Acipenser ruthenus (sterlet): 117429415 Help Entry 117429415         CDS       T07327                                  Symbol fbn1 Name (RefSeq) fibrillin-1   KO K06825   fibrillin 1 Organism arut  Acipenser ruthenus (sterlet) Pathway arut04350   TGF-beta signaling pathway arut04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:arut00001]  09130 Environmental Information Processing   09132 Signal transduction    04350 TGF-beta signaling pathway     117429415 (fbn1)  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     117429415 (fbn1)  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:arut00536]     117429415 (fbn1) Glycosaminoglycan binding proteins [BR:arut00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    117429415 (fbn1) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  EGF_CA cEGF FXa_inhibition EGF hEGF TB EGF_3 Fibrillin_U_N Plasmod_Pvs28 EGF_FBN_1st EGF_MSP1_1 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  117429415 NCBI-ProteinID:  XP_034763022 LinkDB All DBs Position 27:complement(21160282..21231695) Genome browser AA seq 2878 aa AA seqDB search MRLGCLLRFVLGFAAVSSLSVKESEGAERDTEADRYSEQKASRSKRRGGGQDVLKGPNVC GSRFNAYCCPGWKTLSGGNQCIVPICRSSCGDGFCSRPNMCTCPSGQIAPSCGSKSVQHC NIRCMNGGSCAEDQCLCQKGYTGNHCGQPVCESGCINGGRCVGPNRCACTYGFTGAQCER DYRTGPCFSSVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNI RTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHRFNELTQKCEDIDECSNVPGIC NGGECSNTKGSYFCKCPQGYYTPPDGSRCIDVRAGYCFSSLVSGRCANQLPQLLTRMQCC CDSGRCWSDGSAPAMCPMRGTDEYRKLCSVQIPGPDSEWPVPSVPVGPGGLPFSPVTGER PPVQPDGGLPRPPINGQPPVILTQNITFGVNTCQLYRNLCINGRCIPTPGSYRCECNMGF MLDVRGECIDDVECDRNPCVSGDCVNTQGSYFCQCHAGFQSTATRTECRDIDECLANGRI CNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFEVTSDGRNCEDQDECLIKNMCLNGMCINEDGSFKCICKS GFQLAPNGRFCQDIDECETPGMCMNGRCVNTEGSFRCDCLPGLAVGLDGRVCVDTHMRST CYGGYKRGQCVKPFFGAVTKSECCCANIEYAFGEPCQPCPALNSAEFNALCSKGSGIASD GRDINECALDPDLCQNGVCENLHRTYRCNCNQGYEIDSSGKNCVDIDECAINRQLCENGQ CRNTPGSFTCFCPKGYVFKSDTDVCEDVNECESSPCVNGNCRNNPGSFSCECPQGSTLDT TGTVCVETGKGTCWLKIINGRCEVNINGETLKSHCCATMGAAWGSPCAPCEPDPFCSKGY ARVRGTTCEDVNECEVFPGVCTNGKCVNTVGSFICQCPSGMTLDATGRTCVDLRMEFCYL THEDERCSSPIPSKHRVDACCCSVGAAWGPECEECPEKRTPEYDQLCPRGPGFSHRGDFI NGRPFLKDVNECKMIHNLCSNGKCRNTIGSFKCKCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDL CGQGTCVNTPGDFACECFEGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGVCINTEGSFLCEC PTGHQVATDGSACLDVNECELSDNLCRNGRCVNMIGRYQCACNTGYRSTDDRLACVDIDE CTIQNGGCETFCTNSEGSYECSCRAGYALMPDQRTCTDIDECEDNPDICDGGQCTNIPGE YRCLCYDGFMSSEDMKTCLDVDECDLNPNICLSGNCENTKGSFICHCDLGYSVKKGTTGC TDINECEIGAHNCDKHATCTNTAGSFKCSCGPGWIGNGIKCVDLDECSNGTHMCSANAEC RNTMGSYRCQCKEGYSGDGFFCTDSDECADNVNLCENGHCLNIPGGYRCDCDMGFSPTVD GKACQDIDECAFPDICVYGTCHNIPGLFRCECDTGYELDRTGGNCTDVNECADPTTCISG ICVNTPGSYRCNCPPGFELNPTRVGCVDTRSGNCYLEFQPRGDGSDVLSCSNEIGVGVSK ASCCCSLGQAWGNPCEQCPPINSSHYKILCPGGEGFRPNPITVILEDINECQELPGLCQG GNCINTFGSFQCECPPGFYLNVETRVCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYM QVNGGNNCMDMRRSLCYRNFHSDNGTCDGELPFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIP STNEFAILCGSQRPGFVIDIYTGQPVDIDECRDIPGVCENGVCINMIGSFRCECPVGFVY NDKLLICEDIDECQNGPVCQQNADCLNTAGSYRCECKPGYRFTSTGQCIDRNECLELPNA CSHGQCIDIVGSFRCICNNGFKATADQTMCIDVDECERQPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPG FDLSHNSDCIDVDECSTNRGLCRHGNCINTVGSFVCVCQDGYELTADGRSCVDINECVVN PGTCGPGTCQNLDGTYRCICPPGYYLTEERCEDIDECAESPDICVFGTCSNTQGSFICKC PEGFQLSSTGRRCNDIRVNFCFTKFENGKCFAAKAKNTTKSACCCSAMPGEGWGSPCEIC PKQNEPAFALLCPGGYGHDVDNGDSRVDLDECSSDPGICKNGQCINTDGSFRCECPFGFS LDYSGINCEDTDECSVGNPCGNGTCTNVIGAFECACEEGFEPGPMMSCEDVNECAQNRLL CAFRCVNIVGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQNECEDGIDDCESRGMLCKNLIGLYMCIC PPGYVRRPNGDGCIDKNECTAKPGICENGRCINTVGSYRCSCHEGFSASSSETECIDNRQ GFCFTEVLQSLCQMTSSSQNAVTKSECCCDGGRGWGPNCEICPLPGTGQFKKMCPLGPGY TTDGKDIDECRVIGGLCQNGQCINNMGSYSCLCKSGYTTDLTGTGCVDLDECVQAPKPCN FICKNIEGSYLCSCPRGYILQEDGKSCRDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFT QHHTACIDNNECMSEAGLCGAKGICQNTPGSFSCECQRGYLLDQNGQNCEDMDECDGNHR CQHGCQNMIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSSQVCGGASCHNTLGSFRCICPTG FQFEQFHGACHDVNECASSQSPCSYGCSNTDGGYLCACPTGYYRVGQGHCVSGVGFGNGD QALAVEGVGGDTDDNSLSPEACYECKINGYPKKGRKRRSTNGTEAESQNDSQDENESISL ASVDIEEPLVFSLNITDLDKKDHILELVPALTALTNHVRYLIDFGNEDGFFKINQKEGIS YLHLTKKKPIPGAYSLQISSVPLYKKKELDNLEDKHDKDYLTGELGDILKMKIQIILH NT seq 8637 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaggttggggtgtctgctgaggtttgttctgggatttgcagctgtttcatctctctcc gtcaaggagagtgaaggtgctgagcgagataccgaagctgacagatacagcgaacagaaa gccagcaggtcaaaaagaaggggaggcggtcaagatgtgctgaagggaccaaatgtttgt ggatcacggttcaatgcatactgctgcccaggatggaagactctgtctgggggaaaccag tgcattgtcccgatttgccgaagctcttgtggagatggattttgctccaggccaaatatg tgcacctgcccaagtggtcaaattgcaccctcttgtggttccaaatcagttcaacactgc aatattcgatgcatgaatgggggatcgtgtgctgaagaccagtgtttgtgtcagaagggt tacactgggaatcactgtggtcagcctgtctgtgaaagtgggtgtataaatggagggaga tgtgttggacctaaccgatgtgcctgcacatatgggtttaccggagcacagtgtgaaaga gattacaggaccggaccatgcttctcttctgtaagcaaccagatgtgccaggggcaactg agtggcattgtgtgcaccaagactttgtgctgtgcgacagtggggcgggcatgggggcac ccctgtgagatgtgtccagcccagccccatccctgtcgccggggattcattccaaacatc cgaacaggagcctgtcaagatgtggatgaatgccaggccattccagggctctgtcaagga ggaaattgtattaacactgtgggatcctttgagtgcaaatgcccagccggacacagattt aacgaactaacacaaaaatgtgaagacattgatgaatgctctaatgttcctggcatctgt aatggaggtgaatgttccaacacaaagggaagttacttctgcaagtgtcctcaagggtat tatacaccccctgatggctcaagatgtatagatgtacgagctggatactgcttctcaagc ctagtgagtggtcgctgtgccaaccagctcccccaactcctcaccagaatgcagtgctgc tgtgacagtggacggtgctggtctgatgggtctgctccagcaatgtgcccaatgcgtgga actgatgagtacagaaagctctgctccgttcagatcccaggcccagactcagaatggcct gttcctagtgtgccagttggaccaggtggtctccccttttccccagtgactggagagcgg cctcctgtgcaaccggatggtggactacccaggcccccaatcaatggacaacctccagtg attcttacacaaaatataacttttggtgtgaatacctgtcaattgtaccggaatctgtgc attaatggacgctgtatccctactcctgggagctatcgatgcgagtgtaacatgggcttc atgctcgatgtccggggagaatgtattgatgatgtcgaatgtgacagaaacccctgtgtc agtggcgattgtgtaaatactcaaggatcttatttctgccaatgccacgctggttttcaa agcacagcaacaaggacagagtgcagagatatcgatgaatgtttggcgaatggcaggatc tgtaacaatggacgctgtgttaatacagatggcagctttcactgtgtatgcaatgctggc ttcgaggtaacatcagacgggcgcaactgtgaagatcaagatgaatgccttattaaaaac atgtgtcttaatggtatgtgcattaatgaagatgggagttttaaatgcatatgtaaatct ggcttccagttagcaccaaatggacgattctgccaagatattgatgagtgtgagacacca ggcatgtgcatgaatggacgctgtgtaaacacggaaggctcatttagatgtgactgtctc cctggtctggcggtgggactggatgggcgggtctgtgttgatacacacatgcgcagcaca tgttatggaggttacaagagagggcaatgtgttaaaccgttctttggagctgtgaccaaa tcggagtgttgttgtgccaacattgaatatgcctttggggagccttgtcaaccttgccca gcactaaactcagctgaattcaatgccttgtgcagtaaaggatctggtattgcttctgat gggagagatataaatgagtgtgccctggatcctgacctttgtcaaaatggagtttgtgag aacctgcacagaacatacagatgtaactgtaaccaaggatatgaaatagattcaagtggc aaaaactgcgttgatattgatgaatgtgcaataaacaggcagctgtgtgaaaatggacaa tgccgaaacacgcctgggagcttcacctgtttctgcccaaagggatatgtctttaaatcg gacactgacgtatgtgaagatgttaatgagtgtgaatccagcccttgtgttaatggaaac tgcaggaacaaccctggctccttctcctgtgaatgtccccagggaagcacactagataca actggaactgtttgtgttgaaacaggcaaggggacttgctggctgaagatcattaatggg cgatgtgaggtcaatatcaatggagagaccctgaagtcacactgctgtgccacaatgggg gcggcctggggaagcccttgtgccccgtgtgagccagatccattctgttcaaagggatat gcgagagttagagggacaacttgtgaagatgtgaatgaatgtgaagtatttcctggagtt tgcaccaatggaaagtgtgtaaatacagtgggatcttttatttgtcagtgccccagtgga atgaccctggatgccactggtcgaacatgcgttgatctgcgtatggagttttgttatttg acccatgaagatgagaggtgctcctctccaatccccagcaaacaccgcgtggatgcgtgc tgctgctccgtgggtgctgcctggggacccgagtgtgaagagtgccccgagaaacgcacc ccagagtatgatcagctttgccctcgaggcccaggcttctcccacagaggcgatttcatc aacggaaggcctttcttgaaagacgtcaacgagtgcaaaatgatccataacctgtgcagt aatggcaaatgcaggaacacaatcggcagtttcaaatgtaaatgtgacagtggctttgca cttgactcggaggaaaggaactgcactgatattgacgagtgtcggatatctcctgatctt tgcggacagggaacttgtgtcaacactcccggggactttgcatgtgaatgctttgagggc tacgaaagtggatttatgatgatgaagaactgcatggacatcgatgagtgtgaaaggaac ccccttctgtgccgcggaggggtgtgtattaacacggagggcagtttcctctgtgaatgc cccactggccaccaggttgctacggatgggtcggcttgtttagatgttaatgaatgtgag ctaagtgataacctttgcaggaacggccgttgtgtgaatatgattgggcgctaccagtgt gcctgtaacacagggtatagatctactgatgacagattagcctgtgttgatattgatgag tgcaccatacaaaacggaggatgtgaaaccttttgtacaaactctgaaggaagttatgag tgcagctgtagagcaggctatgcactgatgccagatcaaagaacctgcacagacattgat gaatgtgaggacaatcctgatatctgtgacgggggacagtgcaccaacatccctggcgaa tatcgatgtctgtgttacgatgggtttatgtcctctgaggatatgaagacatgcctagat gttgatgagtgtgacctcaatccaaatatctgccttagtgggaactgtgaaaacacaaaa ggctcattcatttgccactgtgacctgggatattcagtgaagaagggaaccactggctgt acagatataaacgagtgtgagattggggctcacaactgcgacaaacacgctacctgtact aatacagcagggagctttaaatgcagctgtggtccaggatggattggcaatggaattaaa tgtgttgatctggacgagtgttctaatggaactcacatgtgcagtgctaatgcagaatgt agaaacaccatggggtcttaccggtgtcagtgtaaagagggctactctggagatggcttc ttctgtacagatagtgacgagtgtgcagataatgtcaatctgtgtgagaatggccactgt ctgaatattcctggtggataccgttgcgattgtgacatgggcttttcaccaactgtggat ggaaaagcatgtcaagatattgatgaatgtgcattccctgatatctgtgtctatggaacc tgtcacaatattccaggactgtttcgatgtgaatgtgacacagggtatgaattggacagg actggtggcaactgtacagatgtcaatgagtgcgccgatccgacgacttgcatcagtgga atttgtgttaacacccctggcagctaccgctgcaactgtcctccaggttttgagctcaac cctacgcgggttggctgcgtggatacacgttctggcaattgttacctggaattccagcca cgtggagacgggtctgatgttctgtcctgttctaatgagatcggtgtcggcgtttcaaag gcttcttgttgctgttcgttgggtcaagcttggggcaacccttgtgagcagtgcccgccc attaactcttctcattataaaatattatgtccgggtggagaaggcttcagacccaacccc atcacagtcattcttgaagatatcaatgagtgtcaggagctaccggggctttgccaagga ggaaattgcatcaacacatttggaagtttccagtgtgaatgtccccctggcttttaccta aatgtagaaacacgagtctgcgatgatgttaacgaatgtgaaacacctggtatctgtggt ccaggaacatgttacaatacagtcggaaactatacctgtatttgccctccagactacatg caggtcaatggtggaaacaactgtatggatatgaggaggagtctgtgctacaggaatttt cattctgacaatgggacttgcgatggtgagctaccgttcaatatgaccaagaagatgtgt tgctgctcctataatattggacgtgcctggaacaagccttgtgaacagtgccctataccg agcaccaatgagtttgcgatcctctgtggaagccagagacctggatttgtaattgacatc tatacagggcagccagttgacattgatgaatgcagggatatcccaggagtatgtgagaat ggagtctgcatcaacatgattggcagcttcaggtgtgaatgcccggtgggctttgtgtac aacgacaaattactgatctgcgaagacattgatgaatgtcagaatggaccagtttgtcaa cagaacgcagactgtctgaacacagcaggcagctatcgctgtgaatgtaaaccaggctac aggttcacttctactgggcagtgtattgatcgcaatgagtgtctggaattgcccaatgca tgtagtcatgggcagtgtattgacattgttggaagcttccgttgcatctgcaataatgga tttaaagcaactgcagatcaaactatgtgtatagatgttgatgaatgcgaacggcaaccg tgtggcaatgggacatgtaaaaataccgttggctcatacaactgcctgtgttatcctgga tttgatctttctcacaacagtgactgcatagatgtggacgagtgttcaaccaataggggg ctctgcaggcacggcaactgtataaacactgtgggctcgttcgtgtgtgtgtgccaggat ggctacgaactcaccgccgatggcaggagctgtgttgatatcaatgagtgtgtggtgaat cctggtacttgcggtcctggaacctgtcagaatttggacgggacctacagatgtatctgc ccacctggatactacttgacagaggagagatgtgaagatattgacgaatgcgcagagagt ccggatatctgtgtattcggcacttgctcaaatactcaaggtagttttatatgcaagtgt ccagaaggcttccaattgtcatcaactgggagaagatgtaatgatataagagtaaacttc tgttttactaagtttgagaacgggaagtgttttgctgccaaagccaagaacaccacaaag tcagcgtgttgctgtagtgccatgccaggggagggctggggcagcccgtgtgaaatctgc cctaaacagaatgaaccggcgttcgctctgctctgcccaggagggtatggccacgatgtt gacaatggggactcccgagttgatttggacgagtgctcatcagacccaggtatctgcaaa aatgggcagtgcattaatacagatggctccttccggtgtgaatgtccgtttggatttagt ctggattacagtggaataaattgtgaagatactgacgagtgttctgtgggtaatccttgt ggcaatggaacatgcacaaatgtgattggagctttcgaatgcgcctgtgaagagggcttt gagcctggacccatgatgtcctgtgaagatgtgaacgaatgtgctcagaatcgcctgctc tgtgcttttcgctgtgtgaacattgtgggctcatatgagtgcaaatgtcctgcgggctat gttctcagagaagataaaagaatgtgcaaagaccaaaatgagtgtgaagatggaattgat gactgtgagtccagagggatgctctgcaagaacctgataggactctacatgtgtatctgc ccacctgggtatgtgcgcaggccgaatggagacggctgcattgataagaatgaatgtaca gccaaaccgggcatctgtgagaacggccgctgcattaacacagttggcagctacagatgc tcatgccatgaagggtttagtgccagctcctctgagactgaatgcattgacaaccggcaa gggttttgcttcactgaggtcctgcagagtctctgccagatgacgtctagcagccagaac gccgtcaccaagtctgagtgctgctgtgacggagggcgtggctggggtccgaactgcgag atctgccccttgcctggtaccggacagttcaaaaagatgtgcccgctcgggcccgggtac actactgatgggaaagacattgatgaatgccgtgtcataggaggtctttgtcaaaatgga cagtgtataaataacatgggatcctatagctgcttgtgcaaatctggatatactacagat ttaacagggactggctgtgtggatcttgacgaatgcgttcaagcgccaaagccttgcaat ttcatctgcaaaaacattgaagggagctacctgtgctcctgtccaagaggctacatcctc caagaagatggaaagagttgcagagaccttgacgagtgctcaaccaaacagcacaattgt cagtttctgtgtgtcaacacaattggggggttcacttgcaaatgcccacctgggtttaca caacatcacacagcatgcatcgataacaatgaatgcatgtcggaggctggactgtgcgga gcaaagggaatctgccagaatactccaggaagcttcagctgtgaatgccagcgtggatat ctgctggaccaaaatggacagaactgtgaagatatggacgagtgtgacgggaaccatcga tgccagcatggttgtcagaatatgattggagggtaccgatgcagctgccctcaagggtat cttcagcattaccagtggaaccagtgtgtggatgaaaacgaatgcctcagctctcaggtt tgcggaggagcctcctgccacaatacgctcggaagcttccggtgtatctgccccacagga ttccagtttgaacagttccacggagcatgccatgatgtcaatgagtgtgcttcctctcag agtccctgcagctatggatgctccaacactgacggtggttacctctgtgcctgtccaact ggctattacagagtaggacaagggcactgtgtatctggagtcggatttggaaatggggac caagcactggcagtagaaggagtgggaggagatacagatgacaactcactttcaccagaa gcttgttatgaatgcaagattaatggctatcccaagaagggcaggaaacgcagaagcacc aatggaacagaagctgaatctcagaacgactcacaggatgaaaatgagagcatcagcctt gccagtgtggacattgaagaacctctagtcttcagcttgaacatcactgacctggacaaa aaagaccacatcctggagctggtaccagcgctcaccgcactgactaaccacgtgcgatac ttgattgattttggaaacgaggacggcttcttcaaaatcaaccagaaagaaggaataagc tatcttcacctgaccaagaagaaacccatacctggagcctattcgttacaaatcagcagc gtcccgctgtataaaaagaaggaacttgacaatctggaggacaaacatgacaaagactac ctcactggtgagctcggtgacatccttaaaatgaaaatccaaattattcttcattaa

DBGET integrated database retrieval system