Aquarana catesbeiana (American bullfrog): 141133908
Help
Entry
141133908 CDS
T11018
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
acat Aquarana catesbeiana (American bullfrog)
Pathway
acat04350
TGF-beta signaling pathway
acat04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acat00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
141133908 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
141133908 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
acat00536
]
141133908 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
acat00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
141133908 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
141133908
NCBI-ProteinID:
XP_073479626
LinkDB
All DBs
Position
LG03:67775091..68183343
Genome browser
AA seq
2872 aa
AA seq
DB search
MRLASVLGLAVGFTAFLSFSASQGADKDATAADTVKEARANRAKRRGGGAGAGHDVLKGP
NVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQTAPSCGSKSV
QQCSIRCMNGGTCSDEHCQCQKGYTGAHCGQPVCEHGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQ
CERDYRTGPCFSAISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFI
PNIRTGACQDVDECQAIPGMCQGGNCINTVGSFECKCPAGHRFNELTQKCEDVDECATIP
GICEAGECANTVGSYFCKCPSGFFTSADGSRCIDVRPGYCFTSLSNGRCTNQLPQLLPKM
QCCCDTGRCWSSAATTPPEVCPFRGTEEYRKLCTMSWSRPGQIPGLEPGPVIQPGLPYPP
EYPPPLGPQVPPGYPPVFPPPVFPGFPTRTPSVVLPVNLTQQQPVTDYCVLFRNLCLHGR
CIPTPGSYRCECNKGFHLDGRGECIDVDECERNPCLHADCVNTQGSYICQCYAGFQSTST
RTECRDIDECLQNGRICNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVSPDGKNCQDMDECSVRNMCLN
GMCINEDGSFKCICKPGFQLAPNGRFCTDIDECETPGICMNGHCVNTDGSFRCECFPGLA
VGLDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLQGAVTKSECCCASTEFAFGEPCKPCPAKTS
DEYQALCSSGPGITSTGTDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCVCNSGYDVDTTGKSCN
DIDECAINRLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGYVYKPDLKTCEDVDECESNPCINGACKNI
PGSFVCECPPGSTLDTTKTICIETVKGTCWKDIVNGRCEVNINGGTLRSQCCSTLGAAWG
SPCLPCEPDPVCAKGFARSKGTVCEDVDECKVFPGLCINSRCVNTMGSFTCECPNGMTLD
ASGRSCLDIRLETCYLKHEDEECSAPIAGRHRMDACCCSVGAAWGFDCEQCPPKGTTEFE
TLCPRGPGFASKEITPGKIFSKDINECKMIPSLCKYGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDAEE
RNCTDIDECRISPDVCGQGNCINTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECQQNPLLCR
GGNCLNTEGSFKCECPDGHEVTPDGTACLDINECELSTDLCRHGRCINLIGRYQCTCEPG
YKPSDDKLSCVDVDECEIFNGGCDTNCTNSQGSYECSCIEGFALMPDHRTCTDIDECETN
PNICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGYMASVDMKTCLDVDECDLHDNICLSGSCENTKGSFIC
HCNPGYSGKKGQTGCTDVNECEIGAHNCDRHATCTNTPGAFKCSCNPGWVGNGVKCTGTV
FSLIFRCSICNFKNAFFKHCLLSLTDIDECTENVNLCGNGQCLNTPGGYRCDCDMGFLPS
IDGKTCEDIDECALPNICVFGTCKNLPGLFRCDCDIGYELDRSGGNCTDVDECADPTTCI
SGTCSNTPGSYECECPPDFQLNPTRVGCVDTRSGNCYLVAKPRGDNGDLSCSVEIGVGVS
KASCCCAPGKAWGNPCEHCPPVNSTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECLELPGLCQ
GGKCINTFGSFQCRCPPGFFLNEETRVCDDVNECDQPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDY
MPINGGNNCMDMRRSLCFRNYYADNQTCDGELLYNMTKKMCCCSYNIGRAWNRPCEECPL
PSTDEFSGLCGSARPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPMGFF
YNDKLLICEDIDECQNGPVCPRNADCVNTAGSYRCDCKPGYKFTPTGQCVDRNECLEIPN
VCSHGECHDKVGGYYCVCHNGFKTNDDQTMCLDINECERDPCGNGTCRNTIGSYNCRCFD
GFILSHNNDCIDIDECTTLNGQLCRNGQCVNVIGSFQCICNEGYEMTSDGRTCLDINECE
LDPGKCAPGTCQNLDGTYRCICPPGYVLKDDKCEDIDECVEEPEICALGTCSNVPGSFIC
MCPEGFVLSSTGRRCQDLRVGYCYTKFEAGQCLSPKILNHTKQECCCAMKGAGWGSPCEI
CPVEGDEAFREICPFGSGVVVGPNDERVDMDECIDPDKCKNGQCINTDGSYRCECSFGYV
LTGDECIDVDECSIQNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMSCEDVNECAQNPLLCA
FRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQDECEDGLHDCDSKQMMCKNLIGTYMCICGP
GFQRRPDGEGCIDLNECLKPGLCENGKCLNTVGSYKCECKDGFNTSITETECIDNRLGYC
FTDVLHTMCQLGSSNKNSVTKSECCCNGGRGWGIICEICPFSGTIQFKKLCPYGKGYTTG
GEDIDECHVLHGICRNGQCVNERGKYKCECNIGYIPDVTGTSCIDLDECGQSPKPCNFIC
KNTEGSFQCSCPRGYVLQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFICVNTMGGFTCKCPPGFTQHH
TACIDNNECSQEVNLCGAKGVCQNTPGSYVCDCQRGFSLDQSGAACEDVDECEGSHRCQH
GCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECMNTHACGGAACHNTLGSFKCICPTGFQF
EQYGGSCQDINECGSSQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVTGAGLSRAAQDM
AASGEIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSANDTASSDNEEQLQLEAPVSLASWDSE
KTAILSFNVSHLNSRDRILELTPALTTLQDHNRYLIDSGNEHGLFRLNQKEGISYLHLTK
KKPVPGVYNIQISSFPLYKEKELFQLEDRHDRDYLTGELGDILKMKIRILLH
NT seq
8619 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggctggccagtgtattggggttggcagtgggatttacagccttcctgtccttcagt
gccagtcaaggtgccgacaaagatgccaccgcagcggacacggtgaaggaagccagagcc
aaccgagccaagaggagaggtggaggagcaggagcggggcacgacgtgctgaaaggacca
aatgtatgtggatcccgttataatgcctactgctgtcctggatggaaaacgttacctgga
gggaaccaatgtattgttcccatttgtcggcactcctgtggcgatgggttttgctcacgg
cctaacatgtgtacgtgtcctacgggtcaaacagctccatcatgcggttccaaatctgtt
cagcagtgtagtatcagatgtatgaatggaggcacatgcagtgatgaacattgtcaatgc
caaaagggttacactggggcacactgtggacagcctgtgtgtgaacatggatgtttaaat
ggtggaagatgtgtagctccaaaccgatgtgcctgcacatatggcttcaccggaccacaa
tgtgaaagggattacaggactggaccttgtttctccgctatcagtaaccagatgtgccaa
ggacagctgagtggcatcgtttgcacaaagacactatgctgtgctacagtgggaagagca
tggggccacccttgtgagatgtgcccggcccagccacatccttgccgacgaggctttatt
ccaaacattcgaacaggagcgtgtcaagatgtggacgaatgccaagccatccctgggatg
tgtcaaggaggaaattgtattaatacagttggatcttttgagtgcaaatgcccagctgga
cacagatttaatgaattaacacaaaaatgtgaagatgttgatgaatgtgccactatcccg
gggatctgtgaagccggtgaatgtgctaatacagtgggcagttacttttgcaagtgtcca
tcaggattttttacatcggcagatggatcaagatgcatagatgttcgccctgggtattgt
tttacttcgttatccaatggccgttgcaccaatcagctcccccaactgctacctaagatg
caatgttgctgtgatactggaagatgttggtcttcagctgcaaccacaccacccgaagtg
tgccccttccgtgggacagaggaataccgtaaactgtgcacgatgtcttggtcacgtcct
ggacagatccctggactggaaccaggaccagttattcaacctgggttgccctatcctcca
gaataccctcctccattaggtccacaggtgccaccaggataccctcctgtgtttccacct
ccagtttttcctggatttcctacccggactccttcagtggttctgccagtaaaccttaca
caacagcagcctgtgacagattactgtgtcttattccgaaacctgtgtttgcatggtcgc
tgcatacctactcctggaagctatcgctgtgagtgtaacaagggatttcacctggatggt
agaggagaatgtatagatgttgacgagtgtgaaagaaatccttgccttcacgcagactgt
gtaaatacacagggatcgtacatctgtcaatgttatgctggattccagagtacatcaact
aggacagaatgcagagacattgatgagtgcttacagaatggaagaatctgtaacaatggc
agatgtgtgaatacggatggtagtttccactgcgtgtgcaatgcaggcttccaagtgtca
cctgatgggaagaattgtcaagatatggatgaatgcagcgtaaggaacatgtgccttaat
ggaatgtgtattaatgaggatggaagttttaaatgcatctgtaaacctgggttccagctt
gcgccaaatggacgcttttgtacagatatcgatgagtgtgagacaccgggcatctgcatg
aatggacattgcgtgaacacagatggctcctttagatgtgaatgcttccctggtctagca
gttggacttgatggtcgagtgtgtgtagatactcacatgaggagcacttgctatggaggt
tacaagagaggtcagtgcgtcagaccacttcaaggagcagtgacaaaatcagagtgctgt
tgtgcaagcacagaatttgcatttggggaaccttgtaaaccctgtcctgccaagacttca
gatgaatatcaagctctgtgcagcagtggcccaggaataacatctacaggaaccgatatt
aatgaatgtgctctggatcctgatatatgtcctaatggaatttgtgaaaaccttcgggga
acctataaatgtgtttgtaattctggatacgatgtggacactactgggaagagttgcaat
gacattgatgaatgtgcaataaacagactgctgtgcgacaatggacaatgtcggaacact
ccaggaagctttacctgcacctgtcctaaaggatatgtctataaacctgatctcaagact
tgtgaagatgttgatgagtgtgagtccaacccctgcatcaatggtgcatgcaaaaatatc
ccaggatcctttgtgtgcgaatgccctcccggaagtacattggatacaaccaagaccatc
tgcattgaaactgttaaaggtacatgctggaaagatatagtgaatggaagatgtgaagtc
aacatcaatgggggaactttacgatcacagtgctgttctacattgggtgccgcctgggga
agtccttgtctaccttgtgaaccagatcctgtctgcgctaaaggttttgcaagatcaaaa
ggcacagtatgtgaagatgttgatgaatgtaaggtgtttcctggattgtgcatcaactct
cgatgtgttaacacaatgggatcctttacttgcgaatgccccaatgggatgacgcttgat
gcttctggacgctcatgtcttgacatccgcttggagacttgctacctaaagcatgaggat
gaagagtgctctgctcctattgctggacgccaccggatggatgcctgttgctgttctgtt
ggggctgcctggggctttgactgcgagcagtgtcccccgaaaggaaccacagaatttgag
accctttgtccaagaggacctggctttgcttctaaagaaataacccccggaaaaatattt
tcaaaagatattaatgaatgtaagatgatcccaagcttatgcaagtatggaaaatgcaga
aacactattggcagcttcaagtgccgatgtgacagtggcttcgctctggatgcagaagaa
aggaactgcacagatattgatgaatgcaggatatcaccagatgtgtgtggacaaggcaac
tgcatcaatacaccaggagactttgagtgtgactgcttcgaaggatacgagagtggattt
atgatgatgaagaactgcatggatattgatgaatgccagcagaatccactcctctgtcgt
ggtgggaactgcctcaacacagagggaagttttaaatgtgaatgtcctgatgggcatgag
gtcacacctgatggcacggcttgcttagatatcaacgagtgtgagctcagcactgacttg
tgcagacatgggcgatgtataaacctaattggaagataccaatgtacttgtgaacctgga
tataaaccatcagatgataaactctcatgtgttgatgttgatgaatgtgaaattttcaat
ggcggatgtgacacaaattgtacaaactcccaaggaagttatgaatgcagttgcatcgaa
ggttttgctttaatgccagaccacaggacctgtacagatattgatgagtgtgaaacaaat
cccaatatttgtgatggaggacagtgcacaaacatacccggagagtaccgctgcctctgc
tttgatggttacatggcatctgttgatatgaagacctgtctagatgttgatgagtgtgat
ctccatgataacatctgtctgagtggaagttgtgagaacacaaaaggctcgttcatctgc
cactgcaatcctgggtattctggaaagaaaggacaaactggatgcacagatgttaatgaa
tgtgagatcggtgcccacaactgtgacagacatgccacatgtacaaacacccctggagct
ttcaaatgcagctgtaatcctggatgggtagggaatggcgtcaagtgtacaggtacagta
ttttcactgatattcagatgttctatttgtaactttaaaaatgccttctttaaacattgt
ctgctttctttaacagatattgatgagtgcaccgagaatgtgaatctgtgtggaaatggt
caatgcctcaacacccctggaggataccgatgtgactgcgatatgggattcttaccaagc
attgatggaaaaacatgtgaagatattgatgaatgtgcactgcccaacatatgtgtcttt
ggtacctgcaagaatctccctggtctctttagatgtgattgtgacataggatacgagctg
gatagaagtggaggcaactgtacagatgtggatgaatgtgctgatcctacaacctgtatt
agtgggacatgttcgaatactcctggtagctacgagtgcgagtgtccaccagacttccaa
ttaaatcccactcgagttggatgtgtcgacactcggtctggcaactgctacctagtggca
aagccacgaggagataatggagacctgtcctgcagtgttgagattggtgttggtgtatcc
aaggcttcatgctgttgcgcacctgggaaggcctggggaaacccctgtgaacactgccct
ccagtgaattcgactgaatataaagttctgtgtccaggaggagaaggattcagaccaaat
cctattacagtaattttagaagatatcgatgaatgtcttgagttgccaggtctctgtcaa
ggtggaaagtgcataaacacatttggaagtttccagtgccgttgtccaccaggatttttc
ctcaatgaagaaactcgtgtttgcgatgatgtcaatgaatgtgaccagcctggaatttgt
ggccctggaacatgttataacactgttggcaattatacctgtatatgtccacccgattat
atgccgataaatggaggaaacaactgtatggacatgagaagaagcttgtgcttcagaaat
tattatgctgacaatcagacttgtgatggagaattgctttacaacatgacgaaaaaaatg
tgctgctgttcctacaatattgggcgagcttggaatcgaccttgtgaagaatgtccattg
ccgagcactgatgaattttctggactttgtggaagtgctcgtcctggttttgtcatcgat
atctacactggactgccagttgatattgatgaatgcagagaaattcctggtgtttgtgag
aatggagtttgtataaacatggtgggaagcttccgatgtgaatgtccaatgggatttttc
tacaatgacaagttacttatctgtgaagatattgatgaatgccagaatggcccagtgtgt
ccgaggaatgcagactgtgttaatacagcagggagctaccgctgtgactgcaaacctggc
tacaagttcacacccacaggacaatgcgtcgatcgcaatgagtgtttggaaattccaaat
gtctgcagccatggagagtgccatgataaggttgggggatattactgtgtgtgccacaat
ggatttaagaccaatgatgatcagactatgtgtcttgatattaatgaatgtgaaagagat
ccttgtggcaatgggacatgtaggaatacaattggatcttacaactgccgctgtttcgat
gggtttatcctatcacacaacaatgattgtatagatatcgatgaatgtaccacgctcaat
ggtcagttatgcagaaatggacagtgtgtcaatgttattggatccttccaatgtatctgt
aatgaaggatatgaaatgacatctgatggaagaacatgtctagatatcaatgagtgtgaa
cttgatcccgggaagtgcgctcctggaacttgtcaaaatctggacggcacctaccgttgc
atctgtcctcctggatatgtgctaaaagatgacaagtgtgaagacattgatgaatgcgtt
gaagagccagagatttgtgcactgggaacttgtagcaatgttcctggcagttttatctgt
atgtgtcccgagggttttgtactatcatcaacaggaaggagatgccaagatctaagagtc
ggttactgctacaccaaatttgaagcgggacagtgcctttctccaaagatcctaaaccac
accaagcaggaatgttgctgtgcaatgaaaggagcaggatggggatccccatgtgaaata
tgcccggtggaaggagatgaggctttccgagagatctgtccctttggaagtggtgtggtg
gttggaccaaatgatgagcgagttgacatggatgaatgtatcgatccagacaaatgcaag
aatggccagtgtatcaacacagatggatcgtatcggtgcgaatgctcctttggatatgtg
cttacaggagatgaatgtatagatgttgatgagtgttctattcaaaacccatgtgggaat
ggaacttgcaagaatgtgattggtggatttgagtgcacatgtgaagaaggctttgagcct
ggaccaatgatgtcctgtgaagatgttaatgaatgtgctcagaaccctctgttgtgcgct
ttccgatgcgttaacacctacggttcatatgaatgcaagtgcccagctggctatgtgctc
cgggaagacaagagaatgtgcaaagatcaggacgagtgtgaagatggccttcatgactgt
gactctaaacaaatgatgtgcaagaatctcattggaacatacatgtgtatatgtggacca
gggttccagcgtagaccggatggtgaaggctgtatagatttgaatgagtgccttaagcct
gggctatgtgaaaatggaaaatgtctgaacactgtgggcagttacaagtgtgagtgcaaa
gacggattcaataccagcattacagagacagaatgtattgacaaccgactcggatattgc
ttcaccgatgtattacatacaatgtgccagcttggatcgtcaaacaagaattccgttacc
aaatctgagtgttgctgtaatggtggcaggggatggggtattatctgtgagatctgcccc
ttctctggaacaattcagtttaaaaagctttgtccatatggcaagggatatacaactgga
ggagaagatattgatgaatgtcatgttctacatggaatttgtcgcaatggacaatgtgtc
aacgaaagaggaaaatacaaatgtgaatgcaatataggttatatccctgatgtgactggc
acttcctgtatagatcttgatgaatgtggtcagtcccccaaaccttgcaatttcatttgc
aagaatactgaaggaagtttccagtgttcctgtccacgtggttatgttttgcaggaggat
ggaagaagctgtaaagatcttgatgaatgtgcaaccaagcaacataattgtcagtttatt
tgtgtgaacacaatgggaggatttacatgtaaatgtcctcctggatttacacagcatcat
actgcctgcattgataacaacgaatgctctcaggaagtgaacctgtgtggtgctaaaggc
gtttgccagaatactccaggcagctatgtgtgtgattgccagcgtggcttttcccttgat
cagagtggagcagcatgtgaagatgtggatgagtgtgaaggaagccatcgctgtcagcat
ggatgccagaacattattggcgggtatagatgtagttgcccacaaggttatctccaacat
tatcagtggaaccaatgtgtggatgagaacgaatgcatgaacacccatgcatgtggggga
gctgcgtgccacaacacattgggaagcttcaagtgtatatgtccaacaggatttcagttt
gaacagtatggtggttcatgtcaagacatcaatgagtgcggctcttctcaagcaccatgt
agctacggttgttcaaatactgaaggaggatatgtctgtggatgtccacctggatacttc
agaataggacaaggacactgtgtaacaggagccggtctaagcagagctgcccaggatatg
gcagcgagcggagaaatagatgataactctctgtcccccgaagcatgctatgactgtaag
atcaatggctatcccaagagaggaaggaaacggagaagtgccaatgatactgcgtccagt
gataatgaggagcagcttcaattggaagcccctgttagcctcgccagttgggattcagag
aaaacagcaatcctttcctttaatgtttcccacttgaacagtagagaccgaattctggag
cttacaccagctctcacaactctgcaagaccacaaccgatacctaatagactctgggaat
gaacatggcttatttaggctcaaccaaaaggaaggcatcagttacctgcatctaaccaag
aagaagccagtgcctggtgtttataacatacagattagcagtttccctctttataaggag
aaagagcttttccagcttgaagacagacacgacagagactacctcactggtgaactgggt
gacattcttaaaatgaaaattagaatcttacttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
