Agarivorans sp. B2Z047: LQZ07_22715
Help
Entry
LQZ07_22715 CDS
T08685
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18299
multidrug efflux pump
Organism
agq
Agarivorans sp. B2Z047
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
agq02000
]
LQZ07_22715
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
agq01504
]
LQZ07_22715
Transporters [BR:
agq02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
LQZ07_22715
Antimicrobial resistance genes [BR:
agq01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexEF-OprN [MD:
M00641
]
LQZ07_22715
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQN42555
LinkDB
All DBs
Position
complement(4933654..4936833)
Genome browser
AA seq
1059 aa
AA seq
DB search
MFSQFFIKRPIFAAVISLLMFIGGAIAVWQLPITEYPEVVPPTVVVTANYPGANPKVIAE
TVASPLEQEINGVEDMLYMSSQATSDGRMTLTVTFAIGTDIDQAQTQVQSRVDRATPRLP
LEVQRLGIVTEKSSPDLTMVVHLSSPEDRYDLLYLSNYAALNVKDELARIEGVGAVRLFG
AGDYSLRIWLDPNKVAALGLNPNQIIASIREQNQQAAAGSLGAQPSGESDFQILINVKGR
LSTTEEFENIIIKVGEQGEVSRLRDVARVELGASSYALRSLLDNKDAIAIGVFQASGSNA
IQISEDVRARMAELAQSFPEGLNYDTVYDPTVFVRGSIEAVVKTLFEAVLLVVLVVVLFL
QTWRASIIPLVAVPVSLVGTFAFMHLMGFSLNALSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVERN
IAEGLSPVAATQRAMKEVTGPIVATTLVLAAVFIPTAFMSGLTGQFYKQFALTITISTFI
SAINSLTLSPALSALLLKGHDEPKDRLTRIMDSLFGRFIFAPFNRLFNKGANVYGGIIKK
TIRLSALVGIIYVGLLGLTAYQFDTTPTGYVPGQDKQYLVAFAQLPDAASLERTEAVVKK
MSEIALAQPGVEHAVAFPGLSINGFTNSPNSAILFTPLADFDQRQDPSLSANAIAGALNQ
QFAGIQEAFIAIFPPPPVQGLGTIGGFRLQIQDRASLGYEELANVTMQVMQKAWATPSLT
GIFSSYQVNVPQLDLDLDRTKAMQQGVAIDEVFSTLQAYMGSTYVNDFNKFGRTYQVNIQ
ADESFRQSPEQISQLKVRNADGAMIPLGSFVDVSYVAGPDRVMHYNGYTTAEINGGPAPG
YSSGEAQAAIEQILAETLPIGMTFEWTELTYQQKLSGNTAMLIYPLVIILVFMVLAAQYE
SLRLPMAIILIIPMTLLSAISGVLLWGGDNNIFTQIGLIVLVGLATKNAILIVEFAKELQ
DQGRTVMEAVLEASRLRLRPILMTSIAFIMGVVPMVFSTGEGAEMRQAMGVAVFSGMIGV
TIFGLLLTPLFYYLLAKRNPKTSEQAEPLALDADILAAK
NT seq
3180 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttctcagttttttattaaacggccgatttttgcggccgttatatcgctgctgatg
tttattggcggtgccattgccgtatggcaattacccattaccgagtacccagaagtggtg
ccaccaacagtagtagttacagctaactaccctggggcaaaccctaaggtgattgccgaa
accgtggcttcaccgcttgagcaagaaattaacggtgttgaagacatgttgtatatgtct
tctcaggccacctctgacgggcgcatgacgctgaccgttacttttgccattggcaccgat
atcgaccaagctcaaacgcaggtgcaaagccgggttgatcgcgccacaccgcgtttgccc
ttagaagtgcagcgcttaggtattgtgaccgaaaagtcatcaccagaccttactatggtg
gttcaccttagttcaccagaagatcgctacgacttattgtacctgtccaactatgcggcg
cttaacgttaaagacgagctagcccgaattgaaggtgtgggtgctgtgcgtttgtttggt
gcgggtgattacagcttaagaatttggctagaccctaataaagtagctgctctaggttta
aatccaaaccaaattatcgcttcgattagagagcaaaaccagcaagccgctgccggtagt
ttgggcgcacagcctagcggtgagtctgattttcagattttgatcaacgtgaaggggcgt
ttaagtaccaccgaagagtttgagaacatcatcattaaagtgggcgagcaaggcgaagtt
agccgcttgcgagatgttgctcgggttgagttgggtgctagcagctatgcattacgctcg
ttactcgacaacaaggatgcaattgctattggtgtgtttcaagcatctggctcgaacgct
atccagatctctgaagatgtacgtgcgcgtatggccgagttagcgcaaagctttccagaa
ggtctaaactacgacaccgtttacgacccaaccgtgtttgtgcgtggctctattgaagcg
gtagttaaaaccttgtttgaagcggtactgctagtggtattagtggtggtgctgttccta
caaacctggcgcgcttctattattccattagtggcagtaccggtttctttagtaggtacc
tttgcctttatgcatcttatgggcttctcgctcaatgccttgtcgttatttggtttggta
ttagccatcggtattgtggtagatgatgccattgtggtggtggagaacgtggagcgaaat
attgcagaaggtttaagcccggtagcggctacccagcgcgccatgaaagaggtgacgggg
ccaattgtggcaactaccttagtattggcggcagtgtttattcctactgcttttatgtct
ggcttaaccggacagttttacaagcagtttgctttaaccattactatctctacctttatt
tcagcgattaactcattaaccttgagtccagctttgtctgccttgctgctaaaaggtcac
gacgaaccgaaagaccgtttaactcgcattatggacagcttgtttggcaggtttatattt
gcgccgtttaatcgcttatttaataaaggtgccaatgtatatggtggcatcatcaaaaag
acaattcgcttgtcggccttggttggcattatttatgtgggtttattagggcttacggct
tatcaatttgacaccactcctactggttatgtgccagggcaagacaaacaatacttagtg
gcgtttgctcagttgcccgacgctgcctctttagagcgcaccgaagcggtagtgaaaaaa
atgtctgagattgccttggcacaacctggggttgagcacgcggtggcgtttcctggctta
agcattaatggctttaccaacagtccaaacagcgcgattttatttacacctttggccgat
tttgaccaacgccaagacccaagtctttcggccaatgccatcgctggggcgcttaaccaa
cagtttgcaggtattcaagaagcctttattgcgattttcccaccaccaccggtgcagggt
ttaggcactattggtggctttagattgcagatccaagaccgcgcaagccttggttatgaa
gagttagccaatgtcaccatgcaagtcatgcaaaaagcctgggcaacaccatcacttact
ggcattttctctagttaccaagtaaatgtgccgcagcttgatttggatttggatagaacc
aaagccatgcaacaaggggtggcgatagatgaagtattttctaccttgcaagcttacatg
ggttcaacctatgtaaatgactttaataagtttggcagaacctatcaggtgaatattcaa
gccgatgagtcctttaggcaatcgccagaacaaattagccagctaaaggtgagaaatgcc
gatggtgcgatgatccccttaggctcctttgttgatgtctcttatgtggcgggtccagat
cgagtgatgcactacaacggttataccactgccgagatcaatggtgggccagcgccgggt
tatagctccggtgaagcgcaggctgccatcgagcagattttggcggaaactttgcccatc
ggcatgacctttgagtggaccgagcttacctatcaacaaaagctgtcgggtaatactgca
atgctgatttatcccttggtgattattttggtattcatggtgttagctgctcagtacgag
agcttgcgtttgccaatggcgattattttaatcattcctatgaccttgttatcggccatt
agtggggtattgctttggggcggagacaacaacatcttcactcaaattggtttgatcgta
ttggtaggcttggctaccaagaatgccattttaattgtcgagtttgctaaggaattacaa
gaccaaggtcgcacagtaatggaagcggtattagaggcttcacgcttacgtttacggcca
attctaatgacctctatcgcctttattatgggggttgtgccaatggtgttttctactggt
gaaggcgcagagatgcgtcaagcgatgggggtggcggtgttctctggcatgattggggtt
accatttttggtttgctacttaccccactgttttactacttgctggcaaaacgtaatcca
aaaaccagtgagcaagccgagccgctggcgctagacgctgatatattggctgccaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system