Anas platyrhynchos (mallard): 101798014
Help
Entry
101798014 CDS
T02816
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X2
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
apla
Anas platyrhynchos (mallard)
Pathway
apla04350
TGF-beta signaling pathway
apla04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apla00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
101798014 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
101798014 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
apla00536
]
101798014 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
apla00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
101798014 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
EGF_3
TB
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101798014
NCBI-ProteinID:
XP_021128088
Ensembl:
ENSAPLG00000005565
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(1816049..1976226)
Genome browser
AA seq
2508 aa
AA seq
DB search
MQCCCDSGRCWSSGAAGAPEMCPIRSTDEYRKLCTVAALLPARPDIPPGRPEVMPPPVVY
PPLVPQQPEIVYPSRAPPPHVILPVNFTDYCQLFRHLCLNGRCIPTPGSYRCECNKGFQL
DVRGECIDVDECEKNPCISGDCVNTQGSYICQCRIGYQSTPTRTECRDIDECLQNGRICN
NGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGF
QLASDGRYCRDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRSTCY
GGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGTGMTAGGN
DINECLLDTDLCPNGRCENLHGTYKCICNPGYEVDSTGKNCIDIDECALNMLLCDNGQCR
NTPGSFTCTCPKGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCVNGVCKNTPGSFACECSPESTLDTTR
TICIETVKGTCWQNIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCERDPICQKGYSR
IRGTLCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPSGMTLDASGRTCLDIRLESCYLQH
EDEQCTLQIPGRHRMDACCCSVGAAWGFECEECPLKGSPEFEALCPRGSGFSTKIEITGK
PFSKDINECKMVPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDLCGQ
GICVNTPGDFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCRGGTCLNTEGSFRCDCPPG
HQISPNISACIDINECDLSTNLCRNGHCVNLIGKYQCSCNPGYQSTPDKLHCVDIDECSI
MNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPGEYRC
LCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTGCTDI
NECEIGAHNCDRHAICTNTAGSFKCSCSPGWVGNGIKCTDLDECSNGTHMCSPHADCKNT
MGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGGYRCECDMGFLPSPDGKA
CEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGGNCTDVNECADPTTCISGTCI
NTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGDNGGTFCSNEIGVGVSKASCC
CSLGRAWGVPCEQCPPVNTTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGKCI
NTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECDTPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYMQVNG
GNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIPSTDE
FSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICINMVGSFRCECPVGFFYNDKL
LICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTSTGRCTDRNECQEIPNICSHG
QCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACGNGTCRNTIGSFNCRCNLGFILS
HNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYEVALDGRTCVDVNECALDPGK
CSPGTCQNLDGSFRCICPPGYVLQNDKCEDIDECVEQPEICALGTCSNTPGSFKCLCPEG
FVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCCALKGQGWGDPCELCPEEA
DEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCINTDGSFRCECPYGYILQETQ
CVDTDECAVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCVDGFEPGPMMTCEDVNECIQNPLLCAFRCVN
TYGSYECKCPAGYVLREDRRMCRDQDECEEGIHDCDSKQMECKNLIGTYMCICGPGYQRR
PDGEGCVDENECQTKPGICENGRCVNTVGGYRCECNEGFTVSDSQKECLDNREGYCFTEV
LQSMCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGPNCEVCPFPGTVAFKKLCPHGRGYMSNGADI
DECKVIHDVCRNGECINERGSYRCHCNLGYTTDITGTLCIDLNECNESPKPCNFICKNTE
GSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTACI
DNNECATEINLCGAKGICQNTPGSFVCECQRGFSLDQTGLSCEDVDECDGNHRCQHGCQN
IIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQYEQFS
GGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVSGVGLGKGQGQELSLS
GEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETANEAEDQQESEPPISLASWDIEKAAV
FSINISDLSNKDRILKLLPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGFFRINKKDGISYLHFTKKKPV
PGNYSLQITSIPLYKKKELNQLEEKHDKDYLSGELGDNLKMKIQISLH
NT seq
7527 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagtgttgctgtgacagtggccgatgctggtcttctggtgcagctggtgctcctgaa
atgtgtccgatcagatccactgatgagtatcgcaaattgtgcacagtagccgctctgctg
ccagcaagacctgacattcctccgggtcgtcctgaagtcatgcctccacctgttgtttat
cctcctctggtccctcaacagccagaaattgtctatccatctcgggctccaccacctcat
gtgatcttgccggtgaacttcactgactattgccagttgttccgacatctctgccttaat
gggcgctgtattcccactcctgggagctaccgctgcgagtgcaacaaaggattccaatta
gatgttagaggggaatgcattgatgttgatgaatgtgagaagaatccatgtatcagtgga
gactgtgtgaacacccagggatcctacatatgccagtgtcgtataggatatcagagcaca
ccaacgagaacagagtgccgagacattgatgaatgtttacagaatggtcgtatctgcaat
aatggacgatgcataaatacagatggcagttttcactgcgtgtgcaatgctggatttcaa
gtggcagctgatgggaaaaactgtgaagatatggatgaatgcagcataagaaatatgtgc
ctgaatgggatgtgcatcaatgaggacggcagttttaaatgcatttgtaaaccagggttc
cagttagcatctgatggacgttattgcagagacatcgatgagtgtgagacagctggaata
tgcatgaacgggcgctgtgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccctggc
cttgcagtaggactggatggacgtgtgtgtgttgatacacatatgcgaagcacgtgctat
ggtggctacaagagagggcaatgtgtaagaccattaaccggtgcagttacaaaatcggaa
tgttgttgtgccagcactgactatgcctttggggagccttgtcaaccctgtccagcacaa
aattcagctgaatatcaggctctgtgcagtagtggaactggcatgacagcaggaggaaat
gatattaatgagtgcttactggatactgatctctgtcccaatggaaggtgtgagaatctg
catggaacatacaaatgtatttgtaaccctgggtatgaagtggattcaactggaaaaaac
tgcattgacattgatgaatgtgcactgaacatgctgctttgtgacaacgggcaatgcaga
aatacgcctgggagtttcacctgcacttgtcccaaaggatttgtatacactccagaccta
aaaacatgtgaagatattgacgagtgtgaatctaacccctgcgttaatggggtatgcaaa
aacacaccaggctcttttgcttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatacaacaaga
actatctgcatagaaactgttaagggtacctgttggcagaacatagttgatggaagatgt
gaaataaatatcaatggagcaactctaaagtcccagtgctgttcctcactaggtgctgct
tggggtagtccatgtacaccatgtgaacgagacccaatatgccaaaagggatattcaaga
ataagaggaacattatgtgaagatgtaaatgaatgtgaggtgttccctggagtctgtacc
aatgggcagtgtgtcaataccttgggatcgtttgtttgccagtgccccagtggaatgact
ttagatgcttctggacggacgtgtcttgacattcgcttggagagttgctacctgcagcat
gaagatgagcaatgcactttacaaataccaggccgacaccgaatggatgcttgctgctgt
tctgtgggggcagcatggggctttgagtgtgaggaatgtcctctgaagggatcgccagaa
tttgaagctctttgtcccagaggatctggattctctacaaagatagagattactgggaaa
cctttttctaaagatatcaatgaatgtaaaatggtccccagcctttgtacccatggaaaa
tgcagaaacaccattggcagtttcaagtgtagatgtgatagtggatttgcccttgattct
gaagagaggaactgcacagatatcgatgaatgccgcatctctcctgatctttgtggtcaa
ggcatctgtgtcaatactcctggggacttcgaatgtgaatgttttgaaggctatgaaagt
ggatttatgatgatgaaaaactgcatggacatcgatgagtgtcagcgcaacccccttctc
tgccgaggtggaacctgcctcaacacagagggaagttttcggtgtgattgtcctccaggc
catcagatatcaccaaatatttctgcatgtatagacattaatgaatgtgatctaagcacc
aacttgtgccgaaatggacattgtgtcaacctgattggaaagtatcagtgttcttgtaac
cctggatatcagtccacacctgacaagttacactgtgttgatattgatgagtgcagcata
atgaatggtggctgtgagaacttctgtacaaactccgagggcagctatgaatgtagctgt
aaacaaggctttgcactcatgccagaccacaggacgtgtactgatattgacgagtgtgaa
gacaatcctaacatctgtgatggaggccagtgcacaaacatcccaggagaatacaggtgt
ctttgctatgatggattcatggcatcagaggacatgaagacttgtgtagatgttaatgag
tgtgatctgcatccaaacatttgtctgagtggaacctgtgagaacacaaaaggctcattt
atctgtcattgtgacatgggatattcaggcaagaaaggcacaactggttgcacagatatc
aatgagtgtgaaattggagcccataactgtgataggcatgccatatgtacgaacacagca
ggaagtttcaaatgtagctgcagccctggctgggttgggaatggtatcaagtgcacagat
ctggatgagtgctcaaatggaacccacatgtgcagtccacatgctgactgcaagaacaca
atgggttcttatcgttgcctgtgtaaagaaggttatactggggatggcttcacttgtaca
gacctagatgaatgctcagaaaacttaaatctctgtgaaaatgggcagtgcctcaatgcc
ccgggaggatatcgctgtgaatgtgatatgggatttttgccaagtccggatgggaaagca
tgtgaagatattgatgagtgctcccttcctaacatctgtgtctacggtacttgtcataac
cttcctggacttttccgatgtgagtgcgaagtaggctatgaactggacagaagtggtggt
aactgcacagatgttaatgaatgtgcagatcccacaacctgcatcagtggcacatgtatc
aatactgctggtagttacacctgtgagtgccctccagattttgagctgaatcctacccgt
gttggctgtgttgatacacgatctggcaactgttacttggacattaaaacacgtggagat
aatggtggcaccttctgcagcaatgagatcggagtgggtgtttctaaggcctcctgttgc
tgctctctgggcagagcttggggagttccctgtgaacagtgcccacctgtgaacacaact
gaatataaggttctttgccctggaggagaaggattccgaccaaaccctattacagttata
ttagaggatattgatgaatgtcaagaactgcctgggctctgccaaggaggaaaatgtatt
aatacatttggtagcttccagtgtcagtgtccatcagggtactatttgaatgaagagact
cgagtatgcgatgatgtgaatgagtgtgatacacctggcatatgtggacctggcacatgt
tacaatactgttgggaactacacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagtcaatgga
gggaacaactgtatggatatgagaagaagtctgtgctacagaaattactatgctgataac
caaacctgtgatggcgagctactctttaatatgaccaagaaaatgtgctgctgttcctac
aacattggacgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcctatacctagcaccgatgaa
ttctctacgctctgtggaagtcagaggcctggcttcttcattgatatatatacaggacta
ccagttgatattgatgaatgtagagagattcctggagtgtgtgaaaatggcatctgtata
aacatggttggcagcttccgatgcgagtgtcctgtgggtttcttctacaatgacaagcta
ctgatctgcgaagatattgatgaatgccaaaatggaccagtatgtcagcaaaatgctgag
tgtgtcaacacagctggtagctaccgttgtgactgtaaacctggctatagattcacatca
accggacgctgcactgatcggaacgaatgtcaagaaattcccaatatctgcagccatggg
cagtgtattgacactgtcggaagtttttactgtatttgtcacaacggattcaagaccaac
gatgacagaacaatgtgtatagatatcaatgagtgtgagagagatgcctgtggcaatgga
acctgcagaaacaccattggctctttcaattgccgctgcaatttggggttcatcctctca
cataacaatgactgcatagacgtggatgaatgtgcaagtggaaatgggatgctctgcagg
aatggtcagtgtgtgaacacgattggatctttccagtgtctttgcaatgatggctatgag
gtggctctggatggaaggacttgtgttgatgtgaatgagtgtgcactggatcctggaaaa
tgctcaccgggcacgtgccagaacttggatgggtcattcagatgcatttgtcctcctgga
tatgtcctgcaaaatgacaaatgtgaagatattgatgagtgtgtagaacagccagaaatt
tgtgccctgggcacatgcagcaacacaccaggcagtttcaaatgcttgtgtccagaaggt
tttgtgttgtcttccacaggaaggcgatgccaagatctgagagtgagttactgctttacc
aaatttgaagatggaaaatgttctgtgccgaagtcccgaaaccactccaaacaagagtgt
tgctgtgccttgaaaggacaagggtggggagatccctgtgaactctgcccagaggaagca
gatgaggcattcagacagatttgtccatttggaataggcatccttgttggacctggtgat
gcaagactggatgtggatgagtgccttgatccagataattgtaaatttgggcagtgtatc
aacacagatgggtctttccgctgtgaatgtccatatggttatatcctacaggaaactcaa
tgtgtggatactgatgaatgtgctgttggaaatccgtgcggaaatggaacttgcaggaat
gtagtgggaggttttgaatgcacctgtgttgatggatttgagcctggaccaatgatgacg
tgtgaagatgtcaacgagtgcattcagaaccctctgctctgtgctttccgctgtgtgaac
acctacggatcctatgagtgcaagtgccctgcagggtacgttctgcgagaagaccggaga
atgtgcagagatcaggatgagtgtgaagaaggcattcacgactgtgactcaaaacagatg
gagtgcaaaaacctaataggtacctatatgtgtatctgtggaccaggttatcagcgcaga
ccagatggggaaggctgtgtagatgagaatgaatgtcagaccaaacctgggatctgtgag
aatggccggtgtgtaaacacagtgggaggttacagatgtgaatgcaatgagggattcact
gtcagtgacagccagaaagaatgcctcgacaacagggaaggctactgcttcactgaagtc
ttacaaagtatgtgtcaaatcggatcaagcaacaggaactctgtcaccaagtctgaatgc
tgctgtgatggtggccgaggctgggggccaaactgcgaggtctgccccttcccaggcact
gtggcctttaagaagctttgtcctcatggtcgaggatatatgtctaatggagcagatatt
gatgagtgcaaggttattcatgatgtctgccgtaatggggaatgcattaatgaaagggga
tcttaccgttgtcattgcaacctgggctacactacagacataactggcactctttgcata
gacctgaatgaatgtaacgagtcccccaaaccttgcaatttcatctgcaaaaacacagag
gggagcttccagtgttcatgtccgaaagggtacatccttcaagaagatgggagaagctgc
aaagatcttgatgaatgtgctacaaagcagcacaactgccagttcctttgtgtcaatact
attggaggttttacttgtaaatgtcctcctggattcactcagcatcatacagcctgcatt
gataataatgaatgtgctactgaaatcaacctgtgtggggcgaagggtatttgccagaat
acaccaggaagttttgtttgtgaatgtcaacgtggcttctcactagatcaaaccgggctt
agctgtgaagatgttgatgaatgtgatggaaaccaccggtgtcagcatggctgccaaaat
ataattggaggatacaggtgtagctgtccgcaaggatatctccagcattaccaatggaac
caatgtgttgatgaaaatgaatgtctcagtgcacacatttgtggaggagcatcttgccac
aatactttgggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacagtttagt
ggaggttgccaagatatcaatgaatgcggttctgcacaagccccatgcagttatggttgt
tcaaatactgaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaataggacaa
ggacactgtgtttctggagtggggctaggcaaaggtcaaggacaagaactttcactcagt
ggagaagtagatgacaactctctctctccagaagcttgctatgaatgtaaaatcaatggc
tatcccaagagaggaaggaagcgcagaagcactaatgaaactgcaaatgaagcagaggat
cagcaagagtcggagcccccgatcagccttgccagctgggatattgagaaagcagcagtc
ttttctatcaacatctctgatctcagtaacaaagatcgcatcctgaaactgcttcctgcc
ctcacaacactgacaaaccataaccgatacttaattgactccggaaatgaagatggtttc
tttagaatcaataagaaggacgggataagttaccttcatttcacaaagaagaagccagtg
cctggaaactattcattacaaatcactagtattccactctataaaaagaaggaacttaac
cagcttgaagagaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataatctgaaa
atgaaaattcagatatcacttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
