Aphis gossypii (cotton aphid): 114121350
Help
Entry
114121350 CDS
T05869
Name
(RefSeq) integrator complex subunit 4
KO
K13141
integrator complex subunit 4
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ags03041
]
114121350
Spliceosome [BR:
ags03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
Integrator complex
114121350
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
INTS4_8HBD
HEAT
HEAT_2
Ipi1_N
bHLH_LHW
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114121350
NCBI-ProteinID:
XP_027839442
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(33362304..33370368)
Genome browser
AA seq
964 aa
AA seq
DB search
MAAVLKKRALAEYSTQVLEQQPPVKKLKCLVKLSALTTGATLSLVNTINGRKTPNDVVQI
LLQILEQLQFQDSDISNILIKLSEHFKLQSDSTVKILIFSVLSAIGSSDETSEDNVYKIV
EEIFTLMKDVKSQKIKTSGLKTLLALGKRMNHDMDLHLKLTNYAKKTLGDYRPNITCESL
EVIGELMPVKIPEDGLEIHSEMLKLIGSYTQHYNAKTRSNAFNTMVRLHDRGIRLNPAVY
LDVCSVINDDNEMVREAALNVISVLGNYYPEERIKGSNGEEMARMSDEAFENICNFMTDI
SYRIRTQAAKLLGSFLSVSTNVLLKTLDQTLMSNLRRKRTSIERVWECLAKGTAMMSALS
TKDTPQEMLDAQQVSLVSTGASGAYLHGLEDEFLEVRIATISSMCSLATRHSEFAVIAME
FLVDMFNDEIEEVRLIAIESLVKLSYASGLRDDQVEIILAVIEDSSSVVREGLHNIFASF
ELLNQEGLMMCTNRLIESLKKYPEDKKSIWNCMKNLGLRHPTLTLALVPELLAIHPMFET
PEPNVEEPSYVSVLILVFNAASKCNSIISLLEDKTIKHYSYLRDIMPHLVPSLQLGGRLS
ISQVELRPTESDSPKSLELLESLINQVSVVKGSTKVKISLLETFYHNLIRLAQLDQSVNG
TAELSALYMHSQLLLNKVLNNNNKTFYSNAVSTHQANNVRTNISQLLQNTLKMQYLFVGL
SVQELASIKQFKLKVIALLLVYIVNATNQSARTLSHYFLTQLEDTMKYISEHDLQLESFT
SVVFKELSQLEESKPGIVAKLLLPILQSSEPTPPPKPNTNIKMCKVVINRPQGGPDTTHK
LSAGLILPIPLNAELYSLQTESLSLLRLKIKYPDQQTHLIMPPRNHLRLVNLSNESYYLL
DTNALISHRSEWSEACFVELSLAFDLTETEGALAHVLPPTQPCIVDLCKPVKLKVHPKPV
RRGM
NT seq
2895 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggcagttttaaaaaaaagagcactagctgagtatagtacacaagtgttggaacaa
caaccaccagtaaaaaaattgaaatgtctagtgaaattatcggctttaacaactggtgct
accctatcattagttaacacaattaatggtcgtaaaacaccaaatgatgtagtgcaaatt
ttgctgcaaatattagaacaacttcagtttcaggattcagatatctctaacattttaatt
aaactcagtgaacattttaaacttcaatcagattctacggtcaagatattaatattttct
gttttatcagctattggttcttcggacgaaactagtgaagataatgtgtacaaaattgtt
gaagaaatatttactttaatgaaagatgttaagtctcagaaaatcaaaactagtggtcta
aaaacactattagcacttgggaaacgtatgaatcatgatatggatcttcacttgaaactc
actaattatgctaaaaaaacattgggagattatagaccaaacatcacatgtgagagttta
gaggtaataggtgaattgatgccagtgaaaattccagaggatggtttagaaattcattct
gaaatgttaaaattaattggaagttatacacagcattacaatgcaaaaacaaggagtaat
gcttttaatacaatggttcgattgcacgaccgaggtattagattaaaccctgctgtatac
ctagatgtttgttcagttataaatgacgataatgaaatggtgagagaagctgctttaaat
gtaatttctgttctaggaaattattatcctgaagaaagaatcaaaggtagtaatggtgaa
gaaatggctcgaatgtctgatgaagcatttgaaaacatatgtaactttatgactgatata
agttaccgaattcgtactcaagcagcaaagcttcttggatcttttttgtctgtcagtaca
aatgttttgttgaagacactggatcaaacattgatgtctaatttgcgtagaaaacgaact
tctattgaacgtgtttgggaatgtttagcaaagggtacagctatgatgagtgcattaagt
actaaagatacaccacaagaaatgctggatgcacagcaagttagtttggttagcacagga
gctagtggtgcttaccttcatggcttagaagatgaatttcttgaggtacgcatagctaca
ataagttctatgtgctcattggctactagacattcagaatttgcagtgattgcaatggag
ttcttagtagatatgtttaatgatgaaattgaagaagttcgcttaatagctattgaaagt
ctcgtgaagctttcatatgcatctggactccgtgatgatcaagtggagattattttagca
gtgattgaagattcgtcaagtgttgtgcgtgaaggcttacataatatatttgcatcattt
gaactattaaatcaagaaggattaatgatgtgcactaacagattaattgaaagtttaaaa
aaatatccagaggacaaaaaatctatatggaattgtatgaaaaatttagggctaagacat
ccgacattaacattggcattagtacctgaattgttggccattcatcctatgtttgaaact
ccggaaccaaatgtagaagaaccatcgtatgtaagtgttttgattttagtattcaatgca
gcatccaagtgtaattctattatatcattacttgaggataaaaccattaaacactatagt
tacttaagagatattatgcctcacttagttccatctttacaactaggtgggcgtttatca
ataagtcaagtagaattaagacctactgaatcagattcacctaaatctcttgaacttctt
gaatcattaatcaatcaagtttctgttgtcaaaggaagtactaaagtaaaaattagtttg
ttggaaaccttttatcataatcttatacgactggctcaacttgatcaatctgtgaatggt
acagcagagcttagtgcattatatatgcatagtcaacttttattaaataaagtattgaat
aataataataaaacattttattcaaatgctgtgtctactcatcaagcaaataatgtgcgc
acaaatatttcgcagctattgcagaatactttaaaaatgcaatacttatttgttggcttg
agtgttcaagaattagctagtataaaacaattcaaattaaaagttatagctctccttctt
gtatatattgtaaatgctacaaaccaatcagccagaacactaagtcattattttctaact
cagttagaagacactatgaagtatattagtgaacatgatctacaacttgagtcattcact
tctgttgtttttaaagaattatcgcaattagaagaatcaaaaccaggaattgtggctaaa
ttacttctacccatattgcagagctctgaacctactccaccaccaaaaccaaacactaac
atcaaaatgtgtaaggttgttattaatcgcccacaaggaggtccagataccacccataag
ttatcagcaggtttaattcttcctatccctttaaatgcagaattatacagtttacaaaca
gagtcattatcattattacgtttaaaaattaaatatcctgatcaacaaacacatttaata
atgccaccaagaaatcacttacgtctagtaaatctcagtaatgagtcatattatctactt
gataccaatgcattaatatcacaccgttctgagtggtcagaagcatgttttgttgagctg
agcttagcatttgatctaactgaaacagaaggagctctggcccatgtcttacctcctacg
caaccgtgtattgttgatttatgcaaaccagtcaaacttaaagtgcaccctaaacctgta
agacgtggaatgtga
DBGET
integrated database retrieval system
