Arcobacter nitrofigilis: Arnit_3025
Help
Entry
Arnit_3025 CDS
T01235
Name
(GenBank) transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
ant
Arcobacter nitrofigilis
Pathway
ant01501
beta-Lactam resistance
ant01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ant00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
Arnit_3025
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Arnit_3025
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ant02000
]
Arnit_3025
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
ant01504
]
Arnit_3025
Transporters [BR:
ant02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Arnit_3025
Antimicrobial resistance genes [BR:
ant01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
Arnit_3025
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
UCR_14kD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADG94673
UniProt:
D5V7Q3
LinkDB
All DBs
Position
3056304..3059432
Genome browser
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MFSAFFINRPVFSAVVSILIFLAGLLSMINLPIEQYPKVVPPQIIVTTSYPGASAETISK
TVAAPLEEKINGAKDMIYMNSLAADSGVVSINVYFEVGTNADDAKIDVNNRVQSALAKLP
AEVQKQGVTVTERSPSLLQVISFYSPDNSKNTTYLSNYALMNIADNLKRIKGVGDATIFG
AKDYAIRVWVDPEKLSNFGLTTTDLINAIKEQNHQYAAGKFAAEPIANKQMFTYTLRTPP
RLSTPTEFGNIVIRANKDGSALLLKDVATVELGASSYNLNSKLNGLPSIPIGIFLQSGAN
AIDTAKAVKETLLKASEKFPAGVSYRIPYSSTDFIQVSIKEVAKTFVEAIILVVAIIFLF
LQNWRATLIPVLAVPVSIVGAFAGMYLLGFSINLLTLFGLVLAIGIVVDDAIIVIENVER
HLSEGMAPKEAAFKAMKEVSGALVAIILVLSAVFIPVAFISGLSGVMYKQFAITIVVSIV
ISGFVALTLTPSLCAVLLKDGHVKPQGFFKWFNNMFDKFTSGYSYMVKKTIRYSILSFLL
FGGLIFITYNMYTNMRTTLVPQEDQGALFIFSYNPPGSSLSRTTKLTDEVYDTVKQDKSV
ANTLTLSGLDFMTFALRTNSAATIVKLKDWDERKKPEEQASAIANRFTGQLMGRTTDGFS
FAVLPPPIMGMGVSGGFEMYVQNKSGSGVEDLNKYVQEIIQKANARPELTAVRTTLATNV
PQYSLKVDNIKAKSKGVNIADIFSTLSSTFGSYYINDFNLYGRTYTVNIQAKGEFRKGIE
DLNKVFVKASNNELLPVSSFVSITKTTGADLVERFNLFTSAKISGQPAPGYSSGDALKAI
EEVSKEVLPNNYAISWVGTAYQEKRISSKSYLAFIFGILFLYLILAAQYERWMMPISVVM
AIPFGVFGAVVATMMRGLENDIYFQVGILVLIGLSAKNAILIVEFAMQQRKEGKSIYDAA
INAAKLRIRPIIMTSLAFMLGVVPLAISTGAGAASRHAIGTGVIGGMLTATIIAIVFIPL
FYIFVSKLSEKKHKETNLKETE
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcagcatttttcataaatagaccggttttttcagccgttgtatctatccttatt
ttcctagctggattactttcaatgataaatttacctattgaacagtatccaaaggttgtt
ccacctcaaattattgtaacaacttcatatccaggtgctagtgcagaaacaatttcaaaa
actgttgctgcaccactagaagagaaaattaatggtgccaaagatatgatttatatgaat
tcattggcagcagatagtggagttgttagtatcaatgtatattttgaagtaggaactaat
gctgatgatgccaaaatcgatgtaaataaccgtgtacaatcagccttagcaaaacttcca
gcagaagtacagaaacaaggggtgacagtaacagagagatctcctagtttacttcaagta
ataagtttctattcaccagataattctaaaaatactacttatctttctaattatgcatta
atgaatattgctgataacttaaaaagaatcaaaggtgttggtgatgctacaattttcggt
gcaaaagattatgctataagagtttgggtagaccctgagaagttatcaaactttggactt
actacaacagatcttataaatgcgattaaagaacaaaatcatcaatatgcagcaggtaag
tttgcagcagaaccaatcgcaaataaacaaatgtttacatataccttgcgaactcctcca
agacttagtactccaacagagtttggtaacatagtaattagagcaaataaagacggtagt
gctttattattaaaagatgtagcaactgtggaattaggagctagtagttataatttaaat
tccaaattaaatggtcttccttcaattcctattggtatatttttacaaagtggtgcaaat
gctattgatacagcaaaagctgtaaaagaaacactattaaaggctagtgaaaaatttcca
gctggggtatcttatagaataccttatagtagtactgactttatccaagtatcaataaaa
gaagttgcaaaaacttttgttgaagcaattattcttgttgttgcaattattttcttattt
ttacaaaattggagagcaacacttattcctgttttagcagttccagtttctattgtcggg
gcatttgcaggaatgtatctgcttggatttagtataaacttattaaccctatttggttta
gtattggcaattggtattgttgttgatgatgctattattgtaatcgaaaatgtcgagagg
catttaagtgaaggaatggctccaaaagaggctgcatttaaagcaatgaaagaagtttct
ggagcattagtagctattatattagtactttctgctgtatttattcctgttgcatttatt
agtggtttatcaggtgtaatgtataagcagtttgccattacaattgttgtctctatcgtt
atttcaggatttgttgcattgacattgactccttcactttgtgcagttttattaaaagat
ggacatgtaaaaccacaaggttttttcaaatggtttaacaacatgtttgataagtttaca
agtggttattcttatatggtaaaaaaaacaattagatattctatattaagttttctccta
tttggaggcttaatatttattacatataatatgtacacaaatatgagaacaacacttgtt
cctcaagaagaccaaggggcactatttattttctcttataaccctcctggttcatctttg
agtagaactactaaattgacagatgaagtttatgatacggttaaacaagataaaagtgtg
gcaaatacattaacacttagtggactagactttatgacttttgcattaagaactaactct
gctgcaacaattgttaagcttaaagactgggacgaaagaaaaaaaccagaagagcaagca
agtgcaattgcaaatagatttacaggacaactaatgggtagaactacagatggcttctca
tttgcagtacttcctcctccaattatgggtatgggtgtttctggtggttttgaaatgtat
gtacaaaataaatcaggaagtggtgttgaagatttaaataaatatgttcaagagataatt
caaaaagcaaatgcaagaccagaattaacagcagttagaacaactcttgcaacaaatgtg
ccacaatattcacttaaagttgataatataaaagccaaatcaaaaggtgtaaatattgca
gatatattttcaactcttagttcaacttttggaagttattatataaatgacttcaactta
tatggaagaacatatactgtaaatattcaggcaaaaggtgaatttagaaaagggattgaa
gatttaaataaagtatttgtaaaagcttcaaacaatgaacttcttcctgtaagttctttt
gtatcaattacaaaaacaactggtgctgatttagttgagagattcaacctttttacatct
gcaaaaatttcaggacaaccagctcctggatatagttcaggtgatgcattaaaagccatt
gaagaagtttcaaaagaggttttaccaaataactatgcaatttcttgggtgggaactgct
tatcaagagaaaagaatctctagtaaaagttatttagcctttatttttggtatattattt
ttatacttaatcctagcagcacaatatgaaagatggatgatgccaatttctgttgttatg
gctattccttttggggtatttggtgcagttgtagcaactatgatgagaggattagaaaat
gatatttacttccaggtgggtattttagttttaattggactatccgctaaaaatgcaatt
ttaattgtagagtttgctatgcaacaaagaaaagagggtaaaagtatttatgatgcagca
attaatgcagcaaaattaagaattagaccaattattatgacttctcttgcatttatgtta
ggagttgttcctttagctattagtacaggtgcaggtgctgcaagtagacatgctattgga
actggtgtaattggaggaatgcttacagctacaatcattgctattgtctttattccttta
ttttatattttcgtttcaaaactaagtgaaaaaaagcataaagaaacaaatctcaaagaa
actgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
