KEGG   Aliarcobacter faecis: AFAEC_1324
Entry
AFAEC_1324        CDS       T06664                                 
Name
(GenBank) RND family efflux system, inner membrane transporter, AcrB family
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
afc  Aliarcobacter faecis
Pathway
afc01501  beta-Lactam resistance
afc01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:afc00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    AFAEC_1324
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    AFAEC_1324
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:afc02000]
    AFAEC_1324
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:afc01504]
    AFAEC_1324
Transporters [BR:afc02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   AFAEC_1324
Antimicrobial resistance genes [BR:afc01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    AFAEC_1324
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C Syndecan
Other DBs
NCBI-ProteinID: QKF73485
LinkDB
Position
1296404..1299553
AA seq 1049 aa
MISAFFIKNPVFAGVLSIIIFLVGLISMVNLPIEQSPRVLPPQIIVSTAYPGASADTIAK
TVAAPLEEQINGAKNMLYMNSQAEDSGRLSINVFFEVGTDPDQAKIDVNNRVQAALASMP
EQVKRQGVVVGEKSPSILLFAMLQSPNKTYDSLYLSNYALLNMVETLKRVEGVGDAMIFG
AKDYSIRIWIDPAKLSKYSLATTDVITAIQEQNNQYAAGKIGAEPLENKQMYTYTIRTPD
RFSDPNQFSNIVIRANEDGSSLKLKDVATVELGASSYGVQTRLNNSPSIPIGVFLQSGAN
ALDTAKAIKKALEDASKNFPQDMTYSIPYDSTDFIVASIEEVVKTFVEALLLVILIIFIF
LQSWRATIIPLIAVPISIVGAFAGMYVLGFSINLLTLFGLVLAIGIVVDDAIIVIENIER
HMEEGKTPLESAYIAMKEVTGALIAIILVLGAVFIPVAFMGGLSGEMYRQFAITIVISVI
ISGFVAITLTPSLCVRILKNKKHEPKGFAKWFNNMFDKFTSGYSFIVKKTIRFSLISILL
FGGLLFVSWDMFKSMKTGLIPDEDQGTIFVFGFNPPGSSLSRTLSLSEEINAIIEKDPNV
NNIITLAGYDFTTSAERTHTVATIIKLKDWSLRPNPDQDAQALLKKFSKQLMGTSEGFSF
AVVPPPIMGMSVTGGFDMYVQDRNGRSIEELGNAVNQIIAKASTRPELVGVRTSLAANIP
QFKIDVDIEKAKAKGVNVNDIYSTINATFGSFYVNDFSLYGRTYKVNLQAIEEYRNNINN
MQNIFVRSKNGELLPLNSFVTAKQQVGADLIERFNLFQAAKVSGQPAPGYSSGDALNAIE
EVANEVLPSGYTISWVGTAYQEKQIGGSSAQAFIFGIVFLFLILAALYERWLLPISVVLA
VPFAIFGAILATNIRGLDNNIYFQIGLLVLAGLAAKNAILIVEFALQKRKEGFNLVDAAL
EAAKVRLRPIIMTSLAFTIGVLPLAISGGAGAASKHSIGTGVIGGMLTATFIAIIFIPLF
YILISRLSREKEGSITADLKKEENSNSEK
NT seq 3150 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatttcagcattctttataaaaaaccccgtttttgctggtgttttaagtataattatt
ttccttgttgggttaatctctatggttaatcttccaattgaacaatcccctagggtttta
cctccacaaattattgttagtactgcttatccaggggctagtgcagatactattgcaaaa
actgttgctgcacctcttgaagagcaaataaatggtgcaaaaaatatgctttatatgaac
tctcaagcagaagatagtggaagattaagtataaatgtattttttgaagttggaacagat
ccagaccaagcaaaaatcgatgtaaataatagagttcaagcagcacttgcatctatgcct
gagcaagtaaaaagacaaggtgtagttgttggagagaaaagccctagtattttacttttt
gctatgcttcaatctccaaataagacttatgactctttatatctttcaaactatgctctt
ttaaatatggttgaaactctaaaaagagttgaaggtgttggagatgcaatgatttttgga
gcaaaagattactctattagaatctggattgatcctgctaaattatcaaaatattctctt
gcaacaactgatgtaattacagctattcaagaacagaacaatcaatatgcagctggaaaa
attggtgctgaaccacttgaaaataaacagatgtatacatatactattcgaactcctgat
agatttagtgatcctaatcaattctcaaatattgttattagagcaaatgaagatggaagt
agtttaaaattaaaagatgttgcaactgttgaattaggagctagctcttacggtgttcaa
acaagattaaacaattctccatctattccaattggagtatttttacaaagtggagctaat
gctttagatactgcaaaagccataaaaaaagcacttgaagatgcaagtaaaaacttccct
caggatatgacttatagtatcccttatgatagtacagatttcattgttgcttctattgaa
gaagttgtaaaaacatttgttgaagcacttttacttgttattttaattattttcatcttc
ttacaaagctggagagcaactattattcctttaatcgctgttccaatatctattgttgga
gcttttgcaggaatgtatgttttaggatttagtatcaatcttctaactctttttggtctt
gttcttgctattggaattgttgttgatgatgctattattgttattgaaaacattgaaaga
catatggaagaaggaaaaactccacttgaatcagcatatattgctatgaaagaggtaaca
ggtgctctaatcgccattattttagttttaggtgcagtttttatacctgttgcatttatg
ggtggtttatcaggagagatgtatagacaatttgccataacaatagttatttcagttata
atttcaggatttgttgctattactttaacaccatctttatgcgtaagaatattaaaaaat
aaaaaacatgaaccaaaaggctttgcaaaatggttcaataatatgtttgataagtttaca
agtggatactcttttatagttaaaaaaacaattagattctctttaatatctattctactt
tttggtggattactatttgtttcatgggatatgtttaaatctatgaagacaggacttatt
ccagatgaagatcaaggaacaatatttgtatttggatttaaccctccaggttcttcactt
tcaagaacacttagtttaagtgaagagataaatgcaataattgaaaaagatcctaatgta
aataatataataactcttgcaggatatgattttacaacatcagcagaaagaactcatact
gttgcaactattattaaattaaaagattggagtttaagaccaaatccagaccaagatgca
caagcacttttaaagaaatttagtaaacaattaatgggtactagtgaaggtttctctttt
gcagttgttccacctccaattatggggatgagtgttactggtggatttgatatgtatgtt
caagatagaaatggaagatcaatagaagaacttggaaatgctgtaaatcaaatcattgca
aaagcaagtacaagacctgaattagttggtgttagaacttcattagctgcaaatatccct
cagtttaaaatcgatgtagatattgaaaaagcaaaagcaaaaggggtaaatgtaaatgat
atttatagcactataaatgcaacttttggaagcttttatgtaaatgatttctcactttat
ggaagaacttataaggtaaatttacaagcaattgaagagtatagaaataatataaataat
atgcaaaatatatttgtgagatctaaaaatggtgaacttttaccacttaactcttttgtt
acggcaaaacaacaagttggagcggatttaatagagagatttaaccttttccaagctgca
aaagtttcaggacaaccagctcctggatatagttctggagatgctttaaatgctattgaa
gaagttgcaaatgaagttttacctagtggttatacaatttcatgggtaggaactgcttat
caagagaaacaaattggtggaagttcagcacaagcatttatctttggtattgtattctta
ttcctaattcttgcagctttatatgaaagatggttattaccaatttcagttgttttagct
gttccttttgctatatttggagcaatcttagctacaaatataagaggattagataataat
atctatttccaaattggacttttagttcttgctggacttgctgctaaaaatgctattttg
attgtagagtttgctttacaaaaaagaaaagaagggtttaatcttgttgatgcagcacta
gaagctgcaaaagtgcgattaagaccaattattatgacatctttagcatttactattggt
gttttaccacttgctattagtggaggagctggagctgctagtaaacactctattggaaca
ggtgttattggtggaatgcttacagcaacatttatagcaattatttttatcccactattt
tatatacttatctctagattaagccgtgaaaaagagggaagtattacagcagatttaaaa
aaagaagaaaatagtaatagtgagaaatag

DBGET integrated database retrieval system