Antechinus flavipes (yellow-footed antechinus): 127551136
Help
Entry
127551136 CDS
T08818
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
afz
Antechinus flavipes (yellow-footed antechinus)
Pathway
afz04350
TGF-beta signaling pathway
afz04518
Integrin signaling
afz04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
afz00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
127551136
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
127551136
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
127551136
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
afz00536
]
127551136
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
afz00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
127551136
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_PEAR1L
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127551136
NCBI-ProteinID:
XP_051836577
LinkDB
All DBs
Position
2
Genome browser
AA seq
2872 aa
AA seq
DB search
MRRRGLLELALGFTVLLSSYTSHGAEGNSETGNVKETRASRAKRRGGGGHDALKGPNVCG
SRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQISPSCGSRSIQHCN
IRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCESGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQCERD
YRTGPCFTLVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIR
TGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCEDIDECITIPGVCD
GGECSNTVSSYFCKCPPGFYTSPDGTRCIDVRQGFCYASLANGRCNNQLPQQLSKVQCCC
EVGRCWAPGPATAPEMCPIRATEEFHRLCTLPGIVPGRPDIPLPPGVFPPSGPVPPGVPV
PPGIYPPIPRPQLPEPYPSREPSRVLPVNITDYCQLYRGLCLNGHCIPTPGSYRCECNKG
FQLDIRGECIDVDECEKNPCVGGECVNTQGSYICQCRVGYQSTLTRTECRDIDECLQNGR
ICNNGRCINTDGSFHCVCNAGFHVASDGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICK
PGFQLASDGRYCKDINECETPGICMNGRCVNTDGSYRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRS
TCYGGYKRGQCVKPLFGAVTKSECCCASTEYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPGMTS
GGSDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNSGYEVDASGKNCVDINECALNTLLCDNG
QCRNTPGSFTCTCPKGFVYKPDLKTCEDIDECESSPCVNGVCKNTLGSFVCECSSESTLD
ATKTICIETIKGTCWQSIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCQTDPICAKG
YSRIKGTQCEDIDECIVFPGVCKNGHCVNTLGSFVCQCPSGMTLDLTGRICLDIRLETCY
LKHEDEECSLPVAGRHRMDACCCSVGAAWGSVECEECPLRNTPEYDALCPRGPGFATRGE
IINGKPFFKDINECKMIPNLCTHGKCRNTIGSFKCRCDNGFALDSEERNCTDIDECRISP
DLCGQGICVNTPGDFRCECFDGYESGFMMMKNCMDIDECQRDPLLCRGGTCLNTEGSYRC
ECPPGHQMAPNISACIDINECDLSVNLCRNGRCVNLIGKYQCACNPGYHATPDKLFCVDI
DECSIMNGGCDTFCTNSEGSYECSCRQGFALMPDQRSCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIP
GEYRCLCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLNPNICLSGSCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTT
GCTDINECEIGAHNCDRHAVCTNTAGSFKCSCSPGWIGNGIKCTDLDECSNGTHMCNQHA
DCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCIDLDECSENLNLCGNGQCLNAPGGYRCECDMGFVPS
ADGKACEDIDECSLPNICVFGTCHNLPGLFRCECETGYELDRTGGNCTDVNECLDPTTCI
SGNCVNTPGSYTCDCPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIRPRGDNGDTSCSNEIGVGVS
KASCCCSLGKAWGTPCELCPAVNTSEYKILCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQ
GGKCINTFGSFQCRCPTGYYLNEETRVCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDY
MQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPI
PSTDEFATLCGSQRPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPVGFF
YNDKLLVCEDIDECQNGPVCQRNAECMNTPGSFRCDCKPGYRFTSTGQCNDRNECQEIPN
ICSHGQCIDTLGSYYCLCQTGFKTNAEKNMCVDINECERDACGNGTCRNTVGSFNCRCNH
GFILSHNNDCIDVDECATGNGNLCRNGQCLNTVGSFQCQCNEGYEVTADGRSCIDINECL
ADPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYSLQNDNCEDIDECVEEPEICALGTCSNTPGSFKC
LCPEGFSLSSTGRRCQDLRMSYCYAKFEGGKCSSPKSRNHSKQECCCALKGEGWGDPCEL
CPTEPDEAFRQICPYGSGIIVGPDDTRIDMDECKEPDICKYGQCINTDGSYRCECPFGYI
LHGVECVDTDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCA
FRCVNTYGSYECKCPTGYVLREDRRMCKDENECEEGKHDCAEKQMECKNLIGTYMCICGP
GYQRRPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCLNTRGSYTCECNDGFTASPAQDECLDNREGY
CFTEVLQSMCQIGSSNRNPVTKSECCCDGGRGWGPHCEICPFQGTVAFKKLCPHGRGFMT
NGADIDECKVIHDVCRNGECVNERGSYHCNCNTGYTPDITGTTCVDLNECNQAPKPCNFI
CKNTEGSYQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQH
HTACIDNNECTSEVNLCGAKGVCQNTPGSFTCECQRGFSLDQSGASCEDVDECEGNHRCQ
HGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQ
YEQFSGGCQDVNECGSAQAPCSYGCSNTEGGYLCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGMGRGPES
PVSGEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRRRRSVNETDALDAEDQPEMEAPVSLASWDVE
KTAVFTFNVSLISNKVRILELLPALTTLTNHNRYLIESGNEDGLFKINQKEGISYLHFSK
KKPVAGTYSLQISSIPLYKKKELNQLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8619 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggagaaggggtctgctggagctagccctgggatttacagtgctcttgtcttcctac
acgagccatggtgctgaagggaattcggagactgggaatgtgaaggaaaccagagccagc
cgggcaaagagaagaggtggaggaggacacgatgcgctcaaaggaccaaatgtgtgtgga
tcacgttacaatgcttattgttgccctggatggaaaaccttacctggtggaaatcagtgc
attgtcccaatctgtcggcattcctgtggagatggattttgttcaaggccaaacatgtgt
acttgcccaactggacagatatctccttcctgtggctcaagatcaatacaacactgtaac
atccggtgtatgaatggaggtagctgtagtgatgatcactgtttgtgccagaaaggatat
acgggaacacattgtggacaacctgtctgtgagagtggttgtcttaatggaggtagatgt
gtggcacccaatcgctgtgcttgtacatatggtttcacaggacctcagtgtgaaagagat
tacagaaccggtccatgtttcacactagtcagcaaccagatgtgccagggacagctcagt
gggattgtctgtacaaagactctttgctgtgccacagtaggaagagcttggggccatccc
tgtgagatgtgcccagcccaacctcacccctgccgccgaggcttcatcccaaacatccga
acaggagcttgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggctctgtcaaggagga
aattgcattaacactgttggatcatttgagtgcaagtgccctgctggacacaaatttaat
gaagtaacacaaaaatgtgaagatattgatgagtgtatcactattcctggagtctgtgat
gggggtgaatgctcaaatactgtcagcagttatttttgcaaatgtcccccaggattttat
acctctcctgatggaaccagatgtatagatgttcgccaaggattctgttacgcgtccctg
gccaatggacgctgcaacaaccagcttccccagcagctctccaaggtccagtgctgctgc
gaggtgggccgctgctgggccccggggcccgcgacagcccccgagatgtgccccatccgg
gccacagaggaattccacaggctttgcaccctacctgggatagttcccggaagacctgat
attcctttgcctcctggtgtcttccctcccagtggtccagtgcctcctggtgtccctgtg
cctcctggtatctatccaccaatcccaagaccacaactcccagagccttatccatctcgg
gaaccgtcacgggtgttgccagtcaatatcacagattactgccagctgtatcgaggtctc
tgcctcaatgggcactgtattcccactcctgggagctaccgctgtgaatgcaacaaagga
ttccagcttgacattcgtggagaatgcattgatgttgatgagtgtgaaaaaaatccttgt
gtaggtggagagtgtgtcaatactcaaggatcctacatttgtcagtgtcgagttgggtat
cagagcacattgacaaggactgaatgtcgagatattgatgaatgtttacagaatggccgg
atctgcaataatggacgttgtataaacacagacggcagtttccattgtgtatgtaatgct
ggtttccatgtagcaagtgatgggaaaaattgtgaagatatggatgaatgcagcataagg
aacatgtgcctcaatggaatgtgcatcaatgaagatggcagttttaagtgcatttgtaaa
cctggcttccagctggcatcagatggccgttactgcaaagatattaatgaatgtgaaaca
cctggaatctgcatgaatggacgctgtgtgaacactgatggatcctatcgatgtgaatgc
ttccctggactagcagtggggctagatggacgagtgtgtgttgatactcacatgcggagt
acatgttatggtggatacaagagaggacagtgtgtcaaacctctgtttggagcagttact
aagtctgaatgctgctgtgccagcaccgaatatgcctttggggagccttgccagccttgc
ccggcacagaattcagcggaatatcaagcactttgcagcagtgggccgggaatgacttca
ggaggcagtgatataaatgaatgtgccttggatcctgatatttgcccaaatggaatttgt
gagaatttacgtggcacatacaagtgtatatgcaattcaggatatgaagtggatgcaagt
gggaaaaactgtgttgatattaatgaatgtgcattaaacaccttgctttgtgacaacggg
caatgcagaaatactcctggaagtttcacctgtacctgtcccaagggatttgtatacaaa
cctgacctaaaaacttgtgaagatattgatgaatgtgaatcaagtccttgtgttaatgga
gtatgcaagaacaccctgggttcttttgtttgtgaatgttcttcagaaagtactttggat
gcaacaaaaactatctgcatagaaacaattaaaggtacttgttggcagagtattgttgat
ggaagatgtgaaatcaatatcaatggagccactttgaagtcacaatgctgttcttcactg
ggtgctgcctggggaagcccatgtacaccgtgtcaaacagacccaatatgtgctaagggg
tactcaagaattaaaggaacacagtgtgaagatatagatgaatgtattgtattccctgga
gtgtgcaaaaatggccactgtgtcaacactttgggatcatttgtttgccagtgtcccagt
gggatgactttggatctcacaggaagaatctgtcttgatatccgcctagaaacttgctat
ctgaaacatgaagatgaggaatgctctttgcctgttgctggccgtcaccgaatggatgca
tgctgctgttctgttggcgctgcttggggcagtgtagaatgtgaggagtgtcccctgaga
aatacccctgaatatgatgctctttgccctagagggcctggatttgccacaagaggagag
ataataaatggaaaacctttcttcaaagatataaatgaatgcaagatgatcccaaatttg
tgtacacatggcaaatgcagaaataccattggcagctttaaatgcaggtgtgataatggt
tttgctctcgattctgaagaaaggaactgcacagatattgatgaatgccggatatctcct
gatttgtgtggccaaggcatctgtgtgaataccccaggggactttagatgcgagtgcttt
gatggatatgaaagtggatttatgatgatgaagaactgcatggatattgatgaatgtcag
agagaccctcttctttgtcgaggtggcacatgcctcaatacagaaggaagttaccgatgc
gagtgccctcctggccatcaaatggctcctaatatctcagcttgtatagacatcaatgag
tgtgatctcagtgttaacctctgcagaaatggccgctgtgtgaacctgattgggaagtac
caatgtgcttgtaatccaggctaccatgccacacctgataaactgttttgtgttgatatt
gatgaatgtagcataatgaatggaggctgtgacaccttctgcaccaattctgaaggcagt
tatgaatgcagttgtcgacagggatttgcacttatgccagatcagagatcttgcactgac
attgatgagtgtgaagataatcctaatatttgtgatggaggtcagtgtacaaacatacct
ggagagtacaggtgcctgtgttatgatgggttcatggcatctgaggatatgaagacatgt
gtagatgttaatgaatgtgatcttaatccaaacatttgtctgagtggcagctgtgagaac
acgaaaggctcatttatctgtcattgtgacatgggatattcaggcaaaaaaggaacaact
ggctgtacagacatcaatgaatgtgaaattggagcacataattgtgacaggcatgctgtc
tgcactaacacagcagggagcttcaaatgcagctgcagtccaggatggattggtaatggc
attaagtgcacagatttggatgaatgctctaatgggactcatatgtgtaaccaacatgct
gactgtaaaaatacgatgggatcttaccgctgtttatgtaaggaaggatacactggagat
ggattcacttgtatagatcttgatgaatgctcagaaaatctaaacctttgtggaaatggg
caatgccttaatgccccaggaggatatcgttgtgaatgtgatatgggatttgtgccgagt
gctgatggaaaagcatgtgaagatattgatgagtgttcccttcctaatatctgtgtcttt
gggacttgtcataatcttcctggtcttttccgttgtgagtgtgagactggctatgaactg
gacagaactggaggaaactgcacagatgttaatgagtgcctggaccctacaacttgtatt
agtgggaattgcgtgaatactccaggcagttatacctgtgattgtccacctgattttgag
ctgaaccccaccagagttggctgtgttgatacacgatccggcaattgctatttggatatt
cgccctcgaggagacaatggagatacatcatgtagcaatgaaattggagttggtgtttct
aaggcttcctgctgctgttccctgggtaaagcttggggtaccccttgtgaactctgccct
gctgtgaatacatctgaatataaaattctttgcccaggaggagaaggctttcgaccaaat
cctatcactgttatattggaagatattgatgagtgtcaagaactgcctggactttgccaa
ggagggaaatgtatcaacacatttggcagtttccagtgtcgctgcccaactggttactac
ttgaatgaagaaacccgagtgtgcgatgatgtaaatgaatgtgaaactcctggtatctgt
ggtcctggaacatgttataacacagttgggaactacacttgcatttgtcctccagactat
atgcaagttaatggtggaaataactgcatggatatgagaaggagcttatgctaccgaaat
tattatgctgacaaccagacctgtgatggagaactgctgttcaatatgaccaagaaaatg
tgttgctgttcctataacattggccgtgcctggaataagccctgtgaacagtgtcccatt
cccagcactgatgaatttgctacactgtgtggtagtcagaggcctggttttgtcattgac
atttataccggcttaccagttgatattgatgaatgccgagagatccctggagtctgtgaa
aatggagtttgtatcaatatggttggtagcttcagatgcgaatgtcccgtggggttcttt
tataatgacaagttattggtttgtgaagatattgatgaatgccagaatggccctgtatgt
cagcgcaatgcagaatgtatgaacacaccagggagcttccgctgtgactgtaagccagga
tacagattcacctcaacaggacaatgcaatgataggaatgaatgccaagaaattcctaat
atctgcagccatggtcagtgcattgacacacttggaagttactattgcctttgtcaaact
ggatttaaaacaaatgctgaaaaaaacatgtgcgtggatataaatgagtgcgaaagggat
gcctgtggaaatggaacttgtagaaacactgttggttctttcaactgccgatgcaaccat
ggattcatcctctcacacaacaatgattgtatagatgttgatgaatgtgctactgggaat
gggaacctttgcagaaatggtcagtgtctcaatacagttggatccttccagtgtcaatgc
aatgagggctatgaggtgactgctgatggaagaagttgtattgatataaatgagtgtcta
gctgatcctggaaaatgtgctccaggcacgtgtcaaaacttggatggatcctacagatgc
atttgtcctcctggttacagcctgcaaaatgacaactgtgaagatattgatgagtgtgtg
gaagagccagaaatctgtgccttaggcacctgcagtaacactccaggcagcttcaaatgt
ctctgtccagaaggtttttcattatcctctactggaagaagatgccaagacttaagaatg
agctactgctatgcgaagtttgaaggaggcaaatgttcatctcctaaatccagaaatcat
tccaaacaagaatgttgctgtgccttaaagggagaaggttggggagacccatgtgagctg
tgtcccactgagccagatgaagcatttcgtcaaatctgcccatacggaagtggtatcatt
gttggacctgatgatactcgtattgatatggatgaatgcaaagaacctgatatctgcaaa
tatggccaatgtatcaacacagatggttcctaccgctgcgagtgtccttttgggtatatc
ctccatggagttgagtgtgtagatactgatgaatgttcggtgggtaatccttgtggaaat
ggaacgtgcaagaacgttattggaggttttgaatgtacctgtgaagaaggatttgaacca
ggtcccatgatgacatgtgaagatatcaatgaatgtgctcagaatcctctgctctgtgcc
ttccgatgtgtaaacacttatgggtcatatgaatgcaaatgtccaactggttacgttctt
agagaagacaggagaatgtgcaaagatgagaatgaatgtgaagaaggaaagcacgactgt
gctgagaaacaaatggagtgcaagaacctaattggcacatatatgtgcatctgtggtcct
ggctaccaacgaagacctgatggagagggttgcatagatgagaatgaatgtcagaccaag
ccaggaatctgtgaaaatggacggtgcctcaataccagaggaagctatacatgcgagtgc
aatgatggctttacagctagccctgctcaagatgagtgtcttgacaaccgagaaggatac
tgcttcactgaagttctacaaagcatgtgtcagattggatcaagtaacagaaatccagtc
accaaatctgagtgttgctgtgatggtgggagaggctggggcccccactgtgagatctgc
ccattccagggcactgtagcctttaaaaaactttgccctcatggccgaggattcatgacc
aatggagcagatattgatgaatgcaaggttattcatgatgtttgccggaatggagaatgt
gttaatgagagaggatcctaccattgcaattgtaatactggctatactccagatatcact
ggcaccacctgtgtagatctaaatgagtgtaaccaggctcccaaaccctgcaatttcata
tgcaaaaacacagaaggaagttaccagtgttcctgtccaaagggatacatccttcaggag
gatgggagaagctgcaaagatcttgatgagtgtgcaactaaacaacataattgtcaattc
ctttgtgttaacaccattggaggctttacatgtaaatgtccacctgggtttacccaacat
catacagcctgtattgataacaatgaatgtacctctgaagtcaatctttgtggagctaaa
ggtgtatgtcagaacactcctggaagcttcacttgtgaatgtcagaggggtttttcacta
gatcagagtggagccagctgtgaagatgtggatgagtgtgaggggaaccaccgatgccaa
catggctgccagaacattattggaggatacaggtgtagctgccctcagggatatctccag
cactaccagtggaaccagtgtgtggatgaaaatgaatgcctcagtgcacacatatgtgga
ggagcctcttgccataataccctgggaagctacaagtgcatgtgtcccactggattccag
tatgaacagtttagtggaggatgccaggatgtcaatgaatgtggttctgctcaggcccca
tgcagctacgggtgctccaacacagaaggaggctacttgtgtggctgcccaccaggctac
ttcaggatcggccaagggcattgtgtttctggaatgggcatgggcagaggtcctgagtct
cctgtcagtggagaagtggatgacaattccctctcaccagaagcttgctatgaatgtaaa
attaatggctacccaaaacgaggcagaagacgaaggagtgttaatgaaacagatgccctt
gatgcagaagatcagcctgagatggaagccccagtaagtctggcaagttgggatgttgag
aagacagctgtttttacttttaatgtttccttgatcagtaacaaagttcggattctggaa
ctccttccagcccttacaactctaacaaatcacaatcgatatttaattgaatctgggaat
gaagatggcctctttaaaatcaatcagaaggaagggataagctatcttcacttctccaag
aagaagccagtggctggaacctattcattacaaatcagcagtattcctctttataaaaag
aaggaacttaaccagctagaagacaaacatgacaaagactacctcagtggtgaactgggt
gataacctgaaaatgaaaattcagattttgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
