gaagaacttattgcattatcaagtttgattaatataaatagtaaagaattagcttctgtg
ataaaaagatatgatagacaaaaacaagttacaattggaagtgatataacaaatggttta
gcgcttgatgttttagtaaaccttgtagttgaaaatcaagagaaatggcttttagatgga
gtaacttatacttttgaaggagatgcaaaagatatgcaagatacagcaaatgcttttggc
gttgcaatagtagctgctcttataatgatatatttaattcttgcttcattatatgaatca
cctcttcagccagttatcatcatgagtgcaatgccacttagttttacaggagctttttta
gggctttatttagcaaatatgaatatgagtttatttagtatgatgggattatttttactt
ctaggtttagttggtaaaaactcaactttaatagttgatgctgcaaatagaaatagagaa
aataatacaactttagatgaagcgattattgaagcagggatatcaagactaagaccaatt
ttgatgacaactatttctatgtgtttaggtatgcttccccttgcactttctgttggtgaa
ggttcaagtatcaaagctcctatggctattagtgttataagtggtttaataatatctaca
atgttaagtttatttgtagttccagctttatataaattaatagctccacttgatgataaa
atcagaaaactttatactcacaaatag
DBGET
integrated database retrieval system